MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Burkholderia phymatum STM815 chromosome 1

Total Repeats: 3035

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010622	ACGTG	2	10	423	432	20 %	20 %	40 %	20 %	186474774
2	NC_010622	AGCGC	2	10	3687	3696	20 %	0 %	40 %	40 %	186474776
3	NC_010622	CGTGG	2	10	3866	3875	0 %	20 %	60 %	20 %	186474776
4	NC_010622	GACGC	2	10	4633	4642	20 %	0 %	40 %	40 %	186474776
5	NC_010622	GCCGC	2	10	5806	5815	0 %	0 %	40 %	60 %	186474776
6	NC_010622	CGCGA	2	10	7275	7284	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010622	CAGGG	2	10	9681	9690	20 %	0 %	60 %	20 %	186474779
8	NC_010622	AAGCG	2	10	10521	10530	40 %	0 %	40 %	20 %	186474780
9	NC_010622	GCGCA	2	10	10807	10816	20 %	0 %	40 %	40 %	186474780
10	NC_010622	GTTGC	2	10	13099	13108	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_010622	GCATC	2	10	16020	16029	20 %	20 %	20 %	40 %	186474785
12	NC_010622	TGCGC	2	10	16356	16365	0 %	20 %	40 %	40 %	186474785
13	NC_010622	GCGCG	2	10	18267	18276	0 %	0 %	60 %	40 %	186474787
14	NC_010622	GTCGC	2	10	20085	20094	0 %	20 %	40 %	40 %	186474789
15	NC_010622	GCGCA	2	10	20364	20373	20 %	0 %	40 %	40 %	186474789
16	NC_010622	GCCAC	2	10	20431	20440	20 %	0 %	20 %	60 %	186474789
17	NC_010622	ATCGC	2	10	24041	24050	20 %	20 %	20 %	40 %	186474793
18	NC_010622	CTGGC	2	10	24911	24920	0 %	20 %	40 %	40 %	186474793
19	NC_010622	TTCCT	2	10	25326	25335	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_010622	TGGCG	2	10	27117	27126	0 %	20 %	60 %	20 %	186474794
21	NC_010622	ACCAT	2	10	30421	30430	40 %	20 %	0 %	40 %	186474797
22	NC_010622	GCTCG	2	10	34333	34342	0 %	20 %	40 %	40 %	186474801
23	NC_010622	CGTGC	2	10	34459	34468	0 %	20 %	40 %	40 %	186474801
24	NC_010622	TGGCC	2	10	34512	34521	0 %	20 %	40 %	40 %	186474801
25	NC_010622	GGCAG	2	10	35043	35052	20 %	0 %	60 %	20 %	186474801
26	NC_010622	GATCG	2	10	35531	35540	20 %	20 %	40 %	20 %	186474801
27	NC_010622	GCACG	2	10	36632	36641	20 %	0 %	40 %	40 %	186474802
28	NC_010622	GCGCC	2	10	41411	41420	0 %	0 %	40 %	60 %	186474805
29	NC_010622	CGCGG	2	10	43882	43891	0 %	0 %	60 %	40 %	186474808
30	NC_010622	GACGG	2	10	44821	44830	20 %	0 %	60 %	20 %	186474809
31	NC_010622	GGCCG	2	10	45523	45532	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010622	GCGAC	2	10	46518	46527	20 %	0 %	40 %	40 %	186474810
33	NC_010622	TACGT	2	10	46805	46814	20 %	40 %	20 %	20 %	186474810
34	NC_010622	GCCGG	2	10	47095	47104	0 %	0 %	60 %	40 %	186474811
35	NC_010622	GCTTC	2	10	47378	47387	0 %	40 %	20 %	40 %	186474811
36	NC_010622	CACGT	2	10	47416	47425	20 %	20 %	20 %	40 %	186474811
37	NC_010622	TGCAG	2	10	48463	48472	20 %	20 %	40 %	20 %	186474812
38	NC_010622	GACGC	2	10	49547	49556	20 %	0 %	40 %	40 %	186474812
39	NC_010622	AAGCC	2	10	51105	51114	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_010622	CGCAG	2	10	51418	51427	20 %	0 %	40 %	40 %	186474814
41	NC_010622	GCTCG	2	10	51492	51501	0 %	20 %	40 %	40 %	186474814
42	NC_010622	GATGT	2	10	54053	54062	20 %	40 %	40 %	0 %	186474817
43	NC_010622	TGGCG	2	10	54681	54690	0 %	20 %	60 %	20 %	186474818
44	NC_010622	TTTTG	2	10	54845	54854	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010622	ACGCG	2	10	56572	56581	20 %	0 %	40 %	40 %	186474820
46	NC_010622	CGTGC	2	10	57426	57435	0 %	20 %	40 %	40 %	186474820
47	NC_010622	GCACG	2	10	60982	60991	20 %	0 %	40 %	40 %	186474823
48	NC_010622	TGCTT	2	10	61148	61157	0 %	60 %	20 %	20 %	186474823
49	NC_010622	GGGCC	2	10	61353	61362	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010622	GCGCC	2	10	63754	63763	0 %	0 %	40 %	60 %	186474826
51	NC_010622	CGCGC	2	10	63875	63884	0 %	0 %	40 %	60 %	186474826
52	NC_010622	ATCAG	2	10	63934	63943	40 %	20 %	20 %	20 %	186474826
