MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN03

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010630	TAG	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010630	TAT	2	6	81	86	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010630	ATA	2	6	116	121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010630	TTA	2	6	134	139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010630	TCA	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010630	TTA	3	9	167	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010630	GTT	2	6	212	217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010630	CAA	2	6	227	232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_010630	AAG	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010630	GTA	2	6	390	395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010630	TAT	2	6	424	429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010630	ATT	2	6	435	440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010630	ATG	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010630	AAT	2	6	685	690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010630	TGC	2	6	705	710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010630	CAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010630	TAA	2	6	870	875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010630	TCA	3	9	906	914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010630	CGT	2	6	916	921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010630	CTA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010630	GTC	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010630	AGC	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010630	CAG	2	6	1493	1498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010630	AGT	2	6	1507	1512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010630	GCA	2	6	1583	1588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010630	ACT	2	6	1621	1626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010630	CTA	2	6	1685	1690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010630	TAA	2	6	1882	1887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010630	TAT	2	6	2229	2234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010630	TTA	2	6	2237	2242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010630	ATA	2	6	2260	2265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010630	CAA	2	6	2369	2374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010630	CGA	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010630	AAT	2	6	3995	4000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010630	ATT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010630	ACA	2	6	6460	6465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010630	AAT	2	6	6564	6569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010630	GAA	2	6	6815	6820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010630	TAC	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010630	TCA	2	6	11802	11807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010630	ACA	2	6	11830	11835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010630	AAT	2	6	13730	13735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010630	TCT	2	6	13796	13801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010630	TTC	2	6	13843	13848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010630	TAT	2	6	25575	25580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010630	ATT	2	6	25676	25681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010630	GAA	2	6	26224	26229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010630	ATT	2	6	26235	26240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010630	ATT	2	6	26371	26376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010630	AAC	2	6	27095	27100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010630	AGA	2	6	28100	28105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010630	AGA	2	6	28158	28163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010630	TAG	2	6	28166	28171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010630	ACT	2	6	28203	28208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010630	ACG	2	6	28220	28225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010630	AAT	2	6	28288	28293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010630	TGT	2	6	28311	28316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010630	TAC	2	6	28363	28368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010630	ATC	2	6	28394	28399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010630	GCA	2	6	28522	28527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010630	ACC	2	6	28557	28562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010630	GAT	2	6	28711	28716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010630	AAT	2	6	28747	28752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010630	TTG	2	6	28986	28991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010630	TTG	2	6	29053	29058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010630	AAG	2	6	29070	29075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010630	TAG	2	6	29088	29093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010630	GAA	2	6	29185	29190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010630	CTA	2	6	29195	29200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010630	GTA	2	6	29264	29269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010630	CTT	2	6	29355	29360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010630	TGG	2	6	29362	29367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010630	AAT	2	6	29420	29425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010630	TTA	2	6	29491	29496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010630	TGC	2	6	29616	29621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010630	GAA	2	6	29690	29695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010630	CTG	2	6	29703	29708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010630	AAC	2	6	29748	29753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010630	TGA	2	6	30124	30129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010630	CTA	2	6	30246	30251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010630	TGG	2	6	30343	30348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010630	TGA	2	6	30357	30362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010630	GAA	2	6	30379	30384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010630	TTC	3	9	30418	30426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010630	ATT	2	6	30451	30456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010630	ATG	2	6	30615	30620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010630	CAA	2	6	30677	30682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010630	TTA	2	6	30770	30775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010630	GTG	2	6	30887	30892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010630	CTA	2	6	30948	30953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010630	TGA	2	6	31029	31034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010630	AGG	2	6	31038	31043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010630	TGA	2	6	31071	31076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010630	GGA	2	6	31081	31086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010630	TTA	2	6	31323	31328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010630	ATT	2	6	31365	31370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010630	CAA	2	6	31593	31598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010630	TAC	2	6	31759	31764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010630	GAT	4	12	34133	34144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010630	CTT	2	6	34264	34269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010630	GTA	2	6	34645	34650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010630	ATT	2	6	34676	34681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010630	ATT	2	6	34723	34728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010630	ACG	2	6	34730	34735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010630	ATC	2	6	34768	34773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010630	ATT	2	6	34779	34784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010630	GTG	2	6	34940	34945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010630	TAC	2	6	35063	35068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010630	TCC	2	6	35436	35441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_010630	TCT	2	6	35541	35546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010630	TGT	2	6	35600	35605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010630	AAT	2	6	35739	35744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010630	TTA	2	6	35791	35796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010630	TAG	2	6	35922	35927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010630	GCT	2	6	35981	35986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010630	ATT	2	6	37441	37446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010630	ATA	2	6	42009	42014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010630	CAA	2	6	42075	42080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010630	ACA	2	6	42136	42141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010630	AAT	2	6	42208	42213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010630	ATA	2	6	42630	42635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010630	TTA	2	6	42668	42673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010630	ATT	2	6	42818	42823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010630	GAT	2	6	42833	42838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010630	ACT	2	6	42846	42851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010630	CAA	2	6	42890	42895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010630	AGG	2	6	44431	44436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010630	TGA	2	6	45549	45554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010630	GGT	2	6	45583	45588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010630	AGA	2	6	45589	45594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010630	ATT	2	6	45638	45643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010630	CAG	2	6	46903	46908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_010630	TGC	2	6	46994	46999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010630	TCC	2	6	47215	47220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010630	TGT	2	6	47463	47468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010630	TGA	2	6	47511	47516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010630	CAA	2	6	47572	47577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010630	CAA	2	6	47610	47615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010630	AGA	2	6	48043	48048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010630	ACA	2	6	48182	48187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_010630	CCA	2	6	48192	48197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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263	NC_010630	TAC	2	6	122896	122901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.