MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN03

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010630	CGAT	2	8	45	52	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010630	CAAA	2	8	717	724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010630	TAAA	2	8	1480	1487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010630	CCAA	2	8	1548	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010630	AAAC	2	8	1589	1596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010630	TTAA	2	8	1755	1762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010630	CAAT	2	8	1941	1948	50 %	25 %	0 %	25 %	186686665
8	NC_010630	GATT	2	8	3060	3067	25 %	50 %	25 %	0 %	186686666
9	NC_010630	AGAA	2	8	3263	3270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010630	CAAT	2	8	3360	3367	50 %	25 %	0 %	25 %	186686667
11	NC_010630	CTTT	2	8	3504	3511	0 %	75 %	0 %	25 %	186686667
12	NC_010630	TCTG	2	8	3582	3589	0 %	50 %	25 %	25 %	186686667
13	NC_010630	TAAA	2	8	5083	5090	75 %	25 %	0 %	0 %	186686670
14	NC_010630	CAAC	2	8	5567	5574	50 %	0 %	0 %	50 %	186686671
15	NC_010630	AACT	2	8	5774	5781	50 %	25 %	0 %	25 %	186686671
16	NC_010630	CCAG	2	8	5997	6004	25 %	0 %	25 %	50 %	186686671
17	NC_010630	CTCC	2	8	6737	6744	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
18	NC_010630	TGGG	2	8	7017	7024	0 %	25 %	75 %	0 %	186686672
19	NC_010630	AGCA	2	8	7314	7321	50 %	0 %	25 %	25 %	186686673
20	NC_010630	GAAA	2	8	8210	8217	75 %	0 %	25 %	0 %	186686673
21	NC_010630	CTGG	2	8	9110	9117	0 %	25 %	50 %	25 %	186686673
22	NC_010630	CGAC	2	8	9475	9482	25 %	0 %	25 %	50 %	186686673
23	NC_010630	ATTG	2	8	9661	9668	25 %	50 %	25 %	0 %	186686673
24	NC_010630	AGAA	2	8	9855	9862	75 %	0 %	25 %	0 %	186686673
25	NC_010630	AACC	2	8	10596	10603	50 %	0 %	0 %	50 %	186686673
26	NC_010630	AAAG	2	8	10678	10685	75 %	0 %	25 %	0 %	186686673
27	NC_010630	GATG	2	8	10789	10796	25 %	25 %	50 %	0 %	186686673
28	NC_010630	ACTG	2	8	11182	11189	25 %	25 %	25 %	25 %	186686673
29	NC_010630	CCAG	2	8	11236	11243	25 %	0 %	25 %	50 %	186686673
30	NC_010630	ATCA	2	8	12849	12856	50 %	25 %	0 %	25 %	186686674
31	NC_010630	GATT	2	8	12961	12968	25 %	50 %	25 %	0 %	186686674
32	NC_010630	GTTG	2	8	13172	13179	0 %	50 %	50 %	0 %	186686674
33	NC_010630	GACT	2	8	13356	13363	25 %	25 %	25 %	25 %	186686675
34	NC_010630	TAAC	2	8	13641	13648	50 %	25 %	0 %	25 %	186686675
35	NC_010630	ATAA	2	8	13742	13749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010630	AAAT	2	8	13783	13790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010630	AAAT	2	8	14165	14172	75 %	25 %	0 %	0 %	186686676
38	NC_010630	AAAG	2	8	14312	14319	75 %	0 %	25 %	0 %	186686676
39	NC_010630	GCCA	2	8	14513	14520	25 %	0 %	25 %	50 %	186686676
40	NC_010630	TTTG	2	8	14637	14644	0 %	75 %	25 %	0 %	186686676
41	NC_010630	AATT	2	8	14807	14814	50 %	50 %	0 %	0 %	186686676
42	NC_010630	GTTT	2	8	15472	15479	0 %	75 %	25 %	0 %	186686676
43	NC_010630	CCCT	2	8	15726	15733	0 %	25 %	0 %	75 %	186686677
44	NC_010630	GGGA	2	8	16755	16762	25 %	0 %	75 %	0 %	186686677
45	NC_010630	TAAC	2	8	17309	17316	50 %	25 %	0 %	25 %	186686678
46	NC_010630	CTTG	2	8	17630	17637	0 %	50 %	25 %	25 %	186686678
47	NC_010630	TAAC	2	8	17789	17796	50 %	25 %	0 %	25 %	186686678
48	NC_010630	ATTG	3	12	17924	17935	25 %	50 %	25 %	0 %	186686679
49	NC_010630	CCAG	2	8	18065	18072	25 %	0 %	25 %	50 %	186686679
