MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND01

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010580	C	6	6	433	438	0 %	0 %	0 %	100 %	182676826
2	NC_010580	G	6	6	1574	1579	0 %	0 %	100 %	0 %	182676828
3	NC_010580	C	6	6	14568	14573	0 %	0 %	0 %	100 %	182676841
4	NC_010580	A	9	9	15885	15893	100 %	0 %	0 %	0 %	182676843
5	NC_010580	C	6	6	17769	17774	0 %	0 %	0 %	100 %	182676844
6	NC_010580	G	6	6	18975	18980	0 %	0 %	100 %	0 %	182676844
7	NC_010580	G	6	6	19264	19269	0 %	0 %	100 %	0 %	182676844
8	NC_010580	T	6	6	24916	24921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010580	C	6	6	27218	27223	0 %	0 %	0 %	100 %	182676846
10	NC_010580	T	6	6	29464	29469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010580	A	6	6	29558	29563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010580	T	6	6	29627	29632	0 %	100 %	0 %	0 %	182676848
13	NC_010580	T	6	6	30935	30940	0 %	100 %	0 %	0 %	182676849
14	NC_010580	T	6	6	31802	31807	0 %	100 %	0 %	0 %	182676850
15	NC_010580	A	6	6	32602	32607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010580	T	7	7	32632	32638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_010580	G	6	6	36986	36991	0 %	0 %	100 %	0 %	182676861
18	NC_010580	T	6	6	37059	37064	0 %	100 %	0 %	0 %	182676861
19	NC_010580	T	6	6	37842	37847	0 %	100 %	0 %	0 %	182676862
20	NC_010580	T	7	7	38269	38275	0 %	100 %	0 %	0 %	182676863
21	NC_010580	T	6	6	43815	43820	0 %	100 %	0 %	0 %	182676871
22	NC_010580	T	6	6	44727	44732	0 %	100 %	0 %	0 %	182676874
23	NC_010580	T	6	6	45153	45158	0 %	100 %	0 %	0 %	182676876
24	NC_010580	T	6	6	46602	46607	0 %	100 %	0 %	0 %	182676878
25	NC_010580	T	6	6	46955	46960	0 %	100 %	0 %	0 %	182676878
26	NC_010580	G	6	6	47767	47772	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010580	G	6	6	47789	47794	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010580	T	6	6	49619	49624	0 %	100 %	0 %	0 %	182676880
29	NC_010580	A	8	8	55138	55145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010580	T	6	6	55455	55460	0 %	100 %	0 %	0 %	182676883
31	NC_010580	T	6	6	56895	56900	0 %	100 %	0 %	0 %	182676886
32	NC_010580	A	8	8	57580	57587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010580	C	6	6	58381	58386	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_010580	T	6	6	63319	63324	0 %	100 %	0 %	0 %	182676896
35	NC_010580	T	6	6	63449	63454	0 %	100 %	0 %	0 %	182676896
36	NC_010580	T	6	6	65018	65023	0 %	100 %	0 %	0 %	182676899
37	NC_010580	A	6	6	68016	68021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_010580	A	6	6	69082	69087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010580	T	6	6	70619	70624	0 %	100 %	0 %	0 %	182676904
40	NC_010580	G	6	6	77705	77710	0 %	0 %	100 %	0 %	182676908
41	NC_010580	C	6	6	79716	79721	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_010580	C	6	6	84185	84190	0 %	0 %	0 %	100 %	182676915
43	NC_010580	T	6	6	86580	86585	0 %	100 %	0 %	0 %	182676918
44	NC_010580	A	6	6	87886	87891	100 %	0 %	0 %	0 %	182676920
45	NC_010580	A	7	7	88951	88957	100 %	0 %	0 %	0 %	182676921
46	NC_010580	A	6	6	89162	89167	100 %	0 %	0 %	0 %	182676921
47	NC_010580	C	6	6	97119	97124	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_010580	T	6	6	97608	97613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010580	T	6	6	100027	100032	0 %	100 %	0 %	0 %	182676930
50	NC_010580	A	6	6	100619	100624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010580	G	6	6	100832	100837	0 %	0 %	100 %	0 %	182676931
52	NC_010580	T	7	7	102644	102650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010580	G	6	6	103348	103353	0 %	0 %	100 %	0 %	182676933
54	NC_010580	T	6	6	104381	104386	0 %	100 %	0 %	0 %	182676934
55	NC_010580	T	6	6	105215	105220	0 %	100 %	0 %	0 %	182676935
56	NC_010580	G	6	6	108850	108855	0 %	0 %	100 %	0 %	182676937
57	NC_010580	A	6	6	114396	114401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_010580	T	6	6	116038	116043	0 %	100 %	0 %	0 %	182676943
60	NC_010580	T	7	7	116452	116458	0 %	100 %	0 %	0 %	182676943
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62	NC_010580	T	6	6	126019	126024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010580	A	6	6	126298	126303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010580	A	6	6	126755	126760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010580	A	6	6	126815	126820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_010580	A	6	6	126827	126832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010580	A	6	6	127652	127657	100 %	0 %	0 %	0 %	182676954
68	NC_010580	T	6	6	127931	127936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010580	A	6	6	128411	128416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010580	A	6	6	128568	128573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010580	A	6	6	129397	129402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_010580	T	6	6	130352	130357	0 %	100 %	0 %	0 %	182676955
74	NC_010580	A	6	6	132643	132648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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76	NC_010580	A	6	6	138628	138633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010580	A	6	6	138998	139003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_010580	A	8	8	139212	139219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_010580	T	7	7	140557	140563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010580	A	6	6	140678	140683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_010580	T	6	6	146949	146954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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90	NC_010580	A	6	6	150251	150256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010580	A	7	7	150332	150338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010580	A	6	6	154014	154019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_010580	G	6	6	157025	157030	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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99	NC_010580	A	7	7	159887	159893	100 %	0 %	0 %	0 %	182676978
100	NC_010580	A	6	6	161474	161479	100 %	0 %	0 %	0 %	182676980
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102	NC_010580	A	6	6	167071	167076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010580	A	7	7	167202	167208	100 %	0 %	0 %	0 %	182676986
104	NC_010580	A	6	6	167447	167452	100 %	0 %	0 %	0 %	182676986
105	NC_010580	C	6	6	170087	170092	0 %	0 %	0 %	100 %	182676989
106	NC_010580	G	6	6	170394	170399	0 %	0 %	100 %	0 %	182676990
107	NC_010580	T	6	6	173480	173485	0 %	100 %	0 %	0 %	182676992
108	NC_010580	T	7	7	173786	173792	0 %	100 %	0 %	0 %	182676993
109	NC_010580	T	7	7	173943	173949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010580	A	6	6	178222	178227	100 %	0 %	0 %	0 %	182676996
111	NC_010580	T	6	6	178485	178490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_010580	T	7	7	179804	179810	0 %	100 %	0 %	0 %	182676999
113	NC_010580	T	6	6	180132	180137	0 %	100 %	0 %	0 %	182677000
114	NC_010580	T	7	7	181223	181229	0 %	100 %	0 %	0 %	182677001
115	NC_010580	A	6	6	181693	181698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.