MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 8889

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010581	CTTT	2	8	1709	1716	0 %	75 %	0 %	25 %	182677005
2	NC_010581	CGCC	2	8	2427	2434	0 %	0 %	25 %	75 %	182677005
3	NC_010581	CGAC	2	8	2983	2990	25 %	0 %	25 %	50 %	182677005
4	NC_010581	GGCA	2	8	3403	3410	25 %	0 %	50 %	25 %	182677006
5	NC_010581	GGCC	2	8	4178	4185	0 %	0 %	50 %	50 %	182677007
6	NC_010581	AGCG	2	8	4515	4522	25 %	0 %	50 %	25 %	182677008
7	NC_010581	CGAT	2	8	4617	4624	25 %	25 %	25 %	25 %	182677008
8	NC_010581	GCCC	2	8	4755	4762	0 %	0 %	25 %	75 %	182677008
9	NC_010581	GCGG	2	8	5057	5064	0 %	0 %	75 %	25 %	182677008
10	NC_010581	GACC	2	8	5092	5099	25 %	0 %	25 %	50 %	182677008
11	NC_010581	GGCC	2	8	5913	5920	0 %	0 %	50 %	50 %	182677009
12	NC_010581	GGAT	2	8	6375	6382	25 %	25 %	50 %	0 %	182677009
13	NC_010581	ATCT	2	8	6912	6919	25 %	50 %	0 %	25 %	182677010
14	NC_010581	GAAA	2	8	9325	9332	75 %	0 %	25 %	0 %	182677013
15	NC_010581	TGGC	2	8	9982	9989	0 %	25 %	50 %	25 %	182677014
16	NC_010581	GATC	2	8	10058	10065	25 %	25 %	25 %	25 %	182677014
17	NC_010581	TCGA	2	8	11221	11228	25 %	25 %	25 %	25 %	182677015
18	NC_010581	CAAA	2	8	11454	11461	75 %	0 %	0 %	25 %	182677015
19	NC_010581	CCGG	2	8	12158	12165	0 %	0 %	50 %	50 %	182677015
20	NC_010581	GCGG	2	8	12444	12451	0 %	0 %	75 %	25 %	182677015
21	NC_010581	AGCC	2	8	13037	13044	25 %	0 %	25 %	50 %	182677015
22	NC_010581	ATCA	2	8	13578	13585	50 %	25 %	0 %	25 %	182677015
23	NC_010581	TGGC	2	8	14112	14119	0 %	25 %	50 %	25 %	182677015
24	NC_010581	CATG	2	8	14145	14152	25 %	25 %	25 %	25 %	182677015
25	NC_010581	CGGC	2	8	14617	14624	0 %	0 %	50 %	50 %	182677016
26	NC_010581	ATTC	2	8	15868	15875	25 %	50 %	0 %	25 %	182677016
27	NC_010581	GCCG	2	8	16019	16026	0 %	0 %	50 %	50 %	182677016
28	NC_010581	GCCC	2	8	17258	17265	0 %	0 %	25 %	75 %	182677017
29	NC_010581	GGTT	2	8	17464	17471	0 %	50 %	50 %	0 %	182677017
30	NC_010581	GGCC	2	8	17530	17537	0 %	0 %	50 %	50 %	182677017
31	NC_010581	TTCC	2	8	17606	17613	0 %	50 %	0 %	50 %	182677017
32	NC_010581	GATC	2	8	17666	17673	25 %	25 %	25 %	25 %	182677017
33	NC_010581	CGCC	2	8	17890	17897	0 %	0 %	25 %	75 %	182677017
34	NC_010581	ATCC	2	8	17993	18000	25 %	25 %	0 %	50 %	182677017
35	NC_010581	GATC	2	8	18215	18222	25 %	25 %	25 %	25 %	182677017
36	NC_010581	TGCG	2	8	19460	19467	0 %	25 %	50 %	25 %	182677018
37	NC_010581	CTCA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	0 %	50 %	182677019
38	NC_010581	ATTG	2	8	20292	20299	25 %	50 %	25 %	0 %	182677019
39	NC_010581	CCGT	2	8	20794	20801	0 %	25 %	25 %	50 %	182677020
40	NC_010581	TCCA	2	8	21415	21422	25 %	25 %	0 %	50 %	182677020
41	NC_010581	TGCT	2	8	22109	22116	0 %	50 %	25 %	25 %	182677021
42	NC_010581	TGAG	2	8	22560	22567	25 %	25 %	50 %	0 %	182677021
43	NC_010581	AGGA	2	8	23467	23474	50 %	0 %	50 %	0 %	182677022
44	NC_010581	GCCG	2	8	23543	23550	0 %	0 %	50 %	50 %	182677022
45	NC_010581	CAGC	2	8	23793	23800	25 %	0 %	25 %	50 %	182677022
46	NC_010581	ATGG	2	8	24202	24209	25 %	25 %	50 %	0 %	182677023
