MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	CATGC	2	10	8884	8893	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010580	AGCCG	2	10	35975	35984	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_010580	TTGGT	2	10	38955	38964	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010580	AGCTC	2	10	42206	42215	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_010580	GAAGG	2	10	44913	44922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010580	TCCTT	2	10	47563	47572	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_010580	CAGCG	2	10	55047	55056	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010580	GATGG	2	10	55199	55208	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010580	CAGCG	2	10	56664	56673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_010580	GGATT	2	10	56790	56799	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010580	CAGCG	2	10	63619	63628	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_010580	GGCGC	2	10	64231	64240	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_010580	CTGGG	2	10	68231	68240	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_010580	CTGCG	2	10	69307	69316	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_010580	GTCGA	2	10	71528	71537	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_010580	TTGAT	2	10	88643	88652	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010580	CAATG	2	10	93531	93540	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_010580	ATCAG	2	10	94024	94033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_010580	TTTGC	2	10	94449	94458	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010580	AAAAT	2	10	96406	96415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010580	CGATC	2	10	98104	98113	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_010580	CCATT	2	10	101362	101371	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_010580	GCTTG	2	10	101880	101889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_010580	TGTTT	2	10	123638	123647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010580	AGAAA	2	10	125914	125923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010580	ACAAA	2	10	125926	125935	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_010580	GGAAG	2	10	128335	128344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010580	GTCGA	2	10	129757	129766	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_010580	AGCGC	2	10	133020	133029	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
30	NC_010580	CTTCA	2	10	135044	135053	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_010580	GCAGC	2	10	137474	137483	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_010580	TGTTT	2	10	138654	138663	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010580	GAAAC	2	10	138888	138897	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_010580	TTTAG	2	10	139236	139245	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010580	TCCCA	2	10	147304	147313	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_010580	TATTT	2	10	148968	148977	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010580	GAAGA	2	10	149963	149972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010580	AGGGG	2	10	151796	151805	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.