MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN01

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010631	AGCAA	2	10	4548	4557	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_010631	CTTGC	2	10	6246	6255	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010631	AACTC	2	10	6552	6561	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010631	CCAAA	2	10	18335	18344	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010631	AAAAC	2	10	23884	23893	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_010631	TTATT	2	10	25078	25087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010631	GCAGT	2	10	32952	32961	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010631	CCCTG	2	10	33554	33563	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_010631	TAGCG	2	10	35527	35536	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_010631	TTTTG	2	10	37181	37190	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010631	TATAA	2	10	59511	59520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010631	CAGTA	2	10	65435	65444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010631	TAGCG	2	10	65477	65486	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010631	AACTT	2	10	71006	71015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010631	ATTGG	2	10	80975	80984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010631	TGGTG	2	10	82103	82112	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010631	GAAGC	2	10	145420	145429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010631	CAAAC	2	10	147432	147441	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010631	TATAT	2	10	148488	148497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010631	GTGAG	2	10	158068	158077	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010631	AAAGT	2	10	161701	161710	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010631	AAACT	2	10	170401	170410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_010631	TTTAA	2	10	180436	180445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010631	ACTCA	2	10	186333	186342	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010631	TACAC	2	10	196292	196301	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_010631	ATTTT	2	10	204554	204563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010631	TGGCT	2	10	219022	219031	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_010631	ATTTG	2	10	219144	219153	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010631	TGAAA	2	10	219804	219813	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010631	GTTTA	2	10	220271	220280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010631	AAGGA	2	10	224023	224032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010631	GAAAT	2	10	245825	245834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010631	ACGTT	2	10	251003	251012	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010631	CAAAG	2	10	251133	251142	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_010631	TACGC	2	10	252700	252709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_010631	GGTTC	2	10	253548	253557	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010631	CGCTA	2	10	253670	253679	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
38	NC_010631	GGAGC	2	10	254464	254473	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010631	GGCGT	2	10	260271	260280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_010631	AAAGC	2	10	261287	261296	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010631	CTCTT	2	10	283734	283743	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_010631	CTTGT	2	10	285376	285385	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_010631	CAAGA	2	10	286723	286732	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_010631	CGAAC	2	10	296618	296627	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_010631	GAAAA	2	10	301289	301298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010631	AATTC	2	10	309599	309608	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010631	TTCAT	2	10	314487	314496	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_010631	TATTT	2	10	321680	321689	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010631	ATAGT	2	10	336092	336101	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010631	AAATA	2	10	336249	336258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010631	ACTTC	2	10	343495	343504	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010631	CAAGA	2	10	344636	344645	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.