MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	TACA	2	8	76	83	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010632	GTTA	2	8	154	161	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010632	TTTA	2	8	540	547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010632	TTCA	2	8	3075	3082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010632	TAGG	2	8	11299	11306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010632	TGAG	2	8	11327	11334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010632	TAGG	2	8	11371	11378	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010632	TGAG	2	8	11399	11406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010632	GCGT	2	8	11524	11531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_010632	TTAT	2	8	11766	11773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010632	ATTT	2	8	11855	11862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010632	CTGG	2	8	12594	12601	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_010632	TCAG	2	8	12700	12707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010632	TACT	2	8	15120	15127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_010632	ATAA	2	8	15145	15152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010632	ATAA	2	8	17474	17481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010632	CTAT	2	8	17483	17490	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010632	AGCA	2	8	17861	17868	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010632	CTGA	2	8	18001	18008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010632	GAAA	2	8	18025	18032	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010632	TTCT	2	8	18415	18422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010632	TAAC	2	8	19072	19079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_010632	ACTG	2	8	19899	19906	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010632	TTAA	2	8	20024	20031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010632	AAAG	2	8	20057	20064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010632	TCAA	2	8	20103	20110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010632	TATT	2	8	22330	22337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010632	GTAA	2	8	23115	23122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010632	ATTT	2	8	24406	24413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010632	AAAT	2	8	26873	26880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010632	ATTC	2	8	28988	28995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010632	CCAA	2	8	29256	29263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010632	TAAA	2	8	29391	29398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010632	TATT	2	8	33770	33777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010632	GACT	2	8	34013	34020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010632	GCTT	2	8	34049	34056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010632	TAAG	2	8	36220	36227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010632	AACA	2	8	44773	44780	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010632	ACTT	2	8	44831	44838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010632	TTAA	2	8	45088	45095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010632	AATT	2	8	45104	45111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010632	AATT	2	8	45158	45165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010632	ATCT	2	8	46859	46866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_010632	ATCC	2	8	53629	53636	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010632	CTTT	2	8	58560	58567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010632	TATG	2	8	58667	58674	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010632	TATC	2	8	60648	60655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010632	GCCA	2	8	64102	64109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010632	CATA	2	8	66071	66078	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010632	ACTT	2	8	67240	67247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010632	CGAG	2	8	67649	67656	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010632	AATA	2	8	69529	69536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010632	TTCT	2	8	69740	69747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_010632	TAAT	2	8	70326	70333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010632	TTTG	2	8	71200	71207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010632	ATTT	2	8	73465	73472	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010632	AAAG	2	8	74201	74208	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010632	TAAG	2	8	74247	74254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010632	ACAG	2	8	76143	76150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010632	GCCC	2	8	76210	76217	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
61	NC_010632	AAAT	2	8	76854	76861	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010632	AACA	2	8	76874	76881	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010632	ATTA	2	8	77286	77293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010632	CTTT	2	8	77359	77366	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010632	AAGC	2	8	77373	77380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010632	ATCC	2	8	77473	77480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_010632	ACTG	2	8	77776	77783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010632	GATT	2	8	77797	77804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010632	TTAA	2	8	77821	77828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010632	TTCT	2	8	77835	77842	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010632	AATT	2	8	77952	77959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010632	CCGT	2	8	78020	78027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010632	AAGC	2	8	78941	78948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_010632	AAGT	2	8	80990	80997	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010632	TTTA	2	8	81129	81136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010632	TCAA	2	8	81223	81230	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010632	ATTA	2	8	81575	81582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010632	AGTG	2	8	83523	83530	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010632	TTGC	2	8	83603	83610	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010632	TAAT	2	8	83648	83655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010632	TTAT	2	8	103862	103869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010632	GGCA	2	8	104913	104920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010632	GTAT	2	8	108277	108284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010632	GGGA	2	8	118649	118656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010632	TAAG	2	8	119297	119304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010632	ATGG	2	8	119434	119441	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010632	ACAA	2	8	119492	119499	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010632	GAAA	2	8	119554	119561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010632	AAGA	2	8	119756	119763	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010632	GTTT	2	8	119825	119832	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010632	TCAT	2	8	120093	120100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_010632	TTAA	2	8	120354	120361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010632	GGTT	2	8	120520	120527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010632	CAAC	2	8	121080	121087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010632	GCCT	2	8	121143	121150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010632	TTTC	2	8	121158	121165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010632	GTAA	2	8	121283	121290	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010632	CAGT	2	8	123531	123538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010632	AATC	2	8	126743	126750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010632	TAAA	2	8	126931	126938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010632	TTCC	2	8	127401	127408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010632	AACT	2	8	127594	127601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010632	GATT	2	8	127772	127779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010632	TTAA	2	8	128145	128152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010632	TTGC	2	8	128184	128191	