MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 1437

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	TATAA	2	10	1078	1087	60 %	40 %	0 %	0 %	184152656
2	NC_010609	GTTAA	2	10	2366	2375	40 %	40 %	20 %	0 %	184152657
3	NC_010609	TGTTT	2	10	2681	2690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010609	AAGAT	2	10	3057	3066	60 %	20 %	20 %	0 %	184152658
5	NC_010609	AGCAA	2	10	5576	5585	60 %	0 %	20 %	20 %	184152660
6	NC_010609	AATCA	2	10	7626	7635	60 %	20 %	0 %	20 %	184152661
7	NC_010609	AGTAA	2	10	9245	9254	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010609	TGATA	2	10	10267	10276	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010609	AGATG	2	10	13407	13416	40 %	20 %	40 %	0 %	184152667
10	NC_010609	GACAA	2	10	13934	13943	60 %	0 %	20 %	20 %	184152667
11	NC_010609	AAAAT	2	10	17120	17129	80 %	20 %	0 %	0 %	184152670
12	NC_010609	AAAAT	2	10	17169	17178	80 %	20 %	0 %	0 %	184152670
13	NC_010609	AAACC	2	10	19649	19658	60 %	0 %	0 %	40 %	184152672
14	NC_010609	AGCAG	2	10	21545	21554	40 %	0 %	40 %	20 %	184152674
15	NC_010609	TTCAT	2	10	23275	23284	20 %	60 %	0 %	20 %	184152675
16	NC_010609	CACGA	2	10	23321	23330	40 %	0 %	20 %	40 %	184152675
17	NC_010609	TAATT	2	10	23454	23463	40 %	60 %	0 %	0 %	184152675
18	NC_010609	GGATC	2	10	23787	23796	20 %	20 %	40 %	20 %	184152675
19	NC_010609	ATATT	2	10	24711	24720	40 %	60 %	0 %	0 %	184152676
20	NC_010609	ATGGA	2	10	25609	25618	40 %	20 %	40 %	0 %	184152677
21	NC_010609	ACAAT	2	10	29264	29273	60 %	20 %	0 %	20 %	184152680
22	NC_010609	AAAAG	2	10	30081	30090	80 %	0 %	20 %	0 %	184152681
23	NC_010609	TACCT	2	10	30438	30447	20 %	40 %	0 %	40 %	184152681
24	NC_010609	GATTT	2	10	30619	30628	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010609	TTAGT	2	10	31288	31297	20 %	60 %	20 %	0 %	184152683
26	NC_010609	ACCTA	2	10	35727	35736	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_010609	AAATT	2	10	35814	35823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010609	AAAAG	2	10	36932	36941	80 %	0 %	20 %	0 %	184152688
29	NC_010609	AATAT	2	10	37712	37721	60 %	40 %	0 %	0 %	184152689
30	NC_010609	ATGGG	2	10	37985	37994	20 %	20 %	60 %	0 %	184152689
31	NC_010609	GTTTT	2	10	38892	38901	0 %	80 %	20 %	0 %	184152690
32	NC_010609	CGTGA	2	10	39711	39720	20 %	20 %	40 %	20 %	184152691
33	NC_010609	TTCTC	2	10	40131	40140	0 %	60 %	0 %	40 %	184152691
34	NC_010609	TCAAC	2	10	41151	41160	40 %	20 %	0 %	40 %	184152692
35	NC_010609	TAGTT	2	10	41355	41364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010609	ACAAA	2	10	42199	42208	80 %	0 %	0 %	20 %	184152693
37	NC_010609	GTTGG	2	10	45922	45931	0 %	40 %	60 %	0 %	184152696
38	NC_010609	ATTTA	2	10	46863	46872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010609	ATTTA	2	10	46875	46884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010609	CAAGA	2	10	47142	47151	60 %	0 %	20 %	20 %	184152697
41	NC_010609	AAAAT	2	10	47278	47287	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010609	AAGGT	2	10	48565	48574	40 %	20 %	40 %	0 %	184152698
43	NC_010609	CAAGC	2	10	51010	51019	40 %	0 %	20 %	40 %	184152699
44	NC_010609	TTAAC	2	10	52132	52141	40 %	40 %	0 %	20 %	184152699
45	NC_010609	AAGAT	2	10	54965	54974	60 %	20 %	20 %	0 %	184152701
46	NC_010609	TTGCA	2	10	55022	55031	20 %	40 %	20 %	20 %	184152701
47	NC_010609	TTAAA	2	10	55385	55394	60 %	40 %	0 %	0 %	184152701
48	NC_010609	CAGCT	2	10	56095	56104	20 %	20 %	20 %	40 %	184152702