53	NC_010622	CGGCG	2	10	64697	64706	0 %	0 %	60 %	40 %	186474826
54	NC_010622	CGAAG	2	10	64925	64934	40 %	0 %	40 %	20 %	186474826
55	NC_010622	TCGGC	2	10	67996	68005	0 %	20 %	40 %	40 %	186474829
56	NC_010622	CGGCA	2	10	68305	68314	20 %	0 %	40 %	40 %	186474830
57	NC_010622	ATGAG	2	10	69560	69569	40 %	20 %	40 %	0 %	186474830
58	NC_010622	CGCGC	2	10	73250	73259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
59	NC_010622	CGTCC	2	10	73418	73427	0 %	20 %	20 %	60 %	186474835
60	NC_010622	GCGCG	2	10	74337	74346	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010622	ACGCG	2	10	78995	79004	20 %	0 %	40 %	40 %	186474840
62	NC_010622	GAAAA	2	10	80630	80639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010622	CGCGC	2	10	83250	83259	0 %	0 %	40 %	60 %	186474844
64	NC_010622	CAGCG	2	10	85249	85258	20 %	0 %	40 %	40 %	186474846
65	NC_010622	GCTTC	2	10	89734	89743	0 %	40 %	20 %	40 %	186474850
66	NC_010622	CCGAT	2	10	90224	90233	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_010622	GAACG	2	10	90281	90290	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010622	CACGA	2	10	91524	91533	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_010622	TGGCC	2	10	91916	91925	0 %	20 %	40 %	40 %	186474853
70	NC_010622	GCGAC	2	10	93606	93615	20 %	0 %	40 %	40 %	186474855
71	NC_010622	ACCGG	2	10	93763	93772	20 %	0 %	40 %	40 %	186474855
72	NC_010622	CGCGG	2	10	93819	93828	0 %	0 %	60 %	40 %	186474855
73	NC_010622	AGTCG	2	10	95328	95337	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_010622	TTTGC	2	10	95368	95377	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_010622	CGCGC	2	10	97719	97728	0 %	0 %	40 %	60 %	186474860
76	NC_010622	GCGCC	2	10	99412	99421	0 %	0 %	40 %	60 %	186474862
77	NC_010622	CGTGC	2	10	99737	99746	0 %	20 %	40 %	40 %	186474862
78	NC_010622	CGCGC	2	10	100220	100229	0 %	0 %	40 %	60 %	186474862
79	NC_010622	GCCGG	2	10	100269	100278	0 %	0 %	60 %	40 %	186474862
80	NC_010622	GCGCC	2	10	101509	101518	0 %	0 %	40 %	60 %	186474864
81	NC_010622	CTTCG	2	10	102047	102056	0 %	40 %	20 %	40 %	186474864
82	NC_010622	TCGAT	2	10	102814	102823	20 %	40 %	20 %	20 %	186474865
83	NC_010622	GCCGC	2	10	103148	103157	0 %	0 %	40 %	60 %	186474865
84	NC_010622	CGTGG	2	10	105330	105339	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_010622	GCCGG	2	10	106652	106661	0 %	0 %	60 %	40 %	186474867
86	NC_010622	TCGCG	2	10	108436	108445	0 %	20 %	40 %	40 %	186474869
87	NC_010622	CGGCA	2	10	109911	109920	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_010622	CAGTT	2	10	111282	111291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_010622	GGCGA	2	10	111904	111913	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_010622	TCGGC	2	10	114515	114524	0 %	20 %	40 %	40 %	186474874
91	NC_010622	TCGAT	2	10	116240	116249	20 %	40 %	20 %	20 %	186474876
92	NC_010622	ATCCG	2	10	116830	116839	20 %	20 %	20 %	40 %	186474877
93	NC_010622	GGCAG	2	10	116908	116917	20 %	0 %	60 %	20 %	186474877
94	NC_010622	ACCGC	2	10	117085	117094	20 %	0 %	20 %	60 %	186474878
95	NC_010622	GATCG	2	10	118175	118184	20 %	20 %	40 %	20 %	186474879
96	NC_010622	CGGCG	2	10	118949	118958	0 %	0 %	60 %	40 %	186474880
97	NC_010622	AGCCG	2	10	119630	119639	20 %	0 %	40 %	40 %	186474880
98	NC_010622	CGGCG	2	10	121085	121094	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
99	NC_010622	TTTTG	2	10	122859	122868	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010622	GCGCC	2	10	124648	124657	0 %	0 %	40 %	60 %	186474884
101	NC_010622	GCGCG	2	10	124887	124896	0 %	0 %	60 %	40 %	186474884
102	NC_010622	ATTGC	2	10	126020	126029	20 %	40 %	20 %	20 %	186474885
103	NC_010622	TCGCA	2	10	126113	126122	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_010622	GGTCG	2	10	126639	126648	0 %	20 %	60 %	20 %	186474886
