MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri JCM 1112

Total Repeats: 1898

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010609	TC	5	10	103	112	0 %	50 %	0 %	50 %	184152656
2	NC_010609	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010609	TA	3	6	1470	1475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010609	AC	3	6	4099	4104	50 %	0 %	0 %	50 %	184152659
5	NC_010609	TA	4	8	8767	8774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010609	AG	3	6	9255	9260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010609	GT	3	6	9537	9542	0 %	50 %	50 %	0 %	184152663
8	NC_010609	TA	3	6	10394	10399	50 %	50 %	0 %	0 %	184152665
9	NC_010609	AT	3	6	10651	10656	50 %	50 %	0 %	0 %	184152665
10	NC_010609	CT	3	6	13354	13359	0 %	50 %	0 %	50 %	184152667
11	NC_010609	AT	3	6	14633	14638	50 %	50 %	0 %	0 %	184152668
12	NC_010609	GA	3	6	15934	15939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010609	AT	3	6	16938	16943	50 %	50 %	0 %	0 %	184152670
14	NC_010609	AT	3	6	17027	17032	50 %	50 %	0 %	0 %	184152670
15	NC_010609	TC	3	6	17264	17269	0 %	50 %	0 %	50 %	184152670
16	NC_010609	AT	3	6	17295	17300	50 %	50 %	0 %	0 %	184152670
17	NC_010609	TA	3	6	17535	17540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010609	TA	3	6	17617	17622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010609	AT	3	6	20589	20594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010609	TG	4	8	22448	22455	0 %	50 %	50 %	0 %	184152674
21	NC_010609	GT	3	6	23723	23728	0 %	50 %	50 %	0 %	184152675
22	NC_010609	AC	3	6	23931	23936	50 %	0 %	0 %	50 %	184152675
23	NC_010609	TA	3	6	27426	27431	50 %	50 %	0 %	0 %	184152678
24	NC_010609	AG	3	6	33109	33114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010609	AT	3	6	33137	33142	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010609	GT	3	6	33499	33504	0 %	50 %	50 %	0 %	184152685
27	NC_010609	AT	3	6	33932	33937	50 %	50 %	0 %	0 %	184152685
28	NC_010609	GA	3	6	34029	34034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010609	TA	3	6	37494	37499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010609	TA	3	6	39880	39885	50 %	50 %	0 %	0 %	184152691
31	NC_010609	TA	4	8	40764	40771	50 %	50 %	0 %	0 %	184152692
32	NC_010609	TA	3	6	41453	41458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010609	GT	3	6	42610	42615	0 %	50 %	50 %	0 %	184152693
34	NC_010609	TA	3	6	46483	46488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010609	AT	3	6	49841	49846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010609	TC	3	6	50321	50326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010609	AC	3	6	51954	51959	50 %	0 %	0 %	50 %	184152699
38	NC_010609	AG	3	6	52822	52827	50 %	0 %	50 %	0 %	184152699
39	NC_010609	AT	3	6	53949	53954	50 %	50 %	0 %	0 %	184152700
40	NC_010609	AT	3	6	55632	55637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010609	TA	3	6	56228	56233	50 %	50 %	0 %	0 %	184152702
42	NC_010609	CG	3	6	57401	57406	0 %	0 %	50 %	50 %	184152702
43	NC_010609	AT	3	6	57881	57886	50 %	50 %	0 %	0 %	184152702
44	NC_010609	CT	4	8	58896	58903	0 %	50 %	0 %	50 %	184152702
45	NC_010609	TA	3	6	59925	59930	50 %	50 %	0 %	0 %	184152703
46	NC_010609	TA	3	6	60738	60743	50 %	50 %	0 %	0 %	184152703
47	NC_010609	CT	3	6	64624	64629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_010609	TG	3	6	65784	65789	0 %	50 %	50 %	0 %	184152705
49	NC_010609	TA	3	6	68106	68111	50 %	50 %	0 %	0 %	184152707
50	NC_010609	TC	3	6	70526	70531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010609	AT	3	6	72003	72008	50 %	50 %	0 %	0 %	184152710
52	NC_010609	GC	3	6	73212	73217	0 %	0 %	50 %	50 %	184152711
53	NC_010609	AT	3	6	73616	73621	50 %	50 %	0 %	0 %	184152711
54	NC_010609	AT	3	6	73739	73744	50 %	50 %	0 %	0 %	184152712
55	NC_010609	TA	3	6	75574	75579	50 %	50 %	0 %	0 %	184152713
56	NC_010609	TA	3	6	76553	76558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010609	TA	3	6	76622	76627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010609	GA	3	6	76744	76749	50 %	0 %	50 %	0 %	184152714
59	NC_010609	GC	3	6	77334	77339	0 %	0 %	50 %	50 %	184152715
60	NC_010609	TG	3	6	78195	78200	0 %	50 %	50 %	0 %	184152716
61	NC_010609	GC	3	6	78533	78538	0 %	0 %	50 %	50 %	184152716
62	NC_010609	CA	3	6	78706	78711	50 %	0 %	0 %	50 %	184152716
63	NC_010609	AT	3	6	78901	78906	50 %	50 %	0 %	0 %	184152716
