MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010631	GCAGCC	2	12	8807	8818	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	186686748
2	NC_010631	TAACTT	2	12	10082	10093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186686749
3	NC_010631	TTTGGT	2	12	11266	11277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686750
4	NC_010631	AATCAG	2	12	14953	14964	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686754
5	NC_010631	TTGATT	2	12	26408	26419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186686760
6	NC_010631	TATTAG	2	12	27919	27930	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186686763
7	NC_010631	CGCAGG	2	12	28460	28471	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186686763
8	NC_010631	GTCTTT	2	12	28514	28525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	186686763
9	NC_010631	ATTTCT	2	12	30420	30431	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	186686763
10	NC_010631	CTCTGC	2	12	30608	30619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	186686763
11	NC_010631	AAAGCT	2	12	36214	36225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686769
12	NC_010631	GCTGGC	2	12	38661	38672	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	186686770
13	NC_010631	TCGCCA	2	12	43779	43790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186686770
14	NC_010631	CTCCTT	2	12	44068	44079	0 %	50 %	0 %	50 %	186686771
15	NC_010631	ACTTTG	2	12	44635	44646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686771
16	NC_010631	GATTAG	2	12	44720	44731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686771
17	NC_010631	TCAAAA	2	12	45125	45136	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	186686772
18	NC_010631	GCTAGA	2	12	46042	46053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686772
19	NC_010631	AGTGCT	2	12	51281	51292	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186686777
20	NC_010631	TGGCTG	3	18	51488	51505	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	186686777
21	NC_010631	TGCTGA	2	12	74355	74366	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186686793
22	NC_010631	CAAAGT	2	12	75588	75599	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686794
23	NC_010631	TTCTTT	2	12	78480	78491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	186686795
24	NC_010631	AATTAA	2	12	78522	78533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686795
25	NC_010631	CTGGAA	2	12	78785	78796	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686796
26	NC_010631	TTGAAA	2	12	84854	84865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186686801
27	NC_010631	TTCTGC	2	12	85451	85462	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686801
28	NC_010631	AATCTG	2	12	91599	91610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186686803
29	NC_010631	TTCTGC	2	12	91635	91646	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686803
30	NC_010631	GAATTT	2	12	95231	95242	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186686806
31	NC_010631	CAAAGG	2	12	106933	106944	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	186686811
32	NC_010631	ATGCAG	2	12	111836	111847	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686814
33	NC_010631	CATGAC	2	12	113776	113787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686815
34	NC_010631	TTATCA	2	12	116886	116897	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186686817
35	NC_010631	GCCAAA	2	12	117432	117443	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186686817
36	NC_010631	ACTTGC	2	12	122841	122852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186686819
37	NC_010631	CGGACG	2	12	129487	129498	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186686820
38	NC_010631	GGCGAT	2	12	131012	131023	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186686821
39	NC_010631	AGCAGA	2	12	132496	132507	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	186686822
40	NC_010631	TAAAGA	2	12	133231	133242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	186686822
41	NC_010631	CGCATC	2	12	136943	136954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186686823
42	NC_010631	ACGCGA	2	12	139433	139444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686824
43	NC_010631	GGTTCA	2	12	147817	147828	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186686828
44	NC_010631	GCAGAA	2	12	150163	150174	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	186686829
45	NC_010631	CGGACG	2	12	151344	151355	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186686829
46	NC_010631	AGCTGA	2	12	151810	151821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686830
47	NC_010631	CGGACG	2	12	154174	154185	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	186686830
48	NC_010631	CTGCAC	2	12	154497	154508	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186686831
49	NC_010631	GCTTTA	2	12	156015	156026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686831
50	NC_010631	TTTTGA	2	12	157559	157570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186686831
51	NC_010631	TCCCAA	2	12	158000	158011	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186686831
52	NC_010631	TTCTAC	2	12	162039	162050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186686837
53	NC_010631	CCCATA	2	12	165999	166010	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186686841
54	NC_010631	TGCTTA	2	12	176210	176221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686844
55	NC_010631	TTGCTG	2	12	176901	176912	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686845
56	NC_010631	CTCTTA	2	12	178723	178734	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186686846
