MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 1310

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010610	ACCAC	2	10	1211	1220	40 %	0 %	0 %	60 %	184154477
2	NC_010610	ATTCT	2	10	8791	8800	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_010610	CCCAA	2	10	9757	9766	40 %	0 %	0 %	60 %	184154484
4	NC_010610	AAAGA	2	10	9942	9951	80 %	0 %	20 %	0 %	184154484
5	NC_010610	TATGA	2	10	10291	10300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010610	CGGCG	2	10	13216	13225	0 %	0 %	60 %	40 %	184154488
7	NC_010610	CATGT	2	10	16167	16176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_010610	GGGCT	2	10	18764	18773	0 %	20 %	60 %	20 %	184154492
9	NC_010610	TGGGG	2	10	21227	21236	0 %	20 %	80 %	0 %	184154495
10	NC_010610	AGCGA	2	10	24890	24899	40 %	0 %	40 %	20 %	184154499
11	NC_010610	TGGAG	2	10	26108	26117	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010610	CGGAC	2	10	26344	26353	20 %	0 %	40 %	40 %	184154500
13	NC_010610	TAGGA	2	10	30832	30841	40 %	20 %	40 %	0 %	184154503
14	NC_010610	GACAA	2	10	31875	31884	60 %	0 %	20 %	20 %	184154504
15	NC_010610	CGCCC	2	10	32786	32795	0 %	0 %	20 %	80 %	184154505
16	NC_010610	CAGGT	2	10	32859	32868	20 %	20 %	40 %	20 %	184154505
17	NC_010610	GGCTT	2	10	34855	34864	0 %	40 %	40 %	20 %	184154507
18	NC_010610	TTGGA	2	10	35253	35262	20 %	40 %	40 %	0 %	184154507
19	NC_010610	ACCCA	2	10	36651	36660	40 %	0 %	0 %	60 %	184154509
20	NC_010610	TGAAG	2	10	38383	38392	40 %	20 %	40 %	0 %	184154509
21	NC_010610	AGTGA	2	10	38791	38800	40 %	20 %	40 %	0 %	184154510
22	NC_010610	GCCCC	2	10	39139	39148	0 %	0 %	20 %	80 %	184154511
23	NC_010610	GTCCT	2	10	41023	41032	0 %	40 %	20 %	40 %	184154512
24	NC_010610	GCGAA	2	10	42166	42175	40 %	0 %	40 %	20 %	184154512
25	NC_010610	TGACC	2	10	43821	43830	20 %	20 %	20 %	40 %	184154512
26	NC_010610	GGGGC	2	10	43831	43840	0 %	0 %	80 %	20 %	184154512
27	NC_010610	GGCCT	2	10	44428	44437	0 %	20 %	40 %	40 %	184154512
28	NC_010610	GGCGA	2	10	47089	47098	20 %	0 %	60 %	20 %	184154513
29	NC_010610	GGCTT	2	10	47240	47249	0 %	40 %	40 %	20 %	184154513
30	NC_010610	CTGAC	2	10	47426	47435	20 %	20 %	20 %	40 %	184154513
31	NC_010610	GGTCA	2	10	48175	48184	20 %	20 %	40 %	20 %	184154513
32	NC_010610	CAATT	2	10	50577	50586	40 %	40 %	0 %	20 %	184154515
33	NC_010610	AAGTT	2	10	57248	57257	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010610	GCCCC	2	10	58909	58918	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
35	NC_010610	ATTGG	2	10	62247	62256	20 %	40 %	40 %	0 %	184154526
36	NC_010610	CCAAA	2	10	63998	64007	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010610	GCGCC	2	10	64552	64561	0 %	0 %	40 %	60 %	184154527
38	NC_010610	GACCG	2	10	64933	64942	20 %	0 %	40 %	40 %	184154527
39	NC_010610	CTGGG	2	10	64979	64988	0 %	20 %	60 %	20 %	184154527
40	NC_010610	GGTTT	2	10	65978	65987	0 %	60 %	40 %	0 %	184154528
41	NC_010610	GGCCT	2	10	66067	66076	0 %	20 %	40 %	40 %	184154528
42	NC_010610	AGCGA	2	10	67279	67288	40 %	0 %	40 %	20 %	184154528
43	NC_010610	AACGA	2	10	68907	68916	60 %	0 %	20 %	20 %	184154530
44	NC_010610	TTTGG	2	10	69848	69857	0 %	60 %	40 %	0 %	184154531
45	NC_010610	GGCCG	2	10	72206	72215	0 %	0 %	60 %	40 %	184154533
46	NC_010610	TTGGT	2	10	72843	72852	0 %	60 %	40 %	0 %	184154533
47	NC_010610	CCAGC	2	10	73063	73072	20 %	0 %	20 %	60 %	184154533
48	NC_010610	GTAAT	2	10	73887	73896	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010610	ACCAG	2	10	76163	76172	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_010610	GGCTA	2	10	76325	76334	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010610	TGATC	2	10	79279	79288	20 %	40 %	20 %	20 %	184154539
