MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	AGAACA	2	12	3560	3571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	182676831
2	NC_010580	GATCGT	2	12	3926	3937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676832
3	NC_010580	GCCAAA	2	12	5753	5764	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	182676834
4	NC_010580	CCGCGC	2	12	6593	6604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676835
5	NC_010580	GACATC	2	12	6987	6998	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182676835
6	NC_010580	TTAGCA	2	12	9268	9279	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_010580	ATATTA	2	12	9338	9349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010580	ATCAAG	2	12	9433	9444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_010580	AACCTG	2	12	9776	9787	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010580	TGACGT	2	12	11170	11181	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676840
11	NC_010580	CCTGAT	2	12	12675	12686	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182676841
12	NC_010580	GTCGCG	2	12	12772	12783	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	182676841
13	NC_010580	CATCTT	2	12	15333	15344	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010580	CTTCAT	2	12	25820	25831	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	182676845
15	NC_010580	TCAGCT	2	12	26404	26415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182676845
16	NC_010580	CCAGCG	2	12	26813	26824	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182676845
17	NC_010580	CATCGC	2	12	26825	26836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182676845
18	NC_010580	GTTCAG	2	12	33148	33159	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676852
19	NC_010580	ATTTGT	2	12	34914	34925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	182676855
20	NC_010580	CTCGAC	2	12	36625	36636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182676860
21	NC_010580	CTTCCC	2	12	37164	37175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182676861
22	NC_010580	GCCCTT	2	12	38150	38161	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182676863
23	NC_010580	GCTCGC	2	12	38409	38420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182676864
24	NC_010580	GGCGAA	2	12	49778	49789	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	182676880
25	NC_010580	GGTCCT	2	12	55847	55858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676884
26	NC_010580	GTTGGA	2	12	57278	57289	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	182676888
27	NC_010580	CTCGTT	2	12	59845	59856	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182676893
28	NC_010580	ATGGCC	2	12	60176	60187	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676893
29	NC_010580	CCCGCG	2	12	72463	72474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182676905
30	NC_010580	TCACCT	2	12	72675	72686	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	182676905
31	NC_010580	GCCTTG	2	12	72758	72769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676905
32	NC_010580	CTCGAC	2	12	75831	75842	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182676908
33	NC_010580	ATGCCG	2	12	76162	76173	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676908
34	NC_010580	CTGCGC	2	12	76389	76400	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182676908
35	NC_010580	CTCTTG	2	12	80752	80763	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	182676911
36	NC_010580	CGCAGC	2	12	83774	83785	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182676914
37	NC_010580	CGCGGC	2	12	86105	86116	0 %	0 %	50 %	50 %	182676917
38	NC_010580	GCGCCA	2	12	86152	86163	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182676917
39	NC_010580	GCTTCA	2	12	95663	95674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_010580	TCCGCC	2	12	97992	98003	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_010580	GATCCT	2	12	105826	105837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182676935
42	NC_010580	GCCAGC	2	12	106315	106326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182676936
43	NC_010580	TCGATG	2	12	106771	106782	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676936
44	NC_010580	GACGCT	2	12	108441	108452	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676937
45	NC_010580	GCCTCG	2	12	114789	114800	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	182676942
46	NC_010580	CTTCGC	2	12	115217	115228	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	182676943
47	NC_010580	TGGCCT	2	12	122685	122696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182676949
48	NC_010580	TTTATT	2	12	123333	123344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	182676950
49	NC_010580	GAAGCC	2	12	123549	123560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010580	CTTGCC	2	12	129961	129972	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_010580	GAAGCA	2	12	131561	131572	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_010580	ATGTCG	2	12	141409	141420	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676964
53	NC_010580	GACGGC	2	12	147995	148006	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010580	CAGCCA	2	12	148487	148498	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_010580	GACAGC	2	12	150501	150512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182676968
56	NC_010580	ATGGCC	2	12	152255	152266	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676970
57	NC_010580	CGAGCG	2	12	154842	154853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	182676973
58	NC_010580	CGATGA	2	12	161300	161311	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182676980
59	NC_010580	TCGGGA	2	12	162143	162154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182676980
60	NC_010580	TGGCAT	2	12	162290	162301	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	182676980
61	NC_010580	CGCTGA	2	12	165543	165554	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182676983
62	NC_010580	TTATTC	2	12	166780	166791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	182676985
63	NC_010580	CCTGAT	2	12	167810	167821	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182676987
64	NC_010580	TCCAAT	2	12	169737	169748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182676989
65	NC_010580	GGCGCG	2	12	171463	171474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182676990
66	NC_010580	GCGGAT	2	12	175550	175561	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	182676996
67	NC_010580	ATGAGC	2	12	177115	177126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	182676996
68	NC_010580	CAAATA	2	12	180580	180591	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	182677001

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.