MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 10919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010581	TCTT	2	8	327	334	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010581	GGAG	2	8	1225	1232	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010581	CTGC	2	8	1442	1449	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_010581	CTTT	2	8	1709	1716	0 %	75 %	0 %	25 %	182677005
5	NC_010581	CGCC	2	8	2427	2434	0 %	0 %	25 %	75 %	182677005
6	NC_010581	CGAC	2	8	2983	2990	25 %	0 %	25 %	50 %	182677005
7	NC_010581	GGCA	2	8	3403	3410	25 %	0 %	50 %	25 %	182677006
8	NC_010581	GGCC	2	8	4178	4185	0 %	0 %	50 %	50 %	182677007
9	NC_010581	AGCG	2	8	4515	4522	25 %	0 %	50 %	25 %	182677008
10	NC_010581	CGAT	2	8	4617	4624	25 %	25 %	25 %	25 %	182677008
11	NC_010581	GCCC	2	8	4755	4762	0 %	0 %	25 %	75 %	182677008
12	NC_010581	GCGG	2	8	5057	5064	0 %	0 %	75 %	25 %	182677008
13	NC_010581	GACC	2	8	5092	5099	25 %	0 %	25 %	50 %	182677008
14	NC_010581	GAAT	2	8	5512	5519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010581	GGCC	2	8	5913	5920	0 %	0 %	50 %	50 %	182677009
16	NC_010581	GGAT	2	8	6375	6382	25 %	25 %	50 %	0 %	182677009
17	NC_010581	ATCT	2	8	6912	6919	25 %	50 %	0 %	25 %	182677010
18	NC_010581	GAAA	2	8	9325	9332	75 %	0 %	25 %	0 %	182677013
19	NC_010581	TTCA	2	8	9418	9425	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_010581	CGGA	2	8	9491	9498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010581	TGGC	2	8	9982	9989	0 %	25 %	50 %	25 %	182677014
22	NC_010581	GATC	2	8	10058	10065	25 %	25 %	25 %	25 %	182677014
23	NC_010581	GAAG	2	8	10262	10269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010581	TCGA	2	8	11221	11228	25 %	25 %	25 %	25 %	182677015
25	NC_010581	CAAA	2	8	11454	11461	75 %	0 %	0 %	25 %	182677015
26	NC_010581	CCGG	2	8	12158	12165	0 %	0 %	50 %	50 %	182677015
27	NC_010581	GCGG	2	8	12444	12451	0 %	0 %	75 %	25 %	182677015
28	NC_010581	AGCC	2	8	13037	13044	25 %	0 %	25 %	50 %	182677015
29	NC_010581	ATCA	2	8	13578	13585	50 %	25 %	0 %	25 %	182677015
30	NC_010581	TGGC	2	8	14112	14119	0 %	25 %	50 %	25 %	182677015
31	NC_010581	CATG	2	8	14145	14152	25 %	25 %	25 %	25 %	182677015
32	NC_010581	CGGC	2	8	14617	14624	0 %	0 %	50 %	50 %	182677016
33	NC_010581	ATTC	2	8	15868	15875	25 %	50 %	0 %	25 %	182677016
34	NC_010581	GCCG	2	8	16019	16026	0 %	0 %	50 %	50 %	182677016
35	NC_010581	GCCC	2	8	17258	17265	0 %	0 %	25 %	75 %	182677017
36	NC_010581	GGTT	2	8	17464	17471	0 %	50 %	50 %	0 %	182677017
37	NC_010581	GGCC	2	8	17530	17537	0 %	0 %	50 %	50 %	182677017
38	NC_010581	TTCC	2	8	17606	17613	0 %	50 %	0 %	50 %	182677017
39	NC_010581	GATC	2	8	17666	17673	25 %	25 %	25 %	25 %	182677017
40	NC_010581	CGCC	2	8	17890	17897	0 %	0 %	25 %	75 %	182677017
41	NC_010581	ATCC	2	8	17993	18000	25 %	25 %	0 %	50 %	182677017
42	NC_010581	GATC	2	8	18215	18222	25 %	25 %	25 %	25 %	182677017
43	NC_010581	TGCG	2	8	19460	19467	0 %	25 %	50 %	25 %	182677018
44	NC_010581	CTCA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	0 %	50 %	182677019
45	NC_010581	ATTG	2	8	20292	20299	25 %	50 %	25 %	0 %	182677019
46	NC_010581	CCGT	2	8	20794	20801	0 %	25 %	25 %	50 %	182677020
47	NC_010581	TCCA	2	8	21415	21422	25 %	25 %	0 %	50 %	182677020
48	NC_010581	TGCT	2	8	22109	22116	0 %	50 %	25 %	25 %	182677021
49	NC_010581	TGAG	2	8	22560	22567	25 %	25 %	50 %	0 %	182677021
