MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 2599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010581	CGATT	2	10	648	657	20 %	40 %	20 %	20 %	182677004
2	NC_010581	CGAGC	2	10	4901	4910	20 %	0 %	40 %	40 %	182677008
3	NC_010581	GGGCG	2	10	8871	8880	0 %	0 %	80 %	20 %	182677012
4	NC_010581	TTTCG	2	10	9924	9933	0 %	60 %	20 %	20 %	182677014
5	NC_010581	TCTAT	2	10	10959	10968	20 %	60 %	0 %	20 %	182677015
6	NC_010581	CGTCC	2	10	11440	11449	0 %	20 %	20 %	60 %	182677015
7	NC_010581	AGAAA	2	10	12177	12186	80 %	0 %	20 %	0 %	182677015
8	NC_010581	CCGGG	2	10	12845	12854	0 %	0 %	60 %	40 %	182677015
9	NC_010581	GCGAT	2	10	14087	14096	20 %	20 %	40 %	20 %	182677015
10	NC_010581	CGCTG	2	10	15005	15014	0 %	20 %	40 %	40 %	182677016
11	NC_010581	GACGA	2	10	15321	15330	40 %	0 %	40 %	20 %	182677016
12	NC_010581	CCGAC	2	10	15625	15634	20 %	0 %	20 %	60 %	182677016
13	NC_010581	GCTGG	2	10	19746	19755	0 %	20 %	60 %	20 %	182677018
14	NC_010581	GCGGT	2	10	21554	21563	0 %	20 %	60 %	20 %	182677021
15	NC_010581	TCCAA	2	10	22512	22521	40 %	20 %	0 %	40 %	182677021
16	NC_010581	CTTCG	2	10	23085	23094	0 %	40 %	20 %	40 %	182677022
17	NC_010581	CGACC	2	10	27010	27019	20 %	0 %	20 %	60 %	182677026
18	NC_010581	GTTCA	2	10	28021	28030	20 %	40 %	20 %	20 %	182677027
19	NC_010581	GTCCA	2	10	30151	30160	20 %	20 %	20 %	40 %	182677029
20	NC_010581	GGCGA	2	10	32530	32539	20 %	0 %	60 %	20 %	182677031
21	NC_010581	CAGCG	2	10	33390	33399	20 %	0 %	40 %	40 %	182677032
22	NC_010581	CACCC	2	10	34712	34721	20 %	0 %	0 %	80 %	182677034
23	NC_010581	AGCCC	2	10	35411	35420	20 %	0 %	20 %	60 %	182677034
24	NC_010581	CAGCT	2	10	35876	35885	20 %	20 %	20 %	40 %	182677035
25	NC_010581	AGGCG	2	10	38069	38078	20 %	0 %	60 %	20 %	182677038
26	NC_010581	CTACG	2	10	40381	40390	20 %	20 %	20 %	40 %	182677040
27	NC_010581	TCGGC	2	10	40836	40845	0 %	20 %	40 %	40 %	182677041
28	NC_010581	GCGCC	2	10	42903	42912	0 %	0 %	40 %	60 %	182677043
29	NC_010581	GCCAT	2	10	44707	44716	20 %	20 %	20 %	40 %	182677045
30	NC_010581	ATCGA	2	10	47304	47313	40 %	20 %	20 %	20 %	182677049
31	NC_010581	GCCAT	2	10	51436	51445	20 %	20 %	20 %	40 %	182677052
32	NC_010581	GGTGC	2	10	51882	51891	0 %	20 %	60 %	20 %	182677052
33	NC_010581	GCGCC	2	10	52473	52482	0 %	0 %	40 %	60 %	182677053
34	NC_010581	AGGCC	2	10	54396	54405	20 %	0 %	40 %	40 %	182677053
35	NC_010581	ATCCG	2	10	54450	54459	20 %	20 %	20 %	40 %	182677053
36	NC_010581	AGGGT	2	10	56131	56140	20 %	20 %	60 %	0 %	182677055
37	NC_010581	TCGGC	2	10	60164	60173	0 %	20 %	40 %	40 %	182677058
38	NC_010581	GGCCG	2	10	62021	62030	0 %	0 %	60 %	40 %	182677061
39	NC_010581	TCGTC	2	10	62721	62730	0 %	40 %	20 %	40 %	182677062
40	NC_010581	GCCAC	2	10	63906	63915	20 %	0 %	20 %	60 %	182677063
41	NC_010581	CGATC	2	10	66359	66368	20 %	20 %	20 %	40 %	182677065
42	NC_010581	ATCAC	2	10	66865	66874	40 %	20 %	0 %	40 %	182677065
43	NC_010581	ATCGC	2	10	66994	67003	20 %	20 %	20 %	40 %	182677065
44	NC_010581	CGCCT	2	10	68177	68186	0 %	20 %	20 %	60 %	182677067