57	NC_010631	CCTCAA	2	12	180359	180370	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186686847
58	NC_010631	AACCCC	2	12	183604	183615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186686850
59	NC_010631	GGTCAA	2	12	202477	202488	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686857
60	NC_010631	TTCAGC	2	12	205290	205301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186686859
61	NC_010631	TGGATG	2	12	207835	207846	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	186686863
62	NC_010631	AGCTGA	2	12	207900	207911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686863
63	NC_010631	CAATCG	2	12	212635	212646	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686868
64	NC_010631	GCTTGG	2	12	216795	216806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	186686875
65	NC_010631	AAAATG	2	12	230105	230116	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	186686880
66	NC_010631	TTACAG	2	12	230557	230568	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186686880
67	NC_010631	AAAAGG	2	12	241541	241552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686890
68	NC_010631	AATGGA	2	12	242099	242110	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186686891
69	NC_010631	TAGTTT	2	12	242354	242365	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186686891
70	NC_010631	TTAGAG	2	12	245143	245154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686893
71	NC_010631	CAGCAA	2	12	247174	247185	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186686894
72	NC_010631	AATGAA	2	12	248331	248342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	186686894
73	NC_010631	TTTTAG	2	12	249157	249168	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186686894
74	NC_010631	TTAGCA	2	12	249264	249275	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186686894
75	NC_010631	AGAAAA	2	12	249941	249952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	186686894
76	NC_010631	ACAAGT	2	12	255397	255408	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686899
77	NC_010631	TTTAGC	2	12	255930	255941	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686900
78	NC_010631	CCACTA	2	12	257926	257937	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186686902
79	NC_010631	AAGCCT	2	12	259633	259644	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686903
80	NC_010631	ATTTGG	2	12	261006	261017	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	186686904
81	NC_010631	TGACCC	2	12	267503	267514	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186686907
82	NC_010631	CGTAGC	2	12	270288	270299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	186686909
83	NC_010631	TAAGAG	2	12	274469	274480	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	186686914
84	NC_010631	CAGCAA	2	12	276291	276302	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186686915
85	NC_010631	TAAGCA	2	12	276982	276993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686916
86	NC_010631	GATTGA	2	12	287783	287794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686925
87	NC_010631	GCAGAT	2	12	290993	291004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	186686932
88	NC_010631	TTGCCA	2	12	295329	295340	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186686938
89	NC_010631	GCTTGT	2	12	295885	295896	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686938
90	NC_010631	ACAATT	2	12	298924	298935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186686942
91	NC_010631	GATTGA	2	12	299268	299279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686942
92	NC_010631	TAATTG	2	12	302284	302295	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186686946
93	NC_010631	TTAAGC	2	12	304674	304685	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	186686947
94	NC_010631	CCAATT	2	12	305699	305710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686948
95	NC_010631	GTGATT	2	12	311489	311500	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	186686952
96	NC_010631	ACAGCC	2	12	314272	314283	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186686955
97	NC_010631	TTTGCC	2	12	315138	315149	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686957
98	NC_010631	AAAGCT	2	12	316971	316982	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686959
99	NC_010631	TATTTG	2	12	317658	317669	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	186686961
100	NC_010631	CAGAAC	2	12	318678	318689	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186686961
101	NC_010631	CTTGTC	2	12	319861	319872	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686963
102	NC_010631	CTTGTC	5	30	319891	319920	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686963
103	NC_010631	TGTCCT	2	12	319929	319940	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686963
104	NC_010631	GACAGC	2	12	323412	323423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686966
105	NC_010631	TTTGCT	2	12	324783	324794	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	186686966
106	NC_010631	GCTTTA	2	12	334253	334264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686972
107	NC_010631	TGAAAT	2	12	335816	335827	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	186686972
108	NC_010631	TTTGGG	2	12	341213	341224	0 %	50 %	50 %	0 %	186686974
109	NC_010631	CTGCTT	2	12	342175	342186	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686975
110	NC_010631	CAAGTA	2	12	351301	351312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686993
111	NC_010631	TCCCAA	2	12	352488	352499	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	186686995

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.