49	NC_010609	TATTC	2	10	56500	56509	20 %	60 %	0 %	20 %	184152702
50	NC_010609	GACAA	2	10	57952	57961	60 %	0 %	20 %	20 %	184152702
51	NC_010609	AATTG	2	10	59593	59602	40 %	40 %	20 %	0 %	184152703
52	NC_010609	AAGCA	2	10	60550	60559	60 %	0 %	20 %	20 %	184152703
53	NC_010609	AATTT	2	10	64422	64431	40 %	60 %	0 %	0 %	184152704
54	NC_010609	TGGGG	2	10	65672	65681	0 %	20 %	80 %	0 %	184152705
55	NC_010609	GTTTT	2	10	67376	67385	0 %	80 %	20 %	0 %	184152706
56	NC_010609	AGCAA	2	10	67885	67894	60 %	0 %	20 %	20 %	184152707
57	NC_010609	GAAAA	2	10	70595	70604	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010609	AGTCA	2	10	70702	70711	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_010609	CTGGA	2	10	71957	71966	20 %	20 %	40 %	20 %	184152710
60	NC_010609	TATTT	2	10	72259	72268	20 %	80 %	0 %	0 %	184152710
61	NC_010609	AGCAG	2	10	73031	73040	40 %	0 %	40 %	20 %	184152711
62	NC_010609	AATTA	2	10	73977	73986	60 %	40 %	0 %	0 %	184152712
63	NC_010609	ATTTT	2	10	74961	74970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010609	ATGCA	2	10	75274	75283	40 %	20 %	20 %	20 %	184152713
65	NC_010609	TGCGT	2	10	76265	76274	0 %	40 %	40 %	20 %	184152713
66	NC_010609	ATTAT	2	10	80884	80893	40 %	60 %	0 %	0 %	184152717
67	NC_010609	TTAAC	2	10	81581	81590	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010609	TATCT	2	10	87341	87350	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_010609	ATATA	2	10	89253	89262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010609	ATCAT	2	10	89263	89272	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_010609	AAAAG	2	10	89311	89320	80 %	0 %	20 %	0 %	184152725
72	NC_010609	CAAAG	2	10	90470	90479	60 %	0 %	20 %	20 %	184152726
73	NC_010609	TCAAT	2	10	90672	90681	40 %	40 %	0 %	20 %	184152727
74	NC_010609	GAAAT	2	10	94275	94284	60 %	20 %	20 %	0 %	184152730
75	NC_010609	TGAAT	2	10	95912	95921	40 %	40 %	20 %	0 %	184152731
76	NC_010609	CATAC	2	10	97036	97045	40 %	20 %	0 %	40 %	184152732
77	NC_010609	CAGAC	2	10	97912	97921	40 %	0 %	20 %	40 %	184152732
78	NC_010609	ATTTT	2	10	98751	98760	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010609	TTTTA	2	10	98889	98898	20 %	80 %	0 %	0 %	184152733
80	NC_010609	CAATG	2	10	100183	100192	40 %	20 %	20 %	20 %	184152733
81	NC_010609	ATTTC	2	10	102516	102525	20 %	60 %	0 %	20 %	184152735
82	NC_010609	AACTC	2	10	103523	103532	40 %	20 %	0 %	40 %	184152735
83	NC_010609	ATTGC	2	10	105729	105738	20 %	40 %	20 %	20 %	184152736
84	NC_010609	ATCTT	2	10	105891	105900	20 %	60 %	0 %	20 %	184152736
85	NC_010609	TAAAA	2	10	106637	106646	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010609	AACGA	2	10	111506	111515	60 %	0 %	20 %	20 %	184152740
87	NC_010609	AATTT	2	10	113790	113799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010609	CTTAC	2	10	116765	116774	20 %	40 %	0 %	40 %	184152744
89	NC_010609	AGTTT	2	10	120780	120789	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010609	GAAAA	2	10	123261	123270	80 %	0 %	20 %	0 %	184152747
91	NC_010609	TACTA	2	10	123290	123299	40 %	40 %	0 %	20 %	184152747
92	NC_010609	TTATT	2	10	125833	125842	20 %	80 %	0 %	0 %	184152749
93	NC_010609	ATTAT	2	10	126487	126496	40 %	60 %	0 %	0 %	184152749
94	NC_010609	TCTTT	2	10	126817	126826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_010609	TTGGA	2	10	129581	129590	20 %	40 %	40 %	0 %	184152751
96	NC_010609	GATAA	2	10	131755	131764	60 %	20 %	20 %	0 %	184152753
