MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 plasmid pXFAS01

Total Repeats: 465

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010579	GCA	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682735
2	NC_010579	TTA	2	6	248	253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682735
3	NC_010579	CAA	2	6	278	283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682735
4	NC_010579	AAT	2	6	319	324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682735
5	NC_010579	TGC	2	6	354	359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
6	NC_010579	GTT	2	6	367	372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682736
7	NC_010579	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
8	NC_010579	TCT	2	6	445	450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
9	NC_010579	GAT	2	6	470	475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
10	NC_010579	CGT	2	6	510	515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
11	NC_010579	CAT	2	6	597	602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
12	NC_010579	GCA	2	6	698	703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
13	NC_010579	GAG	2	6	710	715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182682736
14	NC_010579	TTC	2	6	758	763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
15	NC_010579	ATG	3	9	828	836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
16	NC_010579	ATC	2	6	1035	1040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
17	NC_010579	CGG	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682736
18	NC_010579	GGT	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
19	NC_010579	ATC	2	6	1248	1253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
20	NC_010579	TTC	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682736
21	NC_010579	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
22	NC_010579	TCA	2	6	1385	1390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
23	NC_010579	CTA	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
24	NC_010579	TGA	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
25	NC_010579	CGA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
26	NC_010579	CGT	2	6	1601	1606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
27	NC_010579	TTG	2	6	1610	1615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682736
28	NC_010579	CTG	2	6	1637	1642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
29	NC_010579	CCT	2	6	1694	1699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682736
30	NC_010579	TGC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
31	NC_010579	ATT	2	6	1784	1789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682736
32	NC_010579	TGG	2	6	1830	1835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682736
33	NC_010579	CGT	2	6	1847	1852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
34	NC_010579	TCA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
35	NC_010579	CGC	2	6	1997	2002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182682736
36	NC_010579	CTG	2	6	2306	2311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
37	NC_010579	GAA	2	6	2330	2335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682736
38	NC_010579	CTG	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682736
39	NC_010579	TGA	2	6	2377	2382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
40	NC_010579	GAA	3	9	2449	2457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682736
41	NC_010579	CAT	2	6	2518	2523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
42	NC_010579	ATC	2	6	2630	2635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
43	NC_010579	ACT	3	9	2658	2666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682736
44	NC_010579	TGA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682736
45	NC_010579	AGC	2	6	2866	2871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682736
46	NC_010579	GAA	2	6	2901	2906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682737
47	NC_010579	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682737
48	NC_010579	TCG	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682737
49	NC_010579	TGC	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682737
50	NC_010579	GGT	2	6	3049	3054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682737
51	NC_010579	CAG	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682737
52	NC_010579	CAG	2	6	3388	3393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682737
53	NC_010579	ATG	2	6	3469	3474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682737
54	NC_010579	TCA	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682737
55	NC_010579	GAC	2	6	3721	3726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682738
56	NC_010579	GGC	2	6	3736	3741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682738
57	NC_010579	TGC	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682738
58	NC_010579	ATA	2	6	3971	3976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682738
59	NC_010579	ACG	2	6	4013	4018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682738
60	NC_010579	CAC	2	6	4027	4032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682738
61	NC_010579	CAT	2	6	4279	4284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682738
62	NC_010579	CAA	2	6	4304	4309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682738
63	NC_010579	GTC	2	6	4331	4336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682738
64	NC_010579	GAT	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682738
65	NC_010579	ATG	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682739
66	NC_010579	GCG	2	6	4576	4581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682739
67	NC_010579	GCA	2	6	4699	4704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682739
68	NC_010579	GCG	2	6	4783	4788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682739
69	NC_010579	GCG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682740
70	NC_010579	TCG	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
71	NC_010579	TCA	2	6	5065	5070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
72	NC_010579	AAT	2	6	5133	5138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182682740
73	NC_010579	GAA	3	9	5174	5182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
74	NC_010579	ATT	2	6	5235	5240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682740
75	NC_010579	CAA	2	6	5306	5311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
76	NC_010579	CAC	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682740
77	NC_010579	TGA	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
78	NC_010579	ACA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
79	NC_010579	CAG	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
80	NC_010579	GAG	2	6	5491	5496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182682740
81	NC_010579	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
82	NC_010579	CGA	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
83	NC_010579	GCA	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682740
84	NC_010579	CAA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
85	NC_010579	CAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
86	NC_010579	GCG	2	6	5830	5835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682740
87	NC_010579	ACA	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682740
88	NC_010579	ATC	2	6	6088	6093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
89	NC_010579	CTG	2	6	6120	6125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
90	NC_010579	CGT	3	9	6145	6153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682740
91	NC_010579	AGT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
92	NC_010579	GAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682740