52	NC_010610	TGCGG	2	10	80400	80409	0 %	20 %	60 %	20 %	184154539
53	NC_010610	AAAGA	2	10	83673	83682	80 %	0 %	20 %	0 %	184154541
54	NC_010610	TTCCG	2	10	86375	86384	0 %	40 %	20 %	40 %	184154542
55	NC_010610	GCCGT	2	10	86873	86882	0 %	20 %	40 %	40 %	184154542
56	NC_010610	AGTTC	2	10	88110	88119	20 %	40 %	20 %	20 %	184154543
57	NC_010610	GATTA	2	10	90035	90044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010610	ACTTT	2	10	90289	90298	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010610	AAATT	2	10	92847	92856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010610	CACAT	2	10	94589	94598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_010610	ATTTG	2	10	96172	96181	20 %	60 %	20 %	0 %	184154549
62	NC_010610	ATTAA	2	10	97245	97254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010610	CTTGG	2	10	97393	97402	0 %	40 %	40 %	20 %	184154550
64	NC_010610	TAAAA	2	10	98668	98677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010610	GGAAA	2	10	99800	99809	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010610	AAGCC	2	10	100021	100030	40 %	0 %	20 %	40 %	184154551
67	NC_010610	TTGGA	2	10	100820	100829	20 %	40 %	40 %	0 %	184154552
68	NC_010610	CCGCC	2	10	101542	101551	0 %	0 %	20 %	80 %	184154553
69	NC_010610	GGAAG	2	10	110774	110783	40 %	0 %	60 %	0 %	184154562
70	NC_010610	GTTCC	2	10	112371	112380	0 %	40 %	20 %	40 %	184154564
71	NC_010610	CGCCA	2	10	112576	112585	20 %	0 %	20 %	60 %	184154564
72	NC_010610	ACTAT	2	10	116499	116508	40 %	40 %	0 %	20 %	184154568
73	NC_010610	GTTTT	2	10	117267	117276	0 %	80 %	20 %	0 %	184154569
74	NC_010610	GTTGC	2	10	117618	117627	0 %	40 %	40 %	20 %	184154569
75	NC_010610	GCTTG	2	10	120942	120951	0 %	40 %	40 %	20 %	184154572
76	NC_010610	GTTAA	2	10	121197	121206	40 %	40 %	20 %	0 %	184154573
77	NC_010610	AATTT	2	10	125237	125246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010610	AATTT	2	10	125632	125641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010610	TTCGT	2	10	126077	126086	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_010610	AGGGG	2	10	128332	128341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010610	TAGTT	2	10	129451	129460	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010610	AGGTG	2	10	129521	129530	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010610	AAGGT	2	10	130056	130065	40 %	20 %	40 %	0 %	184154581
84	NC_010610	AAAGA	2	10	134851	134860	80 %	0 %	20 %	0 %	184154585
85	NC_010610	ATCAA	2	10	135081	135090	60 %	20 %	0 %	20 %	184154586
86	NC_010610	GATGG	2	10	135940	135949	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010610	CGGTA	2	10	136662	136671	20 %	20 %	40 %	20 %	184154588
88	NC_010610	TCAAA	2	10	137248	137257	60 %	20 %	0 %	20 %	184154590
89	NC_010610	GCGCT	2	10	137306	137315	0 %	20 %	40 %	40 %	184154590
90	NC_010610	GGACA	2	10	137637	137646	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_010610	GTGAA	2	10	137849	137858	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010610	TTCAC	2	10	137888	137897	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010610	GGGAA	2	10	140765	140774	40 %	0 %	60 %	0 %	184154593
94	NC_010610	GCTGG	2	10	141987	141996	0 %	20 %	60 %	20 %	184154593
95	NC_010610	TAATC	2	10	142434	142443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_010610	CCGGA	2	10	145155	145164	20 %	0 %	40 %	40 %	184154596
