MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 5056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010610	CTA	2	6	1423	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010610	ACT	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010610	TTA	2	6	1445	1450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010610	GGA	2	6	1469	1474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010610	GAG	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010610	ACG	2	6	8814	8819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_010610	AGG	2	6	8868	8873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010610	AGA	2	6	9195	9200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010610	ACT	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010610	TGT	2	6	14327	14332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010610	TTC	2	6	15937	15942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_010610	ACA	2	6	16004	16009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010610	TTA	2	6	16188	16193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010610	GAA	2	6	16300	16305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010610	TAG	2	6	21833	21838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010610	TGG	2	6	23369	23374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010610	TGG	2	6	23440	23445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010610	TTG	2	6	23564	23569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010610	AGT	2	6	24264	24269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010610	ATT	2	6	24348	24353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010610	GAG	2	6	25960	25965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010610	GAG	2	6	26092	26097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010610	GCG	2	6	32357	32362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010610	TAA	2	6	33326	33331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010610	TTC	2	6	33443	33448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010610	ATA	2	6	33561	33566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010610	ACC	2	6	35915	35920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_010610	GAG	2	6	40494	40499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010610	ATA	2	6	40507	40512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010610	CCG	2	6	40548	40553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_010610	TAA	2	6	40574	40579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010610	GTC	2	6	40718	40723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010610	CAA	2	6	40728	40733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010610	ATA	2	6	49533	49538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010610	GCC	2	6	49612	49617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010610	GGT	2	6	49628	49633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010610	GAA	2	6	49660	49665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010610	TTC	2	6	51488	51493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_010610	TGG	2	6	51574	51579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010610	TAT	2	6	53852	53857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010610	CAA	2	6	53876	53881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010610	AAT	2	6	53887	53892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010610	GGT	2	6	54519	54524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010610	GAA	2	6	54553	54558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010610	TAG	2	6	54596	54601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010610	TCT	2	6	54698	54703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010610	CCA	2	6	54711	54716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010610	TGG	2	6	54863	54868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010610	ATC	2	6	54887	54892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010610	GCG	2	6	54999	55004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010610	TGG	2	6	55078	55083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010610	CGG	2	6	55138	55143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010610	AAG	2	6	55146	55151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010610	GTT	2	6	55162	55167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010610	GTA	3	9	55382	55390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010610	TTC	2	6	55418	55423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010610	TCA	2	6	55548	55553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010610	AAC	2	6	55685	55690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010610	GTA	2	6	55715	55720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010610	ATT	2	6	57176	57181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010610	CCA	2	6	57188	57193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_010610	AAC	2	6	57351	57356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010610	ATT	2	6	57363	57368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010610	AGG	2	6	57370	57375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010610	GGC	2	6	58887	58892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010610	AAT	2	6	58931	58936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010610	GCC	2	6	58993	58998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_010610	AGG	2	6	59692	59697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010610	CCG	2	6	61130	61135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_010610	AAG	2	6	61214	61219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010610	CTT	2	6	61272	61277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010610	TTA	2	6	61378	61383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010610	GGT	2	6	61395	61400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010610	CTG	2	6	61450	61455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010610	CCA	2	6	62059	62064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010610	CGA	2	6	63918	63923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010610	GGT	2	6	64009	64014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010610	ATT	3	9	64111	64119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010610	CCT	2	6	64149	64154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_010610	CGC	2	6	64188	64193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_010610	CAA	2	6	64200	64205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010610	CGA	2	6	64278	64283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010610	TTG	2	6	67356	67361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010610	TGG	2	6	67467	67472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010610	GAG	2	6	67573	67578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010610	GGT	2	6	67605	67610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010610	GGT	2	6	67621	67626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010610	CCT	2	6	70372	70377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_010610	GGA	2	6	70468	70473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010610	CAA	2	6	71657	71662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010610	TGT	2	6	71681	71686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010610	TGC	2	6	71764	71769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010610	GAG	2	6	71792	71797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010610	TAA	2	6	71813	71818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010610	TGG	2	6	73555	73560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010610	GGT	2	6	73709	73714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010610	TGA	2	6	73842	73847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010610	ATT	2	6	73900	73905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010610	TAC	2	6	75576	75581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010610	AGT	2	6	75616	75621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010610	CAG	2	6	75630	75635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010610	ACT	2	6	75667	75672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010610	AAG	2	6	75748	75753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010610	GTG	2	6	75834	75839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010610	CTC	2	6	75855	75860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_010610	GCA	2	6	75997	76002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_010610	GGT	2	6	76055	76060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010610	GTC	2	6	76101	76106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010610	TCA	2	6	76132	76137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_010610	CCG	2	6	76138	76143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_010610	CGC	2	6	76184	76189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010610	ATG	2	6	76300	76305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010610	CGA	2	6	76308	76313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010610	GAG	2	6	76354	76359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010610	GAT	2	6	80835	80840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010610	TAT	2	6	80874	80879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010610	TGA	2	6	80970	80975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010610	AGG	2	6	81062	81067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010610	GTG	2	6	85409	85414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010610	TGG	2	6	85472	85477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010610	GGT	2	6	85518	85523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010610	AGG	2	6	85585	85590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010610	AAC	2	6	86910	86915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010610	CTG	2	6	86923	86928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010610	GTT	2	6	86929	86934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010610	ACC	2	6	87216	87221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_010610	GGT	2	6	87229	87234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010610	CAG	2	6	87329	87334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010610	GTG	2	6	88411	88416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010610	GAG	2	6	88444	88449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010610	ATT	2	6	88611	88616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010610	TCC	2	6	89912	89917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010610	ACC	2	6	89993	89998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_010610	ACC	2	6	90093	90098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_010610	AGT	2	6	90322	90327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010610	TGG	2	6	90441	90446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010610	TTC	2	6	92601	92606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010610	AAC	2	6	92650	92655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010610	GAA	2	6	92682	92687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010610	AGG	2	6	92739	92744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010610	AGT	2	6	92795	92800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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