MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium marinum M chromosome

Total Repeats: 212

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010612	CCGGAT	2	12	11101	11112	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010612	ATCGGG	2	12	47941	47952	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_010612	CCGTGG	2	12	55633	55644	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010612	GGGCGG	2	12	84871	84882	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010612	AAATGA	2	12	193217	193228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010612	ACACCG	2	12	222859	222870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_010612	CCGCTG	2	12	232250	232261	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010612	GGCCGC	2	12	334528	334539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010612	GGTCGG	2	12	416691	416702	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_010612	CCGCGC	2	12	430848	430859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_010612	GGGGCC	3	18	456945	456962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010612	GTGAAC	2	12	488378	488389	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_010612	GATTCA	2	12	491835	491846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010612	CGGTGC	2	12	507363	507374	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010612	GCCGGG	2	12	535834	535845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010612	CCCGGA	2	12	568432	568443	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010612	GGTTGC	2	12	570799	570810	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_010612	CGGAAA	2	12	574074	574085	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010612	CCCCGA	2	12	597673	597684	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_010612	ATCTGA	2	12	630330	630341	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010612	AAAGCG	2	12	692861	692872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_010612	TGGATT	2	12	763787	763798	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010612	CGGGCA	2	12	800037	800048	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010612	GAGCCG	2	12	804730	804741	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010612	GAGCCG	2	12	804784	804795	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010612	GTATAT	2	12	816461	816472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010612	AAGACG	2	12	857362	857373	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_010612	GCAGAC	2	12	951168	951179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010612	CAACGC	2	12	953345	953356	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_010612	TGGTTG	2	12	982908	982919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010612	ACCAGT	2	12	989377	989388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_010612	CTGACC	2	12	1042319	1042330	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010612	GGCGCG	2	12	1125680	1125691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010612	CCCGGT	2	12	1125695	1125706	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010612	CGAACT	2	12	1125791	1125802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010612	GACTTC	2	12	1207770	1207781	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010612	ATCCTC	2	12	1223346	1223357	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010612	CGCTGA	2	12	1246081	1246092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010612	GCGATC	2	12	1285286	1285297	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010612	CAAAGG	2	12	1316764	1316775	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010612	GGGGGA	2	12	1352438	1352449	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010612	CGGCCG	2	12	1385872	1385883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_010612	CTCGGC	2	12	1479405	1479416	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010612	TGTCAA	2	12	1521604	1521615	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_010612	TGACAA	2	12	1521626	1521637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010612	TGGCCG	2	12	1668801	1668812	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010612	TCGTGG	2	12	1670374	1670385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_010612	CCGACA	2	12	1712579	1712590	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_010612	CGTTGT	2	12	1718946	1718957	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_010612	CGATCC	2	12	1740034	1740045	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010612	CACCGA	2	12	1742435	1742446	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010612	CGTTGT	2	12	1756438	1756449	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010612	CGACGG	2	12	1764286	1764297	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010612	CGGAAG	2	12	1769087	1769098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010612	TGGCCG	2	12	1776918	1776929	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010612	TGCCCA	3	18	1779203	1779220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_010612	GTGGTT	2	12	1895373	1895384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010612	GCGCCG	2	12	1913570	1913581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010612	GCCCGT	2	12	1914844	1914855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010612	CCGGTG	2	12	1916276	1916287	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_010612	CGGTTC	2	12	1916968	1916979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010612	CGGTGC	2	12	1917583	1917594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010612	CGGTGC	2	12	1918276	1918287	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010612	ATGTAC	2	12	1950340	1950351	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010612	GCAGAC	2	12	1999763	1999774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010612	GTCTGC	2	12	1999803	1999814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010612	CGGGTG	2	12	2106576	2106587	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010612	GGCCGC	2	12	2126231	2126242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010612	CGGTGG	2	12	2261690	2261701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_010612	GTCGGC	2	12	2365277	2365288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010612	ATCCGC	2	12	2419555	2419566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010612	CGGCTG	2	12	2431639	2431650	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010612	GAGGGG	2	12	2469756	2469767	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010612	GCCGGG	2	12	2497081	