MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus fermentum IFO 3956

Total Repeats: 26027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010610	ACC	2	6	146	151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154477
2	NC_010610	AGC	2	6	164	169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154477
3	NC_010610	GTC	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154477
4	NC_010610	CGC	2	6	266	271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154477
5	NC_010610	ATG	2	6	355	360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154477
6	NC_010610	AAC	2	6	472	477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154477
7	NC_010610	CCG	2	6	579	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154477
8	NC_010610	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154477
9	NC_010610	TTC	2	6	628	633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154477
10	NC_010610	ACA	2	6	689	694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154477
11	NC_010610	GAA	2	6	844	849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154477
12	NC_010610	ACG	2	6	869	874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154477
13	NC_010610	TGA	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154477
14	NC_010610	CCA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154477
15	NC_010610	ACG	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154477
16	NC_010610	ACA	2	6	1073	1078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154477
17	NC_010610	TCG	2	6	1121	1126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154477
18	NC_010610	CGG	2	6	1200	1205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154477
19	NC_010610	AAG	2	6	1259	1264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154477
20	NC_010610	CAA	2	6	1523	1528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154478
21	NC_010610	TTC	2	6	1544	1549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154478
22	NC_010610	GTC	2	6	1587	1592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154478
23	NC_010610	ACA	2	6	1594	1599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154478
24	NC_010610	AGA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154478
25	NC_010610	TTC	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154478
26	NC_010610	AAG	2	6	1737	1742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154478
27	NC_010610	CAA	2	6	1752	1757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154478
28	NC_010610	CGG	2	6	1807	1812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154478
29	NC_010610	GCT	2	6	1872	1877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154478
30	NC_010610	GCG	2	6	1890	1895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154478
31	NC_010610	GAT	2	6	2117	2122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154478
32	NC_010610	ACG	2	6	2262	2267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154478
33	NC_010610	GGC	2	6	2294	2299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154478
34	NC_010610	CGT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154478
35	NC_010610	CCA	2	6	2324	2329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154478
36	NC_010610	CGT	2	6	2342	2347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154478
37	NC_010610	GAA	2	6	2418	2423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154478
38	NC_010610	ACG	2	6	2535	2540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154478
39	NC_010610	AGA	2	6	2899	2904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154479
40	NC_010610	CAT	2	6	2908	2913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154479
41	NC_010610	GCT	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154479
42	NC_010610	GAT	2	6	2978	2983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154479
43	NC_010610	GAA	2	6	2992	2997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154479
44	NC_010610	GTC	2	6	3023	3028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154479
45	NC_010610	GTT	2	6	3041	3046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154479
46	NC_010610	GAT	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154480
47	NC_010610	GCG	2	6	3282	3287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154480
48	NC_010610	GCC	2	6	3306	3311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154480
49	NC_010610	CCA	2	6	3333	3338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
50	NC_010610	ACC	2	6	3360	3365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
51	NC_010610	CAG	2	6	3533	3538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154480
52	NC_010610	CAA	2	6	3581	3586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154480
53	NC_010610	AGT	2	6	3643	3648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154480
54	NC_010610	GGC	2	6	3688	3693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154480
55	NC_010610	ACC	2	6	3702	3707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
56	NC_010610	AGA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154480
57	NC_010610	GCC	2	6	3804	3809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154480
58	NC_010610	GAG	2	6	3824	3829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154480
59	NC_010610	ACC	2	6	3938	3943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
60	NC_010610	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154480
61	NC_010610	GAC	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154480
62	NC_010610	GAC	2	6	4040	4045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154480
63	NC_010610	CAC	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
64	NC_010610	CAC	2	6	4136	4141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154480
65	NC_010610	AGG	2	6	4179	4184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154480
66	NC_010610	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154481
67	NC_010610	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154481
68	NC_010610	ACG	2	6	4241	4246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154481
69	NC_010610	CCA	2	6	4313	4318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154481
70	NC_010610	CAC	2	6	4333	4338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154481
71	NC_010610	TCG	2	6	4352	4357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154481
72	NC_010610	CGA	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154481
73	NC_010610	TGA	2	6	4392	4397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154481
74	NC_010610	TTG	2	6	4409	4414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154481
75	NC_010610	ATC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154481
76	NC_010610	TCC	2	6	4514	4519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154481
77	NC_010610	CGG	2	6	4542	4547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154481
78	NC_010610	GTC	2	6	4588	4593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154481
79	NC_010610	TAC	2	6	4645	4650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154481
80	NC_010610	GAC	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154481
81	NC_010610	ACA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154481
82	NC_010610	AAC	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154481
83	NC_010610	CCG	2	6	5195	5200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154481
84	NC_010610	ATG	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154481
85	NC_010610	TCG	2	6	5348	5353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154481
86	NC_010610	CGC	2	6	5385	5390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154481
87	NC_010610	AAG	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154481
