MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN03

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010630	GTTAG	2	10	248	257	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010630	ATCTC	2	10	1210	1219	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010630	GAACC	2	10	2313	2322	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_010630	TGGTA	2	10	2858	2867	20 %	40 %	40 %	0 %	186686666
5	NC_010630	AAGTA	2	10	4710	4719	60 %	20 %	20 %	0 %	186686669
6	NC_010630	CCAAA	2	10	5064	5073	60 %	0 %	0 %	40 %	186686670
7	NC_010630	GGTAA	2	10	6671	6680	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010630	ATGGC	2	10	8528	8537	20 %	20 %	40 %	20 %	186686673
9	NC_010630	GCCTT	2	10	12217	12226	0 %	40 %	20 %	40 %	186686674
10	NC_010630	CCATG	2	10	12389	12398	20 %	20 %	20 %	40 %	186686674
11	NC_010630	AATCA	2	10	12786	12795	60 %	20 %	0 %	20 %	186686674
12	NC_010630	TTGCT	2	10	13712	13721	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_010630	ATGGC	2	10	14829	14838	20 %	20 %	40 %	20 %	186686676
14	NC_010630	AAAGC	2	10	17599	17608	60 %	0 %	20 %	20 %	186686678
15	NC_010630	GCTGG	2	10	19125	19134	0 %	20 %	60 %	20 %	186686679
16	NC_010630	TTTGA	2	10	19419	19428	20 %	60 %	20 %	0 %	186686679
17	NC_010630	TTGCT	2	10	21201	21210	0 %	60 %	20 %	20 %	186686681
18	NC_010630	AAGCA	2	10	25389	25398	60 %	0 %	20 %	20 %	186686684
19	NC_010630	GAGCC	2	10	26138	26147	20 %	0 %	40 %	40 %	186686685
20	NC_010630	AACCA	2	10	26418	26427	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010630	ACACA	2	10	27292	27301	60 %	0 %	0 %	40 %	186686687
22	NC_010630	TTACG	2	10	27921	27930	20 %	40 %	20 %	20 %	186686687
23	NC_010630	AGTGA	2	10	29270	29279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010630	TATTT	2	10	33816	33825	20 %	80 %	0 %	0 %	186686688
25	NC_010630	TGGGG	2	10	34001	34010	0 %	20 %	80 %	0 %	186686688
26	NC_010630	AAAAG	2	10	34689	34698	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010630	CCCAA	2	10	37633	37642	40 %	0 %	0 %	60 %	186686691
28	NC_010630	AACAA	2	10	38673	38682	80 %	0 %	0 %	20 %	186686691
29	NC_010630	AAGCA	2	10	40650	40659	60 %	0 %	20 %	20 %	186686692
30	NC_010630	AACTC	2	10	40896	40905	40 %	20 %	0 %	40 %	186686692
31	NC_010630	AATCC	2	10	41342	41351	40 %	20 %	0 %	40 %	186686693
32	NC_010630	GAAGT	2	10	42506	42515	40 %	20 %	40 %	0 %	186686694
33	NC_010630	TGCTA	2	10	42568	42577	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010630	GAAAA	2	10	42948	42957	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010630	AAGTC	2	10	44271	44280	40 %	20 %	20 %	20 %	186686697
36	NC_010630	ATTTG	2	10	47550	47559	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010630	ACTAG	2	10	48960	48969	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010630	AAAAC	2	10	49497	49506	80 %	0 %	0 %	20 %	186686703
39	NC_010630	TGCAG	2	10	49633	49642	20 %	20 %	40 %	20 %	186686703
40	NC_010630	CTTAA	2	10	52145	52154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_010630	AAAGA	2	10	54475	54484	80 %	0 %	20 %	0 %	186686706
42	NC_010630	TGTGC	2	10	55425	55434	0 %	40 %	40 %	20 %	186686707
43	NC_010630	AAATT	2	10	56015	56024	60 %	40 %	0 %	0 %	186686707
44	NC_010630	CCCAG	2	10	57051	57060	20 %	0 %	20 %	60 %	186686707
45	NC_010630	ACAGG	2	10	57462	57471	40 %	0 %	40 %	20 %	186686708
46	NC_010630	CTGGA	2	10	57945	57954	20 %	20 %	40 %	20 %	186686708
47	NC_010630	TGAGT	2	10	60520	60529	20 %	40 %	40 %	0 %	186686708
48	NC_010630	AAGAG	2	10	61457	61466	60 %	0 %	40 %	0 %	186686708
49	NC_010630	TAAGG	2	10	62318	62327	40 %	20 %	40 %	0 %	186686708
50	NC_010630	ATCAA	2	10	63511	63520	60 %	20 %	0 %	20 %	186686709
51	NC_010630	AATAT	2	10	64207	64216	60 %	40 %	0 %	0 %	186686710
52	NC_010630	AACTC	2	10	65758	65767	40 %	20 %	0 %	40 %	186686712
