MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 470

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	GAT	2	6	8263	8268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010580	TAA	2	6	8306	8311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010580	TAA	2	6	8321	8326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010580	ACG	2	6	9039	9044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_010580	GTC	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_010580	AAG	2	6	9094	9099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010580	ATT	2	6	9206	9211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010580	ATG	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010580	TGA	2	6	9376	9381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010580	GCG	2	6	9498	9503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010580	TCC	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_010580	TCT	2	6	15199	15204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_010580	ACA	2	6	15232	15237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_010580	AAG	2	6	15256	15261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_010580	ATC	2	6	15583	15588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_010580	GGC	2	6	15603	15608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010580	TCA	2	6	15646	15651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_010580	TAA	2	6	16110	16115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010580	CGG	2	6	24881	24886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010580	CTT	2	6	24922	24927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010580	AAG	2	6	28732	28737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010580	ATC	2	6	28743	28748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_010580	TTC	2	6	28765	28770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_010580	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010580	CTT	2	6	28802	28807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_010580	CAT	2	6	29287	29292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_010580	AGA	2	6	29305	29310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010580	TTC	2	6	29455	29460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010580	AGC	2	6	32643	32648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_010580	ACG	2	6	32672	32677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010580	AGG	2	6	33790	33795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010580	ATG	2	6	35110	35115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010580	CAG	2	6	35178	35183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010580	GAT	2	6	35930	35935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010580	GCA	2	6	37501	37506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_010580	TGA	2	6	37553	37558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010580	TTG	2	6	38019	38024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010580	TGA	2	6	38057	38062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010580	CGC	2	6	38728	38733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_010580	CAA	2	6	38746	38751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_010580	GGA	2	6	38825	38830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010580	GAG	2	6	38903	38908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010580	GAA	2	6	38922	38927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010580	GCG	2	6	38934	38939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010580	TTG	2	6	38943	38948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010580	GCC	2	6	39292	39297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_010580	CCT	2	6	39737	39742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_010580	CTG	2	6	41729	41734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_010580	GGA	2	6	41849	41854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010580	GAG	2	6	41926	41931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010580	GAA	2	6	41948	41953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010580	CGG	2	6	42022	42027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010580	CGG	2	6	42264	42269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010580	CAG	2	6	42302	42307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_010580	GAA	2	6	42563	42568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010580	TGA	2	6	42580	42585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010580	TAA	2	6	42627	42632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_010580	GCG	2	6	43966	43971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010580	TGA	2	6	44233	44238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010580	AGA	2	6	45839	45844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010580	GAG	2	6	47796	47801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010580	ATC	2	6	47818	47823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010580	ATC	2	6	47838	47843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010580	TCG	2	6	47882	47887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_010580	TCG	2	6	48013	48018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010580	GCT	2	6	48071	48076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_010580	GGC	2	6	48211	48216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_010580	GAA	2	6	48250	48255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010580	AGC	2	6	48261	48266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010580	GCG	2	6	48293	48298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_010580	TGA	2	6	48343	48348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010580	AGG	2	6	49053	49058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010580	TCT	2	6	54962	54967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_010580	GCG	2	6	55018	55023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_010580	GGC	2	6	55154	55159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_010580	GAC	2	6	55597	55602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010580	TGA	2	6	55628	55633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010580	TCT	2	6	56580	56585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010580	GGA	2	6	56618	56623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010580	GCG	2	6	56635	56640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010580	TCT	2	6	56718	56723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010580	ATT	2	6	57124	57129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_010580	TTG	2	6	57133	57138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_010580	CGG	2	6	57544	57549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_010580	GCC	2	6	57615	57620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_010580	CGA	2	6	57979	57984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_010580	AAG	2	6	57999	58004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010580	TCT	2	6	58117	58122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010580	CGG	2	6	58267	58272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_010580	CGA	2	6	58318	58323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010580	GCC	2	6	58346	58351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_010580	TCT	2	6	58482	58487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010580	ATC	2	6	58618	58623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010580	TCG	2	6	58647	58652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010580	CCA	2	6	63561	63566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_010580	GCG	2	6	63590	63595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_010580	ATT	2	6	65982	65987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010580	CAC	3	9	65993	66001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_010580	GCT	2	6	67760	67765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010580	GAC	2	6	68068	68073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010580	ATC	2	6	68077	68082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010580	CTG	2	6	68140	68145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_010580	ACT	2	6	68154	68159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_010580	GCT	2	6	68172	68177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_010580	TGA	2	6	68265	68270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_010580	CCA	2	6	68357	68362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_010580	TCG	2	6	68491	68496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010580	GAA	2	6	68681	68686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_010580	TTG	2	6	68704	68709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010580	ATG	2	6	68743	68748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010580	GCG	2	6	68788	68793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010580	GCG	3	9	68818	68826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_010580	GGC	2	6	68876	68881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_010580	GAC	2	6	68935	68940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010580	TTC	2	6	69055	69060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_010580	CGC	2	6	69097	69102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_010580	AGC	2	6	69146	69151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_010580	CGC	2	6	69324	69329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_010580	GCT	2	6	69492	69497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010580	ATG	2	6	69538	69543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010580	CTG	2	6	69562	69567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_010580	CAC	2	6	69635	69640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_010580	CTT	2	6	69654	69659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010580	CCG	2	6	69714	69719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010580	ATA	2	6	69786	69791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010580	CTG	2	6	70140	70145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010580	TAA	2	6	70548	70553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_010580	GAA	3	9	70570	70578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_010580	CCG	2	6	70581	70586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_010580	AGC	2	6	70968	70973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_010580	GAT	2	6	70975	70980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_010580	GAA	2	6	71064	71069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_010580	AGC	2	6	71079	71084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010580	GAA	2	6	71100	71105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_010580	GCG	2	6	71216	71221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010580	CAG	2	6	71346	71351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_010580	GCG	2	6	71396	71401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010580	TCA	2	6	71415	71420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_010580	GAC	2	6	71423	71428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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406	NC_010580	ACC	2	6	148453	148458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
407	NC_010580	GGC	2	6	148605	148610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_010580	CTG	2	6	148687	148692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_010580	GCA	2	6	148749	148754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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411	NC_010580	GCC	2	6	148874	148879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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413	NC_010580	GCG	2	6	149105	149110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_010580	GGA	2	6	149799	149804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_010580	ATA	2	6	150138	150143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_010580	TTC	2	6	167082	167087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_010580	TAT	2	6	167644	167649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.