MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU2

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010606	AGTAT	2	10	1398	1407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010606	ATTCA	2	10	1949	1958	40 %	40 %	0 %	20 %	184160019
3	NC_010606	AAATG	2	10	3707	3716	60 %	20 %	20 %	0 %	184160021
4	NC_010606	TTAGA	2	10	4550	4559	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010606	TTGAA	2	10	5620	5629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010606	AATGA	2	10	5991	6000	60 %	20 %	20 %	0 %	184160025
7	NC_010606	TGGAC	2	10	7666	7675	20 %	20 %	40 %	20 %	184160027
8	NC_010606	CTATT	2	10	8088	8097	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_010606	AATAC	2	10	10964	10973	60 %	20 %	0 %	20 %	184160030
10	NC_010606	ACTTT	2	10	11847	11856	20 %	60 %	0 %	20 %	184160032
11	NC_010606	TCAAA	2	10	12661	12670	60 %	20 %	0 %	20 %	184160033
12	NC_010606	ATGCA	2	10	15496	15505	40 %	20 %	20 %	20 %	184160035
13	NC_010606	AAATG	2	10	16378	16387	60 %	20 %	20 %	0 %	184160036
14	NC_010606	AGCAA	2	10	16912	16921	60 %	0 %	20 %	20 %	184160036
15	NC_010606	TCTAT	2	10	17662	17671	20 %	60 %	0 %	20 %	184160037
16	NC_010606	AAAAT	2	10	18862	18871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010606	TTAAG	2	10	19822	19831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010606	CGGGC	2	10	21957	21966	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
19	NC_010606	AATTT	2	10	22555	22564	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010606	AATTT	2	10	23223	23232	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010606	AAATT	2	10	24227	24236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010606	ATTTT	2	10	25887	25896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010606	ATTAA	2	10	26708	26717	60 %	40 %	0 %	0 %	184160044
24	NC_010606	AAAAG	2	10	27188	27197	80 %	0 %	20 %	0 %	184160044
25	NC_010606	ATGGT	2	10	28830	28839	20 %	40 %	40 %	0 %	184160045
26	NC_010606	GTAGA	2	10	28910	28919	40 %	20 %	40 %	0 %	184160045
27	NC_010606	GGAAA	2	10	29541	29550	60 %	0 %	40 %	0 %	184160045
28	NC_010606	ATTAA	2	10	32027	32036	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010606	AAATT	2	10	32548	32557	60 %	40 %	0 %	0 %	184160048
30	NC_010606	AAAAT	2	10	32861	32870	80 %	20 %	0 %	0 %	184160048
31	NC_010606	TAAAA	2	10	33410	33419	80 %	20 %	0 %	0 %	184160049
32	NC_010606	GAAAA	2	10	34100	34109	80 %	0 %	20 %	0 %	184160050
33	NC_010606	TTTAA	2	10	34709	34718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_010606	AAGAA	2	10	35039	35048	80 %	0 %	20 %	0 %	184160051
35	NC_010606	ATTGC	2	10	37918	37927	20 %	40 %	20 %	20 %	184160053
36	NC_010606	AAAAG	2	10	39709	39718	80 %	0 %	20 %	0 %	184160056
37	NC_010606	ATGAA	2	10	39873	39882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010606	AAACA	2	10	39951	39960	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_010606	GTGGG	2	10	40528	40537	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010606	GTTTT	2	10	40654	40663	0 %	80 %	20 %	0 %	184160058
41	NC_010606	TCTTT	2	10	40907	40916	0 %	80 %	0 %	20 %	184160059
42	NC_010606	TTTGT	2	10	41924	41933	0 %	80 %	20 %	0 %	184160060
43	NC_010606	GAAAA	2	10	44472	44481	80 %	0 %	20 %	0 %	184160063
44	NC_010606	AATGC	2	10	44725	44734	40 %	20 %	20 %	20 %	184160063
45	NC_010606	GAATC	2	10	45549	45558	40 %	20 %	20 %	20 %	184160064
46	NC_010606	ATCGT	2	10	48558	48567	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_010606	AATGG	2	10	51379	51388	40 %	20 %	40 %	0 %	184160069
48	NC_010606	AACTT	2	10	51458	51467	40 %	40 %	0 %	20 %	184160069
49	NC_010606	GAAAA	2	10	52449	52458	80 %	0 %	20 %	0 %	184160070
50	NC_010606	ACAGA	2	10	53511	53520	60 %	0 %	20 %	20 %	184160071
51	NC_010606	ACAAA	2	10	53555	53564	80 %	0 %	0 %	20 %	184160071
52	NC_010606	GCAAA	2	10	53673	53682	60 %	0 %	20 %	20 %	184160071
53	NC_010606	ACTTG	2	10	55097	55106	20 %	40 %	20 %	20 %	184160074
54	NC_010606	ATTCA	2	10	55456	55465	40 %	40 %	0 %	20 %	184160074
55	NC_010606	AATTT	2	10	58448	58457	40 %	60 %	0 %	0 %	184160075
56	NC_010606	TGCTA	2	10	60707	60716	20 %	40 %	20 %	20 %	184160077
57	NC_010606	TATAG	2	10	60977	60986	40 %	40 %	20 %	0 %	184160077
58	NC_010606	AGCAA	2	10	61261	61270	60 %	0 %	20 %	20 %	184160077

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.