53	NC_010630	ATTTA	2	10	66120	66129	40 %	60 %	0 %	0 %	186686712
54	NC_010630	TACCT	2	10	67080	67089	20 %	40 %	0 %	40 %	186686712
55	NC_010630	TTGAG	2	10	67249	67258	20 %	40 %	40 %	0 %	186686712
56	NC_010630	TAAGT	2	10	67598	67607	40 %	40 %	20 %	0 %	186686712
57	NC_010630	ATTTG	2	10	68781	68790	20 %	60 %	20 %	0 %	186686713
58	NC_010630	CTGAC	2	10	70534	70543	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_010630	ACAGC	2	10	70590	70599	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_010630	TAAGT	2	10	71058	71067	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010630	TGGAA	2	10	72063	72072	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010630	TATCT	2	10	72556	72565	20 %	60 %	0 %	20 %	186686715
63	NC_010630	AATGG	2	10	72586	72595	40 %	20 %	40 %	0 %	186686715
64	NC_010630	AAGGG	2	10	74255	74264	40 %	0 %	60 %	0 %	186686716
65	NC_010630	CCGCA	2	10	74471	74480	20 %	0 %	20 %	60 %	186686716
66	NC_010630	ATTAT	2	10	75148	75157	40 %	60 %	0 %	0 %	186686717
67	NC_010630	AAGTT	2	10	75964	75973	40 %	40 %	20 %	0 %	186686718
68	NC_010630	TTTTG	2	10	77751	77760	0 %	80 %	20 %	0 %	186686721
69	NC_010630	AAGCA	2	10	78277	78286	60 %	0 %	20 %	20 %	186686722
70	NC_010630	CCCAA	2	10	82165	82174	40 %	0 %	0 %	60 %	186686725
71	NC_010630	TGTAG	2	10	82363	82372	20 %	40 %	40 %	0 %	186686725
72	NC_010630	CATTC	2	10	84643	84652	20 %	40 %	0 %	40 %	186686725
73	NC_010630	TCAAA	2	10	84847	84856	60 %	20 %	0 %	20 %	186686725
74	NC_010630	CCAGT	2	10	88012	88021	20 %	20 %	20 %	40 %	186686725
75	NC_010630	GTAAG	2	10	88039	88048	40 %	20 %	40 %	0 %	186686725
76	NC_010630	CATTC	2	10	91027	91036	20 %	40 %	0 %	40 %	186686725
77	NC_010630	CTTCA	2	10	93590	93599	20 %	40 %	0 %	40 %	186686725
78	NC_010630	AACCC	2	10	93903	93912	40 %	0 %	0 %	60 %	186686725
79	NC_010630	AATGC	2	10	98112	98121	40 %	20 %	20 %	20 %	186686726
80	NC_010630	TCAAT	2	10	99126	99135	40 %	40 %	0 %	20 %	186686726
81	NC_010630	GAAAT	2	10	101292	101301	60 %	20 %	20 %	0 %	186686726
82	NC_010630	GAAAT	2	10	104204	104213	60 %	20 %	20 %	0 %	186686727
83	NC_010630	CTGGT	2	10	104715	104724	0 %	40 %	40 %	20 %	186686727
84	NC_010630	AAGAT	2	10	104982	104991	60 %	20 %	20 %	0 %	186686727
85	NC_010630	TGTGT	2	10	107728	107737	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010630	TTGCA	2	10	108799	108808	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010630	TTGGT	2	10	108928	108937	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010630	TACAG	2	10	109811	109820	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010630	TTTGG	2	10	109934	109943	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010630	ATAAA	2	10	110100	110109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010630	AAACT	2	10	110240	110249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_010630	GTTTA	2	10	110250	110259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010630	GTGCT	2	10	113829	113838	0 %	40 %	40 %	20 %	186686733
94	NC_010630	AGGCG	2	10	116042	116051	20 %	0 %	60 %	20 %	186686734
95	NC_010630	GGTGA	2	10	116271	116280	20 %	20 %	60 %	0 %	186686734
96	NC_010630	TTGAA	2	10	117209	117218	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010630	TGATT	2	10	117326	117335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010630	AATTG	2	10	117732	117741	40 %	40 %	20 %	0 %	186686735
99	NC_010630	GCTAC	2	10	118805	118814	20 %	20 %	20 %	40 %	186686735
100	NC_010630	TATTG	2	10	118898	118907	20 %	60 %	20 %	0 %	186686735
101	NC_010630	TACCT	2	10	119571	119580	20 %	40 %	0 %	40 %	186686735
102	NC_010630	GTACA	2	10	120754	120763	40 %	20 %	20 %	20 %	186686736
103	NC_010630	TATTT	2	10	120764	120773	20 %	80 %	0 %	0 %	186686736
104	NC_010630	TTACC	2	10	120846	120855	20 %	40 %	0 %	40 %	186686736

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.