93	NC_010579	GAA	2	6	6269	6274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682740
94	NC_010579	CAT	3	9	6323	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682740
95	NC_010579	TTG	2	6	6460	6465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182682741
96	NC_010579	GCA	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
97	NC_010579	CAG	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
98	NC_010579	CAG	2	6	6573	6578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
99	NC_010579	ACA	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682741
100	NC_010579	TGA	2	6	6664	6669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682741
101	NC_010579	TGG	2	6	6679	6684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682741
102	NC_010579	CTA	2	6	6701	6706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682741
103	NC_010579	AAG	3	9	6708	6716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182682741
104	NC_010579	GCA	2	6	6721	6726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682741
105	NC_010579	CTG	2	6	6787	6792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682741
106	NC_010579	CAA	2	6	6897	6902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682741
107	NC_010579	TGG	2	6	7209	7214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682742
108	NC_010579	CGT	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682742
109	NC_010579	GTA	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682742
110	NC_010579	TAC	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682742
111	NC_010579	GCC	2	6	7366	7371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182682742
112	NC_010579	ACA	2	6	7529	7534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682743
113	NC_010579	CTG	2	6	7618	7623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682743
114	NC_010579	GAT	2	6	7644	7649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682743
115	NC_010579	CTT	2	6	7716	7721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682743
116	NC_010579	TGG	2	6	7723	7728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682743
117	NC_010579	ATC	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682743
118	NC_010579	CAT	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682743
119	NC_010579	CTG	2	6	7969	7974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682743
120	NC_010579	GCT	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682743
121	NC_010579	CTA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682743
122	NC_010579	GGT	3	9	8026	8034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682743
123	NC_010579	CTA	2	6	8061	8066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682743
124	NC_010579	ATT	2	6	8113	8118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682743
125	NC_010579	TAC	2	6	8146	8151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682743
126	NC_010579	CAA	2	6	8232	8237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682743
127	NC_010579	TCC	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682743
128	NC_010579	GGT	2	6	8269	8274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682743
129	NC_010579	TGC	2	6	8319	8324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682743
130	NC_010579	GGC	2	6	8325	8330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182682743
131	NC_010579	GCT	2	6	8338	8343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682743
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250	NC_010579	TCC	2	6	18638	18643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682752
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253	NC_010579	CGC	2	6	18924	18929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182682752
254	NC_010579	CAA	2	6	18953	18958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682752
255	NC_010579	GGA	2	6	18974	18979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182682752
256	NC_010579	ACT	2	6	18997	19002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682753
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260	NC_010579	CCT	2	6	19368	19373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682754
261	NC_010579	CAT	2	6	19569	19574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682754
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265	NC_010579	CCT	2	6	20099	20104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182682754
266	NC_010579	GGT	2	6	20140	20145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182682754
267	NC_010579	TGC	2	6	20159	20164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
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269	NC_010579	TGA	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682754
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272	NC_010579	CTT	3	9	20560	20568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
273	NC_010579	TCT	2	6	20681	20686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682754
274	NC_010579	ACC	2	6	20713	20718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682754
275	NC_010579	ACC	2	6	20792	20797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682754
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277	NC_010579	TGC	2	6	20926	20931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682754
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283	NC_010579	GTA	2	6	21506	21511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682755
284	NC_010579	CAA	2	6	21644	21649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182682755
285	NC_010579	TCA	2	6	21718	21723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682755
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375	NC_010579	CTG	2	6	28684	28689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682762
376	NC_010579	ATG	2	6	28722	28727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682762
377	NC_010579	TGA	3	9	28731	28739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182682762
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379	NC_010579	CTG	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682762
380	NC_010579	ATC	2	6	29112	29117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682762
381	NC_010579	CTG	2	6	29120	29125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682762
382	NC_010579	CCA	2	6	29363	29368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182682763
383	NC_010579	CTG	2	6	29425	29430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182682763
384	NC_010579	GCA	2	6	29498	29503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182682763
385	NC_010579	TCT	2	6	29592	29597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682763
386	NC_010579	TCA	2	6	29723	29728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682764
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388	NC_010579	CAT	2	6	29785	29790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182682764
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390	NC_010579	CTT	2	6	29885	29890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682764
391	NC_010579	TTA	2	6	29895	29900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682764
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396	NC_010579	TCT	2	6	30265	30270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682764
397	NC_010579	TTC	2	6	30273	30278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682764
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402	NC_010579	TTA	2	6	30830	30835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182682765
403	NC_010579	TCT	2	6	31047	31052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182682765
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