MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU2

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010606	TCAC	2	8	344	351	25 %	25 %	0 %	50 %	184160018
2	NC_010606	AATC	2	8	958	965	50 %	25 %	0 %	25 %	184160018
3	NC_010606	TAAA	2	8	1874	1881	75 %	25 %	0 %	0 %	184160019
4	NC_010606	CAAT	2	8	1906	1913	50 %	25 %	0 %	25 %	184160019
5	NC_010606	AAAT	2	8	2440	2447	75 %	25 %	0 %	0 %	184160020
6	NC_010606	TTGG	2	8	2553	2560	0 %	50 %	50 %	0 %	184160020
7	NC_010606	TTAT	2	8	2631	2638	25 %	75 %	0 %	0 %	184160020
8	NC_010606	AATG	2	8	2666	2673	50 %	25 %	25 %	0 %	184160020
9	NC_010606	AAAT	2	8	2902	2909	75 %	25 %	0 %	0 %	184160021
10	NC_010606	AATT	2	8	3583	3590	50 %	50 %	0 %	0 %	184160021
11	NC_010606	AGTT	2	8	3641	3648	25 %	50 %	25 %	0 %	184160021
12	NC_010606	AAAG	2	8	3858	3865	75 %	0 %	25 %	0 %	184160021
13	NC_010606	TTGA	2	8	3876	3883	25 %	50 %	25 %	0 %	184160021
14	NC_010606	TAAA	2	8	4118	4125	75 %	25 %	0 %	0 %	184160022
15	NC_010606	AAGA	2	8	4295	4302	75 %	0 %	25 %	0 %	184160022
16	NC_010606	TTCA	2	8	5295	5302	25 %	50 %	0 %	25 %	184160024
17	NC_010606	AGTA	2	8	6925	6932	50 %	25 %	25 %	0 %	184160026
18	NC_010606	GCCA	2	8	7059	7066	25 %	0 %	25 %	50 %	184160026
19	NC_010606	AAGC	2	8	7082	7089	50 %	0 %	25 %	25 %	184160026
20	NC_010606	AATC	2	8	7343	7350	50 %	25 %	0 %	25 %	184160026
21	NC_010606	AATT	2	8	7484	7491	50 %	50 %	0 %	0 %	184160027
22	NC_010606	AAAG	2	8	7605	7612	75 %	0 %	25 %	0 %	184160027
23	NC_010606	TGGT	2	8	9433	9440	0 %	50 %	50 %	0 %	184160029
24	NC_010606	ACAA	2	8	9549	9556	75 %	0 %	0 %	25 %	184160029
25	NC_010606	GGAT	2	8	9629	9636	25 %	25 %	50 %	0 %	184160029
26	NC_010606	ATTG	2	8	11342	11349	25 %	50 %	25 %	0 %	184160030
27	NC_010606	GACC	2	8	11774	11781	25 %	0 %	25 %	50 %	184160031
28	NC_010606	TAAT	2	8	12136	12143	50 %	50 %	0 %	0 %	184160032
29	NC_010606	GATT	2	8	12144	12151	25 %	50 %	25 %	0 %	184160032
30	NC_010606	CAAA	2	8	14037	14044	75 %	0 %	0 %	25 %	184160034
31	NC_010606	AACA	2	8	15515	15522	75 %	0 %	0 %	25 %	184160035
32	NC_010606	AGAA	2	8	15697	15704	75 %	0 %	25 %	0 %	184160035
33	NC_010606	TTGA	2	8	16877	16884	25 %	50 %	25 %	0 %	184160036
34	NC_010606	TTCT	2	8	18334	18341	0 %	75 %	0 %	25 %	184160037
35	NC_010606	TATT	2	8	18623	18630	25 %	75 %	0 %	0 %	184160037
36	NC_010606	ATTA	2	8	19848	19855	50 %	50 %	0 %	0 %	184160038
37	NC_010606	TATC	2	8	20986	20993	25 %	50 %	0 %	25 %	184160039
38	NC_010606	CGTT	2	8	21156	21163	0 %	50 %	25 %	25 %	184160039
39	NC_010606	AGCA	2	8	21468	21475	50 %	0 %	25 %	25 %	184160040
40	NC_010606	TAAT	2	8	21542	21549	50 %	50 %	0 %	0 %	184160040
41	NC_010606	TAAT	2	8	21749	21756	50 %	50 %	0 %	0 %	184160040
42	NC_010606	TCAA	2	8	21830	21837	50 %	25 %	0 %	25 %	184160040
43	NC_010606	AAAG	2	8	23578	23585	75 %	0 %	25 %	0 %	184160041
44	NC_010606	TAAT	2	8	23685	23692	50 %	50 %	0 %	0 %	184160041
45	NC_010606	TCTA	2	8	25252	25259	25 %	50 %	0 %	25 %	184160042
46	NC_010606	ATAA	2	8	25389	25396	75 %	25 %	0 %	0 %	184160042
47	NC_010606	TTTG	2	8	25484	25491	0 %	75 %	25 %	0 %	184160042