47	NC_010581	CGAT	2	8	24461	24468	25 %	25 %	25 %	25 %	182677023
48	NC_010581	CCGG	2	8	24501	24508	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
49	NC_010581	GCCT	2	8	24563	24570	0 %	25 %	25 %	50 %	182677023
50	NC_010581	CGGC	2	8	24602	24609	0 %	0 %	50 %	50 %	182677023
51	NC_010581	GGTC	2	8	25142	25149	0 %	25 %	50 %	25 %	182677023
52	NC_010581	GCTT	2	8	26015	26022	0 %	50 %	25 %	25 %	182677025
53	NC_010581	CCGG	2	8	26757	26764	0 %	0 %	50 %	50 %	182677026
54	NC_010581	CCAT	2	8	26883	26890	25 %	25 %	0 %	50 %	182677026
55	NC_010581	CGAA	2	8	27372	27379	50 %	0 %	25 %	25 %	182677026
56	NC_010581	TGGC	2	8	27511	27518	0 %	25 %	50 %	25 %	182677026
57	NC_010581	ATCG	3	12	27997	28008	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
58	NC_010581	ATCG	2	8	28159	28166	25 %	25 %	25 %	25 %	182677027
59	NC_010581	GGGA	2	8	28397	28404	25 %	0 %	75 %	0 %	182677027
60	NC_010581	TCCC	2	8	28425	28432	0 %	25 %	0 %	75 %	182677027
61	NC_010581	GGCA	2	8	28497	28504	25 %	0 %	50 %	25 %	182677027
62	NC_010581	GATG	2	8	29582	29589	25 %	25 %	50 %	0 %	182677028
63	NC_010581	GCTC	2	8	30339	30346	0 %	25 %	25 %	50 %	182677029
64	NC_010581	CGAT	2	8	30703	30710	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
65	NC_010581	ATCG	2	8	31089	31096	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
66	NC_010581	TCGC	2	8	31233	31240	0 %	25 %	25 %	50 %	182677030
67	NC_010581	ATCG	2	8	31256	31263	25 %	25 %	25 %	25 %	182677030
68	NC_010581	CGGG	2	8	31385	31392	0 %	0 %	75 %	25 %	182677030
69	NC_010581	GGCG	2	8	33087	33094	0 %	0 %	75 %	25 %	182677032
70	NC_010581	CTCG	2	8	33171	33178	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
71	NC_010581	CGAC	2	8	33620	33627	25 %	0 %	25 %	50 %	182677032
72	NC_010581	GCCT	2	8	33640	33647	0 %	25 %	25 %	50 %	182677032
73	NC_010581	GATT	2	8	33960	33967	25 %	50 %	25 %	0 %	182677033
74	NC_010581	CGGC	2	8	34847	34854	0 %	0 %	50 %	50 %	182677034
75	NC_010581	ATGG	2	8	35028	35035	25 %	25 %	50 %	0 %	182677034
76	NC_010581	CTGC	2	8	35330	35337	0 %	25 %	25 %	50 %	182677034
77	NC_010581	GACC	2	8	35914	35921	25 %	0 %	25 %	50 %	182677035
78	NC_010581	CTCG	2	8	36006	36013	0 %	25 %	25 %	50 %	182677035
79	NC_010581	GCCC	2	8	36168	36175	0 %	0 %	25 %	75 %	182677035
80	NC_010581	CTTC	2	8	36215	36222	0 %	50 %	0 %	50 %	182677035
81	NC_010581	ATGA	2	8	36830	36837	50 %	25 %	25 %	0 %	182677036
82	NC_010581	CCGG	2	8	36918	36925	0 %	0 %	50 %	50 %	182677036
83	NC_010581	TCGC	2	8	37170	37177	0 %	25 %	25 %	50 %	182677036
84	NC_010581	AGGA	2	8	37682	37689	50 %	0 %	50 %	0 %	182677037
85	NC_010581	CCGC	2	8	37760	37767	0 %	0 %	25 %	75 %	182677037
86	NC_010581	GGCG	2	8	37861	37868	0 %	0 %	75 %	25 %	182677037
87	NC_010581	GCCG	2	8	37962	37969	0 %	0 %	50 %	50 %	182677037
88	NC_010581	AGCC	2	8	39345	39352	25 %	0 %	25 %	50 %	182677039
89	NC_010581	GGCA	2	8	39627	39634	25 %	0 %	50 %	25 %	182677039
90	NC_010581	CCTC	2	8	39785	39792	0 %	25 %	0 %	75 %	182677039
91	NC_010581	AAGA	2	8	40356	40363	75 %	0 %	25 %	0 %	182677040
92	NC_010581	GCCG	2	8	40671	40678	0 %	0 %	50 %	50 %	182677041
