MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	TGGG	2	8	58	65	0 %	25 %	75 %	0 %	182682735
2	NC_010579	AAGA	2	8	182	189	75 %	0 %	25 %	0 %	182682735
3	NC_010579	CTTG	2	8	373	380	0 %	50 %	25 %	25 %	182682736
4	NC_010579	CATG	2	8	1915	1922	25 %	25 %	25 %	25 %	182682736
5	NC_010579	TGAG	2	8	2340	2347	25 %	25 %	50 %	0 %	182682736
6	NC_010579	AGGT	2	8	2996	3003	25 %	25 %	50 %	0 %	182682737
7	NC_010579	GCTT	2	8	3014	3021	0 %	50 %	25 %	25 %	182682737
8	NC_010579	GAAA	2	8	3321	3328	75 %	0 %	25 %	0 %	182682737
9	NC_010579	GCAA	2	8	3831	3838	50 %	0 %	25 %	25 %	182682738
10	NC_010579	AGCC	2	8	3939	3946	25 %	0 %	25 %	50 %	182682738
11	NC_010579	CGCA	2	8	4070	4077	25 %	0 %	25 %	50 %	182682738
12	NC_010579	TGCT	2	8	4526	4533	0 %	50 %	25 %	25 %	182682739
13	NC_010579	CATG	2	8	4560	4567	25 %	25 %	25 %	25 %	182682739
14	NC_010579	CCGC	2	8	4645	4652	0 %	0 %	25 %	75 %	182682739
15	NC_010579	GAAA	2	8	4721	4728	75 %	0 %	25 %	0 %	182682739
16	NC_010579	ATTG	2	8	5102	5109	25 %	50 %	25 %	0 %	182682740
17	NC_010579	CCAA	2	8	6194	6201	50 %	0 %	0 %	50 %	182682740
18	NC_010579	GCAG	2	8	6983	6990	25 %	0 %	50 %	25 %	182682741
19	NC_010579	ACCA	2	8	7014	7021	50 %	0 %	0 %	50 %	182682741
20	NC_010579	CTTG	2	8	7233	7240	0 %	50 %	25 %	25 %	182682742
21	NC_010579	TCGA	2	8	7264	7271	25 %	25 %	25 %	25 %	182682742
22	NC_010579	CGGC	2	8	8354	8361	0 %	0 %	50 %	50 %	182682743
23	NC_010579	CATG	2	8	8766	8773	25 %	25 %	25 %	25 %	182682743
24	NC_010579	CCTT	2	8	8827	8834	0 %	50 %	0 %	50 %	182682744
25	NC_010579	GGGT	2	8	9062	9069	0 %	25 %	75 %	0 %	182682744
26	NC_010579	TCTT	2	8	9690	9697	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010579	CTTC	2	8	10244	10251	0 %	50 %	0 %	50 %	182682745
28	NC_010579	GCGT	2	8	10364	10371	0 %	25 %	50 %	25 %	182682746
29	NC_010579	TTTG	2	8	10932	10939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010579	CGTG	2	8	11325	11332	0 %	25 %	50 %	25 %	182682747
31	NC_010579	CGGT	2	8	11374	11381	0 %	25 %	50 %	25 %	182682747
32	NC_010579	AGAT	2	8	11744	11751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010579	CTAA	2	8	12043	12050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010579	AGTT	2	8	12987	12994	25 %	50 %	25 %	0 %	182682749
35	NC_010579	CTAA	2	8	13195	13202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010579	CTTA	2	8	13825	13832	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_010579	ACAA	2	8	14093	14100	75 %	0 %	0 %	25 %	182682751
38	NC_010579	AGCT	2	8	14503	14510	25 %	25 %	25 %	25 %	182682752
39	NC_010579	AACA	2	8	16197	16204	75 %	0 %	0 %	25 %	182682752
40	NC_010579	TGGG	2	8	16213	16220	0 %	25 %	75 %	0 %	182682752
41	NC_010579	ACAG	2	8	16429	16436	50 %	0 %	25 %	25 %	182682752
42	NC_010579	TCGG	2	8	16452	16459	0 %	25 %	50 %	25 %	182682752
43	NC_010579	AACA	2	8	16602	16609	75 %	0 %	0 %	25 %	182682752
44	NC_010579	TCAA	2	8	16735	16742	50 %	25 %	0 %	25 %	182682752
45	NC_010579	ACGA	2	8	16923	16930	50 %	0 %	25 %	25 %	182682752
46	NC_010579	ATCC	2	8	17222	17229	25 %	25 %	0 %	50 %	182682752
