MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01

Total Repeats: 246

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010631	ACAGC	2	10	1261	1270	40 %	0 %	20 %	40 %	186686741
2	NC_010631	AGCAA	2	10	4548	4557	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010631	GAAAA	2	10	5052	5061	80 %	0 %	20 %	0 %	186686746
4	NC_010631	CTTGC	2	10	6246	6255	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010631	AACTC	2	10	6552	6561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010631	TCTTA	2	10	8773	8782	20 %	60 %	0 %	20 %	186686748
7	NC_010631	TACAT	2	10	9066	9075	40 %	40 %	0 %	20 %	186686749
8	NC_010631	CGGTT	2	10	11706	11715	0 %	40 %	40 %	20 %	186686750
9	NC_010631	ACACA	2	10	14296	14305	60 %	0 %	0 %	40 %	186686754
10	NC_010631	TTACG	2	10	14925	14934	20 %	40 %	20 %	20 %	186686754
11	NC_010631	AGTGA	2	10	16273	16282	40 %	20 %	40 %	0 %	186686755
12	NC_010631	CCAAA	2	10	18335	18344	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010631	TGGTT	2	10	21207	21216	0 %	60 %	40 %	0 %	186686756
14	NC_010631	ATTTT	2	10	22261	22270	20 %	80 %	0 %	0 %	186686757
15	NC_010631	CTTTA	2	10	23118	23127	20 %	60 %	0 %	20 %	186686758
16	NC_010631	AAAAC	2	10	23884	23893	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_010631	TTATT	2	10	25078	25087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010631	CTTTA	2	10	26239	26248	20 %	60 %	0 %	20 %	186686760
19	NC_010631	AGTGA	2	10	26714	26723	40 %	20 %	40 %	0 %	186686761
20	NC_010631	TTTTC	2	10	29346	29355	0 %	80 %	0 %	20 %	186686763
21	NC_010631	CTGTA	2	10	32020	32029	20 %	40 %	20 %	20 %	186686763
22	NC_010631	GCAGT	2	10	32952	32961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010631	CCCTG	2	10	33554	33563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
24	NC_010631	CAGGA	2	10	33786	33795	40 %	0 %	40 %	20 %	186686766
25	NC_010631	TAGCG	2	10	35527	35536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_010631	TTTTG	2	10	37181	37190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010631	CAAAT	2	10	38839	38848	60 %	20 %	0 %	20 %	186686770
28	NC_010631	GTGAT	2	10	39379	39388	20 %	40 %	40 %	0 %	186686770
29	NC_010631	TTCAA	2	10	40318	40327	40 %	40 %	0 %	20 %	186686770
30	NC_010631	ACTTG	2	10	43442	43451	20 %	40 %	20 %	20 %	186686770
31	NC_010631	AGTTC	2	10	45251	45260	20 %	40 %	20 %	20 %	186686772
32	NC_010631	AGTTA	2	10	45346	45355	40 %	40 %	20 %	0 %	186686772
33	NC_010631	CGTCC	2	10	48610	48619	0 %	20 %	20 %	60 %	186686775
34	NC_010631	CGAAG	2	10	49746	49755	40 %	0 %	40 %	20 %	186686775
35	NC_010631	AAAGC	2	10	50400	50409	60 %	0 %	20 %	20 %	186686776
36	NC_010631	ATTAA	2	10	50457	50466	60 %	40 %	0 %	0 %	186686776
37	NC_010631	GAAAT	2	10	50922	50931	60 %	20 %	20 %	0 %	186686777
38	NC_010631	GTTCT	2	10	51944	51953	0 %	60 %	20 %	20 %	186686777
39	NC_010631	TTGAA	2	10	51956	51965	40 %	40 %	20 %	0 %	186686777
40	NC_010631	CCAGC	2	10	52140	52149	20 %	0 %	20 %	60 %	186686778
41	NC_010631	ATTAA	2	10	56071	56080	60 %	40 %	0 %	0 %	186686782
42	NC_010631	GCCGC	2	10	58409	58418	0 %	0 %	40 %	60 %	186686783
43	NC_010631	TATAA	2	10	59511	59520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010631	CAAGT	2	10	59590	59599	40 %	20 %	20 %	20 %	186686786
45	NC_010631	CTGGG	2	10	61149	61158	0 %	20 %	60 %	20 %	186686787
46	NC_010631	CTCAT	2	10	61526	61535	20 %	40 %	0 %	40 %	186686787
47	NC_010631	GGCAA	2	10	61727	61736	40 %	0 %	40 %	20 %	186686787
48	NC_010631	TAGAT	2	10	62143	62152	40 %	40 %	20 %	0 %	186686787
49	NC_010631	TGGTT	2	10	64804	64813	0 %	60 %	40 %	0 %	186686789