48	NC_010606	AAAG	2	8	26091	26098	75 %	0 %	25 %	0 %	184160043
49	NC_010606	ATCA	2	8	26278	26285	50 %	25 %	0 %	25 %	184160043
50	NC_010606	AAAC	2	8	26377	26384	75 %	0 %	0 %	25 %	184160043
51	NC_010606	AATC	2	8	26536	26543	50 %	25 %	0 %	25 %	184160043
52	NC_010606	TGAA	2	8	26555	26562	50 %	25 %	25 %	0 %	184160044
53	NC_010606	ATTT	2	8	26899	26906	25 %	75 %	0 %	0 %	184160044
54	NC_010606	TTAT	2	8	26943	26950	25 %	75 %	0 %	0 %	184160044
55	NC_010606	AAAT	2	8	27583	27590	75 %	25 %	0 %	0 %	184160044
56	NC_010606	ATTT	2	8	28461	28468	25 %	75 %	0 %	0 %	184160044
57	NC_010606	TAGG	2	8	28715	28722	25 %	25 %	50 %	0 %	184160044
58	NC_010606	GGAA	2	8	29585	29592	50 %	0 %	50 %	0 %	184160045
59	NC_010606	AAAC	2	8	29938	29945	75 %	0 %	0 %	25 %	184160045
60	NC_010606	AAAG	2	8	30005	30012	75 %	0 %	25 %	0 %	184160045
61	NC_010606	GAGG	2	8	30359	30366	25 %	0 %	75 %	0 %	184160045
62	NC_010606	AGAA	2	8	30617	30624	75 %	0 %	25 %	0 %	184160045
63	NC_010606	AAGC	2	8	30727	30734	50 %	0 %	25 %	25 %	184160045
64	NC_010606	AAAG	2	8	31467	31474	75 %	0 %	25 %	0 %	184160046
65	NC_010606	CTTT	2	8	32995	33002	0 %	75 %	0 %	25 %	184160049
66	NC_010606	ATCA	2	8	33101	33108	50 %	25 %	0 %	25 %	184160049
67	NC_010606	AATG	2	8	35309	35316	50 %	25 %	25 %	0 %	184160051
68	NC_010606	AAGA	2	8	35491	35498	75 %	0 %	25 %	0 %	184160051
69	NC_010606	TTAA	2	8	35526	35533	50 %	50 %	0 %	0 %	184160051
70	NC_010606	GATT	2	8	35837	35844	25 %	50 %	25 %	0 %	184160051
71	NC_010606	AATA	2	8	36739	36746	75 %	25 %	0 %	0 %	184160052
72	NC_010606	TTAA	2	8	37951	37958	50 %	50 %	0 %	0 %	184160053
73	NC_010606	AATA	2	8	38576	38583	75 %	25 %	0 %	0 %	184160054
74	NC_010606	TGTT	2	8	39339	39346	0 %	75 %	25 %	0 %	184160056
75	NC_010606	GTAT	2	8	39362	39369	25 %	50 %	25 %	0 %	184160056
76	NC_010606	TGGA	2	8	39399	39406	25 %	25 %	50 %	0 %	184160056
77	NC_010606	CATT	2	8	39489	39496	25 %	50 %	0 %	25 %	184160056
78	NC_010606	TCAG	2	8	39768	39775	25 %	25 %	25 %	25 %	184160056
79	NC_010606	CTTA	2	8	40923	40930	25 %	50 %	0 %	25 %	184160059
80	NC_010606	TAAT	2	8	41069	41076	50 %	50 %	0 %	0 %	184160059
81	NC_010606	ATGT	2	8	41816	41823	25 %	50 %	25 %	0 %	184160060
82	NC_010606	CGTT	2	8	41879	41886	0 %	50 %	25 %	25 %	184160060
83	NC_010606	GTAT	2	8	41955	41962	25 %	50 %	25 %	0 %	184160060
84	NC_010606	AACT	2	8	41976	41983	50 %	25 %	0 %	25 %	184160060
85	NC_010606	CAAC	2	8	42506	42513	50 %	0 %	0 %	50 %	184160061
86	NC_010606	GCGA	2	8	42639	42646	25 %	0 %	50 %	25 %	184160061
87	NC_010606	AAGC	2	8	43226	43233	50 %	0 %	25 %	25 %	184160061
88	NC_010606	TTTG	2	8	43662	43669	0 %	75 %	25 %	0 %	184160062
89	NC_010606	CAAT	2	8	44501	44508	50 %	25 %	0 %	25 %	184160063
90	NC_010606	TCTA	2	8	44843	44850	25 %	50 %	0 %	25 %	184160063
91	NC_010606	AGCC	2	8	45025	45032	25 %	0 %	25 %	50 %	184160063
92	NC_010606	AATA	2	8	45057	45064	75 %	25 %	0 %	0 %	184160063
93	NC_010606	TTTA	2	8	45804	45811	25 %	75 %	0 %	0 %	184160064
94	NC_010606	AAGC	2	8	46231	46238	50 %	0 %	25 %	25 %	184160064
95	NC_010606	ATTT	2	8	46667	46674	25 %	75 %	0 %	0 %	184160064