97	NC_010610	CGATT	2	10	148159	148168	20 %	40 %	20 %	20 %	184154598
98	NC_010610	AACCA	2	10	148220	148229	60 %	0 %	0 %	40 %	184154598
99	NC_010610	CGGTA	2	10	148798	148807	20 %	20 %	40 %	20 %	184154599
100	NC_010610	CGAAC	2	10	152029	152038	40 %	0 %	20 %	40 %	184154603
101	NC_010610	GGCCA	2	10	152756	152765	20 %	0 %	40 %	40 %	184154603
102	NC_010610	CACCC	2	10	152768	152777	20 %	0 %	0 %	80 %	184154603
103	NC_010610	ACACG	2	10	155003	155012	40 %	0 %	20 %	40 %	184154605
104	NC_010610	GAGAA	2	10	156026	156035	60 %	0 %	40 %	0 %	184154606
105	NC_010610	AAAGC	2	10	158282	158291	60 %	0 %	20 %	20 %	184154608
106	NC_010610	CGGGG	2	10	159326	159335	0 %	0 %	80 %	20 %	184154608
107	NC_010610	ATTAC	2	10	161326	161335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_010610	GCAAG	2	10	161806	161815	40 %	0 %	40 %	20 %	184154611
109	NC_010610	CTAAA	2	10	163678	163687	60 %	20 %	0 %	20 %	184154613
110	NC_010610	AATTT	2	10	165444	165453	40 %	60 %	0 %	0 %	184154614
111	NC_010610	GGTAA	2	10	165479	165488	40 %	20 %	40 %	0 %	184154614
112	NC_010610	GGCCT	2	10	167069	167078	0 %	20 %	40 %	40 %	184154616
113	NC_010610	TCGTG	2	10	170487	170496	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_010610	GGGAG	2	10	171689	171698	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010610	AATTG	2	10	173193	173202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010610	CTTTC	2	10	174278	174287	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_010610	ACCAC	2	10	177922	177931	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
118	NC_010610	GCCAA	2	10	180014	180023	40 %	0 %	20 %	40 %	184154624
119	NC_010610	CTTAG	2	10	181768	181777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_010610	TTGGG	2	10	182885	182894	0 %	40 %	60 %	0 %	184154625
121	NC_010610	CCCAG	2	10	184305	184314	20 %	0 %	20 %	60 %	184154626
122	NC_010610	GACCC	2	10	184373	184382	20 %	0 %	20 %	60 %	184154626
123	NC_010610	CTTTG	2	10	184603	184612	0 %	60 %	20 %	20 %	184154626
124	NC_010610	TCAAA	2	10	193462	193471	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_010610	TCGTG	2	10	194751	194760	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_010610	GGGAG	2	10	195953	195962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010610	AATTG	2	10	197457	197466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010610	ATTGT	2	10	199952	199961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010610	GGAAT	2	10	203128	203137	40 %	20 %	40 %	0 %	184154636
130	NC_010610	AAGGA	2	10	203321	203330	60 %	0 %	40 %	0 %	184154636
131	NC_010610	TGCTT	2	10	205176	205185	0 %	60 %	20 %	20 %	184154637
132	NC_010610	ATCCG	2	10	206709	206718	20 %	20 %	20 %	40 %	184154639
133	NC_010610	AGGGC	2	10	206864	206873	20 %	0 %	60 %	20 %	184154639
134	NC_010610	ACCAA	2	10	207633	207642	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_010610	GGACC	2	10	210368	210377	20 %	0 %	40 %	40 %	184154644
136	NC_010610	TTGGT	2	10	213621	213630	0 %	60 %	40 %	0 %	184154646
137	NC_010610	ACCGG	2	10	214077	214086	20 %	0 %	40 %	40 %	184154646
138	NC_010610	TGCTT	2	10	214245	214254	0 %	60 %	20 %	20 %	184154646
139	NC_010610	CACGA	2	10	217302	217311	40 %	0 %	20 %	40 %	184154650
140	NC_010610	CAAAT	2	10	218121	218130	60 %	20 %	0 %	20 %	184154651
141	NC_010610	CCGAT	2	10	219914	219923	20 %	20 %	20 %	40 %	184154653
142	NC_010610	CGATT	2	10	220356	220365	20 %	40 %	20 %	20 %	184154653
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146	NC_010610	AAGCT	2	10	227214	227223	40 %	20 %	20 %	20 %	184154658
