MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 1123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	GAAA	2	8	15698	15705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010609	TGGA	2	8	15707	15714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010609	ATGA	2	8	17641	17648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010609	ATTT	2	8	17971	17978	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010609	TAAT	2	8	20608	20615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010609	TTAA	2	8	27736	27743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010609	TAAC	2	8	29733	29740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_010609	TAAA	2	8	32895	32902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010609	GCCA	2	8	32956	32963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_010609	TTGG	2	8	33165	33172	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010609	ATTA	2	8	33184	33191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010609	GTTA	2	8	35855	35862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010609	TTTA	2	8	35982	35989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010609	TGAT	2	8	41221	41228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010609	AAGG	2	8	41265	41272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010609	ATGA	2	8	41459	41466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010609	GGAT	2	8	43038	43045	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010609	GATT	2	8	43115	43122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010609	TTAA	2	8	43207	43214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010609	TGAT	2	8	43231	43238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010609	TATG	2	8	43532	43539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010609	AGAA	2	8	43557	43564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010609	GGAT	2	8	43578	43585	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010609	TTGA	2	8	46771	46778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010609	ATTA	2	8	46787	46794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010609	ATAC	2	8	50156	50163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010609	AATG	2	8	50240	50247	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010609	AGAA	2	8	54047	54054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010609	GAGC	2	8	55576	55583	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_010609	ATTA	2	8	67514	67521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010609	AGCT	2	8	76400	76407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_010609	CAAT	2	8	78078	78085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_010609	TTAT	2	8	81554	81561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010609	ACAA	2	8	81570	81577	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_010609	TCCT	2	8	86617	86624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_010609	ATTA	2	8	86664	86671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010609	ATCC	2	8	89770	89777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010609	CACT	2	8	92367	92374	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_010609	AATT	2	8	93195	93202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010609	TGAG	2	8	93643	93650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010609	TTAA	2	8	98819	98826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010609	TGAT	2	8	106510	106517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010609	TTTA	2	8	106680	106687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010609	GTTT	2	8	108200	108207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010609	GAAA	2	8	109348	109355	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010609	TAAT	2	8	110875	110882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010609	ATAA	2	8	111011	111018	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010609	GAAG	2	8	113948	113955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010609	AACT	2	8	114005	114012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_010609	CGTA	2	8	115695	115702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010609	TTCT	2	8	115798	115805	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_010609	AAAG	2	8	117816	117823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010609	AGTT	2	8	120991	120998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010609	ATAA	2	8	122746	122753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010609	GTTG	2	8	122780	122787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010609	TATT	2	8	122852	122859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010609	GGGA	2	8	126945	126952	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010609	AACA	2	8	126990	126997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_010609	AGAT	2	8	127175	127182	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010609	TGAT	2	8	134687	134694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010609	AAAT	2	8	136771	136778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010609	TAGT	2	8	143248	143255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010609	ATAA	2	8	147567	147574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010609	AGGA	2	8	147607	147614	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010609	CGAC	2	8	147720	147727	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010609	GATT	2	8	152425	152432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010609	AAAG	2	8	155783	155790	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010609	CCAT	2	8	160081	160088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_010609	TATT	2	8	160164	160171	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010609	AGTT	2	8	163230	163237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010609	TTTA	2	8	163285	163292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010609	AATT	2	8	163391	163398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010609	AAAT	2	8	163410	163417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010609	TAGC	3	12	175450	175461	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_010609	ATTA	2	8	177115	177122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010609	TGAT	2	8	177420	177427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010609	AGTG	2	8	177459	177466	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010609	TTTG	2	8	177565	177572	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010609	GTGA	2	8	177776	177783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010609	CGTG	2	8	177825	177832	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010609	AGCG	2	8	177946	177953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010609	GGAG	2	8	178827	178834	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010609	TTAA	2	8	179263	179270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010609	TAGC	2	8	179486	179493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010609	AGAA	2	8	179540	179547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010609	GCTT	2	8	179601	179608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_010609	TGCA	2	8	179955	179962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_010609	TAGG	2	8	181458	181465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010609	GACA	2	8	181693	181700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_010609	TATG	2	8	182064	182071	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010609	ATAG	2	8	182268	182275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010609	TAAT	2	8	182497	182504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010609	TATG	2	8	185088	185095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010609	CTTT	2	8	185506	185513	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_010609	ATTT	2	8	185715	185722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010609	ACTA	2	8	185745	185752	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_010609	CTAA	2	8	185778	185785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010609	TAAA	2	8	185932	185939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010609	TTAT	2	8	185974	185981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010609	AAAT	2	8	186114	186121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010609	CTTT	2	8	187325	187332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010609	ATGA	2	8	187443	187450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010609	ATTA	2	8	194539	194546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010609	ATTA	2	8	194617	194624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010609	TAAT	2	8	196255	196262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010609	ATGA	2	8	200339	200346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010609	AAGC	2	8	200762	200769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_010609	GCAA	2	8	201460	201467	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010609	GACG	2	8	201490	201497	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_010609	GAAA	2	8	201848	201855	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010609	GAAA	2	8	204063	204070	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010609	TAAT	2	8	210922	210929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010609	GTTT	2	8	215875	215882	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010609	ATTG	2	8	217391	217398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010609	TCAA	2	8	226477	226484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_010609	TAAA	2	8	226526	226533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010609	GCTT	2	8	226724	226731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_010609	TACT	2	8	226768	226775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_010609	AATT	2	8	226802	226809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010609	CTAT	2	8	226907	226914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010609	TAAA	2	8	227923	227930	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010609	TCTT	2	8	230465	230472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_010609	TAAT	2	8	230473	230480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010609	TAAA	2	8	230482	230489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010609	GAAA	2	8	237707	237714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010609	TAAT	2	8	240124	240131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010609	ATTT	2	8	244374	244381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010609	TAAC	2	8	250142	250149	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010609	TTAA	2	8	253757	253764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010609	AGAA	2	8	253782	253789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010609	GGAA	2	8	257109	257116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010609	TTTC	2	8	257130	257137	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010609	GTTC	2	8	262915	262922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_010609	ATAA	2	8	264174	264181	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010609	GAAG	2	8	266043	266050	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010609	AACT	2	8	266100	266107	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_010609	CGTA	2	8	267790	267797	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010609	TCGT	2	8	272835	272842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010609	TTGT	2	8	272896	272903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010609	AAAT	2	8	273031	273038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010609	TAAA	2	8	273098	273105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010609	AAGA	2	8	273134	273141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010609	TTGC	2	8	281837	281844	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010609	ATTT	2	8	281933	281940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_010609	TTAT	2	8	282082	282089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_010609	GAAG	2	8	283950	283957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_010609	AACT	2	8	284007	284014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_010609	CGTA	2	8	285697	285704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_010609	ATTA	2	8	290258	290265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010609	TTTA	2	8	290410	290417	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_010609	CCAT	2	8	295422	295429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_010609	TTGT	2	8	295448	295455	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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