MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia phymatum STM815 plasmid pBPHY01

Total Repeats: 1602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010625	ATCGC	2	10	510	519	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010625	TGCGG	2	10	1338	1347	0 %	20 %	60 %	20 %	186470347
3	NC_010625	GACGG	2	10	5427	5436	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_010625	GAGCA	2	10	7185	7194	40 %	0 %	40 %	20 %	186470349
5	NC_010625	CGGCG	2	10	7823	7832	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010625	GCGAC	2	10	7883	7892	20 %	0 %	40 %	40 %	186470351
7	NC_010625	GTACG	2	10	11428	11437	20 %	20 %	40 %	20 %	186470354
8	NC_010625	ACCGC	2	10	11826	11835	20 %	0 %	20 %	60 %	186470354
9	NC_010625	GCGAA	2	10	14353	14362	40 %	0 %	40 %	20 %	186470356
10	NC_010625	TTCCT	2	10	15151	15160	0 %	60 %	0 %	40 %	186470357
11	NC_010625	CCCAG	2	10	15409	15418	20 %	0 %	20 %	60 %	186470358
12	NC_010625	GCCGC	2	10	17457	17466	0 %	0 %	40 %	60 %	186470359
13	NC_010625	AAGCG	2	10	18739	18748	40 %	0 %	40 %	20 %	186470359
14	NC_010625	GTCGT	2	10	22992	23001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_010625	TGGCC	2	10	25246	25255	0 %	20 %	40 %	40 %	186470365
16	NC_010625	CATGC	2	10	28627	28636	20 %	20 %	20 %	40 %	186470366
17	NC_010625	TGCGC	2	10	29213	29222	0 %	20 %	40 %	40 %	186470367
18	NC_010625	CGACT	2	10	29746	29755	20 %	20 %	20 %	40 %	186470368
19	NC_010625	CGGGC	2	10	29836	29845	0 %	0 %	60 %	40 %	186470368
20	NC_010625	GCGCG	2	10	30673	30682	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_010625	GCACA	2	10	31097	31106	40 %	0 %	20 %	40 %	186470369
22	NC_010625	GCGAT	2	10	33124	33133	20 %	20 %	40 %	20 %	186470370
23	NC_010625	TGCGG	2	10	33352	33361	0 %	20 %	60 %	20 %	186470370
24	NC_010625	GATGC	2	10	34042	34051	20 %	20 %	40 %	20 %	186470371
25	NC_010625	GCCGC	2	10	35124	35133	0 %	0 %	40 %	60 %	186470372
26	NC_010625	CGGAT	2	10	35482	35491	20 %	20 %	40 %	20 %	186470372
27	NC_010625	GACTG	2	10	36338	36347	20 %	20 %	40 %	20 %	186470372
28	NC_010625	AGGCA	2	10	36870	36879	40 %	0 %	40 %	20 %	186470373
29	NC_010625	GACGC	2	10	37050	37059	20 %	0 %	40 %	40 %	186470373
30	NC_010625	AGGCA	2	10	37639	37648	40 %	0 %	40 %	20 %	186470374
31	NC_010625	CGCGA	2	10	38458	38467	20 %	0 %	40 %	40 %	186470374
32	NC_010625	GCAAC	2	10	40990	40999	40 %	0 %	20 %	40 %	186470376
33	NC_010625	TCGAA	2	10	42765	42774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010625	GCTCG	2	10	43450	43459	0 %	20 %	40 %	40 %	186470378
35	NC_010625	AAGGC	2	10	43884	43893	40 %	0 %	40 %	20 %	186470378
36	NC_010625	AGTGC	2	10	50357	50366	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_010625	TGGCG	2	10	50370	50379	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_010625	TCGAT	2	10	51094	51103	20 %	40 %	20 %	20 %	186470388
39	NC_010625	CGACA	2	10	51605	51614	40 %	0 %	20 %	40 %	186470388
40	NC_010625	GCCGC	2	10	52943	52952	0 %	0 %	40 %	60 %	186470391
41	NC_010625	GACCG	2	10	53349	53358	20 %	0 %	40 %	40 %	186470391
42	NC_010625	GCGCG	2	10	55488	55497	0 %	0 %	60 %	40 %	186470393
43	NC_010625	GATCT	2	10	55512	55521	20 %	40 %	20 %	20 %	186470393
44	NC_010625	TACGG	2	10	56007	56016	20 %	20 %	40 %	20 %	186470394
45	NC_010625	CGCAG	3	15	57209	57223	20 %	0 %	40 %	40 %	186470394
46	NC_010625	ACGAT	2	10	58247	58256	40 %	20 %	20 %	20 %	186470395
47	NC_010625	GCGCA	3	15	59047	59061	20 %	0 %	40 %	40 %	186470395
48	NC_010625	GGGGC	2	10	60854	60863	0 %	0 %	80 %	20 %	186470397
49	NC_010625	GCCTT	2	10	61953	61962	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010625	GACGC	2	10	62261	62270	20 %	0 %	40 %	40 %	186470399