50	NC_010630	TTAC	2	8	18470	18477	25 %	50 %	0 %	25 %	186686679
51	NC_010630	ACCC	2	8	18484	18491	25 %	0 %	0 %	75 %	186686679
52	NC_010630	TAGT	2	8	18554	18561	25 %	50 %	25 %	0 %	186686679
53	NC_010630	GTAG	2	8	18878	18885	25 %	25 %	50 %	0 %	186686679
54	NC_010630	TCCT	2	8	19069	19076	0 %	50 %	0 %	50 %	186686679
55	NC_010630	TCTG	2	8	19100	19107	0 %	50 %	25 %	25 %	186686679
56	NC_010630	TTGG	2	8	19854	19861	0 %	50 %	50 %	0 %	186686680
57	NC_010630	AGGT	2	8	20014	20021	25 %	25 %	50 %	0 %	186686680
58	NC_010630	TTAG	2	8	20055	20062	25 %	50 %	25 %	0 %	186686680
59	NC_010630	TCTT	2	8	20130	20137	0 %	75 %	0 %	25 %	186686680
60	NC_010630	CCCT	2	8	20160	20167	0 %	25 %	0 %	75 %	186686681
61	NC_010630	ATTT	2	8	20635	20642	25 %	75 %	0 %	0 %	186686681
62	NC_010630	TCCT	2	8	20953	20960	0 %	50 %	0 %	50 %	186686681
63	NC_010630	AGAA	2	8	20991	20998	75 %	0 %	25 %	0 %	186686681
64	NC_010630	AGTT	2	8	21180	21187	25 %	50 %	25 %	0 %	186686681
65	NC_010630	CTTG	2	8	21285	21292	0 %	50 %	25 %	25 %	186686682
66	NC_010630	GTTT	2	8	21351	21358	0 %	75 %	25 %	0 %	186686682
67	NC_010630	AAAT	2	8	22098	22105	75 %	25 %	0 %	0 %	186686683
68	NC_010630	GTAT	2	8	22160	22167	25 %	50 %	25 %	0 %	186686683
69	NC_010630	TTTA	2	8	22203	22210	25 %	75 %	0 %	0 %	186686683
70	NC_010630	CAAC	2	8	22482	22489	50 %	0 %	0 %	50 %	186686684
71	NC_010630	AGGA	2	8	22603	22610	50 %	0 %	50 %	0 %	186686684
72	NC_010630	AAAG	2	8	23804	23811	75 %	0 %	25 %	0 %	186686684
73	NC_010630	GGTT	2	8	23916	23923	0 %	50 %	50 %	0 %	186686684
74	NC_010630	AGTT	3	12	24679	24690	25 %	50 %	25 %	0 %	186686684
75	NC_010630	AATA	2	8	24754	24761	75 %	25 %	0 %	0 %	186686684
76	NC_010630	TAAA	2	8	25870	25877	75 %	25 %	0 %	0 %	186686685
77	NC_010630	AACT	2	8	26408	26415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_010630	CTCG	2	8	26883	26890	0 %	25 %	25 %	50 %	186686686
79	NC_010630	TGCT	2	8	27661	27668	0 %	50 %	25 %	25 %	186686687
80	NC_010630	AGTA	2	8	27740	27747	50 %	25 %	25 %	0 %	186686687
81	NC_010630	ACAT	2	8	27836	27843	50 %	25 %	0 %	25 %	186686687
82	NC_010630	ATTA	2	8	29597	29604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010630	AGAA	2	8	30183	30190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010630	TATT	2	8	30394	30401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010630	CTTT	2	8	31420	31427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010630	GCCA	2	8	31998	32005	25 %	0 %	25 %	50 %	186686688
87	NC_010630	AGGA	2	8	32097	32104	50 %	0 %	50 %	0 %	186686688
88	NC_010630	GGTA	2	8	32865	32872	25 %	25 %	50 %	0 %	186686688
89	NC_010630	CGAA	2	8	33002	33009	50 %	0 %	25 %	25 %	186686688
90	NC_010630	CTGT	2	8	33553	33560	0 %	50 %	25 %	25 %	186686688
91	NC_010630	GGCT	2	8	33796	33803	0 %	25 %	50 %	25 %	186686688
92	NC_010630	GATG	2	8	33834	33841	25 %	25 %	50 %	0 %	186686688
93	NC_010630	GCTG	2	8	33844	33851	0 %	25 %	50 %	25 %	186686688
94	NC_010630	GTTT	2	8	33882	33889	0 %	75 %	25 %	0 %	186686688