45	NC_010581	CGCAA	2	10	70062	70071	40 %	0 %	20 %	40 %	182677068
46	NC_010581	GCTCG	2	10	70526	70535	0 %	20 %	40 %	40 %	182677069
47	NC_010581	CGGCG	2	10	73464	73473	0 %	0 %	60 %	40 %	182677072
48	NC_010581	TTTTC	2	10	73827	73836	0 %	80 %	0 %	20 %	182677073
49	NC_010581	GCCGA	2	10	76640	76649	20 %	0 %	40 %	40 %	182677075
50	NC_010581	CCGTC	2	10	79054	79063	0 %	20 %	20 %	60 %	182677075
51	NC_010581	GACGG	2	10	79193	79202	20 %	0 %	60 %	20 %	182677075
52	NC_010581	AAGCT	2	10	80699	80708	40 %	20 %	20 %	20 %	182677076
53	NC_010581	GAAAA	2	10	80717	80726	80 %	0 %	20 %	0 %	182677076
54	NC_010581	CTGAT	2	10	82503	82512	20 %	40 %	20 %	20 %	182677076
55	NC_010581	CGTTC	2	10	84807	84816	0 %	40 %	20 %	40 %	182677078
56	NC_010581	GGCTG	2	10	85477	85486	0 %	20 %	60 %	20 %	182677078
57	NC_010581	TGATC	2	10	88792	88801	20 %	40 %	20 %	20 %	182677082
58	NC_010581	GCGCC	2	10	89360	89369	0 %	0 %	40 %	60 %	182677082
59	NC_010581	AGGAC	2	10	91004	91013	40 %	0 %	40 %	20 %	182677083
60	NC_010581	CGATG	2	10	93129	93138	20 %	20 %	40 %	20 %	182677085
61	NC_010581	TGGAC	2	10	93633	93642	20 %	20 %	40 %	20 %	182677085
62	NC_010581	ATGGC	2	10	93704	93713	20 %	20 %	40 %	20 %	182677085
63	NC_010581	CGGCC	2	10	93840	93849	0 %	0 %	40 %	60 %	182677085
64	NC_010581	GATCG	2	10	94276	94285	20 %	20 %	40 %	20 %	182677085
65	NC_010581	GCGGT	2	10	94922	94931	0 %	20 %	60 %	20 %	182677085
66	NC_010581	ATCCT	2	10	97477	97486	20 %	40 %	0 %	40 %	182677088
67	NC_010581	CGGGA	2	10	97563	97572	20 %	0 %	60 %	20 %	182677088
68	NC_010581	GGAAT	2	10	99284	99293	40 %	20 %	40 %	0 %	182677089
69	NC_010581	TTCTG	2	10	99299	99308	0 %	60 %	20 %	20 %	182677089
70	NC_010581	TTTTC	2	10	102367	102376	0 %	80 %	0 %	20 %	182677091
71	NC_010581	TGGGC	2	10	104117	104126	0 %	20 %	60 %	20 %	182677092
72	NC_010581	GCGAT	2	10	106873	106882	20 %	20 %	40 %	20 %	182677096
73	NC_010581	CAAGG	2	10	107935	107944	40 %	0 %	40 %	20 %	182677097
74	NC_010581	CGGCG	2	10	109809	109818	0 %	0 %	60 %	40 %	182677099
75	NC_010581	TCGCA	2	10	112296	112305	20 %	20 %	20 %	40 %	182677100
76	NC_010581	ACGGG	2	10	113028	113037	20 %	0 %	60 %	20 %	182677101
77	NC_010581	ATGTC	2	10	113055	113064	20 %	40 %	20 %	20 %	182677101
78	NC_010581	CGAAC	2	10	113131	113140	40 %	0 %	20 %	40 %	182677101
79	NC_010581	GCGAT	2	10	114137	114146	20 %	20 %	40 %	20 %	182677102
80	NC_010581	GGTGC	2	10	115643	115652	0 %	20 %	60 %	20 %	182677103
81	NC_010581	ATGGA	2	10	117901	117910	40 %	20 %	40 %	0 %	182677106
82	NC_010581	CGCGG	2	10	118125	118134	0 %	0 %	60 %	40 %	182677106
83	NC_010581	TCCGA	2	10	119103	119112	20 %	20 %	20 %	40 %	182677107
84	NC_010581	GCGCC	2	10	119623	119632	0 %	0 %	40 %	60 %	182677107
85	NC_010581	CGATG	2	10	120890	120899	20 %	20 %	40 %	20 %	182677108
86	NC_010581	CCGCA	2	10	122817	122826	20 %	0 %	20 %	60 %	182677109
87	NC_010581	GCCGC	2	10	123749	123758	0 %	0 %	40 %	60 %	182677110
88	NC_010581	ACGAA	2	10	124317	124326	60 %	0 %	20 %	20 %	182677110
89	NC_010581	GCATC	2	10	125335	125344	20 %	20 %	20 %	40 %	182677111