51	NC_010625	GCGTC	2	10	63108	63117	0 %	20 %	40 %	40 %	186470400
52	NC_010625	TTCGA	2	10	63509	63518	20 %	40 %	20 %	20 %	186470400
53	NC_010625	CGCTG	2	10	64928	64937	0 %	20 %	40 %	40 %	186470401
54	NC_010625	GACTC	2	10	66841	66850	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010625	TTTCA	2	10	68652	68661	20 %	60 %	0 %	20 %	186470404
56	NC_010625	TGCTC	2	10	70821	70830	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_010625	TGGTC	2	10	71614	71623	0 %	40 %	40 %	20 %	186470407
58	NC_010625	GAGCC	2	10	72228	72237	20 %	0 %	40 %	40 %	186470407
59	NC_010625	TTTCA	2	10	73359	73368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_010625	ACGGC	2	10	79319	79328	20 %	0 %	40 %	40 %	186470413
61	NC_010625	GCGCG	2	10	79965	79974	0 %	0 %	60 %	40 %	186470414
62	NC_010625	GAACG	2	10	88588	88597	40 %	0 %	40 %	20 %	186470419
63	NC_010625	CGGCA	2	10	90169	90178	20 %	0 %	40 %	40 %	186470420
64	NC_010625	GCGCC	2	10	91165	91174	0 %	0 %	40 %	60 %	186470421
65	NC_010625	GACGT	2	10	93009	93018	20 %	20 %	40 %	20 %	186470423
66	NC_010625	AACGC	2	10	93282	93291	40 %	0 %	20 %	40 %	186470423
67	NC_010625	CGGCG	2	10	94186	94195	0 %	0 %	60 %	40 %	186470424
68	NC_010625	CGAAG	2	10	94492	94501	40 %	0 %	40 %	20 %	186470424
69	NC_010625	GGCAA	2	10	95166	95175	40 %	0 %	40 %	20 %	186470425
70	NC_010625	TGCGA	2	10	96992	97001	20 %	20 %	40 %	20 %	186470427
71	NC_010625	GAGAG	2	10	98376	98385	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010625	GTCAC	2	10	105241	105250	20 %	20 %	20 %	40 %	186470431
73	NC_010625	CGACG	2	10	107450	107459	20 %	0 %	40 %	40 %	186470432
74	NC_010625	AGCGA	2	10	107709	107718	40 %	0 %	40 %	20 %	186470432
75	NC_010625	ACGGC	2	10	108367	108376	20 %	0 %	40 %	40 %	186470432
76	NC_010625	TTTTC	2	10	109691	109700	0 %	80 %	0 %	20 %	186470434
77	NC_010625	AGCGA	2	10	111917	111926	40 %	0 %	40 %	20 %	186470437
78	NC_010625	TTCTG	2	10	112611	112620	0 %	60 %	20 %	20 %	186470437
79	NC_010625	CGCTC	2	10	113709	113718	0 %	20 %	20 %	60 %	186470438
80	NC_010625	ATCGC	2	10	114226	114235	20 %	20 %	20 %	40 %	186470439
81	NC_010625	CGGCG	2	10	117459	117468	0 %	0 %	60 %	40 %	186470441
82	NC_010625	AGCCG	2	10	119353	119362	20 %	0 %	40 %	40 %	186470443
83	NC_010625	ACGCG	2	10	119428	119437	20 %	0 %	40 %	40 %	186470443
84	NC_010625	GCCGA	2	10	119756	119765	20 %	0 %	40 %	40 %	186470443
85	NC_010625	CGCGG	2	10	121846	121855	0 %	0 %	60 %	40 %	186470445
86	NC_010625	TCGGA	2	10	123013	123022	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_010625	GCAAT	2	10	124774	124783	40 %	20 %	20 %	20 %	186470447
88	NC_010625	TAAAT	2	10	126643	126652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010625	GGTTG	2	10	128387	128396	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010625	GTATC	2	10	130245	130254	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010625	CTGAA	2	10	130601	130610	40 %	20 %	20 %	20 %	186470452
92	NC_010625	GAGTT	2	10	131323	131332	20 %	40 %	40 %	0 %	186470453
93	NC_010625	CGTGC	2	10	132034	132043	0 %	20 %	40 %	40 %	186470453
94	NC_010625	TCAAT	2	10	132168	132177	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010625	CGGTA	2	10	132715	132724	20 %	20 %	40 %	20 %	186470454
96	NC_010625	CTCGA	2	10	133105	133114	20 %	20 %	20 %	40 %	186470454
97	NC_010625	CAGTG	2	10	134217	134226	20 %	20 %	40 %	20 %	186470454
98	NC_010625	GCAAA	2	10	135952	135961	60 %	0 %	20 %	20 %	186470455
99	NC_010625	GTGCC	2	10	136441	136450	0 %	20 %	40 %	40 %	186470456
