MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN02

Total Repeats: 228

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010632	AT	3	6	596	601	50 %	50 %	0 %	0 %	186687049
2	NC_010632	AC	3	6	691	696	50 %	0 %	0 %	50 %	186687049
3	NC_010632	CT	3	6	774	779	0 %	50 %	0 %	50 %	186687049
4	NC_010632	CT	4	8	3995	4002	0 %	50 %	0 %	50 %	186687052
5	NC_010632	AC	3	6	5787	5792	50 %	0 %	0 %	50 %	186687054
6	NC_010632	CA	3	6	7282	7287	50 %	0 %	0 %	50 %	186687055
7	NC_010632	CT	3	6	7512	7517	0 %	50 %	0 %	50 %	186687055
8	NC_010632	TA	3	6	8621	8626	50 %	50 %	0 %	0 %	186687055
9	NC_010632	AT	3	6	9366	9371	50 %	50 %	0 %	0 %	186687055
10	NC_010632	TA	3	6	12834	12839	50 %	50 %	0 %	0 %	186687057
11	NC_010632	CA	3	6	12956	12961	50 %	0 %	0 %	50 %	186687057
12	NC_010632	AG	3	6	13862	13867	50 %	0 %	50 %	0 %	186687058
13	NC_010632	CA	3	6	14341	14346	50 %	0 %	0 %	50 %	186687058
14	NC_010632	AT	3	6	15489	15494	50 %	50 %	0 %	0 %	186687059
15	NC_010632	AT	3	6	16161	16166	50 %	50 %	0 %	0 %	186687061
16	NC_010632	AT	3	6	16414	16419	50 %	50 %	0 %	0 %	186687061
17	NC_010632	AG	3	6	16508	16513	50 %	0 %	50 %	0 %	186687062
18	NC_010632	GT	3	6	23543	23548	0 %	50 %	50 %	0 %	186687075
19	NC_010632	GA	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	186687077
20	NC_010632	TA	3	6	29704	29709	50 %	50 %	0 %	0 %	186687080
21	NC_010632	AT	3	6	30482	30487	50 %	50 %	0 %	0 %	186687080
22	NC_010632	AG	3	6	31191	31196	50 %	0 %	50 %	0 %	186687081
23	NC_010632	TA	3	6	32332	32337	50 %	50 %	0 %	0 %	186687081
24	NC_010632	CT	3	6	32780	32785	0 %	50 %	0 %	50 %	186687081
25	NC_010632	GT	3	6	35605	35610	0 %	50 %	50 %	0 %	186687084
26	NC_010632	GA	3	6	36868	36873	50 %	0 %	50 %	0 %	186687085
27	NC_010632	AG	4	8	37144	37151	50 %	0 %	50 %	0 %	186687085
28	NC_010632	TG	3	6	37852	37857	0 %	50 %	50 %	0 %	186687086
29	NC_010632	AC	3	6	38394	38399	50 %	0 %	0 %	50 %	186687087
30	NC_010632	GA	3	6	38649	38654	50 %	0 %	50 %	0 %	186687087
31	NC_010632	TG	3	6	39264	39269	0 %	50 %	50 %	0 %	186687087
32	NC_010632	TC	3	6	39503	39508	0 %	50 %	0 %	50 %	186687087
33	NC_010632	TA	3	6	40262	40267	50 %	50 %	0 %	0 %	186687088
34	NC_010632	GA	3	6	41495	41500	50 %	0 %	50 %	0 %	186687089
35	NC_010632	AT	3	6	41902	41907	50 %	50 %	0 %	0 %	186687090
36	NC_010632	TA	3	6	42391	42396	50 %	50 %	0 %	0 %	186687090
37	NC_010632	AT	3	6	43315	43320	50 %	50 %	0 %	0 %	186687091
38	NC_010632	TA	3	6	46293	46298	50 %	50 %	0 %	0 %	186687096
39	NC_010632	AG	3	6	46457	46462	50 %	0 %	50 %	0 %	186687096
40	NC_010632	AG	3	6	50117	50122	50 %	0 %	50 %	0 %	186687098
41	NC_010632	CT	3	6	50285	50290	0 %	50 %	0 %	50 %	186687098
42	NC_010632	TA	3	6	50711	50716	50 %	50 %	0 %	0 %	186687099
43	NC_010632	CT	3	6	51841	51846	0 %	50 %	0 %	50 %	186687099
44	NC_010632	AT	3	6	51873	51878	50 %	50 %	0 %	0 %	186687099
45	NC_010632	TC	3	6	54514	54519	0 %	50 %	0 %	50 %	186687101
46	NC_010632	AC	3	6	55151	55156	50 %	0 %	0 %	50 %	186687102
47	NC_010632	CT	3	6	55776	55781	0 %	50 %	0 %	50 %	186687102
48	NC_010632	AG	3	6	57906	57911	50 %	0 %	50 %	0 %	186687105
49	NC_010632	TC	4	8	59283	59290	0 %	50 %	0 %	50 %	186687107
50	NC_010632	CA	3	6	60147	60152	50 %	0 %	0 %	50 %	186687109
51	NC_010632	AT	3	6	60291	60296	50 %	50 %	0 %	0 %	186687109
52	NC_010632	AG	3	6	61256	61261	50 %	0 %	50 %	0 %	186687110
53	NC_010632	TC	3	6	61323	61328	0 %	50 %	0 %	50 %	186687110
54	NC_010632	TG	3	6	62447	62452	0 %	50 %	50 %	0 %	186687111
55	NC_010632	AC	3	6	64170	64175	50 %	0 %	0 %	50 %	186687114
56	NC_010632	TC	3	6	72519	72524	0 %	50 %	0 %	50 %	186687121
57	NC_010632	TA	3	6	72568	72573	50 %	50 %	0 %	0 %	186687121
58	NC_010632	GT	3	6	72628	72633	0 %	50 %	50 %	0 %	186687121
59	NC_010632	AG	3	6	73904	73909	50 %	0 %	50 %	0 %	186687123