96	NC_010606	TATG	2	8	46977	46984	25 %	50 %	25 %	0 %	184160064
97	NC_010606	GAAA	2	8	47109	47116	75 %	0 %	25 %	0 %	184160064
98	NC_010606	AAAC	2	8	47183	47190	75 %	0 %	0 %	25 %	184160064
99	NC_010606	CGAT	2	8	47962	47969	25 %	25 %	25 %	25 %	184160065
100	NC_010606	ATCT	2	8	49658	49665	25 %	50 %	0 %	25 %	184160067
101	NC_010606	AGAA	2	8	50405	50412	75 %	0 %	25 %	0 %	184160067
102	NC_010606	TTTG	2	8	50495	50502	0 %	75 %	25 %	0 %	184160068
103	NC_010606	AAAC	2	8	50811	50818	75 %	0 %	0 %	25 %	184160068
104	NC_010606	ATGT	2	8	51219	51226	25 %	50 %	25 %	0 %	184160069
105	NC_010606	CAAG	2	8	51598	51605	50 %	0 %	25 %	25 %	184160069
106	NC_010606	GCAC	2	8	52121	52128	25 %	0 %	25 %	50 %	184160070
107	NC_010606	TGCG	2	8	52165	52172	0 %	25 %	50 %	25 %	184160070
108	NC_010606	AAGC	2	8	53201	53208	50 %	0 %	25 %	25 %	184160070
109	NC_010606	TAAA	2	8	53437	53444	75 %	25 %	0 %	0 %	184160071
110	NC_010606	AGAA	2	8	53990	53997	75 %	0 %	25 %	0 %	184160071
111	NC_010606	ATTA	2	8	54454	54461	50 %	50 %	0 %	0 %	184160073
112	NC_010606	AAAT	2	8	54531	54538	75 %	25 %	0 %	0 %	184160073
113	NC_010606	GTTT	2	8	54606	54613	0 %	75 %	25 %	0 %	184160073
114	NC_010606	TAAA	2	8	54717	54724	75 %	25 %	0 %	0 %	184160073
115	NC_010606	CCAA	2	8	55195	55202	50 %	0 %	0 %	50 %	184160074
116	NC_010606	ATAA	2	8	55862	55869	75 %	25 %	0 %	0 %	184160074
117	NC_010606	TAGA	2	8	56036	56043	50 %	25 %	25 %	0 %	184160075
118	NC_010606	TTGG	2	8	56069	56076	0 %	50 %	50 %	0 %	184160075
119	NC_010606	GGAT	2	8	56218	56225	25 %	25 %	50 %	0 %	184160075
120	NC_010606	ACTT	2	8	56244	56251	25 %	50 %	0 %	25 %	184160075
121	NC_010606	ATTA	2	8	57039	57046	50 %	50 %	0 %	0 %	184160075
122	NC_010606	CAAT	2	8	57508	57515	50 %	25 %	0 %	25 %	184160075
123	NC_010606	GAAC	2	8	57710	57717	50 %	0 %	25 %	25 %	184160075
124	NC_010606	TAAG	2	8	57755	57762	50 %	25 %	25 %	0 %	184160075
125	NC_010606	AACA	2	8	58096	58103	75 %	0 %	0 %	25 %	184160075
126	NC_010606	GATT	2	8	58743	58750	25 %	50 %	25 %	0 %	184160075
127	NC_010606	GAAA	2	8	58791	58798	75 %	0 %	25 %	0 %	184160075
128	NC_010606	TGTT	2	8	59761	59768	0 %	75 %	25 %	0 %	184160076
129	NC_010606	ACTT	2	8	60285	60292	25 %	50 %	0 %	25 %	184160076
130	NC_010606	TATT	2	8	60324	60331	25 %	75 %	0 %	0 %	184160076
131	NC_010606	AGAA	2	8	60361	60368	75 %	0 %	25 %	0 %	184160076
132	NC_010606	ACTA	2	8	61003	61010	50 %	25 %	0 %	25 %	184160077
133	NC_010606	TGAA	2	8	61230	61237	50 %	25 %	25 %	0 %	184160077
134	NC_010606	AAAG	2	8	61586	61593	75 %	0 %	25 %	0 %	184160078
135	NC_010606	ATGT	2	8	61866	61873	25 %	50 %	25 %	0 %	184160078
136	NC_010606	AAAT	2	8	62151	62158	75 %	25 %	0 %	0 %	184160079
137	NC_010606	GTAC	2	8	62175	62182	25 %	25 %	25 %	25 %	184160079
138	NC_010606	TACA	2	8	62216	62223	50 %	25 %	0 %	25 %	184160079
139	NC_010606	GAAA	2	8	62438	62445	75 %	0 %	25 %	0 %	184160079
140	NC_010606	TTAT	2	8	62484	62491	25 %	75 %	0 %	0 %	184160079
141	NC_010606	AATT	2	8	63208	63215	50 %	50 %	0 %	0 %	184160080
142	NC_010606	ATAA	2	8	63655	63662	75 %	25 %	0 %	0 %	184160081

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.