MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Nostoc punctiforme PCC 73102 plasmid pNPUN05

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010629	TGT	2	6	104	109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010629	TAG	2	6	136	141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010629	TAA	2	6	332	337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010629	AGC	2	6	367	372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010629	TGT	2	6	428	433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010629	CAG	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010629	CAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_010629	ATG	2	6	628	633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010629	TGG	2	6	672	677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010629	GAC	2	6	693	698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010629	CGG	2	6	860	865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010629	AGC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010629	TTG	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010629	AAT	2	6	1223	1228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010629	GCT	2	6	1317	1322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686639
16	NC_010629	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686639
17	NC_010629	GTT	2	6	1464	1469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686639
18	NC_010629	CGG	2	6	1494	1499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186686639
19	NC_010629	AAT	2	6	1589	1594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686639
20	NC_010629	GAG	2	6	1781	1786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010629	GTA	2	6	1947	1952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686640
22	NC_010629	ACT	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686640
23	NC_010629	TGC	2	6	2025	2030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686640
24	NC_010629	CGT	2	6	2059	2064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686640
25	NC_010629	TAA	2	6	2198	2203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686640
26	NC_010629	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010629	GCA	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010629	AGC	2	6	2387	2392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010629	AGA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010629	TTG	2	6	2586	2591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686641
31	NC_010629	TAG	2	6	2607	2612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686641
32	NC_010629	CAG	2	6	2658	2663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686641
33	NC_010629	AGC	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686641
34	NC_010629	TCA	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686641
35	NC_010629	CTT	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686641
36	NC_010629	CAA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010629	CAA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186686642
38	NC_010629	ATC	2	6	3110	3115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686642
39	NC_010629	TCT	2	6	3174	3179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686642
40	NC_010629	GAA	2	6	3211	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686642
41	NC_010629	CTT	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686642
42	NC_010629	CCT	2	6	3549	3554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010629	TAA	2	6	3580	3585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010629	TGG	2	6	3591	3596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010629	AAT	2	6	3633	3638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010629	AAT	2	6	3641	3646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010629	AGT	2	6	3736	3741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010629	TAA	2	6	3765	3770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010629	TAA	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010629	ATT	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010629	GGC	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010629	TCT	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
53	NC_010629	TTG	2	6	4051	4056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686643
54	NC_010629	TCT	2	6	4064	4069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
55	NC_010629	ATT	2	6	4070	4075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
56	NC_010629	TCT	2	6	4115	4120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
57	NC_010629	TCA	2	6	4208	4213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
58	NC_010629	ACT	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
59	NC_010629	TGA	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686643
60	NC_010629	TAA	2	6	4336	4341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686643
61	NC_010629	GCT	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
62	NC_010629	TTC	2	6	4477	4482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
63	NC_010629	TAT	2	6	4500	4505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
64	NC_010629	TAA	2	6	4549	4554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686643
65	NC_010629	CTG	2	6	4590	4595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
66	NC_010629	TTA	2	6	4643	4648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
67	NC_010629	GCT	2	6	4706	4711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
68	NC_010629	TTC	2	6	4731	4736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
69	NC_010629	CTG	3	9	4747	4755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
70	NC_010629	GTT	2	6	4767	4772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686643
71	NC_010629	TGA	2	6	4840	4845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686643
72	NC_010629	GCT	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
73	NC_010629	GTT	2	6	4950	4955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686643
74	NC_010629	TCT	2	6	5037	5042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686643
75	NC_010629	TGA	2	6	5117	5122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686643
76	NC_010629	TCA	2	6	5258	5263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
77	NC_010629	GCT	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
78	NC_010629	GAT	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686643
79	NC_010629	TGC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
80	NC_010629	ATC	2	6	5536	5541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
81	NC_010629	CTG	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686643
82	NC_010629	TTG	2	6	5596	5601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686643