97	NC_010609	ATAAG	2	10	131823	131832	60 %	20 %	20 %	0 %	184152753
98	NC_010609	ATTTT	2	10	133183	133192	20 %	80 %	0 %	0 %	184152755
99	NC_010609	TGCAA	2	10	136304	136313	40 %	20 %	20 %	20 %	184152759
100	NC_010609	CTTTT	2	10	136749	136758	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010609	AAAGG	2	10	139603	139612	60 %	0 %	40 %	0 %	184152762
102	NC_010609	GAATT	2	10	139952	139961	40 %	40 %	20 %	0 %	184152762
103	NC_010609	TGGGA	2	10	140327	140336	20 %	20 %	60 %	0 %	184152763
104	NC_010609	ATGAT	2	10	140806	140815	40 %	40 %	20 %	0 %	184152763
105	NC_010609	ATGGA	2	10	143476	143485	40 %	20 %	40 %	0 %	184152766
106	NC_010609	AGCCT	2	10	143991	144000	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_010609	GCGGT	2	10	144427	144436	0 %	20 %	60 %	20 %	184152767
108	NC_010609	GATTG	2	10	145389	145398	20 %	40 %	40 %	0 %	184152768
109	NC_010609	AATTA	2	10	146574	146583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010609	TTTTA	2	10	146631	146640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010609	ACCAG	2	10	149990	149999	40 %	0 %	20 %	40 %	184152773
112	NC_010609	TGGAA	2	10	151134	151143	40 %	20 %	40 %	0 %	184152775
113	NC_010609	ATCCC	2	10	153010	153019	20 %	20 %	0 %	60 %	184152777
114	NC_010609	TAAAG	2	10	153671	153680	60 %	20 %	20 %	0 %	184152778
115	NC_010609	TTTTC	2	10	153688	153697	0 %	80 %	0 %	20 %	184152778
116	NC_010609	ATGTA	2	10	153722	153731	40 %	40 %	20 %	0 %	184152778
117	NC_010609	AGTAA	2	10	154014	154023	60 %	20 %	20 %	0 %	184152778
118	NC_010609	AATTT	2	10	154704	154713	40 %	60 %	0 %	0 %	184152779
119	NC_010609	TATTG	2	10	155501	155510	20 %	60 %	20 %	0 %	184152779
120	NC_010609	ATTTT	2	10	155649	155658	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010609	ACTTT	2	10	157308	157317	20 %	60 %	0 %	20 %	184152780
122	NC_010609	GGTCA	2	10	159529	159538	20 %	20 %	40 %	20 %	184152782
123	NC_010609	TTTAT	2	10	160173	160182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010609	AAATG	2	10	160381	160390	60 %	20 %	20 %	0 %	184152783
125	NC_010609	TTTAC	2	10	161030	161039	20 %	60 %	0 %	20 %	184152784
126	NC_010609	TGATT	2	10	163045	163054	20 %	60 %	20 %	0 %	184152785
127	NC_010609	TTCCG	2	10	163089	163098	0 %	40 %	20 %	40 %	184152785
128	NC_010609	GGCAA	2	10	163470	163479	40 %	0 %	40 %	20 %	184152786
129	NC_010609	AAAGA	2	10	165132	165141	80 %	0 %	20 %	0 %	184152789
130	NC_010609	AGCAC	2	10	169862	169871	40 %	0 %	20 %	40 %	184152792
131	NC_010609	CAAAT	2	10	171623	171632	60 %	20 %	0 %	20 %	184152793
132	NC_010609	GGCGA	2	10	171726	171735	20 %	0 %	60 %	20 %	184152793
133	NC_010609	GGTTG	2	10	173360	173369	0 %	40 %	60 %	0 %	184152795
134	NC_010609	AAGAT	2	10	174473	174482	60 %	20 %	20 %	0 %	184152796
135	NC_010609	CCATT	2	10	176199	176208	20 %	40 %	0 %	40 %	184152797
136	NC_010609	GGTAA	2	10	177626	177635	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010609	GTCTG	2	10	178109	178118	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_010609	TCGTG	2	10	178443	178452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_010609	AACAA	2	10	179224	179233	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_010609	GAGAT	2	10	182115	182124	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010609	TCTTT	2	10	182470	182479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_010609	ATTGT	2	10	183794	183803	20 %	60 %	20 %	0 %	184152800
