MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 chromosome

Total Repeats: 48841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010581	CGC	2	6	53	58	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677003
2	NC_010581	GAG	2	6	113	118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677003
3	NC_010581	GCC	2	6	137	142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677003
4	NC_010581	CGC	2	6	166	171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677003
5	NC_010581	CGC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677004
6	NC_010581	TCA	2	6	614	619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677004
7	NC_010581	CCG	2	6	699	704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677004
8	NC_010581	GAC	2	6	1554	1559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677005
9	NC_010581	CGA	2	6	1723	1728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677005
10	NC_010581	CCG	2	6	1858	1863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677005
11	NC_010581	TTC	2	6	1944	1949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677005
12	NC_010581	CGC	2	6	2008	2013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677005
13	NC_010581	TCG	2	6	2044	2049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677005
14	NC_010581	TCT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677005
15	NC_010581	ATG	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677005
16	NC_010581	GCG	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677005
17	NC_010581	GAT	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677005
18	NC_010581	CAG	2	6	2358	2363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677005
19	NC_010581	GCC	2	6	2418	2423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677005
20	NC_010581	CGA	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677005
21	NC_010581	CGA	2	6	2510	2515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677005
22	NC_010581	GAG	2	6	2766	2771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677005
23	NC_010581	TCG	2	6	2782	2787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677005
24	NC_010581	CGC	2	6	2829	2834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677005
25	NC_010581	GCC	2	6	2914	2919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677005
26	NC_010581	TGC	2	6	2947	2952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677005
27	NC_010581	GAG	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677005
28	NC_010581	ATG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677006
29	NC_010581	CCG	2	6	3150	3155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677006
30	NC_010581	GCG	2	6	3247	3252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677006
31	NC_010581	GAG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677006
32	NC_010581	TGG	2	6	3424	3429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677006
33	NC_010581	GCC	2	6	3465	3470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677006
34	NC_010581	TCA	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677006
35	NC_010581	ATG	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677006
36	NC_010581	CTG	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677006
37	NC_010581	GCG	2	6	3617	3622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677006
38	NC_010581	GCT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677006
39	NC_010581	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677006
40	NC_010581	GGA	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677007
41	NC_010581	CTC	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677007
42	NC_010581	CGC	2	6	4027	4032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677007
43	NC_010581	TCA	2	6	4038	4043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677007
44	NC_010581	CGC	2	6	4135	4140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677007
45	NC_010581	GCG	3	9	4190	4198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677007
46	NC_010581	CGC	2	6	4256	4261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677007
47	NC_010581	GTC	2	6	4391	4396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677008
48	NC_010581	ATC	2	6	4437	4442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677008
49	NC_010581	GGC	3	9	4467	4475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677008
50	NC_010581	ACC	2	6	4547	4552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677008
51	NC_010581	CGA	2	6	4633	4638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677008
52	NC_010581	GCC	2	6	4641	4646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677008
53	NC_010581	CCG	2	6	4830	4835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677008
54	NC_010581	AAT	2	6	4915	4920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182677008
55	NC_010581	GCC	2	6	4955	4960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677008
56	NC_010581	CCG	2	6	5106	5111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677008
57	NC_010581	CGG	4	12	5125	5136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677008
58	NC_010581	CAA	2	6	5188	5193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182677008
59	NC_010581	GGC	2	6	5222	5227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677008
60	NC_010581	CAC	2	6	5237	5242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182677008
61	NC_010581	GCC	2	6	5243	5248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677008
62	NC_010581	GGC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677008
63	NC_010581	GGC	3	9	5330	5338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677008
64	NC_010581	TCA	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677008
65	NC_010581	CCG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677009
66	NC_010581	AAG	2	6	5675	5680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677009
67	NC_010581	ATC	2	6	5695	5700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677009
68	NC_010581	GCG	2	6	5708	5713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677009
69	NC_010581	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677009
70	NC_010581	GCC	2	6	5934	5939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677009
71	NC_010581	GTC	2	6	5947	5952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677009
72	NC_010581	GCG	2	6	5967	5972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677009
73	NC_010581	ATT	2	6	6015	6020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677009
74	NC_010581	GCC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677009
75	NC_010581	CGC	2	6	6159	6164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677009
76	NC_010581	CGG	2	6	6193	6198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677009
77	NC_010581	GAT	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677009
78	NC_010581	CGC	2	6	6261	6266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677009
79	NC_010581	GGC	2	6	6435	6440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677009
80	NC_010581	TTC	2	6	6496	6501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677009
81	NC_010581	GCC	2	6	6597	6602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677010
82	NC_010581	CCT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677010
83	NC_010581	CGT	2	6	6683	6688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677010
84	NC_010581	TCG	2	6	6787	6792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677010
85	NC_010581	GCG	2	6	6810	6815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677010
86	NC_010581	CCG	2	6	6883	6888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677010
87	NC_010581	CGC	2	6	6895	6900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677010
88	NC_010581	CGC	2	6	6998	7003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677010
89	NC_010581	ATG	2	6	7054	7059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677010
90	NC_010581	ATT	2	6	7075	7080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182677010
91	NC_010581	GGA	2	6	7163	7168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677010
92	NC_010581	GAA	2	6	7227	7232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677010
93	NC_010581	GCC	2	6	7260	7265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677010
94	NC_010581	TCT	2	6	7275	7280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677010