100	NC_010625	GAATG	2	10	137284	137293	40 %	20 %	40 %	0 %	186470456
101	NC_010625	GCCGA	2	10	138311	138320	20 %	0 %	40 %	40 %	186470457
102	NC_010625	CGCGG	2	10	139275	139284	0 %	0 %	60 %	40 %	186470458
103	NC_010625	GTGGG	2	10	140064	140073	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010625	CGCGC	2	10	142148	142157	0 %	0 %	40 %	60 %	186470460
105	NC_010625	CGCAT	2	10	142279	142288	20 %	20 %	20 %	40 %	186470460
106	NC_010625	GTCGC	2	10	144463	144472	0 %	20 %	40 %	40 %	186470461
107	NC_010625	CCGAT	2	10	144835	144844	20 %	20 %	20 %	40 %	186470462
108	NC_010625	GGCGC	2	10	146040	146049	0 %	0 %	60 %	40 %	186470462
109	NC_010625	GCGCG	2	10	146180	146189	0 %	0 %	60 %	40 %	186470462
110	NC_010625	GCGCC	2	10	146836	146845	0 %	0 %	40 %	60 %	186470462
111	NC_010625	CGCTG	2	10	147320	147329	0 %	20 %	40 %	40 %	186470462
112	NC_010625	GGCAC	2	10	147965	147974	20 %	0 %	40 %	40 %	186470462
113	NC_010625	CGCGC	2	10	148443	148452	0 %	0 %	40 %	60 %	186470462
114	NC_010625	GGCGG	2	10	149279	149288	0 %	0 %	80 %	20 %	186470463
115	NC_010625	GCGCC	2	10	149512	149521	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
116	NC_010625	TCATC	2	10	149562	149571	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010625	TCGCC	2	10	149730	149739	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_010625	CGAGT	2	10	150538	150547	20 %	20 %	40 %	20 %	186470465
119	NC_010625	TGCAG	2	10	151718	151727	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010625	ACGGC	2	10	154525	154534	20 %	0 %	40 %	40 %	186470469
121	NC_010625	CGGCG	2	10	158056	158065	0 %	0 %	60 %	40 %	186470471
122	NC_010625	GAAAA	2	10	158855	158864	80 %	0 %	20 %	0 %	186470471
123	NC_010625	CGGCT	2	10	164903	164912	0 %	20 %	40 %	40 %	186470474
124	NC_010625	CGCCT	2	10	165601	165610	0 %	20 %	20 %	60 %	186470474
125	NC_010625	GCGCG	2	10	166021	166030	0 %	0 %	60 %	40 %	186470475
126	NC_010625	TGGCG	2	10	166451	166460	0 %	20 %	60 %	20 %	186470475
127	NC_010625	CGCGG	2	10	166697	166706	0 %	0 %	60 %	40 %	186470475
128	NC_010625	AGCAG	2	10	166895	166904	40 %	0 %	40 %	20 %	186470475
129	NC_010625	CGGGG	2	10	167176	167185	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_010625	GCCGT	2	10	167458	167467	0 %	20 %	40 %	40 %	186470476
131	NC_010625	TGCGA	2	10	171767	171776	20 %	20 %	40 %	20 %	186470480
132	NC_010625	TCATT	2	10	172488	172497	20 %	60 %	0 %	20 %	186470481
133	NC_010625	ATGGC	2	10	173803	173812	20 %	20 %	40 %	20 %	186470481
134	NC_010625	AGGGA	2	10	175383	175392	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010625	AGGCG	2	10	175695	175704	20 %	0 %	60 %	20 %	186470485
136	NC_010625	GCCGC	2	10	178922	178931	0 %	0 %	40 %	60 %	186470488
137	NC_010625	CGACG	2	10	178946	178955	20 %	0 %	40 %	40 %	186470488
138	NC_010625	CTCCG	2	10	179460	179469	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
139	NC_010625	GAGAG	2	10	180340	180349	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010625	GCCGC	2	10	181928	181937	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
141	NC_010625	CACGA	2	10	182389	182398	40 %	0 %	20 %	40 %	186470492
142	NC_010625	TGTCG	2	10	185412	185421	0 %	40 %	40 %	20 %	186470494
143	NC_010625	GCCGC	2	10	185989	185998	0 %	0 %	40 %	60 %	186470494
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146	NC_010625	CACCG	2	10	187109	187118	20 %	0 %	20 %	60 %	186470496
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150	NC_010625	GGCAG	2	10	190130	190139	20 %	0 %	60 %	20 %	186470498
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153	NC_010625	TCGGG	2	10	191486	191495	0 %	20 %	60 %	20 %	186470498