47	NC_010579	TGGA	2	8	18816	18823	25 %	25 %	50 %	0 %	182682752
48	NC_010579	CTTC	2	8	19539	19546	0 %	50 %	0 %	50 %	182682754
49	NC_010579	ATCA	2	8	19717	19724	50 %	25 %	0 %	25 %	182682754
50	NC_010579	CGCC	2	8	20689	20696	0 %	0 %	25 %	75 %	182682754
51	NC_010579	GTCA	2	8	21539	21546	25 %	25 %	25 %	25 %	182682755
52	NC_010579	GACC	2	8	21603	21610	25 %	0 %	25 %	50 %	182682755
53	NC_010579	CTTG	2	8	21875	21882	0 %	50 %	25 %	25 %	182682755
54	NC_010579	TTGA	2	8	22606	22613	25 %	50 %	25 %	0 %	182682756
55	NC_010579	TCCA	2	8	22985	22992	25 %	25 %	0 %	50 %	182682756
56	NC_010579	GCCA	2	8	23304	23311	25 %	0 %	25 %	50 %	182682756
57	NC_010579	GACC	2	8	23391	23398	25 %	0 %	25 %	50 %	182682756
58	NC_010579	TTGA	2	8	23766	23773	25 %	50 %	25 %	0 %	182682756
59	NC_010579	GATA	2	8	24983	24990	50 %	25 %	25 %	0 %	182682757
60	NC_010579	ATAG	2	8	25467	25474	50 %	25 %	25 %	0 %	182682757
61	NC_010579	TGCA	2	8	25791	25798	25 %	25 %	25 %	25 %	182682757
62	NC_010579	CCAA	2	8	25851	25858	50 %	0 %	0 %	50 %	182682757
63	NC_010579	AAGA	2	8	27977	27984	75 %	0 %	25 %	0 %	182682760
64	NC_010579	AAGA	2	8	28017	28024	75 %	0 %	25 %	0 %	182682760
65	NC_010579	CAGC	2	8	28385	28392	25 %	0 %	25 %	50 %	182682761
66	NC_010579	TCTT	2	8	28661	28668	0 %	75 %	0 %	25 %	182682762
67	NC_010579	TTCC	2	8	28843	28850	0 %	50 %	0 %	50 %	182682762
68	NC_010579	TCAA	2	8	29004	29011	50 %	25 %	0 %	25 %	182682762
69	NC_010579	ACGA	2	8	29033	29040	50 %	0 %	25 %	25 %	182682762
70	NC_010579	TTTC	2	8	29287	29294	0 %	75 %	0 %	25 %	182682763
71	NC_010579	ACCA	2	8	29647	29654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_010579	TAGA	2	8	29678	29685	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010579	AGTT	2	8	29697	29704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010579	CGAC	2	8	29811	29818	25 %	0 %	25 %	50 %	182682764
75	NC_010579	AATG	2	8	30221	30228	50 %	25 %	25 %	0 %	182682764
76	NC_010579	ACGC	2	8	30792	30799	25 %	0 %	25 %	50 %	182682765
77	NC_010579	TTTC	2	8	31292	31299	0 %	75 %	0 %	25 %	182682765
78	NC_010579	CTCG	2	8	31601	31608	0 %	25 %	25 %	50 %	182682765
79	NC_010579	TTTG	2	8	31705	31712	0 %	75 %	25 %	0 %	182682765
80	NC_010579	ACTT	2	8	31761	31768	25 %	50 %	0 %	25 %	182682765
81	NC_010579	TGCG	2	8	32338	32345	0 %	25 %	50 %	25 %	182682767
82	NC_010579	ATGG	2	8	32492	32499	25 %	25 %	50 %	0 %	182682767
83	NC_010579	CAAG	2	8	33875	33882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_010579	GCTT	2	8	33889	33896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_010579	TCTA	2	8	34016	34023	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010579	ATTT	2	8	34171	34178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010579	TTGC	2	8	35043	35050	0 %	50 %	25 %	25 %	182682769
88	NC_010579	CTAA	2	8	35593	35600	50 %	25 %	0 %	25 %	182682770
89	NC_010579	TGTC	2	8	35780	35787	0 %	50 %	25 %	25 %	182682770
90	NC_010579	ATCC	2	8	36500	36507	25 %	25 %	0 %	50 %	182682772
91	NC_010579	TCAG	2	8	36957	36964	25 %	25 %	25 %	25 %	182682773

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.