2497092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010612	GCCGGG	2	12	2540085	2540096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010612	GTGGCC	2	12	2575805	2575816	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010612	GACCAC	2	12	2578370	2578381	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010612	CGGCGA	2	12	2583932	2583943	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010612	CCAAAG	2	12	2595305	2595316	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_010612	CGGCGC	2	12	2612031	2612042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_010612	GTCGGC	2	12	2649622	2649633	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010612	GGAAAG	2	12	2664053	2664064	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010612	CGGGGG	2	12	2762035	2762046	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_010612	AGCCGC	2	12	2883870	2883881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010612	ATTGAC	2	12	2886080	2886091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_010612	TCCCAC	2	12	2958601	2958612	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_010612	TGGGTG	2	12	3013577	3013588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010612	GGCAAC	2	12	3088366	3088377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010612	ACCCGA	2	12	3094104	3094115	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_010612	GTGCGC	2	12	3097175	3097186	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010612	ATCGCC	2	12	3107254	3107265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010612	GGGTGC	2	12	3138325	3138336	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_010612	CCCGGT	2	12	3207947	3207958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_010612	CCATGA	2	12	3229367	3229378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010612	CAACTA	2	12	3263305	3263316	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010612	GCCCCG	2	12	3273661	3273672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_010612	CCGGCT	2	12	3275555	3275566	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
98	NC_010612	AGAGGG	2	12	3302685	3302696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010612	GGCATT	2	12	3314274	3314285	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_010612	GCGGCC	2	12	3315501	3315512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010612	GGGCAA	2	12	3340695	3340706	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_010612	CAACCT	2	12	3368947	3368958	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_010612	GCAACC	3	18	3380960	3380977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010612	GCCGGC	2	12	3452127	3452138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010612	GCCCGT	2	12	3452235	3452246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_010612	GGCGCG	2	12	3477337	3477348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010612	GCAGGA	2	12	3480452	3480463	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_010612	GAATGC	2	12	3525122	3525133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_010612	TCCCAG	2	12	3553279	3553290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010612	TTTCCG	2	12	3589532	3589543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010612	TAGCCA	2	12	3591875	3591886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010612	CGGAAA	2	12	3593807	3593818	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_010612	GGAGCC	2	12	3593997	3594008	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010612	GCCATG	2	12	3645388	3645399	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010612	CATCGA	2	12	3706081	3706092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010612	TGTCGC	2	12	3730317	3730328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010612	CACCGC	2	12	3815755	3815766	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010612	CCAACA	2	12	3834871	3834882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_010612	ATACGA	2	12	3848409	3848420	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_010612	ACGCAC	2	12	3851318	3851329	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_010612	AGTTCG	2	12	3851711	3851722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_010612	GCAAGC	2	12	3885992	3886003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010612	CTCAAC	2	12	3889654	3889665	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010612	TAGAGT	2	12	3889668	3889679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010612	TGAGAG	2	12	3925085	3925096	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010612	GACTGT	2	12	3968890	3968901	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_010612	GCCGGG	2	12	4051268	4051279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010612	ACGGTG	2	12	4104221	4104232	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_010612	GCGCGG	2	12	4132518	4132529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010612	CGCGTC	2	12	4160892	4160903	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_010612	TGCCGG	2	12	4178192	4178203	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_010612	CTGCGA	2	12	4182854	4182865	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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138	NC_010612	TAGCTC	2	12	4301650	4301661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010612	TCCCCG	2	12	4307377	4307388	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
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141	NC_010612	TCGCCA	2	12	4339712	4339723	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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143	NC_010612	ACTCCA	2	12	4367994	4368005	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010612	ATCGCC	2	12	4387919	4387930	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010612	GCCTCG	2	12	4390889	4390900	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_010612	CCTGCA	2	12	4408657	4408668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_010612	CCCCCG	2	12	4460829	4460840	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
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155	NC_010612	TCCCGA	2	12	4673981	4673992	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
156	NC_010612	TCGGCG	2	12	4679197	4679208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_010612	TCGGCA	2	12	4791770	4791781	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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212	NC_010612	ACCGCA	2	12	6633598	6633609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.