MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter baumannii ACICU plasmid pACICU1

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010605	AAC	2	6	439	444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159989
2	NC_010605	TTG	2	6	463	468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159989
3	NC_010605	CTG	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159989
4	NC_010605	GAA	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159989
5	NC_010605	TAG	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159989
6	NC_010605	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159989
7	NC_010605	AGA	3	9	1054	1062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159989
8	NC_010605	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159990
9	NC_010605	AAG	2	6	1499	1504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159990
10	NC_010605	TGA	2	6	1506	1511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159990
11	NC_010605	GAA	2	6	1570	1575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159990
12	NC_010605	CAA	2	6	1585	1590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
13	NC_010605	CAG	2	6	1640	1645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159990
14	NC_010605	CAC	2	6	1646	1651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159990
15	NC_010605	ACA	2	6	1696	1701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
16	NC_010605	CAA	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159990
17	NC_010605	AAT	2	6	1726	1731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159990
18	NC_010605	CAT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159991
19	NC_010605	CGT	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159991
20	NC_010605	CAA	2	6	3038	3043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159991
21	NC_010605	GAA	2	6	3047	3052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159991
22	NC_010605	TCA	2	6	3070	3075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159991
23	NC_010605	AAC	2	6	3174	3179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159991
24	NC_010605	CCA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159991
25	NC_010605	TAT	2	6	3318	3323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159991
26	NC_010605	CTG	2	6	4001	4006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159992
27	NC_010605	TGT	2	6	4065	4070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159992
28	NC_010605	AGC	2	6	4122	4127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159992
29	NC_010605	AAG	2	6	4165	4170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159992
30	NC_010605	TCC	2	6	4612	4617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184159993
31	NC_010605	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159993
32	NC_010605	TTC	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184159993
33	NC_010605	TGT	2	6	4781	4786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159993
34	NC_010605	TCA	2	6	4877	4882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
35	NC_010605	TGA	2	6	4911	4916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159993
36	NC_010605	TGC	2	6	5027	5032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159993
37	NC_010605	CAT	2	6	5148	5153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
38	NC_010605	AAG	2	6	5367	5372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159993
39	NC_010605	TAA	2	6	5376	5381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159993
40	NC_010605	ACT	2	6	5396	5401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159993
41	NC_010605	CAA	2	6	5883	5888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159994
42	NC_010605	GCA	2	6	5903	5908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159994
43	NC_010605	TGT	3	9	6079	6087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159994
44	NC_010605	GTA	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159994
45	NC_010605	TCA	2	6	6344	6349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159994
46	NC_010605	CTG	2	6	6384	6389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159994
47	NC_010605	GTT	2	6	6401	6406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159994
48	NC_010605	AAT	2	6	6413	6418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159994
49	NC_010605	TCA	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159995
50	NC_010605	GAG	2	6	6532	6537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184159995
51	NC_010605	GAA	2	6	6678	6683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159995
52	NC_010605	GAA	2	6	6691	6696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159995
53	NC_010605	ACT	2	6	7101	7106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159996
54	NC_010605	CAA	2	6	7182	7187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159996
55	NC_010605	ATT	2	6	7197	7202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159996
56	NC_010605	CTC	2	6	7263	7268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	184159996
57	NC_010605	ATG	2	6	7553	7558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159997
58	NC_010605	AAC	2	6	7560	7565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159997
59	NC_010605	CAA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159997
60	NC_010605	TGA	2	6	7633	7638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159997
61	NC_010605	AGA	2	6	7658	7663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159998
62	NC_010605	GAA	3	9	7712	7720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184159998
63	NC_010605	GTT	2	6	7845	7850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159998
64	NC_010605	ATG	2	6	7894	7899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159998
65	NC_010605	AAT	2	6	8521	8526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184159999
66	NC_010605	CAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
67	NC_010605	GAG	2	6	8696	8701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184159999
68	NC_010605	CAA	2	6	8756	8761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184159999
69	NC_010605	TAT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159999
70	NC_010605	ACC	2	6	8858	8863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184159999
71	NC_010605	GAT	2	6	8891	8896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184159999
72	NC_010605	CTG	2	6	8916	8921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184159999
73	NC_010605	ATC	2	6	8922	8927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
74	NC_010605	TAT	2	6	8995	9000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184159999
75	NC_010605	TTG	2	6	9021	9026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184159999
76	NC_010605	TCA	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184159999
77	NC_010605	AGC	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184159999
78	NC_010605	TTG	2	6	10170	10175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160000
79	NC_010605	ATG	2	6	10406	10411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160000
80	NC_010605	AGG	2	6	10554	10559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184160000
81	NC_010605	GTC	2	6	10605	10610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160000
82	NC_010605	CCA	2	6	10872	10877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	184160001
83	NC_010605	TTA	2	6	10954	10959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160001
84	NC_010605	TCA	2	6	11137	11142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160001
85	NC_010605	TGC	2	6	11193	11198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160001
86	NC_010605	CTG	2	6	11213	11218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160001
87	NC_010605	TAA	2	6	11331	11336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160001
88	NC_010605	ATT	2	6	12022	12027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160002
89	NC_010605	CAA	2	6	12140	12145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160002
90	NC_010605	ACA	2	6	12160	12165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160002
91	NC_010605	AGC	2	6	12244	12249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160002