105	NC_010622	TCGCT	2	10	127219	127228	0 %	40 %	20 %	40 %	186474887
106	NC_010622	AGCGC	2	10	127394	127403	20 %	0 %	40 %	40 %	186474887
107	NC_010622	GTCGC	2	10	128641	128650	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_010622	CGAAA	2	10	128675	128684	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_010622	ACGCG	2	10	131906	131915	20 %	0 %	40 %	40 %	186474892
110	NC_010622	TGCGC	2	10	131942	131951	0 %	20 %	40 %	40 %	186474892
111	NC_010622	TCGTC	2	10	134676	134685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_010622	ACGGT	2	10	136450	136459	20 %	20 %	40 %	20 %	186474898
113	NC_010622	CGCTG	2	10	136984	136993	0 %	20 %	40 %	40 %	186474898
114	NC_010622	GGGCA	2	10	139508	139517	20 %	0 %	60 %	20 %	186474901
115	NC_010622	CTGGG	2	10	140000	140009	0 %	20 %	60 %	20 %	186474902
116	NC_010622	TGCCG	2	10	140598	140607	0 %	20 %	40 %	40 %	186474902
117	NC_010622	GCGCC	2	10	141575	141584	0 %	0 %	40 %	60 %	186474903
118	NC_010622	CCGCT	2	10	142350	142359	0 %	20 %	20 %	60 %	186474904
119	NC_010622	GATCC	2	10	143096	143105	20 %	20 %	20 %	40 %	186474904
120	NC_010622	GGACA	2	10	143792	143801	40 %	0 %	40 %	20 %	186474904
121	NC_010622	GCCCG	2	10	144781	144790	0 %	0 %	40 %	60 %	186474905
122	NC_010622	CGTCG	2	10	144793	144802	0 %	20 %	40 %	40 %	186474905
123	NC_010622	TGCGC	2	10	144889	144898	0 %	20 %	40 %	40 %	186474905
124	NC_010622	CGATG	2	10	147811	147820	20 %	20 %	40 %	20 %	186474905
125	NC_010622	TGCGC	2	10	148978	148987	0 %	20 %	40 %	40 %	186474905
126	NC_010622	TTCGA	2	10	149627	149636	20 %	40 %	20 %	20 %	186474906
127	NC_010622	CGCAG	2	10	151280	151289	20 %	0 %	40 %	40 %	186474907
128	NC_010622	ACGAA	2	10	153109	153118	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_010622	AGCGC	2	10	153839	153848	20 %	0 %	40 %	40 %	186474909
130	NC_010622	CCGTG	2	10	155408	155417	0 %	20 %	40 %	40 %	186474910
131	NC_010622	GCCAG	2	10	157431	157440	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_010622	CGGCG	2	10	159000	159009	0 %	0 %	60 %	40 %	186474912
133	NC_010622	TGTAG	2	10	163294	163303	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010622	GGCGC	2	10	163646	163655	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010622	GCTTC	2	10	164295	164304	0 %	40 %	20 %	40 %	186474917
136	NC_010622	GCTTC	2	10	165834	165843	0 %	40 %	20 %	40 %	186474918
137	NC_010622	GCGTC	2	10	165909	165918	0 %	20 %	40 %	40 %	186474918
138	NC_010622	GTGCG	2	10	167495	167504	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010622	CGCTG	2	10	174722	174731	0 %	20 %	40 %	40 %	186474924
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145	NC_010622	ATGCG	2	10	182977	182986	20 %	20 %	40 %	20 %	186474930
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151	NC_010622	GCGCG	2	10	190076	190085	0 %	0 %	60 %	40 %	186474940
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155	NC_010622	GTCGC	2	10	193521	193530	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
156	NC_010622	GCAGC	2	10	196341	196350	20 %	0 %	40 %	40 %	186474945
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162	NC_010622	CGGGC	2	10	203888	203897	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
163	NC_010622	CCTTG	2	10	204109	204118	0 %	40 %	20 %	40 %	186474952
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171	NC_010622	GTGCG	2	10	209214	209223	0 %	20 %	60 %	20 %	186474957
172	NC_010622	TGCGC	2	10	212009	212018	0 %	20 %	40 %	40 %	186474959
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176	NC_010622	GCCGC	2	10	215744	215753	0 %	0 %	40 %	60 %	186474960
177	NC_010622	ATTCA	2	10	217344	217353	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_010622	CGGCG	2	10	218464	218473	0 %	0 %	60 %	40 %	186474963