154	NC_010625	GCGAC	2	10	193833	193842	20 %	0 %	40 %	40 %	186470502
155	NC_010625	CGACG	2	10	197146	197155	20 %	0 %	40 %	40 %	186470504
156	NC_010625	CGGCG	2	10	197715	197724	0 %	0 %	60 %	40 %	186470505
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158	NC_010625	CGCGG	2	10	202311	202320	0 %	0 %	60 %	40 %	186470509
159	NC_010625	TCGAA	2	10	202843	202852	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_010625	TCCTG	2	10	203179	203188	0 %	40 %	20 %	40 %	186470510
161	NC_010625	GCGTG	2	10	203238	203247	0 %	20 %	60 %	20 %	186470510
162	NC_010625	GCGCG	2	10	203548	203557	0 %	0 %	60 %	40 %	186470511
163	NC_010625	GCCGC	2	10	203609	203618	0 %	0 %	40 %	60 %	186470511
164	NC_010625	GGCGC	2	10	204883	204892	0 %	0 %	60 %	40 %	186470511
165	NC_010625	CAGCG	2	10	205349	205358	20 %	0 %	40 %	40 %	186470512
166	NC_010625	GCGCG	2	10	205573	205582	0 %	0 %	60 %	40 %	186470512
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168	NC_010625	CGCTT	2	10	205943	205952	0 %	40 %	20 %	40 %	186470512
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171	NC_010625	GCGAC	2	10	208860	208869	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
172	NC_010625	TTTTG	2	10	210461	210470	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
173	NC_010625	GGCGT	2	10	211647	211656	0 %	20 %	60 %	20 %	186470515
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175	NC_010625	CGCGC	2	10	212248	212257	0 %	0 %	40 %	60 %	186470515
176	NC_010625	GCACG	2	10	213646	213655	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
177	NC_010625	GCGAT	2	10	213790	213799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
178	NC_010625	GCCCG	2	10	215449	215458	0 %	0 %	40 %	60 %	186470517
179	NC_010625	GGCAT	2	10	217376	217385	20 %	20 %	40 %	20 %	186470517
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189	NC_010625	CGACG	2	10	223747	223756	20 %	0 %	40 %	40 %	186470524
190	NC_010625	TCGGG	2	10	226740	226749	0 %	20 %	60 %	20 %	186470527
191	NC_010625	CTGCG	2	10	226807	226816	0 %	20 %	40 %	40 %	186470527
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195	NC_010625	TCCGT	2	10	230727	230736	0 %	40 %	20 %	40 %	186470530
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197	NC_010625	GTCGT	2	10	234654	234663	0 %	40 %	40 %	20 %	186470530
198	NC_010625	CGCTG	2	10	235019	235028	0 %	20 %	40 %	40 %	186470530
199	NC_010625	GCGAT	2	10	236188	236197	20 %	20 %	40 %	20 %	186470530
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201	NC_010625	GACGC	2	10	241197	241206	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
202	NC_010625	ATACC	2	10	242239	242248	40 %	20 %	0 %	40 %	186470535
203	NC_010625	GCCAT	2	10	242989	242998	20 %	20 %	20 %	40 %	186470535
204	NC_010625	AATTG	2	10	243294	243303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
205	NC_010625	TGGCG	2	10	243791	243800	0 %	20 %	60 %	20 %	186470536
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212	NC_010625	GTCCA	2	10	251072	251081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
213	NC_010625	CGCGG	2	10	254583	254592	0 %	0 %	60 %	40 %	186470544
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223	NC_010625	GCGGA	2	10	271933	271942	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
224	NC_010625	GCGAA	2	10	273206	273215	40 %	0 %	40 %	20 %	186470563
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232	NC_010625	GTATC	2	10	286673	286682	20 %	40 %	20 %	20 %	186470573
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240	NC_010625	CTGCG	2	10	290314	290323	0 %	20 %	40 %	40 %	186470575