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152	NC_010610	AACTG	2	10	236051	236060	40 %	20 %	20 %	20 %	184154666
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156	NC_010610	GACAA	2	10	242190	242199	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_010610	TTAAT	2	10	243924	243933	40 %	60 %	0 %	0 %	184154674
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159	NC_010610	TGATA	2	10	245844	245853	40 %	40 %	20 %	0 %	184154676
160	NC_010610	GCCGG	2	10	247025	247034	0 %	0 %	60 %	40 %	184154678
161	NC_010610	CCAAC	2	10	247216	247225	40 %	0 %	0 %	60 %	184154678
162	NC_010610	CGTAC	2	10	247770	247779	20 %	20 %	20 %	40 %	184154678
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164	NC_010610	GTTTA	2	10	251561	251570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_010610	CTTGT	2	10	251731	251740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
166	NC_010610	ACGTC	2	10	252049	252058	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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184	NC_010610	AATTT	2	10	282736	282745	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_010610	TGGTG	2	10	284277	284286	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
186	NC_010610	GCCTG	2	10	284297	284306	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
187	NC_010610	CCGAT	2	10	284414	284423	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
188	NC_010610	GCCTT	2	10	284816	284825	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
189	NC_010610	CGCTT	2	10	286303	286312	0 %	40 %	20 %	40 %	184154703
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198	NC_010610	AAAAT	2	10	303509	303518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_010610	TAATA	2	10	306141	306150	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_010610	ATTGA	2	10	307965	307974	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
203	NC_010610	GTCGG	2	10	308177	308186	0 %	20 %	60 %	20 %	184154718
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219	NC_010610	TACGT	2	10	342377	342386	20 %	40 %	20 %	20 %	184154752
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239	NC_010610	AACGT	2	10	368264	368273	40 %	20 %	20 %	20 %	184154774
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262	NC_010610	GGCTA	2	10	398584	398593	20 %	20 %	40 %	20 %	184154805
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268	NC_010610	GGTTA	2	10	415678	415687	20 %	40 %	40 %	0 %	184154822
269	NC_010610	GGATC	2	10	415762	415771	20 %	20 %	40 %	20 %	184154822
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271	NC_010610	TGGGT	2	10	417359	417368	0 %	40 %	60 %	0 %	184154823
272	NC_010610	CCCGT	2	10	417403	417412	0 %	20 %	20 %	60 %	184154823
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400	NC_010610	TTGGC	2	10	599475	599484	0 %	40 %	40 %	20 %	184154982
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402	NC_010610	GGCCC	2	10	601262	601271	0 %	0 %	40 %	60 %	184154983
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497	NC_010610	GCAAT	2	10	759781	759790	40 %	20 %	20 %	20 %	184155133
498	NC_010610	TTGCT	2	10	762356	762365	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
499	NC_010610	TGGAA	2	10	770252	770261	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
500	NC_010610	ATTTG	2	10	770431	770440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

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