95	NC_010581	GAT	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677011
96	NC_010581	TGC	2	6	7467	7472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677011
97	NC_010581	CGT	2	6	7606	7611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677011
98	NC_010581	GCC	2	6	7670	7675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677011
99	NC_010581	CGC	2	6	7711	7716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677011
100	NC_010581	GAT	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677011
101	NC_010581	GCG	2	6	7789	7794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677011
102	NC_010581	TGC	2	6	7836	7841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677011
103	NC_010581	CGA	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677011
104	NC_010581	TGA	2	6	7954	7959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677011
105	NC_010581	GAT	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677011
106	NC_010581	GCG	2	6	8088	8093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677011
107	NC_010581	CGG	2	6	8255	8260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677012
108	NC_010581	CTC	2	6	8470	8475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677012
109	NC_010581	GCT	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677012
110	NC_010581	TCA	2	6	8629	8634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677012
111	NC_010581	AGC	2	6	8642	8647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677012
112	NC_010581	TGA	2	6	8666	8671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677012
113	NC_010581	CGT	2	6	8841	8846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677012
114	NC_010581	ATC	2	6	9032	9037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677013
115	NC_010581	TTC	2	6	9113	9118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677013
116	NC_010581	CGA	2	6	9189	9194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677013
117	NC_010581	TGG	2	6	9237	9242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677013
118	NC_010581	TCT	2	6	9249	9254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677013
119	NC_010581	CGG	2	6	9273	9278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677013
120	NC_010581	CGG	2	6	9285	9290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677013
121	NC_010581	ATC	2	6	9341	9346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677013
122	NC_010581	CCT	2	6	10067	10072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677014
123	NC_010581	ATC	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677014
124	NC_010581	AGG	2	6	10760	10765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677015
125	NC_010581	ATG	2	6	10784	10789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677015
126	NC_010581	ACG	2	6	10848	10853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677015
127	NC_010581	GCG	2	6	10913	10918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677015
128	NC_010581	TCA	2	6	10937	10942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677015
129	NC_010581	TGG	2	6	10953	10958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677015
130	NC_010581	CGA	2	6	11031	11036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677015
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134	NC_010581	TGC	2	6	11240	11245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677015
135	NC_010581	CGT	2	6	11355	11360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677015
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138	NC_010581	CCG	2	6	11423	11428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677015
139	NC_010581	GCG	3	9	11431	11439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677015
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240	NC_010581	CGT	2	6	18683	18688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677018
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247	NC_010581	GCC	2	6	19119	19124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677018
248	NC_010581	GGC	2	6	19158	19163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677018
249	NC_010581	GAT	2	6	19208	19213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677018
250	NC_010581	ACG	2	6	19261	19266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677018
251	NC_010581	CGC	2	6	19302	19307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677018
252	NC_010581	GCT	2	6	19314	19319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677018
253	NC_010581	CGG	2	6	19364	19369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677018
254	NC_010581	GCG	2	6	19484	19489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677018
255	NC_010581	GCC	2	6	19496	19501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677018
256	NC_010581	GCG	2	6	19518	19523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677018
257	NC_010581	CCG	2	6	19638	19643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677018
258	NC_010581	TGG	2	6	19766	19771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182677018
259	NC_010581	GCA	2	6	19883	19888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677019
260	NC_010581	ATC	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677019
261	NC_010581	CGC	2	6	20008	20013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677019
262	NC_010581	CCT	2	6	20064	20069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677019
263	NC_010581	GGC	3	9	20115	20123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182677019
264	NC_010581	TTC	2	6	20158	20163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677019
265	NC_010581	CCT	2	6	20301	20306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182677019
266	NC_010581	GCC	3	9	20359	20367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677019
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269	NC_010581	GCT	2	6	20466	20471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677019
270	NC_010581	GAT	2	6	20658	20663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677020
271	NC_010581	TCT	2	6	20756	20761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182677020
272	NC_010581	CGC	2	6	20824	20829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677020
273	NC_010581	GAT	2	6	20838	20843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677020
274	NC_010581	GAT	2	6	20859	20864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677020
275	NC_010581	TGT	2	6	20963	20968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677020
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278	NC_010581	GCC	2	6	21403	21408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677020
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282	NC_010581	TTG	2	6	21660	21665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182677021
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286	NC_010581	CAT	3	9	22018	22026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677021
287	NC_010581	CGC	2	6	22057	22062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677021
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289	NC_010581	AGG	2	6	22242	22247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182677021
290	NC_010581	TCA	2	6	22360	22365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677021
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292	NC_010581	GCA	2	6	22447	22452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677021
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294	NC_010581	GCA	2	6	22742	22747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182677022
295	NC_010581	TGA	2	6	22805	22810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677022
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377	NC_010581	GAA	2	6	29995	30000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182677029
378	NC_010581	CAT	2	6	30067	30072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182677029
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381	NC_010581	GAT	2	6	30240	30245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182677029
382	NC_010581	CTG	2	6	30275	30280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182677029
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500	NC_010581	CCG	2	6	38564	38569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182677038

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