MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 4795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	TAA	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010609	CTA	3	9	1432	1440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_010609	TAA	2	6	2651	2656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010609	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010609	TAA	2	6	2826	2831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010609	AAT	2	6	2847	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010609	GAA	2	6	2891	2896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010609	TGT	2	6	6194	6199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010609	GGA	2	6	6219	6224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010609	TTC	2	6	8887	8892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010609	AGG	2	6	8922	8927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010609	AGG	2	6	9855	9860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010609	TAA	2	6	10125	10130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_010609	TAT	2	6	10157	10162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010609	TAA	2	6	10223	10228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010609	GAT	2	6	10235	10240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010609	TAA	2	6	10289	10294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010609	AGG	2	6	10310	10315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010609	GAG	2	6	14330	14335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010609	AAT	2	6	15569	15574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010609	AGA	2	6	15637	15642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010609	AAT	2	6	15719	15724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010609	TGA	2	6	15778	15783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010609	TAA	2	6	15793	15798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010609	GTA	2	6	15831	15836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010609	AAT	2	6	15866	15871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010609	TTA	2	6	15918	15923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010609	ATG	2	6	15946	15951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010609	TAG	2	6	17497	17502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010609	ATT	2	6	17573	17578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_010609	ATT	2	6	17585	17590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010609	GCA	2	6	17653	17658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010609	GAA	2	6	17719	17724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010609	ACA	2	6	17769	17774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010609	ACC	2	6	17803	17808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_010609	ATG	2	6	17832	17837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010609	ACA	2	6	17918	17923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_010609	ATA	3	9	17927	17935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010609	TCA	3	9	18533	18541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010609	AGG	2	6	18566	18571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010609	GAG	2	6	25362	25367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010609	TGA	2	6	26283	26288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010609	TTG	2	6	27663	27668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010609	TGG	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010609	GTA	2	6	28420	28425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010609	AAT	2	6	29599	29604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010609	GAA	2	6	29615	29620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010609	TGT	2	6	29645	29650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010609	TGT	2	6	29668	29673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010609	ATA	2	6	29696	29701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010609	AAC	2	6	29858	29863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_010609	CAA	2	6	29954	29959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010609	ATT	3	9	30552	30560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_010609	GTT	2	6	30565	30570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010609	AGG	2	6	30949	30954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010609	ATT	2	6	31519	31524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010609	ATT	3	9	31602	31610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010609	GAG	2	6	31702	31707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010609	TAA	2	6	33092	33097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010609	ATT	2	6	33100	33105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010609	TGG	2	6	33202	33207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010609	TAT	2	6	34088	34093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010609	CAT	2	6	35708	35713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010609	CTT	2	6	35775	35780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010609	TAA	2	6	35845	35850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010609	ATA	2	6	35868	35873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010609	AAC	2	6	37387	37392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010609	TAT	2	6	37431	37436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010609	ATT	2	6	37447	37452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010609	GGA	2	6	37538	37543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010609	TAA	2	6	40652	40657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010609	AAT	2	6	41229	41234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010609	TAC	2	6	41307	41312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010609	TAA	2	6	41324	41329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010609	TAT	2	6	42950	42955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010609	AAT	2	6	42977	42982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010609	GTT	2	6	42990	42995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010609	ATT	3	9	43011	43019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010609	AGA	2	6	43076	43081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010609	ATT	2	6	43093	43098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010609	ATT	3	9	43290	43298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010609	ATT	2	6	43332	43337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010609	TTA	2	6	43363	43368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010609	TAA	2	6	43408	43413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010609	ATA	3	9	43465	43473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010609	AAT	2	6	43490	43495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010609	TTA	2	6	43572	43577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010609	TAG	2	6	43618	43623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010609	ACG	2	6	43732	43737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010609	GAA	2	6	43758	43763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010609	CTC	2	6	43770	43775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010609	CCT	2	6	44226	44231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_010609	TCC	2	6	46477	46482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_010609	AAG	2	6	46510	46515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010609	CTT	2	6	46546	46551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010609	CTG	2	6	46628	46633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010609	AGA	2	6	46661	46666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010609	ATC	2	6	46699	46704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010609	TCC	2	6	46711	46716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_010609	ATT	2	6	46730	46735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010609	AAT	2	6	46736	46741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010609	ATT	2	6	46799	46804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010609	ATA	2	6	46825	46830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010609	ATT	2	6	46850	46855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010609	ATA	2	6	46946	46951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010609	AGG	2	6	47222	47227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010609	GAG	2	6	47301	47306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_010609	ATA	2	6	49625	49630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010609	ATT	2	6	49634	49639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010609	ATT	2	6	49723	49728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010609	ACA	2	6	49834	49839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010609	AAT	2	6	49867	49872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010609	TAT	2	6	49890	49895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010609	TTA	2	6	49949	49954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_010609	TAA	2	6	50258	50263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010609	TAG	2	6	50351	50356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010609	AAT	2	6	50392	50397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010609	TTA	2	6	50434	50439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010609	TAA	2	6	53309	53314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010609	TGT	2	6	53347	53352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010609	TCC	2	6	53969	53974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_010609	TAA	2	6	53981	53986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_010609	GGA	2	6	54091	54096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010609	ATT	2	6	64608	64613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010609	CTT	2	6	65903	65908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010609	TTA	2	6	65913	65918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010609	AAT	2	6	65935	65940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010609	ATT	2	6	66057	66062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010609	AAT	2	6	66071	66076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010609	AAT	2	6	66092	66097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010609	GTT	2	6	66135	66140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010609	TAA	2	6	67503	67508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010609	TAA	2	6	67527	67532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_010609	AAT	2	6	70560	70565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010609	ATT	2	6	70620	70625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_010609	CAA	2	6	70737	70742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010609	TGC	2	6	70796	70801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010609	CAG	2	6	70846	70851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010609	GAT	2	6	70857	70862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010609	TAG	2	6	70873	70878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010609	GAC	2	6	70884	70889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_010609	GAC	2	6	71043	71048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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