90	NC_010581	TGATC	2	10	125992	126001	20 %	40 %	20 %	20 %	182677111
91	NC_010581	GCAAA	2	10	127873	127882	60 %	0 %	20 %	20 %	182677112
92	NC_010581	AATGG	2	10	129531	129540	40 %	20 %	40 %	0 %	182677114
93	NC_010581	GATTT	2	10	129861	129870	20 %	60 %	20 %	0 %	182677114
94	NC_010581	TGATC	2	10	129916	129925	20 %	40 %	20 %	20 %	182677114
95	NC_010581	GTGCC	2	10	130141	130150	0 %	20 %	40 %	40 %	182677115
96	NC_010581	AAGGG	2	10	131013	131022	40 %	0 %	60 %	0 %	182677115
97	NC_010581	GCCAG	2	10	131549	131558	20 %	0 %	40 %	40 %	182677116
98	NC_010581	GGAAT	2	10	133115	133124	40 %	20 %	40 %	0 %	182677118
99	NC_010581	GGCGT	2	10	134145	134154	0 %	20 %	60 %	20 %	182677118
100	NC_010581	CATTC	2	10	135880	135889	20 %	40 %	0 %	40 %	182677119
101	NC_010581	TCGCC	2	10	137625	137634	0 %	20 %	20 %	60 %	182677121
102	NC_010581	GCCGC	2	10	138838	138847	0 %	0 %	40 %	60 %	182677122
103	NC_010581	GATTC	2	10	140891	140900	20 %	40 %	20 %	20 %	182677123
104	NC_010581	GCTCG	2	10	141760	141769	0 %	20 %	40 %	40 %	182677123
105	NC_010581	AAATC	2	10	141810	141819	60 %	20 %	0 %	20 %	182677123
106	NC_010581	GGCAA	2	10	144640	144649	40 %	0 %	40 %	20 %	182677125
107	NC_010581	TCCTC	2	10	144719	144728	0 %	40 %	0 %	60 %	182677125
108	NC_010581	GAATT	2	10	144999	145008	40 %	40 %	20 %	0 %	182677125
109	NC_010581	GGATC	2	10	147161	147170	20 %	20 %	40 %	20 %	182677126
110	NC_010581	CATGG	2	10	147227	147236	20 %	20 %	40 %	20 %	182677126
111	NC_010581	CGACA	2	10	149271	149280	40 %	0 %	20 %	40 %	182677128
112	NC_010581	AGCAC	2	10	149324	149333	40 %	0 %	20 %	40 %	182677128
113	NC_010581	ACGGG	2	10	149612	149621	20 %	0 %	60 %	20 %	182677128
114	NC_010581	GGTAA	2	10	150292	150301	40 %	20 %	40 %	0 %	182677129
115	NC_010581	CGGCG	2	10	151392	151401	0 %	0 %	60 %	40 %	182677129
116	NC_010581	GGCGA	2	10	151888	151897	20 %	0 %	60 %	20 %	182677129
117	NC_010581	TCTGA	2	10	155261	155270	20 %	40 %	20 %	20 %	182677132
118	NC_010581	CGCGG	2	10	155863	155872	0 %	0 %	60 %	40 %	182677133
119	NC_010581	GCGGA	2	10	158421	158430	20 %	0 %	60 %	20 %	182677135
120	NC_010581	TGGCA	2	10	161526	161535	20 %	20 %	40 %	20 %	182677138
121	NC_010581	CTGGC	2	10	162111	162120	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
122	NC_010581	CTGGC	2	10	162321	162330	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
123	NC_010581	GCCTG	2	10	162337	162346	0 %	20 %	40 %	40 %	182677138
124	NC_010581	CGGCG	2	10	162495	162504	0 %	0 %	60 %	40 %	182677138
125	NC_010581	AGGCC	2	10	163481	163490	20 %	0 %	40 %	40 %	182677138
126	NC_010581	CGAAG	2	10	167286	167295	40 %	0 %	40 %	20 %	182677140
127	NC_010581	GATCA	2	10	167443	167452	40 %	20 %	20 %	20 %	182677140
128	NC_010581	CGTGG	2	10	167836	167845	0 %	20 %	60 %	20 %	182677140
129	NC_010581	CGATC	2	10	170630	170639	20 %	20 %	20 %	40 %	182677142
130	NC_010581	AGGCG	2	10	171818	171827	20 %	0 %	60 %	20 %	182677142
131	NC_010581	GATCG	2	10	172767	172776	20 %	20 %	40 %	20 %	182677143
132	NC_010581	CCGAG	2	10	176416	176425	20 %	0 %	40 %	40 %	182677146