50	NC_010631	CAGTA	2	10	65435	65444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010631	TAGCG	2	10	65477	65486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_010631	TCATT	2	10	68493	68502	20 %	60 %	0 %	20 %	186686791
53	NC_010631	ATGGG	2	10	68836	68845	20 %	20 %	60 %	0 %	186686791
54	NC_010631	ACCCG	2	10	70496	70505	20 %	0 %	20 %	60 %	186686791
55	NC_010631	AACTT	2	10	71006	71015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010631	TAAAA	2	10	72067	72076	80 %	20 %	0 %	0 %	186686792
57	NC_010631	ATACA	2	10	73101	73110	60 %	20 %	0 %	20 %	186686792
58	NC_010631	AGCAA	2	10	75768	75777	60 %	0 %	20 %	20 %	186686794
59	NC_010631	ATTGG	2	10	80975	80984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010631	TTCTT	2	10	81851	81860	0 %	80 %	0 %	20 %	186686797
61	NC_010631	TGGTG	2	10	82103	82112	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010631	GGATA	2	10	82842	82851	40 %	20 %	40 %	0 %	186686798
63	NC_010631	AGTTT	2	10	83371	83380	20 %	60 %	20 %	0 %	186686799
64	NC_010631	TCCTG	2	10	85131	85140	0 %	40 %	20 %	40 %	186686801
65	NC_010631	CTATT	2	10	87554	87563	20 %	60 %	0 %	20 %	186686802
66	NC_010631	AGGGA	2	10	90063	90072	40 %	0 %	60 %	0 %	186686803
67	NC_010631	TAGCG	2	10	92548	92557	20 %	20 %	40 %	20 %	186686804
68	NC_010631	CAAAA	2	10	93895	93904	80 %	0 %	0 %	20 %	186686805
69	NC_010631	ATTTA	2	10	95206	95215	40 %	60 %	0 %	0 %	186686806
70	NC_010631	CTTGG	2	10	96493	96502	0 %	40 %	40 %	20 %	186686806
71	NC_010631	GAGAA	2	10	96591	96600	60 %	0 %	40 %	0 %	186686806
72	NC_010631	TTGGT	2	10	99286	99295	0 %	60 %	40 %	0 %	186686808
73	NC_010631	TGCGG	2	10	101936	101945	0 %	20 %	60 %	20 %	186686810
74	NC_010631	TTTCT	2	10	102958	102967	0 %	80 %	0 %	20 %	186686810
75	NC_010631	ACATT	2	10	103368	103377	40 %	40 %	0 %	20 %	186686810
76	NC_010631	TTATT	2	10	105551	105560	20 %	80 %	0 %	0 %	186686811
77	NC_010631	GCAAT	2	10	105623	105632	40 %	20 %	20 %	20 %	186686811
78	NC_010631	CAACT	2	10	108809	108818	40 %	20 %	0 %	40 %	186686812
79	NC_010631	GCAAT	2	10	113093	113102	40 %	20 %	20 %	20 %	186686814
80	NC_010631	TTTAA	2	10	114463	114472	40 %	60 %	0 %	0 %	186686816
81	NC_010631	AGTAG	2	10	114625	114634	40 %	20 %	40 %	0 %	186686816
82	NC_010631	ATCAA	2	10	116927	116936	60 %	20 %	0 %	20 %	186686817
83	NC_010631	AAGGT	2	10	117139	117148	40 %	20 %	40 %	0 %	186686817
84	NC_010631	CTCTC	2	10	118690	118699	0 %	40 %	0 %	60 %	186686818
85	NC_010631	ATTGG	2	10	119482	119491	20 %	40 %	40 %	0 %	186686818
86	NC_010631	AAGCA	2	10	119928	119937	60 %	0 %	20 %	20 %	186686818
87	NC_010631	AAACC	2	10	120583	120592	60 %	0 %	0 %	40 %	186686818
88	NC_010631	AACTG	2	10	124291	124300	40 %	20 %	20 %	20 %	186686820
89	NC_010631	CACTT	2	10	124849	124858	20 %	40 %	0 %	40 %	186686820
90	NC_010631	TCGCT	2	10	128339	128348	0 %	40 %	20 %	40 %	186686820
91	NC_010631	AAAAG	2	10	128737	128746	80 %	0 %	20 %	0 %	186686820
92	NC_010631	TACGT	2	10	131181	131190	20 %	40 %	20 %	20 %	186686821
93	NC_010631	CTTTA	2	10	132656	132665	20 %	60 %	0 %	20 %	186686822
94	NC_010631	CAAGC	2	10	136034	136043	40 %	0 %	20 %	40 %	186686823
95	NC_010631	CCCGG	2	10	143840	143849	0 %	0 %	40 %	60 %	186686826
96	NC_010631	GAAGC	2	10	145420	145429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_010631	CAAAC	2	10	147432	147441	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_010631	TCAAT	2	10	147971	147980	40 %	40 %	0 %	20 %	186686828
99	NC_010631	TATAT	2	10	148488	148497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010631	ACCCC	2	10	154593	154602	20 %	0 %	0 %	80 %	186686831