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010632	AGTT	2	8	128867	128874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010632	GCTA	2	8	129118	129125	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010632	CTTG	2	8	129629	129636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010632	TAAA	2	8	129660	129667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010632	GCTT	2	8	130020	130027	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_010632	TATT	2	8	130135	130142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010632	AGCA	2	8	130661	130668	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010632	GAGC	2	8	130892	130899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_010632	TTAT	2	8	131118	131125	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010632	GTTA	2	8	131325	131332	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010632	TAAA	2	8	136612	136619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010632	CCTA	2	8	136716	136723	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010632	TTAA	2	8	136725	136732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010632	CAAT	2	8	136764	136771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010632	CATA	2	8	137028	137035	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010632	AAAT	2	8	139282	139289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010632	GACA	2	8	141746	141753	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010632	AGTA	2	8	141799	141806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010632	ACTT	2	8	141923	141930	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010632	GATT	2	8	142224	142231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010632	AGTC	2	8	142945	142952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_010632	TTTA	2	8	143027	143034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010632	TACT	2	8	143110	143117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010632	TAAT	2	8	143296	143303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010632	CAAA	2	8	143548	143555	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010632	AACA	2	8	143556	143563	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_010632	AAGA	2	8	143881	143888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010632	TTAA	2	8	143964	143971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010632	TACT	3	12	144018	144029	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010632	TATG	2	8	144323	144330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010632	TGGG	2	8	144377	144384	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010632	ATTT	2	8	145064	145071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010632	TGGG	2	8	147565	147572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010632	TCAT	2	8	148327	148334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_010632	CTTG	2	8	148641	148648	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010632	TGCC	2	8	155997	156004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_010632	GTAA	2	8	156577	156584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010632	AATC	2	8	156657	156664	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010632	TTTG	2	8	158287	158294	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010632	TTTA	2	8	160886	160893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010632	GTTA	2	8	161168	161175	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010632	GATT	2	8	163291	163298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010632	CTTC	2	8	164562	164569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_010632	AGAT	2	8	165590	165597	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010632	TTGA	2	8	165834	165841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010632	CAGG	2	8	165990	165997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010632	GATT	2	8	166770	166777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010632	CTAT	2	8	169805	169812	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010632	GACA	2	8	170400	170407	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010632	ACAA	2	8	172451	172458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_010632	TTGA	2	8	174672	174679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
157	NC_010632	TGGG	2	8	176618	176625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
158	NC_010632	TCCT	2	8	176685	176692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_010632	TAAT	2	8	178275	178282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010632	ATCT	2	8	178284	178291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_010632	AAAC	2	8	190619	190626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_010632	AAAG	2	8	190661	190668	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_010632	CACT	2	8	190697	190704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
164	NC_010632	GAAG	2	8	190961	190968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010632	TATT	2	8	196053	196060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_010632	TTTA	2	8	196152	196159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_010632	AGCT	2	8	196377	196384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_010632	TTGA	2	8	196401	196408	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_010632	AGTT	2	8	198702	198709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_010632	TTTA	2	8	198816	198823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_010632	AACT	2	8	199213	199220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
172	NC_010632	AAGA	2	8	199425	199432	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010632	GTTG	3	12	199449	199460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010632	ATTG	2	8	200303	200310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_010632	AATT	2	8	200377	200384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_010632	CTTG	2	8	200394	200401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_010632	AATT	2	8	200472	200479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_010632	TAGG	2	8	200854	200861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
179	NC_010632	TCTA	2	8	201040	201047	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
180	NC_010632	ACAA	2	8	205803	205810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
181	NC_010632	ATTG	2	8	207033	207040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
182	NC_010632	TAAA	2	8	220302	220309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_010632	TCAA	2	8	220369	220376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
184	NC_010632	TAAT	2	8	225884	225891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010632	CTGA	3	12	229457	229468	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
186	NC_010632	CATT	2	8	230327	230334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
187	NC_010632	TTTA	2	8	230348	230355	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_010632	GATT	2	8	231054	231061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_010632	GCAG	2	8	235167	235174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
190	NC_010632	CCTG	2	8	235336	235343	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
191	NC_010632	TAAC	2	8	236002	236009	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
192	NC_010632	AATT	2	8	247249	247256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_010632	TGCT	2	8	248714	248721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
194	NC_010632	TAAT	2	8	248741	248748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_010632	ATTA	2	8	249157	249164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_010632	ATGA	2	8	249738	249745	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
197	NC_010632	AATT	2	8	249879	249886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_010632	AACA	2	8	250993	251000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
199	NC_010632	GATA	2	8	251489	251496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
200	NC_010632	ATTA	2	8	252264	252271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_010632	TTGA	2	8	252327	252334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
202	NC_010632	TTTG	2	8	252372	252379	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
203	NC_010632	AATG	2	8	252412	252419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
204	NC_010632	GAAA	2	8	252810	252817	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
205	NC_010632	CAGG	2	8	253142	253149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.