MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY02

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010627	GCATCG	2	12	515	526	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010627	GATCAA	2	12	1749	1760	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010627	TTTTTG	2	12	27174	27185	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010627	CGATAG	2	12	29375	29386	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010627	CGGGGC	2	12	43131	43142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010627	AGACCA	2	12	43156	43167	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010627	GGACGA	2	12	54766	54777	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010627	TTTTGG	2	12	124972	124983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010627	TCAACC	2	12	131319	131330	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010627	GTTAGA	2	12	131839	131850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010627	CAGCCG	2	12	139654	139665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_010627	GACAAC	2	12	148578	148589	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010627	GCTATC	2	12	162089	162100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010627	GGGCCA	2	12	174425	174436	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010627	GTCCGC	2	12	180527	180538	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_010627	GTGAGC	2	12	194031	194042	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010627	GCGCCG	2	12	196466	196477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010627	GCTTTC	2	12	205562	205573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010627	GCCCTT	2	12	239344	239355	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010627	CCGTGA	2	12	240497	240508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010627	CGGCCA	2	12	259716	259727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010627	CGCTGT	3	18	278765	278782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010627	AGGAAA	2	12	280390	280401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010627	GCTGGC	2	12	280402	280413	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010627	TGCCGA	2	12	281980	281991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010627	GTCATC	2	12	282630	282641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010627	GTCCGC	2	12	310269	310280	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010627	GCCTGC	2	12	312763	312774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010627	GACCAG	2	12	312880	312891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010627	TTTCGT	2	12	319971	319982	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010627	TTTTCA	2	12	359994	360005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010627	GGAACG	2	12	360680	360691	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010627	CGGCTC	2	12	366173	366184	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010627	GCGCGA	2	12	373053	373064	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010627	CAGCTC	2	12	383529	383540	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010627	ACGCGT	2	12	384483	384494	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010627	TGGATC	2	12	386791	386802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_010627	GCTTCA	2	12	387037	387048	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010627	GCGCTG	2	12	388135	388146	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010627	CCAGCG	2	12	397455	397466	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010627	GATCGG	2	12	401515	401526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010627	GCGCAT	2	12	416705	416716	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_010627	CTTTAA	2	12	435164	435175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010627	TTTCCT	2	12	435379	435390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010627	ACGCAA	2	12	436015	436026	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010627	TGCGCT	2	12	440311	440322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010627	TTTTTG	2	12	441118	441129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010627	GAAAGC	2	12	444522	444533	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010627	GTCGGC	2	12	455877	455888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010627	AGGAGA	2	12	461568	461579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010627	CTGGAA	2	12	463895	463906	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010627	CTGCTC	2	12	466354	466365	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010627	GACACT	2	12	504933	504944	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010627	GTGCGC	2	12	521785	521796	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010627	CCGCGC	2	12	522145	522156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_010627	ACGCCG	2	12	558414	558425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010627	CGACGC	2	12	560253	560264	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010627	GATTCC	2	12	583734	583745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010627	GATGTC	2	12	586945	586956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_010627	CGTCGC	2	12	586972	586983	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010627	TTTTTG	2	12	588890	588901	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.