MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010610	AATTAA	2	12	2675	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010610	ATTGAA	2	12	90560	90571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010610	ACTACC	2	12	149002	149013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010610	ACAACC	2	12	168209	168220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_010610	TGGAAG	2	12	174015	174026	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010610	CGGTAC	2	12	177886	177897	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010610	ATAGTA	2	12	190956	190967	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010610	TGGAAG	2	12	198279	198290	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010610	GTTGGA	2	12	250358	250369	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010610	CAATTA	2	12	264575	264586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_010610	ATAAGA	2	12	272877	272888	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010610	TGGAAG	2	12	278320	278331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010610	ATCAGC	2	12	278666	278677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010610	TCTTGA	2	12	294669	294680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010610	TAAAAA	2	12	299066	299077	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010610	AAGCGA	2	12	331537	331548	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_010610	AATTTA	2	12	432503	432514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010610	TTCTCT	2	12	456417	456428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_010610	TGACCC	2	12	457395	457406	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_010610	TCGTAG	2	12	463389	463400	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_010610	GCTCGT	2	12	463648	463659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010610	TGGCAA	2	12	472029	472040	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_010610	TAAGCA	2	12	472106	472117	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_010610	GCCAAC	2	12	498006	498017	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_010610	AATTGA	2	12	538898	538909	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010610	GGCAAA	2	12	550106	550117	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_010610	AGAGGT	2	12	559305	559316	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010610	AGTGGC	2	12	588772	588783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_010610	TGGAAG	2	12	655982	655993	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010610	GCCCCC	2	12	727047	727058	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_010610	TATTTT	2	12	745304	745315	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010610	GTTACC	2	12	762268	762279	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010610	TACTAA	2	12	769550	769561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010610	ATCTAA	2	12	775704	775715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_010610	TGTGGT	2	12	787034	787045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010610	AAATCG	2	12	864157	864168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_010610	ATCACT	2	12	900409	900420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010610	GGTCGA	2	12	902861	902872	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_010610	AAAGCA	2	12	907925	907936	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_010610	CGATTT	2	12	915415	915426	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_010610	AAGCTT	2	12	915599	915610	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_010610	AAATCG	2	12	923341	923352	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_010610	GACCAA	2	12	942697	942708	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010610	ATGTGT	2	12	961762	961773	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010610	CTGGGG	2	12	1003377	1003388	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010610	TTTTTG	2	12	1066454	1066465	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010610	ATTAAT	2	12	1081571	1081582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010610	TAATTT	2	12	1087388	1087399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010610	AAAATG	2	12	1098423	1098434	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010610	GTAGGC	2	12	1111970	1111981	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_010610	ATCGCC	2	12	1114187	1114198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_010610	TTAAAT	2	12	1114273	1114284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010610	TCCCGT	2	12	1120453	1120464	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010610	CAAATA	2	12	1165673	1165684	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010610	GTCGAG	2	12	1169271	1169282	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_010610	CTTTTC	2	12	1169772	1169783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010610	GTTTTA	2	12	1171748	1171759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010610	TCGCAG	2	12	1204019	1204030	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010610	CCCGGC	2	12	1224336	1224347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_010610	GACAAG	2	12	1256853	1256864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_010610	ACCCTC	2	12	1303720	1303731	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010610	CTAGGC	2	12	1325371	1325382	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010610	AAATCG	2	12	1351329	1351340	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_010610	TGATCA	2	12	1355083	1355094	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_010610	AAATCG	2	12	1405044	1405055	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_010610	TCCATT	2	12	1477020	1477031	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010610	GTCAAA	2	12	1555445	1555456	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_010610	CACTTC	2	12	1559937	1559948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010610	ATTTGT	2	12	1598918	1598929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010610	ATTTTT	2	12	1600182	1600193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010610	ATGCTT	2	12	1612049	1612060	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_010610	CATCAG	2	12	1635825	1635836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_010610	TAAAAT	2	12	1648441	1648452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010610	CGATTG	2	12	1657558	1657569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010610	GCCAGG	2	12	1665991	1666002	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010610	CTAAGT	2	12	1670313	1670324	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010610	ATTTTA	2	12	1687030	1687041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010610	ATTACT	2	12	1696391	1696402	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_010610	CTCCCC	2	12	1711868	1711879	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
80	NC_010610	TTTGGC	2	12	1731047	1731058	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010610	TTCTCG	2	12	1776509	1776520	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010610	AAATCG	2	12	1783083	1783094	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010610	GTTCCA	2	12	1830336	1830347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010610	CATCCA	2	12	1843526	1843537	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010610	GCGCAA	2	12	1894866	1894877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010610	TTGCAC	2	12	1915669	1915680	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010610	AAAATT	2	12	1956418	1956429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010610	GTTGCG	2	12	1959723	1959734	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_010610	AAATCG	2	12	1960477	1960488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010610	GACGAA	2	12	2029986	2029997	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010610	GCCCGT	2	12	2033679	2033690	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_010610	TAAATA	2	12	2033996	2034007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010610	AAATCG	2	12	2040952	2040963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_010610	AATTTT	2	12	2052792	2052803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010610	AAATTA	2	12	2068843	2068854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.