83	NC_010629	ATT	2	6	5725	5730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
84	NC_010629	TAA	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686643
85	NC_010629	ATT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
86	NC_010629	ATT	2	6	6172	6177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
87	NC_010629	AAG	2	6	6269	6274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686643
88	NC_010629	TCA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
89	NC_010629	TCA	2	6	6368	6373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
90	NC_010629	TCA	2	6	6437	6442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686643
91	NC_010629	AAT	2	6	6577	6582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686643
92	NC_010629	TAG	2	6	6612	6617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686643
93	NC_010629	TTA	2	6	6632	6637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686643
94	NC_010629	TTC	2	6	6722	6727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686644
95	NC_010629	GTT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686644
96	NC_010629	AAT	2	6	6903	6908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686644
97	NC_010629	CAC	2	6	6932	6937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186686644
98	NC_010629	GCT	2	6	6949	6954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686644
99	NC_010629	GCT	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010629	TTA	2	6	7202	7207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010629	CAA	2	6	7252	7257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010629	AGG	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010629	AAT	2	6	7615	7620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010629	TTA	2	6	7621	7626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010629	AGA	2	6	7677	7682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686645
106	NC_010629	GGC	2	6	7839	7844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186686645
107	NC_010629	AAT	2	6	7891	7896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686645
108	NC_010629	AGT	2	6	7900	7905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686645
109	NC_010629	TCA	3	9	7906	7914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686645
110	NC_010629	GAA	2	6	7927	7932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686645
111	NC_010629	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686645
112	NC_010629	AGT	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686645
113	NC_010629	TCA	3	9	8047	8055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686645
114	NC_010629	TGA	2	6	8143	8148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686646
115	NC_010629	GGT	2	6	8163	8168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186686646
116	NC_010629	CTT	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186686646
117	NC_010629	AAT	2	6	8375	8380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686646
118	NC_010629	TCA	2	6	8509	8514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686646
119	NC_010629	GCG	2	6	8542	8547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186686646
120	NC_010629	ACT	2	6	8680	8685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686646
121	NC_010629	GCT	2	6	8727	8732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686646
122	NC_010629	CAA	2	6	8835	8840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186686646
123	NC_010629	TGC	2	6	8855	8860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686646
124	NC_010629	TCG	2	6	8912	8917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186686646
125	NC_010629	CAA	3	9	8940	8948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186686646
126	NC_010629	CTC	2	6	9148	9153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186686647
127	NC_010629	GAC	2	6	9183	9188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686647
128	NC_010629	GAA	2	6	9195	9200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686647
129	NC_010629	GAA	2	6	9228	9233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686647
130	NC_010629	TAA	2	6	9266	9271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686647
131	NC_010629	TCA	2	6	9295	9300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186686647
132	NC_010629	GAA	2	6	9417	9422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686647
133	NC_010629	GTT	2	6	9501	9506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686647
134	NC_010629	ATT	2	6	9513	9518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686647
135	NC_010629	TTG	2	6	9523	9528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186686647
136	NC_010629	GAT	2	6	9571	9576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686647
137	NC_010629	AAT	2	6	9730	9735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010629	AAT	2	6	9739	9744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186686648
139	NC_010629	ACA	2	6	9814	9819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186686648
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143	NC_010629	ATT	2	6	10254	10259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_010629	GTG	2	6	10278	10283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_010629	ATT	2	6	11141	11146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186686650
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260	NC_010629	GAT	2	6	19789	19794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186686657
261	NC_010629	CCG	2	6	20302	20307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_010629	TAC	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_010629	TGA	2	6	20428	20433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_010629	ATG	2	6	20572	20577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_010629	TGA	2	6	20661	20666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010629	TCT	2	6	20734	20739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_010629	ATT	2	6	20823	20828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_010629	CCA	2	6	21004	21009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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283	NC_010629	GCA	2	6	21700	21705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186686658
284	NC_010629	AGA	2	6	21884	21889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186686658
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286	NC_010629	TAG	2	6	22166	22171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_010629	GTA	2	6	22788	22793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_010629	ATA	2	6	22802	22807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_010629	TAA	2	6	26351	26356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.