88	NC_010610	CCT	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154481
89	NC_010610	GAA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154481
90	NC_010610	CGA	2	6	5673	5678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154481
91	NC_010610	CAA	2	6	5688	5693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154481
92	NC_010610	ATC	2	6	5713	5718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154481
93	NC_010610	TGT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154481
94	NC_010610	GAT	2	6	5793	5798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154481
95	NC_010610	GCC	2	6	5826	5831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154481
96	NC_010610	GGT	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154481
97	NC_010610	AAC	2	6	5969	5974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154481
98	NC_010610	GCC	2	6	6040	6045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154481
99	NC_010610	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154481
100	NC_010610	GAA	2	6	6103	6108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154481
101	NC_010610	AAG	2	6	6362	6367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
102	NC_010610	GCC	2	6	6524	6529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
103	NC_010610	TGC	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154482
104	NC_010610	CAA	2	6	6586	6591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154482
105	NC_010610	ACG	2	6	6618	6623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154482
106	NC_010610	TGA	2	6	6762	6767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154482
107	NC_010610	TGA	2	6	6795	6800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154482
108	NC_010610	GAG	2	6	6917	6922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154482
109	NC_010610	TCG	2	6	6945	6950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154482
110	NC_010610	ACG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154482
111	NC_010610	TCG	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154482
112	NC_010610	AAC	2	6	7121	7126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154482
113	NC_010610	TAC	2	6	7226	7231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154482
114	NC_010610	AAG	3	9	7242	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
115	NC_010610	CGG	2	6	7259	7264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154482
116	NC_010610	TCG	2	6	7305	7310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154482
117	NC_010610	ATC	2	6	7346	7351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154482
118	NC_010610	CAT	2	6	7354	7359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154482
119	NC_010610	GAC	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154482
120	NC_010610	GCC	2	6	7514	7519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
121	NC_010610	CCA	2	6	7546	7551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154482
122	NC_010610	GAA	3	9	7673	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
123	NC_010610	CAT	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154482
124	NC_010610	GAC	2	6	7793	7798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154482
125	NC_010610	CTT	2	6	7843	7848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154482
126	NC_010610	GCC	2	6	7907	7912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
127	NC_010610	CCT	2	6	7933	7938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154482
128	NC_010610	CCG	2	6	7965	7970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
129	NC_010610	AGA	2	6	7990	7995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
130	NC_010610	CTT	2	6	8014	8019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184154482
131	NC_010610	TGA	2	6	8113	8118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154482
132	NC_010610	CGC	2	6	8182	8187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
133	NC_010610	CCG	3	9	8226	8234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154482
134	NC_010610	AAG	2	6	8336	8341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
135	NC_010610	ACC	2	6	8435	8440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154482
136	NC_010610	TGG	2	6	8463	8468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154482
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139	NC_010610	GAA	2	6	8636	8641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154482
140	NC_010610	GAA	2	6	8932	8937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154483
141	NC_010610	CGA	2	6	9138	9143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154483
142	NC_010610	GTA	2	6	9230	9235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154484
143	NC_010610	CGG	2	6	9347	9352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184154484
144	NC_010610	CAG	2	6	9390	9395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154484
145	NC_010610	TCG	2	6	9429	9434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154484
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148	NC_010610	TGG	2	6	9556	9561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184154484
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151	NC_010610	AAC	2	6	9602	9607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184154484
152	NC_010610	CTC	2	6	9663	9668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184154484
153	NC_010610	AAT	2	6	9671	9676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184154484
154	NC_010610	GCT	2	6	9815	9820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154484
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156	NC_010610	CGC	2	6	9853	9858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154484
157	NC_010610	TCA	2	6	9920	9925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154484
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159	NC_010610	CGT	2	6	9994	9999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154485
160	NC_010610	CGT	2	6	10006	10011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154485
161	NC_010610	CGC	2	6	10032	10037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154485
162	NC_010610	CGC	2	6	10150	10155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184154485
163	NC_010610	TGC	2	6	10193	10198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154485
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166	NC_010610	AAG	2	6	10599	10604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184154486
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250	NC_010610	TGA	2	6	15495	15500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184154489
251	NC_010610	TAC	2	6	15527	15532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154489
252	NC_010610	GGA	2	6	15624	15629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154490
253	NC_010610	CTA	2	6	15634	15639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184154490
254	NC_010610	CCA	2	6	15701	15706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154490
255	NC_010610	ACG	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154490
256	NC_010610	CCA	2	6	15822	15827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184154490
257	NC_010610	ACG	2	6	15842	15847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154490
258	NC_010610	GTT	2	6	16353	16358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184154491
259	NC_010610	AGG	2	6	16405	16410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184154491
260	NC_010610	GTC	2	6	16419	16424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184154491
261	NC_010610	ACG	2	6	16432	16437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184154491
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