60	NC_010632	GT	3	6	82594	82599	0 %	50 %	50 %	0 %	186687126
61	NC_010632	TC	3	6	84534	84539	0 %	50 %	0 %	50 %	186687127
62	NC_010632	TA	3	6	86843	86848	50 %	50 %	0 %	0 %	186687128
63	NC_010632	AC	3	6	88519	88524	50 %	0 %	0 %	50 %	186687128
64	NC_010632	AT	3	6	89579	89584	50 %	50 %	0 %	0 %	186687128
65	NC_010632	TA	3	6	90793	90798	50 %	50 %	0 %	0 %	186687129
66	NC_010632	TA	3	6	91310	91315	50 %	50 %	0 %	0 %	186687130
67	NC_010632	AC	3	6	91933	91938	50 %	0 %	0 %	50 %	186687130
68	NC_010632	CT	3	6	92966	92971	0 %	50 %	0 %	50 %	186687130
69	NC_010632	TG	3	6	93825	93830	0 %	50 %	50 %	0 %	186687130
70	NC_010632	TA	4	8	94671	94678	50 %	50 %	0 %	0 %	186687130
71	NC_010632	TC	3	6	94953	94958	0 %	50 %	0 %	50 %	186687130
72	NC_010632	CT	3	6	95738	95743	0 %	50 %	0 %	50 %	186687130
73	NC_010632	CT	3	6	96760	96765	0 %	50 %	0 %	50 %	186687131
74	NC_010632	TA	3	6	97302	97307	50 %	50 %	0 %	0 %	186687131
75	NC_010632	TA	3	6	97409	97414	50 %	50 %	0 %	0 %	186687131
76	NC_010632	TA	3	6	98436	98441	50 %	50 %	0 %	0 %	186687132
77	NC_010632	AT	3	6	99286	99291	50 %	50 %	0 %	0 %	186687132
78	NC_010632	AT	3	6	101458	101463	50 %	50 %	0 %	0 %	186687132
79	NC_010632	AT	3	6	101914	101919	50 %	50 %	0 %	0 %	186687133
80	NC_010632	AT	3	6	102027	102032	50 %	50 %	0 %	0 %	186687133
81	NC_010632	AG	3	6	102186	102191	50 %	0 %	50 %	0 %	186687133
82	NC_010632	TC	3	6	102737	102742	0 %	50 %	0 %	50 %	186687134
83	NC_010632	TG	3	6	102857	102862	0 %	50 %	50 %	0 %	186687134
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90	NC_010632	AT	3	6	109192	109197	50 %	50 %	0 %	0 %	186687143
91	NC_010632	GA	3	6	109250	109255	50 %	0 %	50 %	0 %	186687143
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93	NC_010632	TC	3	6	111341	111346	0 %	50 %	0 %	50 %	186687147
94	NC_010632	TG	3	6	111412	111417	0 %	50 %	50 %	0 %	186687147
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100	NC_010632	TA	5	10	115637	115646	50 %	50 %	0 %	0 %	186687154
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102	NC_010632	AG	3	6	115730	115735	50 %	0 %	50 %	0 %	186687154
103	NC_010632	TG	4	8	115736	115743	0 %	50 %	50 %	0 %	186687154
104	NC_010632	AT	3	6	117984	117989	50 %	50 %	0 %	0 %	186687156
105	NC_010632	TC	4	8	118181	118188	0 %	50 %	0 %	50 %	186687156
106	NC_010632	CG	3	6	118295	118300	0 %	0 %	50 %	50 %	186687156
107	NC_010632	GA	3	6	118362	118367	50 %	0 %	50 %	0 %	186687156
108	NC_010632	AT	3	6	123766	123771	50 %	50 %	0 %	0 %	186687158
109	NC_010632	TA	3	6	123795	123800	50 %	50 %	0 %	0 %	186687158
110	NC_010632	CA	3	6	124151	124156	50 %	0 %	0 %	50 %	186687158
111	NC_010632	CA	3	6	124227	124232	50 %	0 %	0 %	50 %	186687158
112	NC_010632	TA	3	6	124887	124892	50 %	50 %	0 %	0 %	186687159
113	NC_010632	GA	3	6	126468	126473	50 %	0 %	50 %	0 %	186687161
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117	NC_010632	AC	3	6	131832	131837	50 %	0 %	0 %	50 %	186687164
118	NC_010632	GA	3	6	134432	134437	50 %	0 %	50 %	0 %	186687164
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120	NC_010632	TG	3	6	138018	138023	0 %	50 %	50 %	0 %	186687167
121	NC_010632	AG	3	6	138351	138356	50 %	0 %	50 %	0 %	186687167
122	NC_010632	TA	3	6	140938	140943	50 %	50 %	0 %	0 %	186687170
123	NC_010632	AC	3	6	140946	140951	50 %	0 %	0 %	50 %	186687170
124	NC_010632	AT	3	6	141328	141333	50 %	50 %	0 %	0 %	186687171
125	NC_010632	GA	3	6	141543	141548	50 %	0 %	50 %	0 %	186687171
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127	NC_010632	CT	3	6	145950	145955	0 %	50 %	0 %	50 %	186687173
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140	NC_010632	AT	3	6	166585	166590	50 %	50 %	0 %	0 %	186687186
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.