MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium marinum M plasmid pMM23

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010604	GGGTG	2	10	437	446	0 %	20 %	80 %	0 %	184152626
2	NC_010604	GACCA	2	10	1150	1159	40 %	0 %	20 %	40 %	184152626
3	NC_010604	ACGGC	2	10	1212	1221	20 %	0 %	40 %	40 %	184152626
4	NC_010604	CGAAG	2	10	2275	2284	40 %	0 %	40 %	20 %	184152627
5	NC_010604	GTGGA	2	10	2342	2351	20 %	20 %	60 %	0 %	184152627
6	NC_010604	CCGAT	2	10	3798	3807	20 %	20 %	20 %	40 %	184152627
7	NC_010604	CGCGG	2	10	3862	3871	0 %	0 %	60 %	40 %	184152627
8	NC_010604	TCCCG	2	10	4574	4583	0 %	20 %	20 %	60 %	184152627
9	NC_010604	AGTGC	2	10	5315	5324	20 %	20 %	40 %	20 %	184152628
10	NC_010604	CGGTG	2	10	8674	8683	0 %	20 %	60 %	20 %	184152630
11	NC_010604	GTCCG	2	10	10425	10434	0 %	20 %	40 %	40 %	184152633
12	NC_010604	CTGAT	2	10	11290	11299	20 %	40 %	20 %	20 %	184152633
13	NC_010604	ATCAG	2	10	11407	11416	40 %	20 %	20 %	20 %	184152633
14	NC_010604	GGCCG	2	10	14077	14086	0 %	0 %	60 %	40 %	184152636
15	NC_010604	CGGTG	2	10	15130	15139	0 %	20 %	60 %	20 %	184152638
16	NC_010604	TTGTC	2	10	17040	17049	0 %	60 %	20 %	20 %	184152644
17	NC_010604	TGGTC	2	10	17726	17735	0 %	40 %	40 %	20 %	184152645
18	NC_010604	CGGTT	2	10	20431	20440	0 %	40 %	40 %	20 %	184152648
19	NC_010604	GGGGA	2	10	21326	21335	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010604	GCGCC	2	10	22205	22214	0 %	0 %	40 %	60 %	184152652

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.