MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	CGCGC	2	10	1131	1140	0 %	0 %	40 %	60 %	182676827
2	NC_010580	CCCGA	2	10	3249	3258	20 %	0 %	20 %	60 %	182676830
3	NC_010580	GTCTG	2	10	3501	3510	0 %	40 %	40 %	20 %	182676831
4	NC_010580	ACCCG	2	10	5461	5470	20 %	0 %	20 %	60 %	182676833
5	NC_010580	CCCAG	2	10	10396	10405	20 %	0 %	20 %	60 %	182676839
6	NC_010580	TTCGT	2	10	11668	11677	0 %	60 %	20 %	20 %	182676841
7	NC_010580	GCCTT	2	10	12743	12752	0 %	40 %	20 %	40 %	182676841
8	NC_010580	GCCGC	2	10	14368	14377	0 %	0 %	40 %	60 %	182676841
9	NC_010580	GGTCG	2	10	14749	14758	0 %	20 %	60 %	20 %	182676841
10	NC_010580	ATTAT	2	10	16121	16130	40 %	60 %	0 %	0 %	182676844
11	NC_010580	CTATT	2	10	16327	16336	20 %	60 %	0 %	20 %	182676844
12	NC_010580	CGGCG	2	10	16824	16833	0 %	0 %	60 %	40 %	182676844
13	NC_010580	CGGGG	2	10	20466	20475	0 %	0 %	80 %	20 %	182676844
14	NC_010580	CGACG	2	10	20664	20673	20 %	0 %	40 %	40 %	182676844
15	NC_010580	GGCGG	2	10	22189	22198	0 %	0 %	80 %	20 %	182676844
16	NC_010580	GCGCG	2	10	25121	25130	0 %	0 %	60 %	40 %	182676845
17	NC_010580	CTTGC	2	10	27131	27140	0 %	40 %	20 %	40 %	182676846
18	NC_010580	GCCAG	2	10	28093	28102	20 %	0 %	40 %	40 %	182676846
19	NC_010580	AGCAA	2	10	29606	29615	60 %	0 %	20 %	20 %	182676848
20	NC_010580	CTCAT	2	10	30583	30592	20 %	40 %	0 %	40 %	182676849
21	NC_010580	CCAAC	2	10	34461	34470	40 %	0 %	0 %	60 %	182676854
22	NC_010580	CGCCT	2	10	35346	35355	0 %	20 %	20 %	60 %	182676856
23	NC_010580	AGAAA	2	10	36415	36424	80 %	0 %	20 %	0 %	182676859
24	NC_010580	TTATT	2	10	37587	37596	20 %	80 %	0 %	0 %	182676862
25	NC_010580	ACGAT	2	10	40014	40023	40 %	20 %	20 %	20 %	182676866
26	NC_010580	GCGCG	2	10	43168	43177	0 %	0 %	60 %	40 %	182676870
27	NC_010580	TTTCG	2	10	43345	43354	0 %	60 %	20 %	20 %	182676871
28	NC_010580	GTAAT	2	10	43541	43550	40 %	40 %	20 %	0 %	182676871
29	NC_010580	GGAAG	2	10	45181	45190	40 %	0 %	60 %	0 %	182676876
30	NC_010580	CGTCC	2	10	45279	45288	0 %	20 %	20 %	60 %	182676876
31	NC_010580	GGTCA	2	10	46542	46551	20 %	20 %	40 %	20 %	182676878
32	NC_010580	GGGGC	2	10	48432	48441	0 %	0 %	80 %	20 %	182676879
33	NC_010580	CGCGG	2	10	51287	51296	0 %	0 %	60 %	40 %	182676880
34	NC_010580	CTGCG	2	10	52479	52488	0 %	20 %	40 %	40 %	182676880
35	NC_010580	GGCCG	2	10	54063	54072	0 %	0 %	60 %	40 %	182676880
36	NC_010580	AGGCG	2	10	59712	59721	20 %	0 %	60 %	20 %	182676893
37	NC_010580	CCGCG	2	10	60200	60209	0 %	0 %	40 %	60 %	182676893
38	NC_010580	CCGCG	2	10	60681	60690	0 %	0 %	40 %	60 %	182676893
39	NC_010580	GCGAT	2	10	61382	61391	20 %	20 %	40 %	20 %	182676893
40	NC_010580	GATCG	2	10	63398	63407	20 %	20 %	40 %	20 %	182676896
41	NC_010580	CCCTG	2	10	64144	64153	0 %	20 %	20 %	60 %	182676897
42	NC_010580	CCCTC	2	10	65326	65335	0 %	20 %	0 %	80 %	182676899
43	NC_010580	AGTGA	2	10	73616	73625	40 %	20 %	40 %	0 %	182676906
44	NC_010580	GATGC	2	10	77088	77097	20 %	20 %	40 %	20 %	182676908
45	NC_010580	CTTGA	2	10	77223	77232	20 %	40 %	20 %	20 %	182676908
46	NC_010580	TCGCG	2	10	78742	78751	0 %	20 %	40 %	40 %	182676908
47	NC_010580	CGCGG	2	10	78800	78809	0 %	0 %	60 %	40 %	182676908
48	NC_010580	CTCGG	2	10	79598	79607	0 %	20 %	40 %	40 %	182676909
49	NC_010580	CGAGT	2	10	81192	81201	20 %	20 %	40 %	20 %	182676911
50	NC_010580	CGGAT	2	10	85750	85759	20 %	20 %	40 %	20 %	182676916