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194	NC_010622	CGCAT	2	10	234874	234883	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_010622	GCTTC	2	10	235014	235023	0 %	40 %	20 %	40 %	186474981
196	NC_010622	CGACC	2	10	235681	235690	20 %	0 %	20 %	60 %	186474981
197	NC_010622	GGTTC	2	10	236580	236589	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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241	NC_010622	CCACA	2	10	298768	298777	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
242	NC_010622	CAGCG	2	10	301797	301806	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
243	NC_010622	GGGCA	2	10	301964	301973	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
244	NC_010622	ACGCC	2	10	302078	302087	20 %	0 %	20 %	60 %	186475027
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246	NC_010622	GTTCG	2	10	306950	306959	0 %	40 %	40 %	20 %	186475031
247	NC_010622	TTTAC	2	10	307562	307571	20 %	60 %	0 %	20 %	186475032
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249	NC_010622	GCAGC	2	10	312747	312756	20 %	0 %	40 %	40 %	186475038
250	NC_010622	CGCTT	2	10	312954	312963	0 %	40 %	20 %	40 %	186475039
251	NC_010622	CGGCG	2	10	313465	313474	0 %	0 %	60 %	40 %	186475039
252	NC_010622	TGCGC	2	10	313638	313647	0 %	20 %	40 %	40 %	186475039
253	NC_010622	CGCGC	2	10	313732	313741	0 %	0 %	40 %	60 %	186475039
254	NC_010622	CAAAG	2	10	314272	314281	60 %	0 %	20 %	20 %	186475040
255	NC_010622	GCATT	2	10	314283	314292	20 %	40 %	20 %	20 %	186475040
256	NC_010622	ACGCC	2	10	314491	314500	20 %	0 %	20 %	60 %	186475040
257	NC_010622	ACGCG	2	10	314989	314998	20 %	0 %	40 %	40 %	186475042
258	NC_010622	GCGTC	2	10	315185	315194	0 %	20 %	40 %	40 %	186475042
259	NC_010622	GCAGC	2	10	315543	315552	20 %	0 %	40 %	40 %	186475042
260	NC_010622	AGCGG	2	10	318874	318883	20 %	0 %	60 %	20 %	186475045
261	NC_010622	GCGCA	2	10	322195	322204	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
262	NC_010622	GCGAT	2	10	322451	322460	20 %	20 %	40 %	20 %	186475050
263	NC_010622	GACCA	2	10	323458	323467	40 %	0 %	20 %	40 %	186475051
264	NC_010622	CGGCT	2	10	323709	323718	0 %	20 %	40 %	40 %	186475052
265	NC_010622	CGGCG	3	15	324325	324339	0 %	0 %	60 %	40 %	186475052
266	NC_010622	GCTCG	2	10	324632	324641	0 %	20 %	40 %	40 %	186475053
267	NC_010622	CTTTA	2	10	324840	324849	20 %	60 %	0 %	20 %	186475053
268	NC_010622	CGTCA	2	10	327977	327986	20 %	20 %	20 %	40 %	186475057
269	NC_010622	GCGCC	2	10	330176	330185	0 %	0 %	40 %	60 %	186475058
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400	NC_010622	CAGCG	2	10	479428	479437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
401	NC_010622	ATCGA	2	10	480680	480689	40 %	20 %	20 %	20 %	186475189
402	NC_010622	AAAGT	2	10	481185	481194	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
403	NC_010622	GAACG	2	10	481394	481403	40 %	0 %	40 %	20 %	186475190
404	NC_010622	GCACC	2	10	483285	483294	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
405	NC_010622	TTGGC	2	10	483310	483319	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
406	NC_010622	CTGTG	2	10	483530	483539	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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426	NC_010622	GCATT	2	10	507103	507112	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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435	NC_010622	GGCCG	2	10	521950	521959	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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482	NC_010622	TTGCA	2	10	569693	569702	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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