95	NC_010630	ACAA	2	8	34346	34353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010630	AATT	2	8	34375	34382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010630	ACAG	2	8	34915	34922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010630	TGTC	2	8	35159	35166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_010630	TACA	2	8	35210	35217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_010630	TCAT	2	8	35296	35303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_010630	AACC	2	8	35308	35315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010630	TTTA	2	8	35507	35514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010630	TCTA	2	8	35645	35652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010630	GATT	2	8	35660	35667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010630	CTAA	2	8	35677	35684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010630	TAAT	2	8	36450	36457	50 %	50 %	0 %	0 %	186686689
107	NC_010630	ATGG	2	8	36482	36489	25 %	25 %	50 %	0 %	186686689
108	NC_010630	CAAG	2	8	36877	36884	50 %	0 %	25 %	25 %	186686689
109	NC_010630	TTAG	2	8	37332	37339	25 %	50 %	25 %	0 %	186686690
110	NC_010630	ATCC	2	8	37676	37683	25 %	25 %	0 %	50 %	186686691
111	NC_010630	TAAA	2	8	37921	37928	75 %	25 %	0 %	0 %	186686691
112	NC_010630	AGCA	2	8	38657	38664	50 %	0 %	25 %	25 %	186686691
113	NC_010630	TCAG	2	8	39885	39892	25 %	25 %	25 %	25 %	186686691
114	NC_010630	TGTA	2	8	40141	40148	25 %	50 %	25 %	0 %	186686691
115	NC_010630	TTGA	2	8	40828	40835	25 %	50 %	25 %	0 %	186686692
116	NC_010630	AAAG	2	8	40916	40923	75 %	0 %	25 %	0 %	186686692
117	NC_010630	AAAT	2	8	41059	41066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010630	GACA	2	8	41221	41228	50 %	0 %	25 %	25 %	186686693
119	NC_010630	ATAC	2	8	42057	42064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010630	AATT	2	8	42324	42331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010630	ATTT	2	8	42426	42433	25 %	75 %	0 %	0 %	186686694
122	NC_010630	TTGC	2	8	42862	42869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010630	TTGC	2	8	43002	43009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_010630	GAAA	2	8	43558	43565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010630	AATG	2	8	43648	43655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010630	CAAC	2	8	44239	44246	50 %	0 %	0 %	50 %	186686697
127	NC_010630	TCAT	2	8	44357	44364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_010630	CTTA	2	8	44443	44450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010630	GTTC	2	8	44561	44568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_010630	ATAG	2	8	44653	44660	50 %	25 %	25 %	0 %	186686698
131	NC_010630	AATC	2	8	44823	44830	50 %	25 %	0 %	25 %	186686698
132	NC_010630	ATCC	2	8	45491	45498	25 %	25 %	0 %	50 %	186686700
133	NC_010630	TGGT	2	8	45942	45949	0 %	50 %	50 %	0 %	186686701
134	NC_010630	CAAC	2	8	46014	46021	50 %	0 %	0 %	50 %	186686701
135	NC_010630	GGAC	2	8	46045	46052	25 %	0 %	50 %	25 %	186686701
136	NC_010630	TTGA	2	8	46255	46262	25 %	50 %	25 %	0 %	186686701
137	NC_010630	TATT	2	8	46347	46354	25 %	75 %	0 %	0 %	186686702
138	NC_010630	CTGG	2	8	46528	46535	0 %	25 %	50 %	25 %	186686702
139	NC_010630	GCTG	2	8	46686	46693	0 %	25 %	50 %	25 %	186686702
140	NC_010630	CTGT	2	8	46962	46969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_010630	AAGA	2	8	47022	47029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010630	GCAA	2	8	47363	47370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010630	ATTG	2	8	47439	47446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010630	AAAG	2	8	47673	47680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010630	AATT	2	8	47711	47718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.