51	NC_010580	AGGGC	2	10	86042	86051	20 %	0 %	60 %	20 %	182676916
52	NC_010580	TCGCC	2	10	87404	87413	0 %	20 %	20 %	60 %	182676920
53	NC_010580	GCAGG	2	10	87720	87729	20 %	0 %	60 %	20 %	182676920
54	NC_010580	CGGGG	2	10	88357	88366	0 %	0 %	80 %	20 %	182676920
55	NC_010580	ATTGC	2	10	89258	89267	20 %	40 %	20 %	20 %	182676921
56	NC_010580	GATGC	2	10	90675	90684	20 %	20 %	40 %	20 %	182676923
57	NC_010580	TGTCA	2	10	91560	91569	20 %	40 %	20 %	20 %	182676924
58	NC_010580	AGTAG	2	10	99572	99581	40 %	20 %	40 %	0 %	182676929
59	NC_010580	AAGCA	2	10	100051	100060	60 %	0 %	20 %	20 %	182676930
60	NC_010580	TCACC	2	10	102539	102548	20 %	20 %	0 %	60 %	182676932
61	NC_010580	GGGCA	2	10	104487	104496	20 %	0 %	60 %	20 %	182676934
62	NC_010580	CGGAC	2	10	110951	110960	20 %	0 %	40 %	40 %	182676939
63	NC_010580	TCTCG	2	10	111383	111392	0 %	40 %	20 %	40 %	182676939
64	NC_010580	GGAGC	2	10	113099	113108	20 %	0 %	60 %	20 %	182676940
65	NC_010580	ATCGC	2	10	115375	115384	20 %	20 %	20 %	40 %	182676943
66	NC_010580	GCCAT	2	10	115621	115630	20 %	20 %	20 %	40 %	182676943
67	NC_010580	GCTCG	2	10	116216	116225	0 %	20 %	40 %	40 %	182676943
68	NC_010580	CACAG	2	10	116728	116737	40 %	0 %	20 %	40 %	182676943
69	NC_010580	GAGAA	2	10	117411	117420	60 %	0 %	40 %	0 %	182676944
70	NC_010580	CCGCC	2	10	120961	120970	0 %	0 %	20 %	80 %	182676948
71	NC_010580	CTCGC	2	10	121017	121026	0 %	20 %	20 %	60 %	182676948
72	NC_010580	GCCAT	2	10	122033	122042	20 %	20 %	20 %	40 %	182676949
73	NC_010580	TGCCA	2	10	124629	124638	20 %	20 %	20 %	40 %	182676951
74	NC_010580	GAATG	2	10	125880	125889	40 %	20 %	40 %	0 %	182676951
75	NC_010580	CGTCC	2	10	131882	131891	0 %	20 %	20 %	60 %	182676956
76	NC_010580	TCCAT	2	10	142178	142187	20 %	40 %	0 %	40 %	182676965
77	NC_010580	TTCGA	2	10	142511	142520	20 %	40 %	20 %	20 %	182676965
78	NC_010580	ATGCG	2	10	142734	142743	20 %	20 %	40 %	20 %	182676965
79	NC_010580	AACAA	2	10	143826	143835	80 %	0 %	0 %	20 %	182676965
80	NC_010580	TGCTG	2	10	145306	145315	0 %	40 %	40 %	20 %	182676965
81	NC_010580	CTTTT	2	10	159579	159588	0 %	80 %	0 %	20 %	182676978
82	NC_010580	GACGG	2	10	160917	160926	20 %	0 %	60 %	20 %	182676980
83	NC_010580	CGATG	2	10	164924	164933	20 %	20 %	40 %	20 %	182676982
84	NC_010580	CTGTC	2	10	167758	167767	0 %	40 %	20 %	40 %	182676987
85	NC_010580	CATGC	2	10	168715	168724	20 %	20 %	20 %	40 %	182676988
86	NC_010580	CAATT	2	10	169368	169377	40 %	40 %	0 %	20 %	182676989
87	NC_010580	GTCAG	2	10	171395	171404	20 %	20 %	40 %	20 %	182676990
88	NC_010580	CGAGG	2	10	172711	172720	20 %	0 %	60 %	20 %	182676991
89	NC_010580	GCTCT	2	10	174302	174311	0 %	40 %	20 %	40 %	182676994
90	NC_010580	CTCGC	2	10	175212	175221	0 %	20 %	20 %	60 %	182676996
91	NC_010580	GAAGA	2	10	175632	175641	60 %	0 %	40 %	0 %	182676996
92	NC_010580	GCCCC	2	10	176631	176640	0 %	0 %	20 %	80 %	182676996
93	NC_010580	GCTCG	2	10	176702	176711	0 %	20 %	40 %	40 %	182676996
94	NC_010580	TGCCG	2	10	177200	177209	0 %	20 %	40 %	40 %	182676996
95	NC_010580	CGGCT	2	10	178005	178014	0 %	20 %	40 %	40 %	182676996
96	NC_010580	GCGCG	2	10	178859	178868	0 %	0 %	60 %	40 %	182676997
97	NC_010580	GGTCC	2	10	179132	179141	0 %	20 %	40 %	40 %	182676998
98	NC_010580	TTTAC	2	10	180473	180482	20 %	60 %	0 %	20 %	182677000

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.