101	NC_010631	TAGTG	2	10	157670	157679	20 %	40 %	40 %	0 %	186686831
102	NC_010631	TTTAC	2	10	158040	158049	20 %	60 %	0 %	20 %	186686831
103	NC_010631	GTGAG	2	10	158068	158077	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010631	AAAGT	2	10	161701	161710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010631	ATTTA	2	10	162117	162126	40 %	60 %	0 %	0 %	186686837
106	NC_010631	AAACT	2	10	170401	170410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_010631	AATTG	2	10	174212	174221	40 %	40 %	20 %	0 %	186686844
108	NC_010631	GCTAC	2	10	175285	175294	20 %	20 %	20 %	40 %	186686844
109	NC_010631	TATTG	2	10	175378	175387	20 %	60 %	20 %	0 %	186686844
110	NC_010631	TACCT	2	10	176051	176060	20 %	40 %	0 %	40 %	186686844
111	NC_010631	GTACA	2	10	177234	177243	40 %	20 %	20 %	20 %	186686845
112	NC_010631	TATTT	2	10	177244	177253	20 %	80 %	0 %	0 %	186686845
113	NC_010631	TTACC	2	10	177326	177335	20 %	40 %	0 %	40 %	186686845
114	NC_010631	TTTAA	2	10	180436	180445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010631	TTCCC	2	10	181519	181528	0 %	40 %	0 %	60 %	186686849
116	NC_010631	ATTGC	2	10	183808	183817	20 %	40 %	20 %	20 %	186686850
117	NC_010631	CGGAT	2	10	185450	185459	20 %	20 %	40 %	20 %	186686851
118	NC_010631	ACTCA	2	10	186333	186342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_010631	ATTGC	2	10	186858	186867	20 %	40 %	20 %	20 %	186686852
120	NC_010631	GCTGG	2	10	187191	187200	0 %	20 %	60 %	20 %	186686852
121	NC_010631	ACCGA	2	10	191409	191418	40 %	0 %	20 %	40 %	186686853
122	NC_010631	GTGAT	2	10	191669	191678	20 %	40 %	40 %	0 %	186686853
123	NC_010631	TGCAA	2	10	192587	192596	40 %	20 %	20 %	20 %	186686853
124	NC_010631	TACAC	2	10	196292	196301	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_010631	TTGCC	2	10	196975	196984	0 %	40 %	20 %	40 %	186686855
126	NC_010631	GCTTG	2	10	197114	197123	0 %	40 %	40 %	20 %	186686855
127	NC_010631	GGTAT	2	10	199362	199371	20 %	40 %	40 %	0 %	186686856
128	NC_010631	AGCAG	2	10	199700	199709	40 %	0 %	40 %	20 %	186686856
129	NC_010631	TGCAG	2	10	202995	203004	20 %	20 %	40 %	20 %	186686857
130	NC_010631	ATTTT	2	10	204554	204563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010631	AGGAG	2	10	204958	204967	40 %	0 %	60 %	0 %	186686858
132	NC_010631	TTTTC	2	10	207228	207237	0 %	80 %	0 %	20 %	186686861
133	NC_010631	ACCCC	2	10	210956	210965	20 %	0 %	0 %	80 %	186686866
134	NC_010631	ACCCC	2	10	211003	211012	20 %	0 %	0 %	80 %	186686866
135	NC_010631	TTTGA	2	10	211382	211391	20 %	60 %	20 %	0 %	186686866
136	NC_010631	CTGTA	2	10	214392	214401	20 %	40 %	20 %	20 %	186686872
137	NC_010631	ATGGG	2	10	214646	214655	20 %	20 %	60 %	0 %	186686872
138	NC_010631	GCGTT	2	10	216680	216689	0 %	40 %	40 %	20 %	186686875
139	NC_010631	TGGCT	2	10	219022	219031	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010631	ATTTG	2	10	219144	219153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010631	TGAAA	2	10	219804	219813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010631	GTTTA	2	10	220271	220280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010631	CTGGG	2	10	220803	220812	0 %	20 %	60 %	20 %	186686878
144	NC_010631	CTCAT	2	10	221180	221189	20 %	40 %	0 %	40 %	186686878
145	NC_010631	GGCAA	2	10	221381	221390	40 %	0 %	40 %	20 %	186686878
146	NC_010631	TAGAT	2	10	221797	221806	40 %	40 %	20 %	0 %	186686878
147	NC_010631	AAGGA	2	10	224023	224032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_010631	ATAAC	2	10	226423	226432	60 %	20 %	0 %	20 %	186686879
