MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN05

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010629	ATTA	2	8	1	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010629	ATTA	2	8	79	86	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010629	AGGC	2	8	117	124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_010629	TTGT	2	8	125	132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010629	TGCT	2	8	553	560	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010629	TGGG	2	8	1240	1247	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010629	GTGA	2	8	1898	1905	25 %	25 %	50 %	0 %	186686640
8	NC_010629	ACTA	2	8	2365	2372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_010629	ATCC	2	8	2415	2422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010629	AAGT	2	8	2560	2567	50 %	25 %	25 %	0 %	186686641
11	NC_010629	TTGA	2	8	2777	2784	25 %	50 %	25 %	0 %	186686641
12	NC_010629	ACCC	2	8	3217	3224	25 %	0 %	0 %	75 %	186686642
13	NC_010629	AAAT	2	8	3832	3839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010629	GTCA	2	8	4540	4547	25 %	25 %	25 %	25 %	186686643
15	NC_010629	AACT	2	8	5107	5114	50 %	25 %	0 %	25 %	186686643
16	NC_010629	ATAG	2	8	5492	5499	50 %	25 %	25 %	0 %	186686643
17	NC_010629	TGGT	2	8	5673	5680	0 %	50 %	50 %	0 %	186686643
18	NC_010629	TCTG	2	8	5783	5790	0 %	50 %	25 %	25 %	186686643
19	NC_010629	TATT	2	8	5813	5820	25 %	75 %	0 %	0 %	186686643
20	NC_010629	TTTA	2	8	5989	5996	25 %	75 %	0 %	0 %	186686643
21	NC_010629	TGAG	2	8	6681	6688	25 %	25 %	50 %	0 %	186686644
22	NC_010629	ATAG	2	8	6842	6849	50 %	25 %	25 %	0 %	186686644
23	NC_010629	TAGC	2	8	6975	6982	25 %	25 %	25 %	25 %	186686644
24	NC_010629	TTGC	2	8	7313	7320	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010629	GAAA	2	8	8072	8079	75 %	0 %	25 %	0 %	186686645
26	NC_010629	AATT	2	8	8222	8229	50 %	50 %	0 %	0 %	186686646
27	NC_010629	AGTG	2	8	8771	8778	25 %	25 %	50 %	0 %	186686646
28	NC_010629	TCAA	2	8	9542	9549	50 %	25 %	0 %	25 %	186686647
29	NC_010629	ACGG	2	8	9861	9868	25 %	0 %	50 %	25 %	186686648
30	NC_010629	ATTA	2	8	9972	9979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010629	ATTA	2	8	10230	10237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010629	ACTC	2	8	11125	11132	25 %	25 %	0 %	50 %	186686650
33	NC_010629	GTTT	2	8	11361	11368	0 %	75 %	25 %	0 %	186686650
34	NC_010629	GTCA	2	8	11537	11544	25 %	25 %	25 %	25 %	186686650
35	NC_010629	CGGT	2	8	11990	11997	0 %	25 %	50 %	25 %	186686650
36	NC_010629	CCAT	2	8	12287	12294	25 %	25 %	0 %	50 %	186686651
37	NC_010629	TATC	2	8	12785	12792	25 %	50 %	0 %	25 %	186686652
38	NC_010629	TTGC	2	8	12993	13000	0 %	50 %	25 %	25 %	186686652
39	NC_010629	ATCT	2	8	13159	13166	25 %	50 %	0 %	25 %	186686652
40	NC_010629	ATGG	2	8	13734	13741	25 %	25 %	50 %	0 %	186686653
41	NC_010629	GGGT	2	8	13786	13793	0 %	25 %	75 %	0 %	186686653
42	NC_010629	ACTT	2	8	14013	14020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010629	CCAC	2	8	14997	15004	25 %	0 %	0 %	75 %	186686656
44	NC_010629	TGTC	2	8	15045	15052	0 %	50 %	25 %	25 %	186686656
45	NC_010629	GTGG	2	8	15396	15403	0 %	25 %	75 %	0 %	186686656
46	NC_010629	TCAA	2	8	15620	15627	50 %	25 %	0 %	25 %	186686656
47	NC_010629	ACTG	2	8	15629	15636	25 %	25 %	25 %	25 %	186686656
48	NC_010629	TGAT	2	8	15878	15885	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010629	TATT	2	8	16513	16520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010629	TTTG	2	8	16670	16677	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010629	TATC	2	8	16977	16984	25 %	50 %	0 %	25 %	186686657
52	NC_010629	CAAA	2	8	17106	17113	75 %	0 %	0 %	25 %	186686657
53	NC_010629	TTCA	2	8	17903	17910	25 %	50 %	0 %	25 %	186686657
54	NC_010629	TTTA	2	8	18260	18267	25 %	75 %	0 %	0 %	186686657
55	NC_010629	TTGA	2	8	18275	18282	25 %	50 %	25 %	0 %	186686657
56	NC_010629	ATCA	2	8	18481	18488	50 %	25 %	0 %	25 %	186686657
57	NC_010629	TGAA	2	8	18735	18742	50 %	25 %	25 %	0 %	186686657
58	NC_010629	TAAA	2	8	18915	18922	75 %	25 %	0 %	0 %	186686657
59	NC_010629	AGAA	2	8	18999	19006	75 %	0 %	25 %	0 %	186686657
60	NC_010629	ACTG	2	8	19066	19073	25 %	25 %	25 %	25 %	186686657
61	NC_010629	GTTG	2	8	19733	19740	0 %	50 %	50 %	0 %	186686657
62	NC_010629	TTGA	2	8	20006	20013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010629	CCAG	2	8	20174	20181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010629	CAAA	2	8	21494	21501	75 %	0 %	0 %	25 %	186686658
65	NC_010629	ATTG	2	8	21621	21628	25 %	50 %	25 %	0 %	186686658
66	NC_010629	TTTG	2	8	21735	21742	0 %	75 %	25 %	0 %	186686658
67	NC_010629	GCCA	2	8	21758	21765	25 %	0 %	25 %	50 %	186686658
68	NC_010629	TCAT	2	8	21808	21815	25 %	50 %	0 %	25 %	186686658
69	NC_010629	TTGA	2	8	21955	21962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010629	TGTC	2	8	22757	22764	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_010629	TGAG	2	8	23922	23929	25 %	25 %	50 %	0 %	186686660
72	NC_010629	TTAA	2	8	24119	24126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010629	TAAT	2	8	24180	24187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010629	ACTC	2	8	24688	24695	25 %	25 %	0 %	50 %	186686661
75	NC_010629	CAAA	2	8	24835	24842	75 %	0 %	0 %	25 %	186686661
76	NC_010629	GCTT	2	8	25504	25511	0 %	50 %	25 %	25 %	186686662
77	NC_010629	GATA	2	8	26241	26248	50 %	25 %	25 %	0 %	186686663

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.