MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN03

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010630	TATCAA	2	12	3484	3495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186686667
2	NC_010630	AAAAGC	2	12	6887	6898	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010630	GCTGGT	2	12	8546	8557	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	186686673
4	NC_010630	TGCTCT	2	12	8776	8787	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	186686673
5	NC_010630	ACCGCT	2	12	17152	17163	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186686678
6	NC_010630	TTGCTG	2	12	17977	17988	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686679
7	NC_010630	CTGTAG	2	12	18957	18968	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	186686679
8	NC_010630	CTAAAT	2	12	19444	19455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186686680
9	NC_010630	CATATT	2	12	23887	23898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186686684
10	NC_010630	ACTATC	2	12	24887	24898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686684
11	NC_010630	AATCAG	2	12	27949	27960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686687
12	NC_010630	TTGAAT	4	24	32558	32581	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	186686688
13	NC_010630	TGTCTA	2	12	33856	33867	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686688
14	NC_010630	CAAAGC	2	12	37955	37966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	186686691
15	NC_010630	TTACCG	2	12	42366	42377	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186686694
16	NC_010630	AATAAA	2	12	43968	43979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010630	GATTGA	2	12	46095	46106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686701
18	NC_010630	TTTTTA	2	12	46861	46872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	186686702
19	NC_010630	ACTTAT	2	12	52705	52716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186686706
20	NC_010630	TACCAG	2	12	58855	58866	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686708
21	NC_010630	TATCAA	2	12	67034	67045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	186686712
22	NC_010630	CACTTG	2	12	68150	68161	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186686713
23	NC_010630	TGTTGG	2	12	69241	69252	0 %	50 %	50 %	0 %	186686714
24	NC_010630	GTTCTG	2	12	69509	69520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686714
25	NC_010630	AACGCC	2	12	70728	70739	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010630	TCAAAG	2	12	75133	75144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686717
27	NC_010630	GGGCGC	2	12	75839	75850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186686718
28	NC_010630	ATCCGA	2	12	78259	78270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686722
29	NC_010630	CCAGCA	2	12	83571	83582	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186686725
30	NC_010630	GCGTAG	2	12	84207	84218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186686725
31	NC_010630	CCAGCA	2	12	89955	89966	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	186686725
32	NC_010630	GCGTAG	2	12	90591	90602	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	186686725
33	NC_010630	AGCTAA	2	12	95944	95955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	186686726
34	NC_010630	ACAGCT	2	12	99353	99364	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	186686726
35	NC_010630	CTAAGT	3	18	106987	107004	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010630	GCTTCC	2	12	115911	115922	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	186686734
37	NC_010630	CAGTTT	2	12	116677	116688	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686734
38	NC_010630	TTCGGT	2	12	116729	116740	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686734
39	NC_010630	GTTTTG	2	12	116819	116830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686734
40	NC_010630	GTTGCT	2	12	117058	117069	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686734
41	NC_010630	TGCTTA	2	12	119730	119741	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186686735
42	NC_010630	TTGCTG	2	12	120421	120432	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186686736
43	NC_010630	CTCTTA	2	12	122243	122254	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	186686737

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.