MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia phymatum STM815 chromosome 1

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010622	GGGGCC	2	12	2105	2116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010622	ACGCGC	2	12	13138	13149	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_010622	CCATGC	2	12	51165	51176	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010622	GCACTC	2	12	121137	121148	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010622	GGCCGT	2	12	211087	211098	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010622	CCGACG	2	12	222351	222362	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010622	GTATTT	2	12	242780	242791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010622	GTCCGC	2	12	248002	248013	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010622	GTGACG	2	12	282344	282355	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010622	TAAACA	2	12	295373	295384	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010622	AACATC	2	12	305258	305269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010622	CGCTGA	2	12	315779	315790	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010622	TTGTCC	2	12	341413	341424	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010622	AAAGCC	2	12	419847	419858	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010622	AAAATC	2	12	435279	435290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010622	GTCTCC	2	12	476065	476076	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010622	GCCGTC	2	12	483340	483351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_010622	AAGCGT	2	12	532617	532628	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010622	GCGGCC	2	12	537297	537308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010622	TCCTGT	2	12	602719	602730	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010622	CTTTTT	2	12	612534	612545	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010622	CAAAAA	2	12	638091	638102	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010622	CGTGTA	2	12	639522	639533	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010622	CCGGCT	2	12	664112	664123	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010622	GCAATT	2	12	687971	687982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_010622	CGTTTT	2	12	688464	688475	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010622	CGCCGT	2	12	701707	701718	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_010622	CGGCGC	2	12	739657	739668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010622	TCGCGC	2	12	753557	753568	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010622	GCCGTG	2	12	775893	775904	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010622	GCGTGG	2	12	898185	898196	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_010622	CAATGC	2	12	930746	930757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010622	CCCGCT	2	12	932282	932293	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_010622	AAAAAC	2	12	999587	999598	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010622	CAGGCG	2	12	1000193	1000204	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010622	TGCGCG	2	12	1007786	1007797	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010622	GGCCGT	2	12	1107202	1107213	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010622	ATGGTG	2	12	1128964	1128975	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010622	GACGGC	2	12	1220778	1220789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010622	GAACAA	2	12	1255055	1255066	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010622	CTGATC	2	12	1273711	1273722	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010622	GGGAAA	2	12	1283259	1283270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010622	GCCTTT	2	12	1288099	1288110	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010622	GTTTGC	2	12	1320700	1320711	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010622	CGACAT	2	12	1340854	1340865	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010622	TTATGC	2	12	1353360	1353371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_010622	GCATCA	2	12	1362160	1362171	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010622	TGAAAG	2	12	1396519	1396530	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010622	CGTGCG	2	12	1454029	1454040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010622	ACGTCG	2	12	1466597	1466608	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010622	GCGTTT	2	12	1478479	1478490	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010622	CTTTAC	2	12	1514205	1514216	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010622	GCATCG	2	12	1519298	1519309	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010622	AACTGG	2	12	1519377	1519388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010622	ACGAAC	2	12	1538210	1538221	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010622	ACGCGA	2	12	1547150	1547161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010622	GCAAAA	2	12	1578233	1578244	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_010622	CTAAAA	2	12	1584863	1584874	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010622	TTTCCG	2	12	1589100	1589111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_010622	GCTTTT	2	12	1668025	1668036	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010622	GCTGCC	2	12	1690711	1690722	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010622	GGCGCG	2	12	1701171	1701182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010622	GAAAAA	2	12	1757270	1757281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010622	GGTTTT	2	12	1795967	1795978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010622	TTGCTT	2	12	1795979	1795990	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010622	TGGTTT	2	12	1799480	1799491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010622	TCGGCG	2	12	1807988	1807999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010622	AAAAGC	2	12	1809060	1809071	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010622	GCTTTT	2	12	1821992	1822003	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010622	TGAACT	2	12	1934244	1934255	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_010622	GGAGAC	2	12	1944562	1944573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010622	AAGCCG	2	12	1986176	1986187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010622	GCATCC	2	12	2016343	2016354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010622	CGTCGG	2	12	2053418	2053429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010622	CGCATG	2	12	2053529	2053540	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010622	CGTCCC	2	12	2083023	2083034	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_010622	TCGCCG	2	12	2100343	2100354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010622	CAGATA	2	12	2102286	2102297	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010622	CAAAAA	2	12	2150124	2150135	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010622	CCGTGG	2	12	2177675	2177686	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010622	AATTGG	2	12	2269827	2269838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010622	TTTGGT	2	12	2306550	2306561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010622	TTTTGG	2	12	2306562	2306573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010622	CCTGTT	2	12	2314461	2314472	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010622	GCCGCT	2	12	2349494	2349505	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010622	CAGACA	2	12	2365286	2365297	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010622	GAGCGC	2	12	2369732	2369743	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_010622	TTTGGT	2	12	2397844	2397855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010622	CACGAC	2	12	2400514	2400525	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010622	TCGCCG	2	12	2401589	2401600	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
91	NC_010622	TGCGGC	2	12	2409176	2409187	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_010622	CAGCGC	2	12	2418830	2418841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010622	TTTCTT	2	12	2421037	2421048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010622	CGGCCC	2	12	2470761	2470772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_010622	CACGCG	2	12	2472091	2472102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
96	NC_010622	CTGCAT	2	12	2501648	2501659	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010622	CCATTA	2	12	2564166	2564177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010622	GCCCGT	2	12	2611672	2611683	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010622	AGGTGC	2	12	2629305	2629316	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010622	TCAGCA	2	12	2648381	2648392	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010622	CGCAAA	2	12	2650581	2650592	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010622	GCTAGG	2	12	2684550	2684561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010622	CCAGGC	2	12	2743109	2743120	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010622	GAGACA	2	12	2786870	2786881	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_010622	ATTGAG	2	12	2811968	2811979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010622	TTTTAT	2	12	2827938	2827949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010622	TTATAT	2	12	2841176	2841187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010622	CCGCGC	2	12	2864977	2864988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010622	CGGCAC	2	12	2927527	2927538	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010622	AGTCCA	2	12	2946306	2946317	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010622	CCCTTC	2	12	2994292	2994303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010622	GCACGC	2	12	2995654	2995665	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_010622	CGATTG	2	12	3000743	3000754	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_010622	CCTGGC	2	12	3051070	3051081	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_010622	ACGCGA	2	12	3056031	3056042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010622	GTTGCA	2	12	3141374	3141385	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_010622	CGATGC	2	12	3231922	3231933	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010622	ACTTTA	2	12	3236241	3236252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_010622	CGGCGT	2	12	3280648	3280659	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010622	AAAACC	2	12	3299257	3299268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010622	TGGTTT	3	18	3310862	3310879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010622	TTTTGC	2	12	3310889	3310900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_010622	AAAGCA	2	12	3311556	3311567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_010622	AAGCAA	2	12	3311569	3311580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_010622	AAGCAA	2	12	3311587	3311598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_010622	AGCAAA	3	18	3315179	3315196	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010622	AAACCA	2	12	3315246	3315257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010622	CTGCGC	2	12	3329138	3329149	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010622	CCCGAT	2	12	3338190	3338201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010622	CCGCGC	2	12	3339414	3339425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_010622	GCGGGC	2	12	3380957	3380968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010622	TCGAAA	2	12	3418042	3418053	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_010622	CTTGAA	2	12	3429457	3429468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_010622	CATCGA	2	12	3454995	3455006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.