MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 27048

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	AGA	2	6	273	278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152656
2	NC_010609	CTT	2	6	290	295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152656
3	NC_010609	CTC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152656
4	NC_010609	GTT	2	6	343	348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152656
5	NC_010609	GCA	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152656
6	NC_010609	TAA	2	6	564	569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152656
7	NC_010609	AAC	2	6	578	583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152656
8	NC_010609	AGA	2	6	588	593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152656
9	NC_010609	TGA	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152656
10	NC_010609	CGG	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152656
11	NC_010609	ACC	2	6	1222	1227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152656
12	NC_010609	AAT	2	6	1541	1546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152657
13	NC_010609	GTA	2	6	1604	1609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
14	NC_010609	GTA	2	6	1635	1640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
15	NC_010609	TTA	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152657
16	NC_010609	GAA	2	6	1703	1708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
17	NC_010609	CTT	2	6	1735	1740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152657
18	NC_010609	TAA	2	6	1888	1893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152657
19	NC_010609	AAG	2	6	1923	1928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
20	NC_010609	ATG	2	6	1994	1999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
21	NC_010609	ATT	2	6	2102	2107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152657
22	NC_010609	CTG	2	6	2274	2279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152657
23	NC_010609	ACA	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152657
24	NC_010609	ATC	2	6	2314	2319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152657
25	NC_010609	GTG	2	6	2409	2414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152657
26	NC_010609	GAA	2	6	2438	2443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
27	NC_010609	GTA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152657
28	NC_010609	AGA	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152657
29	NC_010609	TTA	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
30	NC_010609	AGA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152658
31	NC_010609	ATT	2	6	2957	2962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
32	NC_010609	AGC	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152658
33	NC_010609	ATG	2	6	3015	3020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152658
34	NC_010609	GAT	2	6	3026	3031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152658
35	NC_010609	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152658
36	NC_010609	ACC	2	6	3078	3083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184152658
37	NC_010609	TTA	2	6	3093	3098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152658
38	NC_010609	TTA	2	6	3296	3301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
39	NC_010609	TAA	2	6	3323	3328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152659
40	NC_010609	ATT	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
41	NC_010609	CGC	2	6	3508	3513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152659
42	NC_010609	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
43	NC_010609	TGC	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152659
44	NC_010609	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
45	NC_010609	TGA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
46	NC_010609	TAC	2	6	3819	3824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152659
47	NC_010609	AAC	2	6	3894	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
48	NC_010609	GAT	2	6	3919	3924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
49	NC_010609	ACA	2	6	3975	3980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
50	NC_010609	AAC	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152659
51	NC_010609	TGA	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152659
52	NC_010609	ATT	4	12	4050	4061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152659
53	NC_010609	GAC	2	6	4143	4148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152659
54	NC_010609	AGG	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152659
55	NC_010609	AAC	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152660
56	NC_010609	ATG	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
57	NC_010609	TCA	2	6	4379	4384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152660
58	NC_010609	TGA	2	6	4439	4444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
59	NC_010609	TGT	2	6	4451	4456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152660
60	NC_010609	GGA	2	6	4572	4577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152660
61	NC_010609	TGG	2	6	4583	4588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152660
62	NC_010609	CGG	2	6	4589	4594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	184152660
63	NC_010609	TGT	2	6	4634	4639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152660
64	NC_010609	TAC	2	6	4692	4697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152660
65	NC_010609	CTT	2	6	4865	4870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152660
66	NC_010609	TTA	2	6	5364	5369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
67	NC_010609	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
68	NC_010609	GCT	2	6	5433	5438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152660
69	NC_010609	ATT	2	6	5540	5545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152660
70	NC_010609	GGT	2	6	5568	5573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152660
71	NC_010609	TTC	2	6	5611	5616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152660
72	NC_010609	TGA	2	6	5720	5725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
73	NC_010609	GCC	2	6	5873	5878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152660
74	NC_010609	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152660
75	NC_010609	ACA	2	6	6030	6035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152660
76	NC_010609	GAC	2	6	6075	6080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152660
77	NC_010609	AAG	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
78	NC_010609	TTG	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152661
79	NC_010609	GCC	2	6	6588	6593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	184152661
80	NC_010609	ATG	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
81	NC_010609	TTA	2	6	6732	6737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
82	NC_010609	CTA	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152661
83	NC_010609	TTA	2	6	6805	6810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
84	NC_010609	TGG	2	6	6893	6898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152661
85	NC_010609	AGT	2	6	6899	6904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
86	NC_010609	TAT	2	6	6953	6958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
87	NC_010609	GAA	2	6	6981	6986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
88	NC_010609	TAA	2	6	7037	7042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152661
89	NC_010609	TCG	2	6	7154	7159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152661
90	NC_010609	AAC	2	6	7214	7219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152661
91	NC_010609	TTG	2	6	7369	7374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152661
92	NC_010609	TGA	2	6	7403	7408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
93	NC_010609	ATT	2	6	7419	7424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
94	NC_010609	TGA	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
95	NC_010609	GCA	2	6	7578	7583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152661
96	NC_010609	GAA	3	9	7737	7745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
97	NC_010609	TGA	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
98	NC_010609	GTG	2	6	7828	7833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152661
99	NC_010609	GAT	2	6	7857	7862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
100	NC_010609	AAC	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152661
101	NC_010609	CTT	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152661
102	NC_010609	GCT	2	6	7971	7976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152661
103	NC_010609	ATT	2	6	7989	7994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
104	NC_010609	TCT	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184152661
105	NC_010609	TAA	3	9	8009	8017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184152661
106	NC_010609	ATG	3	9	8059	8067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
107	NC_010609	TAC	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152661
108	NC_010609	CAG	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152661
109	NC_010609	TTA	2	6	8200	8205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
110	NC_010609	ATT	2	6	8223	8228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
111	NC_010609	ATC	2	6	8261	8266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152661
112	NC_010609	GTT	2	6	8268	8273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152661
113	NC_010609	TGA	2	6	8513	8518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152661
114	NC_010609	ATT	2	6	8550	8555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152661
115	NC_010609	CTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152661
116	NC_010609	AAG	2	6	8662	8667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
117	NC_010609	GAG	2	6	8673	8678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184152661
118	NC_010609	GAA	2	6	8682	8687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
119	NC_010609	CTA	2	6	8689	8694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152661
120	NC_010609	AAG	2	6	8707	8712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152661
121	NC_010609	GAA	2	6	8986	8991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184152662
122	NC_010609	TCG	2	6	9078	9083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152662
123	NC_010609	ACT	2	6	9139	9144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184152662
124	NC_010609	TGA	2	6	9192	9197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152662
125	NC_010609	CAG	2	6	9342	9347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184152663
126	NC_010609	TTG	2	6	9480	9485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152663
127	NC_010609	GTT	2	6	9554	9559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184152663
128	NC_010609	TGG	2	6	9595	9600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184152663
129	NC_010609	CAA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184152663
130	NC_010609	CTC	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184152663
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133	NC_010609	TGA	2	6	9814	9819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184152663
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135	NC_010609	CGT	4	12	9893	9904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184152664
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159	NC_010609	ATT	2	6	11555	11560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184152665
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