143	NC_010609	CTAAA	2	10	184783	184792	60 %	20 %	0 %	20 %	184152800
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145	NC_010609	CTTTA	2	10	188050	188059	20 %	60 %	0 %	20 %	184152802
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148	NC_010609	TGGCT	2	10	192080	192089	0 %	40 %	40 %	20 %	184152806
149	NC_010609	TGTTT	2	10	192789	192798	0 %	80 %	20 %	0 %	184152806
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151	NC_010609	CATTC	2	10	199761	199770	20 %	40 %	0 %	40 %	184152814
152	NC_010609	AAGTT	2	10	200253	200262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_010609	TCTAA	2	10	200279	200288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_010609	GTTAA	2	10	200590	200599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_010609	AACTT	2	10	201542	201551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_010609	GAAAA	2	10	202701	202710	80 %	0 %	20 %	0 %	184152816
157	NC_010609	CCATT	2	10	206724	206733	20 %	40 %	0 %	40 %	184152820
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160	NC_010609	TCATT	2	10	211339	211348	20 %	60 %	0 %	20 %	184152824
161	NC_010609	TAAGT	2	10	212487	212496	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_010609	TTTGC	2	10	213166	213175	0 %	60 %	20 %	20 %	184152826
163	NC_010609	TGAGT	2	10	213468	213477	20 %	40 %	40 %	0 %	184152826
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165	NC_010609	TTTGG	2	10	215310	215319	0 %	60 %	40 %	0 %	184152827
166	NC_010609	TGCAT	2	10	215894	215903	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
167	NC_010609	TTTAC	2	10	218107	218116	20 %	60 %	0 %	20 %	184152830
168	NC_010609	CATTG	2	10	218520	218529	20 %	40 %	20 %	20 %	184152831
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172	NC_010609	TTAGT	2	10	228929	228938	20 %	60 %	20 %	0 %	184152841
173	NC_010609	AAAAT	2	10	229296	229305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_010609	TTTCC	2	10	231296	231305	0 %	60 %	0 %	40 %	184152843
175	NC_010609	GATTA	2	10	231904	231913	40 %	40 %	20 %	0 %	184152843
176	NC_010609	TTTTC	2	10	235922	235931	0 %	80 %	0 %	20 %	184152846
177	NC_010609	TGATT	2	10	236391	236400	20 %	60 %	20 %	0 %	184152846
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180	NC_010609	GATAA	2	10	236689	236698	60 %	20 %	20 %	0 %	184152846
181	NC_010609	AAATT	2	10	237156	237165	60 %	40 %	0 %	0 %	184152846
182	NC_010609	TGGTG	2	10	238544	238553	0 %	40 %	60 %	0 %	184152848
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198	NC_010609	TGTTT	2	10	261472	261481	0 %	80 %	20 %	0 %	184152872
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204	NC_010609	TAAAT	2	10	281725	281734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_010609	TTAAG	2	10	281748	281757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
206	NC_010609	ATTTA	2	10	283616	283625	40 %	60 %	0 %	0 %	184152893
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210	NC_010609	ATTAA	2	10	292450	292459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
211	NC_010609	AAAGA	2	10	293307	293316	80 %	0 %	20 %	0 %	184152902
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222	NC_010609	AATTG	2	10	311609	311618	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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269	NC_010609	AATGA	2	10	381001	381010	60 %	20 %	20 %	0 %	184152980
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