MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae CGSP14 chromosome

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010582	TAAGGA	2	12	16892	16903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010582	GAAGTG	2	12	19975	19986	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010582	ACTAAT	2	12	20005	20016	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_010582	TCTTGT	2	12	21240	21251	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_010582	TAAAAA	2	12	41348	41359	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010582	AAAAAT	2	12	57497	57508	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010582	TTCTAT	2	12	65075	65086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_010582	TAAAAT	2	12	73305	73316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010582	TCAGCT	2	12	74996	75007	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010582	ATAAAA	2	12	119830	119841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010582	ATAAAA	2	12	129075	129086	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010582	ATAAAT	2	12	133986	133997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010582	TTTTAC	2	12	209306	209317	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_010582	TCTTAA	2	12	253338	253349	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_010582	TCTTTT	2	12	292994	293005	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_010582	AGGAGT	2	12	325304	325315	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010582	GAAAAA	2	12	331044	331055	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010582	ACAAGA	2	12	338281	338292	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_010582	AGAAAT	2	12	426179	426190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_010582	ATGAAG	2	12	436836	436847	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010582	GCTTGC	2	12	460984	460995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010582	TAAAAA	2	12	502746	502757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010582	TAAAAA	2	12	505166	505177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010582	TGCTTT	2	12	510842	510853	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_010582	AAAATG	2	12	532890	532901	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010582	AAAGTT	2	12	594309	594320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010582	ACTTCT	2	12	611007	611018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_010582	TAAGAT	2	12	652498	652509	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010582	AGTATT	2	12	653765	653776	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010582	AGGAGC	2	12	653777	653788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_010582	TTTATT	2	12	660461	660472	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010582	AACATA	2	12	719799	719810	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_010582	TCTTGT	2	12	754385	754396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_010582	TAAAAA	2	12	767646	767657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010582	TTCGGG	2	12	790906	790917	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_010582	TTAAAA	2	12	829221	829232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010582	TTAGAT	2	12	832100	832111	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010582	TATAAA	2	12	855809	855820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010582	GCAATC	2	12	862009	862020	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010582	AAAAAG	2	12	908584	908595	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010582	ACAAAC	2	12	915955	915966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_010582	TTTTTA	2	12	928589	928600	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010582	CTATTT	2	12	940067	940078	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_010582	AAAAAG	2	12	940116	940127	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010582	TTTTCT	2	12	950405	950416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_010582	TAAAAA	2	12	982021	982032	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010582	TTAAAA	2	12	986738	986749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010582	TGTCAA	2	12	991459	991470	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_010582	AATGGA	2	12	1003399	1003410	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010582	AAATAA	2	12	1010072	1010083	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010582	AACAAA	2	12	1075956	1075967	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010582	AAACAA	2	12	1085141	1085152	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_010582	AGTTCT	2	12	1095553	1095564	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_010582	CTATTT	2	12	1110655	1110666	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_010582	AATAAA	2	12	1148337	1148348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010582	ACAAAA	2	12	1208602	1208613	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_010582	TTTATT	2	12	1211185	1211196	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010582	TTTTTA	2	12	1247633	1247644	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010582	TAAAAA	2	12	1250254	1250265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010582	TTTAAA	2	12	1275827	1275838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010582	TAGAAT	2	12	1279387	1279398	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010582	ATTCTG	2	12	1281114	1281125	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_010582	AAAATA	2	12	1306350	1306361	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010582	ATAAGA	2	12	1314374	1314385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010582	TAGGTA	2	12	1343658	1343669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010582	TTGAAA	2	12	1354634	1354645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010582	AAAAGA	2	12	1376794	1376805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010582	GATGGT	2	12	1383341	1383352	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010582	TAATTT	2	12	1394660	1394671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010582	TTTTAT	2	12	1394850	1394861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010582	TTTCCT	2	12	1398077	1398088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010582	TTTTAG	2	12	1427976	1427987	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010582	ATGAAA	2	12	1433871	1433882	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010582	CTTTAG	2	12	1453382	1453393	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_010582	TGCTTC	2	12	1453602	1453613	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010582	ACTAAA	2	12	1454924	1454935	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_010582	AAATTT	2	12	1471178	1471189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010582	CCGTTT	2	12	1573625	1573636	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010582	TTAAAA	2	12	1629772	1629783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010582	AACTTG	2	12	1665624	1665635	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_010582	ATTTGA	2	12	1688446	1688457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_010582	TAATCA	2	12	1696613	1696624	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_010582	ATGATT	2	12	1720140	1720151	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010582	CACTTC	2	12	1754868	1754879	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_010582	AAAAAT	2	12	1766133	1766144	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010582	TCTATT	2	12	1771552	1771563	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_010582	GAACAT	2	12	1785982	1785993	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_010582	CTTTCT	2	12	1805072	1805083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010582	TAGGCT	2	12	1805999	1806010	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_010582	TCATTA	2	12	1816469	1816480	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_010582	TAATCA	2	12	1835225	1835236	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_010582	TAAAAA	2	12	1859524	1859535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010582	TATTAG	2	12	1861276	1861287	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010582	CACTTC	2	12	1861307	1861318	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_010582	TCCTTA	2	12	1864395	1864406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010582	TTTTTC	2	12	1889691	1889702	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_010582	CCAGAA	2	12	1892529	1892540	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010582	AGGACA	2	12	1936625	1936636	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_010582	AAAAAT	2	12	1940395	1940406	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_010582	TATTAG	2	12	1952478	1952489	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010582	CACTTC	2	12	1952509	1952520	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_010582	TCCTTA	2	12	1955598	1955609	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010582	ATGATT	2	12	1971868	1971879	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010582	CCCGAA	2	12	2016895	2016906	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
105	NC_010582	TATTAG	2	12	2017769	2017780	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010582	CACTTC	2	12	2017800	2017811	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_010582	TCCTTA	2	12	2020888	2020899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010582	GTTTTT	2	12	2096913	2096924	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010582	TAAATT	2	12	2102797	2102808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010582	TCCAAC	2	12	2108216	2108227	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.