MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN03

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010630	CGAT	2	8	45	52	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010630	CAAA	2	8	717	724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010630	TAAA	2	8	1480	1487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010630	CCAA	2	8	1548	1555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010630	AAAC	2	8	1589	1596	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010630	TTAA	2	8	1755	1762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010630	AGAA	2	8	3263	3270	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010630	CTCC	2	8	6737	6744	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_010630	ATAA	2	8	13742	13749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010630	AAAT	2	8	13783	13790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010630	AACT	2	8	26408	26415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_010630	ATTA	2	8	29597	29604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010630	AGAA	2	8	30183	30190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010630	TATT	2	8	30394	30401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010630	CTTT	2	8	31420	31427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_010630	ACAA	2	8	34346	34353	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_010630	AATT	2	8	34375	34382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010630	ACAG	2	8	34915	34922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_010630	TGTC	2	8	35159	35166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010630	TACA	2	8	35210	35217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010630	TCAT	2	8	35296	35303	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_010630	AACC	2	8	35308	35315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010630	TTTA	2	8	35507	35514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010630	TCTA	2	8	35645	35652	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010630	GATT	2	8	35660	35667	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010630	CTAA	2	8	35677	35684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010630	AAAT	2	8	41059	41066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010630	ATAC	2	8	42057	42064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_010630	AATT	2	8	42324	42331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010630	TTGC	2	8	42862	42869	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010630	TTGC	2	8	43002	43009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010630	GAAA	2	8	43558	43565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010630	AATG	2	8	43648	43655	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010630	TCAT	2	8	44357	44364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010630	CTTA	2	8	44443	44450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010630	GTTC	2	8	44561	44568	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010630	CTGT	2	8	46962	46969	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010630	AAGA	2	8	47022	47029	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010630	GCAA	2	8	47363	47370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010630	ATTG	2	8	47439	47446	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010630	AAAG	2	8	47673	47680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010630	AATT	2	8	47711	47718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010630	TAAA	2	8	47978	47985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010630	CTCG	2	8	48026	48033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010630	ATAC	2	8	48055	48062	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010630	GAAA	2	8	48227	48234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010630	TAGA	2	8	48322	48329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010630	GAAA	2	8	48381	48388	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010630	TATT	2	8	48458	48465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010630	CAAC	2	8	48626	48633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010630	ATTT	2	8	48772	48779	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010630	ATTA	2	8	48987	48994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010630	TAGA	2	8	48999	49006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010630	TCAA	2	8	49066	49073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_010630	TGTT	2	8	50188	50195	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010630	AATG	2	8	50539	50546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010630	AAGA	2	8	51802	51809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010630	TACT	2	8	52026	52033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010630	TTCA	2	8	54777	54784	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010630	AAAT	2	8	63023	63030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010630	TAAG	2	8	63681	63688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010630	CGAA	2	8	71293	71300	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010630	ATTA	2	8	71509	71516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010630	TTGA	2	8	71711	71718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010630	TTCT	2	8	71769	71776	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010630	ATTA	2	8	71846	71853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010630	ACCT	2	8	72155	72162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010630	AATC	2	8	73011	73018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_010630	GGTT	2	8	73328	73335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010630	TTAG	2	8	80031	80038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010630	CCTT	2	8	80183	80190	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010630	GATA	2	8	80236	80243	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010630	ATAA	2	8	81516	81523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010630	AATT	2	8	81618	81625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010630	ATTT	2	8	81714	81721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010630	ATTC	2	8	107366	107373	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_010630	CAAC	2	8	107573	107580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010630	ATTG	2	8	107672	107679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010630	ACTG	2	8	107701	107708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010630	AAAG	2	8	107825	107832	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010630	GCTG	2	8	107863	107870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010630	CGCA	2	8	108037	108044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_010630	ACTT	2	8	109889	109896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010630	ATTG	2	8	110738	110745	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010630	ATAA	2	8	111872	111879	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010630	TAAC	2	8	112013	112020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010630	TTCA	2	8	117262	117269	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010630	TTAT	2	8	122869	122876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.