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244	NC_010625	GCGAT	2	10	293369	293378	20 %	20 %	40 %	20 %	186470577
245	NC_010625	CGCGG	2	10	293635	293644	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
246	NC_010625	GGCGC	2	10	294195	294204	0 %	0 %	60 %	40 %	186470578
247	NC_010625	GCGCT	2	10	295774	295783	0 %	20 %	40 %	40 %	186470581
248	NC_010625	GGCGC	2	10	296073	296082	0 %	0 %	60 %	40 %	186470581
249	NC_010625	CCGGC	2	10	297038	297047	0 %	0 %	40 %	60 %	186470581
250	NC_010625	CGTGC	2	10	297181	297190	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
251	NC_010625	TGCAA	2	10	299751	299760	40 %	20 %	20 %	20 %	186470585
252	NC_010625	CGAAG	2	10	300099	300108	40 %	0 %	40 %	20 %	186470586
253	NC_010625	AGCGG	2	10	302608	302617	20 %	0 %	60 %	20 %	186470588
254	NC_010625	CGCGT	2	10	305506	305515	0 %	20 %	40 %	40 %	186470591
255	NC_010625	CGGTG	2	10	306266	306275	0 %	20 %	60 %	20 %	186470592
256	NC_010625	AAGGA	2	10	307024	307033	60 %	0 %	40 %	0 %	186470593
257	NC_010625	GGCAA	2	10	308265	308274	40 %	0 %	40 %	20 %	186470594
258	NC_010625	AATGC	2	10	310114	310123	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
259	NC_010625	GGCAG	2	10	310909	310918	20 %	0 %	60 %	20 %	186470597
260	NC_010625	CTGCG	2	10	314075	314084	0 %	20 %	40 %	40 %	186470600
261	NC_010625	ACCTG	2	10	316013	316022	20 %	20 %	20 %	40 %	186470602
262	NC_010625	GCCGT	2	10	316227	316236	0 %	20 %	40 %	40 %	186470602
263	NC_010625	TCGCG	2	10	317981	317990	0 %	20 %	40 %	40 %	186470603
264	NC_010625	CGGCG	2	10	318530	318539	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
265	NC_010625	GATGT	2	10	319634	319643	20 %	40 %	40 %	0 %	186470605
266	NC_010625	ATCGC	2	10	319722	319731	20 %	20 %	20 %	40 %	186470605
267	NC_010625	AGACG	2	10	320667	320676	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
268	NC_010625	GCAAG	2	10	321353	321362	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
269	NC_010625	GGCGA	2	10	323417	323426	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
270	NC_010625	CATCG	2	10	323910	323919	20 %	20 %	20 %	40 %	186470610
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401	NC_010625	TCAGT	2	10	475769	475778	20 %	40 %	20 %	20 %	186470744
402	NC_010625	TCGCG	2	10	479143	479152	0 %	20 %	40 %	40 %	186470746
403	NC_010625	GACCA	2	10	480245	480254	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
404	NC_010625	CCGGC	2	10	480265	480274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
405	NC_010625	TGTGC	2	10	483123	483132	0 %	40 %	40 %	20 %	186470750
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419	NC_010625	GGCGT	2	10	503407	503416	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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421	NC_010625	ATCGC	2	10	504297	504306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_010625	TCGCG	2	10	504322	504331	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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439	NC_010625	GACGG	2	10	520456	520465	20 %	0 %	60 %	20 %	186470776
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497	NC_010625	CGGCA	2	10	611980	611989	20 %	0 %	40 %	40 %	186470856
498	NC_010625	CTACA	2	10	617768	617777	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
499	NC_010625	ATCGT	2	10	618034	618043	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
500	NC_010625	ATCAC	2	10	618129	618138	40 %	20 %	0 %	40 %	186470861

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