MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium marinum M chromosome

Total Repeats: 1953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010612	TGTT	2	8	1813	1820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010612	ACCC	2	8	11132	11139	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_010612	GGCC	2	8	13056	13063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010612	AGCG	2	8	26973	26980	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_010612	TGGC	2	8	27262	27269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_010612	ATGT	2	8	32411	32418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010612	ACCT	2	8	32959	32966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010612	CCGG	2	8	38858	38865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_010612	GGGA	2	8	38906	38913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010612	ATTC	2	8	39038	39045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_010612	GTGA	2	8	39046	39053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010612	CCCG	2	8	39502	39509	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13	NC_010612	CAAT	2	8	39527	39534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_010612	GGTG	2	8	47962	47969	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010612	GGGT	2	8	58638	58645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010612	AGCC	2	8	59906	59913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_010612	GCGG	2	8	62495	62502	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_010612	GTTG	2	8	67056	67063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010612	GAAA	2	8	74385	74392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010612	ACAA	2	8	75167	75174	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010612	GGCC	2	8	77605	77612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_010612	CCGA	2	8	77619	77626	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_010612	GTCT	2	8	78491	78498	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_010612	TGCG	2	8	78551	78558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_010612	CGCA	2	8	83960	83967	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_010612	CGGC	2	8	83972	83979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_010612	GCTG	2	8	84068	84075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_010612	AGGA	2	8	87805	87812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010612	CTGA	2	8	88934	88941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010612	CTGG	2	8	132520	132527	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_010612	CCGC	2	8	133835	133842	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_010612	GCCG	2	8	134936	134943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_010612	CGGG	2	8	136889	136896	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010612	GGCC	2	8	136987	136994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010612	CATT	2	8	139619	139626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010612	CTGC	2	8	140728	140735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010612	GCTA	2	8	140736	140743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010612	GGCG	2	8	143292	143299	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010612	CGGG	2	8	147007	147014	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_010612	ATCC	2	8	168217	168224	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_010612	TAGT	2	8	175032	175039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010612	AAGA	2	8	182288	182295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010612	TCGC	2	8	182322	182329	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_010612	GCCC	2	8	187563	187570	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_010612	TGGG	2	8	190047	190054	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010612	CGGC	2	8	190115	190122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010612	CGTA	2	8	190127	190134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_010612	AACA	2	8	214942	214949	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_010612	GACC	2	8	215078	215085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_010612	GCCG	2	8	222748	222755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010612	GTCG	2	8	223421	223428	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010612	CCAG	2	8	223429	223436	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_010612	CCGG	2	8	223447	223454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010612	CCGG	2	8	229912	229919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010612	GGCG	2	8	232308	232315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_010612	CTCC	2	8	243572	243579	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_010612	CCGC	2	8	247348	247355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_010612	CGGT	2	8	247989	247996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010612	GGCT	2	8	251144	251151	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_010612	CTGG	2	8	252578	252585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_010612	GGGT	2	8	257607	257614	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010612	CCGG	2	8	266485	266492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_010612	TCAC	2	8	269358	269365	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010612	CAAT	2	8	274823	274830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_010612	GATT	2	8	274832	274839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010612	AACG	2	8	280788	280795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_010612	GTCA	2	8	281684	281691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_010612	CCGG	2	8	284894	284901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010612	GCGG	2	8	285819	285826	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_010612	TTCC	2	8	294894	294901	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_010612	CGCA	2	8	296405	296412	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010612	GGGC	2	8	297998	298005	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_010612	GGCC	2	8	302879	302886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_010612	CAGT	2	8	308342	308349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010612	CCGG	2	8	309405	309412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_010612	CGAC	2	8	323010	323017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_010612	CGGC	2	8	323313	323320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010612	TCAG	2	8	323441	323448	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_010612	GCGG	2	8	323571	323578	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_010612	GTGC	2	8	327172	327179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010612	GCAC	2	8	342350	342357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_010612	AAAC	2	8	342740	342747	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010612	TGCC	2	8	342886	342893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_010612	GAAT	2	8	343010	343017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010612	CGGC	2	8	348610	348617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_010612	AGCA	2	8	358809	358816	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010612	CGGG	2	8	358823	358830	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010612	CAGC	2	8	364231	364238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010612	GGAG	2	8	368362	368369	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010612	CGGT	2	8	373267	373274	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_010612	CCGC	2	8	376921	376928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_010612	CCGG	2	8	378361	378368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_010612	TCTG	2	8	380290	380297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_010612	CGGC	2	8	381655	381662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010612	GCGG	2	8	408467	408474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
96	NC_010612	GGCC	2	8	411990	411997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_010612	GAGC	2	8	413046	413053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010612	TTCC	2	8	419787	419794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_010612	GGGT	2	8	419826	419833	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010612	GGTG	2	8	430614	430621	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010612	GGCC	2	8	432909	432916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010612	GTGC	2	8	433137	433144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_010612	GGCC	2	8	433157	433164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_010612	GTTC	2	8	436738	436745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010612	GTCG	2	8	441737	441744	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010612	GCCC	2	8	445626	445633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
