MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	GTCACG	2	12	767	778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	182682736
2	NC_010579	GAGTAA	2	12	2101	2112	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	182682736
3	NC_010579	CCGCAG	2	12	4753	4764	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182682739
4	NC_010579	GAAACA	2	12	6166	6177	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	182682740
5	NC_010579	ACATGA	2	12	6391	6402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	182682741
6	NC_010579	CAAGCA	2	12	7492	7503	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	182682743
7	NC_010579	TTCCTC	2	12	9801	9812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_010579	CGCCGA	2	12	10274	10285	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	182682746
9	NC_010579	CTTGTT	2	12	15239	15250	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	182682752
10	NC_010579	TTCTTT	2	12	16086	16097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	182682752
11	NC_010579	GAAACG	2	12	16379	16390	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	182682752
12	NC_010579	CAGACT	2	12	20022	20033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182682754
13	NC_010579	CCCGTA	2	12	27259	27270	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	182682759
14	NC_010579	CGCATT	2	12	32658	32669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	182682767
15	NC_010579	CAAAGC	2	12	32975	32986	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	182682767
16	NC_010579	GCAATC	2	12	37284	37295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	182682773
17	NC_010579	TGGTGC	2	12	38108	38119	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	182682774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.