92	NC_010605	AAT	2	6	12288	12293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160002
93	NC_010605	CAT	2	6	12439	12444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160003
94	NC_010605	TAT	2	6	12531	12536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160003
95	NC_010605	GAT	2	6	12625	12630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160003
96	NC_010605	TAT	2	6	12747	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160003
97	NC_010605	TTG	2	6	12773	12778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160003
98	NC_010605	TCA	2	6	12870	12875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160003
99	NC_010605	AGC	2	6	12927	12932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160003
100	NC_010605	ATT	2	6	13388	13393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160004
101	NC_010605	ATC	2	6	13497	13502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160004
102	NC_010605	ATG	2	6	13561	13566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160004
103	NC_010605	CGT	2	6	13800	13805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160004
104	NC_010605	AAG	2	6	13921	13926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160004
105	NC_010605	CAA	2	6	13983	13988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160004
106	NC_010605	TGT	2	6	13999	14004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160004
107	NC_010605	TTG	2	6	14092	14097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160004
108	NC_010605	GTG	2	6	14115	14120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184160004
109	NC_010605	TGA	2	6	14153	14158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160004
110	NC_010605	ATT	2	6	14215	14220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160004
111	NC_010605	TTG	2	6	14647	14652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160005
112	NC_010605	ATC	2	6	14689	14694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160005
113	NC_010605	TTG	2	6	14710	14715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160005
114	NC_010605	CAA	2	6	15328	15333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160006
115	NC_010605	GAA	2	6	15394	15399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160006
116	NC_010605	ATG	2	6	15404	15409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160006
117	NC_010605	ATG	2	6	15445	15450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160006
118	NC_010605	ATA	2	6	15585	15590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160006
119	NC_010605	TGG	2	6	15644	15649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184160007
120	NC_010605	GTT	2	6	15729	15734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160007
121	NC_010605	TGA	2	6	15833	15838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160007
122	NC_010605	CTT	2	6	15855	15860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184160007
123	NC_010605	GTT	2	6	15864	15869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160007
124	NC_010605	ACG	2	6	15909	15914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160007
125	NC_010605	GGA	2	6	15915	15920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184160007
126	NC_010605	ATG	2	6	16198	16203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160007
127	NC_010605	AAT	2	6	16302	16307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160008
128	NC_010605	CAT	2	6	16453	16458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160008
129	NC_010605	TAT	2	6	16545	16550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160008
130	NC_010605	GAT	2	6	16639	16644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160008
131	NC_010605	TAT	2	6	16761	16766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160008
132	NC_010605	TTG	2	6	16787	16792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160008
133	NC_010605	TCA	2	6	16884	16889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160008
134	NC_010605	AGC	2	6	16941	16946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160008
135	NC_010605	ATT	2	6	17402	17407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160009
136	NC_010605	ATC	2	6	17511	17516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160009
137	NC_010605	ATG	2	6	17575	17580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160009
138	NC_010605	CGT	2	6	17814	17819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	184160009
139	NC_010605	AAG	2	6	17935	17940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160009
140	NC_010605	CAA	2	6	17997	18002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160009
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142	NC_010605	TTG	2	6	18106	18111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160009
143	NC_010605	GTG	2	6	18129	18134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184160009
144	NC_010605	TGA	2	6	18167	18172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160009
145	NC_010605	ATT	2	6	18229	18234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160009
146	NC_010605	TTG	2	6	18661	18666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160010
147	NC_010605	ATC	2	6	18703	18708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160010
148	NC_010605	TTG	2	6	18724	18729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160010
149	NC_010605	CAA	2	6	19342	19347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160011
150	NC_010605	GAA	2	6	19408	19413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160011
151	NC_010605	ATG	2	6	19418	19423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160011
152	NC_010605	ATG	2	6	19459	19464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160011
153	NC_010605	ATA	2	6	19599	19604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160011
154	NC_010605	TGG	2	6	19658	19663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	184160012
155	NC_010605	GTT	2	6	19743	19748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160012
156	NC_010605	TGA	2	6	19847	19852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160012
157	NC_010605	CTT	2	6	19869	19874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	184160012
158	NC_010605	GTT	2	6	19878	19883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160012
159	NC_010605	ACG	2	6	19923	19928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160012
160	NC_010605	GGA	2	6	19929	19934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	184160012
161	NC_010605	ATG	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160012
162	NC_010605	AGC	2	6	20846	20851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160013
163	NC_010605	ATT	2	6	21040	21045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160013
164	NC_010605	TCA	2	6	21089	21094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160013
165	NC_010605	TAT	2	6	21142	21147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160013
166	NC_010605	TTG	2	6	21179	21184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	184160013
167	NC_010605	AAG	2	6	21263	21268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160013
168	NC_010605	GAA	2	6	21478	21483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	184160013
169	NC_010605	CAA	2	6	21499	21504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	184160013
170	NC_010605	ATG	2	6	21530	21535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	184160013
171	NC_010605	ATA	2	6	21608	21613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160013
172	NC_010605	CAT	2	6	21645	21650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160013
173	NC_010605	ATT	2	6	21754	21759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	184160013
174	NC_010605	CAT	2	6	22065	22070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	184160013
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187	NC_010605	GCA	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	184160013
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210	NC_010605	ATA	3	9	26765	26773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160015
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216	NC_010605	AAT	2	6	27319	27324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	184160016

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.