107	NC_010612	GTTT	2	8	447943	447950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010612	ATCA	2	8	451228	451235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010612	ACAA	2	8	457868	457875	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010612	AGGA	2	8	461697	461704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010612	GCGG	2	8	462932	462939	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_010612	GGCG	2	8	462948	462955	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_010612	GGAT	2	8	463010	463017	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010612	GCTG	2	8	475094	475101	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_010612	CTGC	2	8	475176	475183	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_010612	CTGT	2	8	490990	490997	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_010612	CCGG	2	8	498795	498802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_010612	CAGA	2	8	517613	517620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010612	AAGT	2	8	528422	528429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010612	CGGG	2	8	535805	535812	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010612	GGGC	2	8	536165	536172	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_010612	CGGG	2	8	536197	536204	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010612	GCCG	2	8	536234	536241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010612	TACT	2	8	538275	538282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_010612	GTCG	2	8	542342	542349	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_010612	AGGG	2	8	544674	544681	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010612	GCCG	2	8	546485	546492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_010612	GCCG	2	8	546612	546619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_010612	ACCC	2	8	548873	548880	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_010612	GCTT	2	8	554326	554333	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010612	TGGA	2	8	554475	554482	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010612	CAAC	2	8	554499	554506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_010612	GCAG	2	8	562110	562117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010612	TCAG	2	8	565487	565494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_010612	GAGG	2	8	565679	565686	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010612	GGAT	2	8	568585	568592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010612	TGAG	2	8	569547	569554	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_010612	TTGA	2	8	569883	569890	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010612	GGCC	2	8	570527	570534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010612	AAGG	2	8	571099	571106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010612	GCGG	2	8	578587	578594	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010612	ATCA	2	8	584095	584102	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_010612	GTCG	2	8	590419	590426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010612	ACTT	2	8	596127	596134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_010612	GCCG	2	8	597581	597588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_010612	CTTT	2	8	600845	600852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_010612	GCCC	2	8	611280	611287	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
148	NC_010612	CTGG	2	8	615410	615417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010612	TCGT	2	8	618865	618872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
150	NC_010612	AATC	2	8	621592	621599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_010612	CGGT	2	8	623458	623465	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_010612	GACA	2	8	623552	623559	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_010612	GCTG	2	8	625266	625273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_010612	CAGA	2	8	625342	625349	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_010612	GCGG	2	8	633178	633185	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_010612	CCGT	2	8	633355	633362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
157	NC_010612	GCCG	2	8	661678	661685	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
158	NC_010612	GCTA	2	8	661857	661864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_010612	GATC	2	8	665690	665697	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
160	NC_010612	GCTC	2	8	665792	665799	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_010612	CGAC	2	8	672122	672129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_010612	TAGT	2	8	689844	689851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_010612	CGTC	2	8	705982	705989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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192	NC_010612	GCCC	2	8	800016	800023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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196	NC_010612	GCGA	2	8	804764	804771	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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222	NC_010612	GCCC	2	8	913495	913502	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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245	NC_010612	CGGG	2	8	998665	998672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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251	NC_010612	CAGG	2	8	1049818	1049825	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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260	NC_010612	TCGC	2	8	1087309	1087316	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
261	NC_010612	CGGC	2	8	1104057	1104064	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
262	NC_010612	CCGG	2	8	1105934	1105941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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264	NC_010612	CCTG	2	8	1112306	1112313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
265	NC_010612	CTGG	2	8	1125878	1125885	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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267	NC_010612	CGTG	2	8	1129069	1129076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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271	NC_010612	GGCA	2	8	1157256	1157263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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291	NC_010612	TATC	2	8	1211327	1211334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
292	NC_010612	TGGG	2	8	1212494	1212501	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
293	NC_010612	GCCA	2	8	1212720	1212727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
294	NC_010612	TGCG	2	8	1212884	1212891	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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441	NC_010612	GCGG	2	8	1739744	1739751	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
442	NC_010612	CACC	2	8	1739984	1739991	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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482	NC_010612	CGGG	2	8	1831150	1831157	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
483	NC_010612	ATGC	2	8	1831267	1831274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
484	NC_010612	ACGG	2	8	1839311	1839318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_010612	TGGC	2	8	1839326	1839333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_010612	GCCG	2	8	1863931	1863938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
492	NC_010612	GTGC	2	8	1866786	1866793	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
493	NC_010612	TGAC	2	8	1869363	1869370	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
494	NC_010612	TCGC	2	8	1869568	1869575	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
495	NC_010612	CGGC	2	8	1872893	1872900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
496	NC_010612	CGGA	2	8	1876729	1876736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
497	NC_010612	CTGC	2	8	1880303	1880310	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_010612	TGCT	2	8	1880402	1880409	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_010612	CCGT	2	8	1883960	1883967	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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