50	NC_010581	AGGA	2	8	23467	23474	50 %	0 %	50 %	0 %	182677022
51	NC_010581	GCCG	2	8	23543	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	182677022
52	NC_010581	CAGC	2	8	23793	23800	25 %	0 %	25 %	50 %	182677022
53	NC_010581	ATGG	2	8	24202	24209	25 %	25 %	50 %	0 %	182677023
54	NC_010581	CGAT	2	8	24461	24468	25 %	25 %	25 %	25 %	182677023
55	NC_010581	CCGG	2	8	24501	24508	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
56	NC_010581	GCCT	2	8	24563	24570	0 %	25 %	25 %	50 %	182677023
57	NC_010581	CGGC	2	8	24602	24609	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
58	NC_010581	GGTC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	50 %	25 %	182677023
59	NC_010581	GCTT	2	8	26015	26022	0 %	50 %	25 %	25 %	182677025
60	NC_010581	CGCA	2	8	26105	26112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010581	GCAA	2	8	26160	26167	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_010581	CTGG	2	8	26187	26194	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_010581	TTCC	2	8	26318	26325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_010581	CCGG	2	8	26757	26764	0 %	0 %	50 %	50 %	182677026
65	NC_010581	CCAT	2	8	26883	26890	25 %	25 %	0 %	50 %	182677026
66	NC_010581	CGAA	2	8	27372	27379	50 %	0 %	25 %	25 %	182677026
67	NC_010581	TGGC	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	182677026
68	NC_010581	ATCG	3	12	27997	28008	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
69	NC_010581	ATCG	2	8	28159	28166	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
70	NC_010581	GGGA	2	8	28397	28404	25 %	0 %	75 %	0 %	182677027
71	NC_010581	TCCC	2	8	28425	28432	0 %	25 %	0 %	75 %	182677027
72	NC_010581	GGCA	2	8	28497	28504	25 %	0 %	50 %	25 %	182677027
73	NC_010581	GATG	2	8	29582	29589	25 %	25 %	50 %	0 %	182677028
74	NC_010581	GCTC	2	8	30339	30346	0 %	25 %	25 %	50 %	182677029
75	NC_010581	CGAT	2	8	30703	30710	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
76	NC_010581	ATCG	2	8	31089	31096	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
77	NC_010581	TCGC	2	8	31233	31240	0 %	25 %	25 %	50 %	182677030
78	NC_010581	ATCG	2	8	31256	31263	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
79	NC_010581	CGGG	2	8	31385	31392	0 %	0 %	75 %	25 %	182677030
80	NC_010581	AATC	2	8	31583	31590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010581	GTTC	2	8	31817	31824	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010581	GGCG	2	8	33087	33094	0 %	0 %	75 %	25 %	182677032
83	NC_010581	CTCG	2	8	33171	33178	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
84	NC_010581	CGAC	2	8	33620	33627	25 %	0 %	25 %	50 %	182677032
85	NC_010581	GCCT	2	8	33640	33647	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
86	NC_010581	GATT	2	8	33960	33967	25 %	50 %	25 %	0 %	182677033
87	NC_010581	CGGC	2	8	34847	34854	0 %	0 %	50 %	50 %	182677034
88	NC_010581	ATGG	2	8	35028	35035	25 %	25 %	50 %	0 %	182677034
89	NC_010581	CTGC	2	8	35330	35337	0 %	25 %	25 %	50 %	182677034
90	NC_010581	GACC	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	182677035
91	NC_010581	CTCG	2	8	36006	36013	0 %	25 %	25 %	50 %	182677035
92	NC_010581	GCCC	2	8	36168	36175	0 %	0 %	25 %	75 %	182677035
93	NC_010581	CTTC	2	8	36215	36222	0 %	50 %	0 %	50 %	182677035
94	NC_010581	ATGA	2	8	36830	36837	50 %	25 %	25 %	0 %	182677036
95	NC_010581	CCGG	2	8	36918	36925	0 %	0 %	50 %	50 %	182677036