93	NC_010581	CGGG	2	8	42667	42674	0 %	0 %	75 %	25 %	182677043
94	NC_010581	GCGG	2	8	43342	43349	0 %	0 %	75 %	25 %	182677043
95	NC_010581	CCGG	2	8	43983	43990	0 %	0 %	50 %	50 %	182677044
96	NC_010581	AGGA	2	8	44294	44301	50 %	0 %	50 %	0 %	182677044
97	NC_010581	GACC	2	8	44358	44365	25 %	0 %	25 %	50 %	182677044
98	NC_010581	GCCT	2	8	44389	44396	0 %	25 %	25 %	50 %	182677044
99	NC_010581	CTGG	2	8	44646	44653	0 %	25 %	50 %	25 %	182677045
100	NC_010581	CCTG	2	8	44793	44800	0 %	25 %	25 %	50 %	182677045
101	NC_010581	CGGC	2	8	44818	44825	0 %	0 %	50 %	50 %	182677045
102	NC_010581	CCGG	2	8	46510	46517	0 %	0 %	50 %	50 %	182677048
103	NC_010581	TGCC	2	8	46987	46994	0 %	25 %	25 %	50 %	182677049
104	NC_010581	CATC	2	8	47071	47078	25 %	25 %	0 %	50 %	182677049
105	NC_010581	CTTC	2	8	47116	47123	0 %	50 %	0 %	50 %	182677049
106	NC_010581	AGGA	2	8	47454	47461	50 %	0 %	50 %	0 %	182677049
107	NC_010581	GCGG	2	8	47852	47859	0 %	0 %	75 %	25 %	182677049
108	NC_010581	TGGC	2	8	49599	49606	0 %	25 %	50 %	25 %	182677050
109	NC_010581	CGGC	2	8	50289	50296	0 %	0 %	50 %	50 %	182677051
110	NC_010581	TCTT	2	8	50512	50519	0 %	75 %	0 %	25 %	182677051
111	NC_010581	GCCG	2	8	51035	51042	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
112	NC_010581	GCGG	2	8	51398	51405	0 %	0 %	75 %	25 %	182677052
113	NC_010581	CGGC	2	8	51584	51591	0 %	0 %	50 %	50 %	182677052
114	NC_010581	ATGA	2	8	51681	51688	50 %	25 %	25 %	0 %	182677052
115	NC_010581	GCCT	2	8	52309	52316	0 %	25 %	25 %	50 %	182677053
116	NC_010581	GGTC	2	8	52569	52576	0 %	25 %	50 %	25 %	182677053
117	NC_010581	TCCC	2	8	52665	52672	0 %	25 %	0 %	75 %	182677053
118	NC_010581	CCGG	2	8	52706	52713	0 %	0 %	50 %	50 %	182677053
119	NC_010581	TCGA	2	8	53983	53990	25 %	25 %	25 %	25 %	182677053
120	NC_010581	CCGA	2	8	54825	54832	25 %	0 %	25 %	50 %	182677054
121	NC_010581	CCGA	2	8	56292	56299	25 %	0 %	25 %	50 %	182677055
122	NC_010581	CGGC	2	8	56928	56935	0 %	0 %	50 %	50 %	182677055
123	NC_010581	GAAT	2	8	56970	56977	50 %	25 %	25 %	0 %	182677055
124	NC_010581	GAAG	2	8	57269	57276	50 %	0 %	50 %	0 %	182677055
125	NC_010581	CGTT	2	8	57402	57409	0 %	50 %	25 %	25 %	182677055
126	NC_010581	CTGG	2	8	58488	58495	0 %	25 %	50 %	25 %	182677057
127	NC_010581	CAGC	2	8	58917	58924	25 %	0 %	25 %	50 %	182677057
128	NC_010581	GACG	2	8	60569	60576	25 %	0 %	50 %	25 %	182677059
129	NC_010581	GAAC	2	8	60659	60666	50 %	0 %	25 %	25 %	182677059
130	NC_010581	AATG	2	8	61984	61991	50 %	25 %	25 %	0 %	182677061
131	NC_010581	AACC	2	8	62954	62961	50 %	0 %	0 %	50 %	182677062
132	NC_010581	CGGC	2	8	63240	63247	0 %	0 %	50 %	50 %	182677062
133	NC_010581	AAGG	2	8	63259	63266	50 %	0 %	50 %	0 %	182677062
134	NC_010581	GGAT	2	8	63363	63370	25 %	25 %	50 %	0 %	182677062
135	NC_010581	GCAG	2	8	64050	64057	25 %	0 %	50 %	25 %	182677063
136	NC_010581	CTTG	2	8	64150	64157	0 %	50 %	25 %	25 %	182677063
137	NC_010581	CCGT	2	8	64245	64252	0 %	25 %	25 %	50 %	182677063
138	NC_010581	GGAG	2	8	65975	65982	25 %	0 %	75 %	0 %	182677065
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