64	NC_010609	TC	3	6	80164	80169	0 %	50 %	0 %	50 %	184152717
65	NC_010609	TA	3	6	81674	81679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010609	GT	4	8	81737	81744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010609	CG	3	6	83531	83536	0 %	0 %	50 %	50 %	184152720
68	NC_010609	TG	3	6	84028	84033	0 %	50 %	50 %	0 %	184152720
69	NC_010609	CA	3	6	84079	84084	50 %	0 %	0 %	50 %	184152720
70	NC_010609	AT	3	6	84177	84182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010609	CA	3	6	84445	84450	50 %	0 %	0 %	50 %	184152721
72	NC_010609	CA	3	6	84629	84634	50 %	0 %	0 %	50 %	184152721
73	NC_010609	TG	3	6	84764	84769	0 %	50 %	50 %	0 %	184152721
74	NC_010609	CA	3	6	88700	88705	50 %	0 %	0 %	50 %	184152724
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77	NC_010609	CG	3	6	93422	93427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010609	CG	3	6	95753	95758	0 %	0 %	50 %	50 %	184152731
79	NC_010609	AT	3	6	96801	96806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010609	TA	3	6	98400	98405	50 %	50 %	0 %	0 %	184152732
81	NC_010609	GA	3	6	98735	98740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010609	GA	3	6	98881	98886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_010609	TA	3	6	120606	120611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010609	AT	3	6	121935	121940	50 %	50 %	0 %	0 %	184152746
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100	NC_010609	CA	3	6	122479	122484	50 %	0 %	0 %	50 %	184152746
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104	NC_010609	AT	3	6	128290	128295	50 %	50 %	0 %	0 %	184152750
105	NC_010609	AT	3	6	128314	128319	50 %	50 %	0 %	0 %	184152750
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108	NC_010609	AG	3	6	135872	135877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010609	CA	3	6	136913	136918	50 %	0 %	0 %	50 %	184152760
110	NC_010609	AT	3	6	140219	140224	50 %	50 %	0 %	0 %	184152763
111	NC_010609	AT	3	6	141255	141260	50 %	50 %	0 %	0 %	184152764
112	NC_010609	TC	3	6	141677	141682	0 %	50 %	0 %	50 %	184152764
113	NC_010609	AG	3	6	141864	141869	50 %	0 %	50 %	0 %	184152764
114	NC_010609	TG	3	6	143954	143959	0 %	50 %	50 %	0 %	184152766
115	NC_010609	TG	3	6	144255	144260	0 %	50 %	50 %	0 %	184152767
116	NC_010609	AT	3	6	145593	145598	50 %	50 %	0 %	0 %	184152768
117	NC_010609	TA	3	6	145835	145840	50 %	50 %	0 %	0 %	184152768
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119	NC_010609	AG	4	8	147743	147750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_010609	AC	3	6	149829	149834	50 %	0 %	0 %	50 %	184152773
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123	NC_010609	CT	3	6	160133	160138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_010609	GA	3	6	161518	161523	50 %	0 %	50 %	0 %	184152784
125	NC_010609	AG	3	6	161912	161917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010609	CA	3	6	162559	162564	50 %	0 %	0 %	50 %	184152785
127	NC_010609	AT	3	6	162592	162597	50 %	50 %	0 %	0 %	184152785
128	NC_010609	CT	3	6	162652	162657	0 %	50 %	0 %	50 %	184152785
129	NC_010609	TA	3	6	166726	166731	50 %	50 %	0 %	0 %	184152789
130	NC_010609	AT	3	6	166955	166960	50 %	50 %	0 %	0 %	184152789
131	NC_010609	CA	3	6	167097	167102	50 %	0 %	0 %	50 %	184152789
132	NC_010609	AT	3	6	167749	167754	50 %	50 %	0 %	0 %	184152790
133	NC_010609	TC	3	6	170941	170946	0 %	50 %	0 %	50 %	184152793
134	NC_010609	GC	3	6	172479	172484	0 %	0 %	50 %	50 %	184152794
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136	NC_010609	CT	3	6	173848	173853	0 %	50 %	0 %	50 %	184152795
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138	NC_010609	AT	3	6	177066	177071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_010609	AT	3	6	177149	177154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_010609	TA	3	6	177332	177337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010609	GA	3	6	177669	177674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_010609	AT	3	6	178076	178081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010609	AC	3	6	178597	178602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_010609	AC	3	6	178766	178771	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_010609	CT	3	6	179715	179720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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