133	NC_010581	CGGCG	2	10	178239	178248	0 %	0 %	60 %	40 %	182677148
134	NC_010581	GCGCG	2	10	179457	179466	0 %	0 %	60 %	40 %	182677150
135	NC_010581	GGCGG	2	10	182602	182611	0 %	0 %	80 %	20 %	182677153
136	NC_010581	CGATG	2	10	188397	188406	20 %	20 %	40 %	20 %	182677159
137	NC_010581	ATCGC	2	10	196941	196950	20 %	20 %	20 %	40 %	182677165
138	NC_010581	ATAGG	2	10	199241	199250	40 %	20 %	40 %	0 %	182677168
139	NC_010581	AAGCG	2	10	203527	203536	40 %	0 %	40 %	20 %	182677172
140	NC_010581	TCCTG	2	10	203746	203755	0 %	40 %	20 %	40 %	182677172
141	NC_010581	TTCAT	2	10	204066	204075	20 %	60 %	0 %	20 %	182677172
142	NC_010581	TCGCC	2	10	204847	204856	0 %	20 %	20 %	60 %	182677172
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148	NC_010581	GGCTC	2	10	213405	213414	0 %	20 %	40 %	40 %	182677179
149	NC_010581	TGCCG	2	10	214752	214761	0 %	20 %	40 %	40 %	182677180
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152	NC_010581	AGGAA	2	10	219265	219274	60 %	0 %	40 %	0 %	182677183
153	NC_010581	CAAGT	2	10	220841	220850	40 %	20 %	20 %	20 %	182677184
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156	NC_010581	CGTTG	2	10	223110	223119	0 %	40 %	40 %	20 %	182677186
157	NC_010581	TGATC	2	10	223793	223802	20 %	40 %	20 %	20 %	182677188
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161	NC_010581	CCGAG	2	10	227310	227319	20 %	0 %	40 %	40 %	182677192
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170	NC_010581	TGCTT	2	10	235577	235586	0 %	60 %	20 %	20 %	182677198
171	NC_010581	CTGGT	2	10	235757	235766	0 %	40 %	40 %	20 %	182677198
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178	NC_010581	CCGTG	2	10	242480	242489	0 %	20 %	40 %	40 %	182677202
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199	NC_010581	ATTGG	2	10	283288	283297	20 %	40 %	40 %	0 %	182677243
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246	NC_010581	GCAAG	2	10	361422	361431	40 %	0 %	40 %	20 %	182677313
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249	NC_010581	CGTGG	2	10	363416	363425	0 %	20 %	60 %	20 %	182677316
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251	NC_010581	TCAAC	2	10	366392	366401	40 %	20 %	0 %	40 %	182677319
252	NC_010581	CATCG	2	10	369885	369894	20 %	20 %	20 %	40 %	182677324
253	NC_010581	ATGTC	2	10	372972	372981	20 %	40 %	20 %	20 %	182677326
254	NC_010581	TTTTC	2	10	376683	376692	0 %	80 %	0 %	20 %	182677328
255	NC_010581	TCACC	2	10	378860	378869	20 %	20 %	0 %	60 %	182677330
256	NC_010581	GGCGG	2	10	382949	382958	0 %	0 %	80 %	20 %	182677335
257	NC_010581	TGAGA	2	10	383520	383529	40 %	20 %	40 %	0 %	182677335
258	NC_010581	TCCGC	2	10	383828	383837	0 %	20 %	20 %	60 %	182677336
259	NC_010581	GCATT	2	10	384205	384214	20 %	40 %	20 %	20 %	182677336
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261	NC_010581	AGCCA	2	10	387204	387213	40 %	0 %	20 %	40 %	182677340
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263	NC_010581	TGGAC	2	10	389836	389845	20 %	20 %	40 %	20 %	182677342
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