96	NC_010581	TCGC	2	8	37170	37177	0 %	25 %	25 %	50 %	182677036
97	NC_010581	AGGA	2	8	37682	37689	50 %	0 %	50 %	0 %	182677037
98	NC_010581	CCGC	2	8	37760	37767	0 %	0 %	25 %	75 %	182677037
99	NC_010581	GGCG	2	8	37861	37868	0 %	0 %	75 %	25 %	182677037
100	NC_010581	GCCG	2	8	37962	37969	0 %	0 %	50 %	50 %	182677037
101	NC_010581	ATGC	2	8	38691	38698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_010581	GGAA	2	8	38812	38819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010581	CTGG	2	8	39098	39105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_010581	GCAA	2	8	39127	39134	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_010581	AGCC	2	8	39345	39352	25 %	0 %	25 %	50 %	182677039
106	NC_010581	GGCA	2	8	39627	39634	25 %	0 %	50 %	25 %	182677039
107	NC_010581	CCTC	2	8	39785	39792	0 %	25 %	0 %	75 %	182677039
108	NC_010581	AAGA	2	8	40356	40363	75 %	0 %	25 %	0 %	182677040
109	NC_010581	GCCG	2	8	40671	40678	0 %	0 %	50 %	50 %	182677041
110	NC_010581	CGGG	2	8	42667	42674	0 %	0 %	75 %	25 %	182677043
111	NC_010581	GCGG	2	8	43342	43349	0 %	0 %	75 %	25 %	182677043
112	NC_010581	CCGG	2	8	43983	43990	0 %	0 %	50 %	50 %	182677044
113	NC_010581	AGGA	2	8	44294	44301	50 %	0 %	50 %	0 %	182677044
114	NC_010581	GACC	2	8	44358	44365	25 %	0 %	25 %	50 %	182677044
115	NC_010581	GCCT	2	8	44389	44396	0 %	25 %	25 %	50 %	182677044
116	NC_010581	CTGG	2	8	44646	44653	0 %	25 %	50 %	25 %	182677045
117	NC_010581	CCTG	2	8	44793	44800	0 %	25 %	25 %	50 %	182677045
118	NC_010581	CGGC	2	8	44818	44825	0 %	0 %	50 %	50 %	182677045
119	NC_010581	TCAA	2	8	45368	45375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_010581	GCTT	2	8	45714	45721	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_010581	TTTA	2	8	46210	46217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010581	CCGG	2	8	46510	46517	0 %	0 %	50 %	50 %	182677048
123	NC_010581	TGCC	2	8	46987	46994	0 %	25 %	25 %	50 %	182677049
124	NC_010581	CATC	2	8	47071	47078	25 %	25 %	0 %	50 %	182677049
125	NC_010581	CTTC	2	8	47116	47123	0 %	50 %	0 %	50 %	182677049
126	NC_010581	AGGA	2	8	47454	47461	50 %	0 %	50 %	0 %	182677049
127	NC_010581	GCGG	2	8	47852	47859	0 %	0 %	75 %	25 %	182677049
128	NC_010581	GACA	2	8	48384	48391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_010581	AAAG	2	8	48535	48542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010581	ACTA	2	8	48545	48552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_010581	TGGC	2	8	49599	49606	0 %	25 %	50 %	25 %	182677050
132	NC_010581	CTTG	2	8	50208	50215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_010581	CGGC	2	8	50289	50296	0 %	0 %	50 %	50 %	182677051
134	NC_010581	TCTT	2	8	50512	50519	0 %	75 %	0 %	25 %	182677051
135	NC_010581	GCCG	2	8	51035	51042	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
136	NC_010581	GCGG	2	8	51398	51405	0 %	0 %	75 %	25 %	182677052
137	NC_010581	CGGC	2	8	51584	51591	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
138	NC_010581	ATGA	2	8	51681	51688	50 %	25 %	25 %	0 %	182677052
139	NC_010581	GCCT	2	8	52309	52316	0 %	25 %	25 %	50 %	182677053
140	NC_010581	GGTC	2	8	52569	52576	0 %	25 %	50 %	25 %	182677053
141	NC_010581	TCCC	2	8	52665	52672	0 %	25 %	0 %	75 %	182677053
142	NC_010581	CCGG	2	8	52706	52713	0 %	0 %	50 %	50 %	182677053
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