MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Kocuria rhizophila DC2201

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010617	GGCCAG	2	12	42737	42748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010617	ACGGCG	4	24	73337	73360	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010617	CCGCGC	2	12	89609	89620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_010617	CGGGGC	2	12	112402	112413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010617	CAAAGC	2	12	146754	146765	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010617	CGGCGC	2	12	164636	164647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010617	CCCGGG	2	12	176557	176568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010617	CAGCCG	2	12	195381	195392	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010617	CGGGCG	2	12	196743	196754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010617	ACCGGC	2	12	218523	218534	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_010617	TGCCGT	2	12	218566	218577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010617	CGCGGG	2	12	268172	268183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010617	CGCGGG	2	12	268855	268866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010617	GCCGGA	2	12	290364	290375	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010617	ACAGTG	2	12	297521	297532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010617	CGGTGG	2	12	331127	331138	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010617	GGGCCG	2	12	357201	357212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010617	CCGGGC	2	12	378128	378139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_010617	GCAGGC	2	12	454562	454573	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010617	GCTGCG	2	12	496999	497010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010617	CCGGGG	2	12	511017	511028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010617	CCCGCC	2	12	513658	513669	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
23	NC_010617	CTCGCG	2	12	562456	562467	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_010617	GACGGG	2	12	607705	607716	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010617	GGCGCG	2	12	731862	731873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010617	TCGACC	2	12	812202	812213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010617	CCCGAC	2	12	812308	812319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010617	GACCCG	2	12	812512	812523	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_010617	TCCGCC	2	12	846941	846952	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010617	ATCCCG	2	12	850434	850445	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_010617	CGGGCC	2	12	853637	853648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_010617	CCCGCG	2	12	870589	870600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_010617	GACGCC	2	12	874237	874248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_010617	CCCGGG	2	12	900609	900620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010617	CCCCGA	2	12	942599	942610	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010617	GTGCGG	2	12	945245	945256	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010617	CGGCCG	2	12	961279	961290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010617	GGGCGG	2	12	977522	977533	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010617	GACACC	2	12	985852	985863	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010617	GCAGTG	2	12	994928	994939	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010617	GCTCGC	2	12	1005136	1005147	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_010617	CCGGCC	2	12	1012609	1012620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_010617	CCCACA	2	12	1052967	1052978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_010617	GCGCAC	2	12	1058473	1058484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
45	NC_010617	GTCGAC	2	12	1072906	1072917	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010617	ACATGC	2	12	1094909	1094920	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010617	GCGTCG	2	12	1101161	1101172	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010617	CCTCGT	2	12	1155121	1155132	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010617	GCCCGC	2	12	1159653	1159664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_010617	CCCACA	2	12	1219408	1219419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_010617	GTCCGG	2	12	1227529	1227540	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010617	CCGCGT	2	12	1259658	1259669	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010617	CACGTC	2	12	1273956	1273967	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010617	CCGTGG	2	12	1274617	1274628	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010617	GCGGCC	2	12	1312070	1312081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_010617	CCCCGC	2	12	1317801	1317812	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_010617	CACACG	2	12	1366575	1366586	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010617	CAGGGG	2	12	1392713	1392724	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_010617	CCCCGG	2	12	1427273	1427284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010617	TGGGGG	2	12	1428781	1428792	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010617	CGACGC	2	12	1466910	1466921	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010617	GCCGGG	2	12	1482885	1482896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010617	GGGTGG	2	12	1512721	1512732	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010617	GGCCGG	2	12	1540344	1540355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010617	TGGTGC	4	24	1563537	1563560	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010617	CCCTGC	2	12	1570966	1570977	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_010617	CGCGGG	2	12	1573351	1573362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010617	ACGAGG	2	12	1583609	1583620	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_010617	GCGACC	2	12	1603240	1603251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_010617	TCGGCC	2	12	1615724	1615735	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010617	GGTCCG	2	12	1648980	1648991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010617	GCCCCG	2	12	1667863	1667874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_010617	CGGGTC	2	12	1686711	1686722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010617	CCGCCT	2	12	1687521	1687532	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_010617	CCGTGA	2	12	1689642	1689653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010617	CGGACC	2	12	1716841	1716852	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010617	GCTGGG	2	12	1793135	1793146	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_010617	GGCGCG	2	12	1799365	1799376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010617	GGAACG	2	12	1838104	1838115	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_010617	GCGCGG	2	12	1843637	1843648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010617	CTCGTG	2	12	1847960	1847971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010617	GAATGC	2	12	1874042	1874053	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010617	GGTGGA	2	12	1885605	1885616	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010617	CTTCCC	2	12	1918828	1918839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_010617	GTGCCA	3	18	1929555	1929572	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010617	CGGGGC	2	12	1935893	1935904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010617	CTCCGG	2	12	1936067	1936078	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
88	NC_010617	GTCACT	2	12	1984558	1984569	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010617	CCCGTC	2	12	2003658	2003669	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_010617	GCCCCG	2	12	2004864	2004875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_010617	CGGCCG	2	12	2014876	2014887	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010617	GCCCGG	2	12	2048015	2048026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010617	GGTCGG	2	12	2080720	2080731	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010617	CCCGCC	2	12	2080959	2080970	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_010617	GCCGGG	2	12	2121422	2121433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010617	CGGCCC	2	12	2147968	2147979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010617	GGCCCG	2	12	2147988	2147999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010617	GGCCAC	2	12	2197559	2197570	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010617	CGAGAA	2	12	2202913	2202924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010617	CCGGGC	2	12	2241419	2241430	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010617	GCCACC	2	12	2241551	2241562	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_010617	GGCGGG	2	12	2244724	2244735	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_010617	GCGGGC	2	12	2253522	2253533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010617	CCGGGC	2	12	2267622	2267633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010617	GCCCCG	2	12	2287957	2287968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010617	CCGGGC	2	12	2296367	2296378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010617	CGGTTC	2	12	2324929	2324940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010617	CCGCAC	2	12	2326838	2326849	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010617	GCCGTC	2	12	2336014	2336025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010617	TGCCCC	2	12	2348197	2348208	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010617	GCCGGG	2	12	2364608	2364619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010617	GGCCCC	2	12	2377788	2377799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_010617	GTCCGG	2	12	2382856	2382867	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010617	TTCTCG	2	12	2395851	2395862	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010617	GGGGCC	2	12	2437415	2437426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010617	CCCGCC	2	12	2515294	2515305	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
117	NC_010617	TTCCGG	4	24	2527313	2527336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010617	AGGGGA	2	12	2559203	2559214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010617	TCGGGT	2	12	2597783	2597794	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010617	CCACCC	2	12	2662724	2662735	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.