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151	NC_010631	AAAAT	2	10	229958	229967	80 %	20 %	0 %	0 %	186686880
152	NC_010631	AATTA	2	10	233191	233200	60 %	40 %	0 %	0 %	186686882
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155	NC_010631	TTGAC	2	10	236599	236608	20 %	40 %	20 %	20 %	186686886
156	NC_010631	AAAAT	2	10	242866	242875	80 %	20 %	0 %	0 %	186686891
157	NC_010631	AATTT	2	10	242967	242976	40 %	60 %	0 %	0 %	186686891
158	NC_010631	AATTA	2	10	245052	245061	60 %	40 %	0 %	0 %	186686893
159	NC_010631	ACTTA	2	10	245292	245301	40 %	40 %	0 %	20 %	186686893
160	NC_010631	GAAAT	2	10	245825	245834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_010631	TTTTC	2	10	246880	246889	0 %	80 %	0 %	20 %	186686894
162	NC_010631	AAAAG	2	10	247463	247472	80 %	0 %	20 %	0 %	186686894
163	NC_010631	TCGAC	2	10	248372	248381	20 %	20 %	20 %	40 %	186686894
164	NC_010631	AACAG	2	10	248879	248888	60 %	0 %	20 %	20 %	186686894
165	NC_010631	ATTAA	2	10	249486	249495	60 %	40 %	0 %	0 %	186686894
166	NC_010631	AATCA	2	10	250370	250379	60 %	20 %	0 %	20 %	186686894
167	NC_010631	ACGTT	2	10	251003	251012	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_010631	CAAAG	2	10	251133	251142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_010631	TTTGA	2	10	251267	251276	20 %	60 %	20 %	0 %	186686895
170	NC_010631	ATTTG	2	10	251951	251960	20 %	60 %	20 %	0 %	186686896
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172	NC_010631	TACGC	2	10	252700	252709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_010631	GGTTC	2	10	253548	253557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
174	NC_010631	CGCTA	2	10	253670	253679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
175	NC_010631	GGAGC	2	10	254464	254473	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
176	NC_010631	TTTAC	2	10	254699	254708	20 %	60 %	0 %	20 %	186686899
177	NC_010631	TAATG	2	10	255322	255331	40 %	40 %	20 %	0 %	186686899
178	NC_010631	TCTTG	2	10	257998	258007	0 %	60 %	20 %	20 %	186686902
179	NC_010631	ATTTA	2	10	259541	259550	40 %	60 %	0 %	0 %	186686903
180	NC_010631	TTGCC	2	10	259799	259808	0 %	40 %	20 %	40 %	186686903
181	NC_010631	GGCGT	2	10	260271	260280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_010631	TCTGT	2	10	270238	270247	0 %	60 %	20 %	20 %	186686909
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191	NC_010631	CAATT	2	10	278982	278991	40 %	40 %	0 %	20 %	186686916
192	NC_010631	TTTTA	2	10	280339	280348	20 %	80 %	0 %	0 %	186686917
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197	NC_010631	CGGCG	2	10	282655	282664	0 %	0 %	60 %	40 %	186686919
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202	NC_010631	GTTCT	2	10	284693	284702	0 %	60 %	20 %	20 %	186686920
203	NC_010631	CTTGT	2	10	285376	285385	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_010631	AAAAT	2	10	310153	310162	80 %	20 %	0 %	0 %	186686951
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238	NC_010631	ATAGT	2	10	336092	336101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
239	NC_010631	AAATA	2	10	336249	336258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_010631	ACTTC	2	10	343495	343504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
243	NC_010631	ATTGC	2	10	344566	344575	20 %	40 %	20 %	20 %	186686978
244	NC_010631	CAAGA	2	10	344636	344645	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
245	NC_010631	CTTTA	2	10	345612	345621	20 %	60 %	0 %	20 %	186686981
246	NC_010631	AACCT	2	10	353631	353640	40 %	20 %	0 %	40 %	186686996

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.