MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	CGCAC	2	10	860	869	20 %	0 %	20 %	60 %	182682736
2	NC_010579	AATGG	2	10	2011	2020	40 %	20 %	40 %	0 %	182682736
3	NC_010579	CCTTG	2	10	2032	2041	0 %	40 %	20 %	40 %	182682736
4	NC_010579	CATTT	2	10	3544	3553	20 %	60 %	0 %	20 %	182682737
5	NC_010579	CAGTG	2	10	6533	6542	20 %	20 %	40 %	20 %	182682741
6	NC_010579	GTGGC	2	10	11498	11507	0 %	20 %	60 %	20 %	182682747
7	NC_010579	AGCTA	2	10	12096	12105	40 %	20 %	20 %	20 %	182682748
8	NC_010579	CCAAG	2	10	12434	12443	40 %	0 %	20 %	40 %	182682748
9	NC_010579	AGCTA	2	10	13248	13257	40 %	20 %	20 %	20 %	182682750
10	NC_010579	TGCCG	2	10	13788	13797	0 %	20 %	40 %	40 %	182682750
11	NC_010579	ACGAT	2	10	14145	14154	40 %	20 %	20 %	20 %	182682751
12	NC_010579	TTGGC	2	10	15755	15764	0 %	40 %	40 %	20 %	182682752
13	NC_010579	TCCAA	2	10	16295	16304	40 %	20 %	0 %	40 %	182682752
14	NC_010579	TCGTC	2	10	19309	19318	0 %	40 %	20 %	40 %	182682753
15	NC_010579	GCGTA	2	10	20863	20872	20 %	20 %	40 %	20 %	182682754
16	NC_010579	ATCGT	2	10	21314	21323	20 %	40 %	20 %	20 %	182682754
17	NC_010579	AGACA	2	10	22879	22888	60 %	0 %	20 %	20 %	182682756
18	NC_010579	TTGCG	2	10	23797	23806	0 %	40 %	40 %	20 %	182682756
19	NC_010579	CACTT	2	10	24300	24309	20 %	40 %	0 %	40 %	182682757
20	NC_010579	AGCGC	2	10	26116	26125	20 %	0 %	40 %	40 %	182682757
21	NC_010579	ATTTA	2	10	27009	27018	40 %	60 %	0 %	0 %	182682759
22	NC_010579	GGAAG	2	10	27179	27188	40 %	0 %	60 %	0 %	182682759
23	NC_010579	CAACG	2	10	28120	28129	40 %	0 %	20 %	40 %	182682760
24	NC_010579	CCAAA	2	10	30685	30694	60 %	0 %	0 %	40 %	182682764
25	NC_010579	CGTTC	2	10	31622	31631	0 %	40 %	20 %	40 %	182682765
26	NC_010579	GGCTG	2	10	32674	32683	0 %	20 %	60 %	20 %	182682767
27	NC_010579	TGCAC	2	10	33032	33041	20 %	20 %	20 %	40 %	182682767
28	NC_010579	AAAGA	2	10	36346	36355	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_010579	ATTTC	2	10	36463	36472	20 %	60 %	0 %	20 %	182682772
30	NC_010579	TATCA	2	10	36785	36794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_010579	ACCAC	2	10	37531	37540	40 %	0 %	0 %	60 %	182682773

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.