MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039 plasmid pBIND02

Total Repeats: 187

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010578	GAT	2	6	15	20	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010578	AAG	2	6	199	204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010578	ATG	2	6	459	464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010578	TAT	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010578	TAT	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010578	GAA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010578	AAT	2	6	1557	1562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_010578	AAT	2	6	1597	1602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_010578	TCT	2	6	4073	4078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_010578	TCG	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_010578	GTT	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010578	GCC	2	6	5592	5597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_010578	CAC	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_010578	TAC	2	6	5728	5733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_010578	ATG	2	6	5740	5745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_010578	CGA	2	6	5852	5857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_010578	TTG	2	6	5943	5948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_010578	CAC	2	6	5975	5980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_010578	CGA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_010578	CTT	2	6	6410	6415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_010578	TTC	2	6	7661	7666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010578	GAA	2	6	7684	7689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010578	GAT	2	6	7744	7749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_010578	CAT	2	6	10393	10398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_010578	ATT	2	6	10424	10429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_010578	TAA	2	6	10434	10439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_010578	GAT	2	6	10600	10605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_010578	CGT	2	6	10745	10750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_010578	CCA	2	6	10782	10787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_010578	CAT	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010578	GAT	2	6	12152	12157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_010578	AGC	2	6	12182	12187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_010578	TGC	2	6	12237	12242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_010578	AGG	2	6	12277	12282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_010578	ATG	2	6	12411	12416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010578	TCT	2	6	12425	12430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_010578	CTC	2	6	12456	12461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_010578	TAT	2	6	15978	15983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_010578	GTT	2	6	16036	16041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_010578	TGA	2	6	16103	16108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010578	ATA	2	6	16114	16119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010578	TAG	2	6	16146	16151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010578	AGC	2	6	16724	16729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010578	GCT	2	6	16803	16808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_010578	ATC	2	6	16941	16946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_010578	AGT	2	6	17017	17022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_010578	TCG	2	6	17067	17072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010578	GCC	2	6	17124	17129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_010578	CGA	2	6	17131	17136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_010578	ATC	2	6	17207	17212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_010578	GAA	2	6	17393	17398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010578	GAC	2	6	17459	17464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_010578	CTT	2	6	17513	17518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_010578	ATA	2	6	17642	17647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010578	CAT	2	6	17717	17722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_010578	CGA	2	6	17738	17743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_010578	ACA	2	6	20765	20770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_010578	TTC	2	6	20783	20788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_010578	AAT	2	6	21026	21031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_010578	GTG	2	6	21111	21116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_010578	CGG	2	6	21169	21174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_010578	AGC	2	6	22631	22636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_010578	GGA	2	6	22746	22751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010578	GAA	2	6	22794	22799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010578	GGC	2	6	24562	24567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_010578	GGA	2	6	24641	24646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_010578	GTG	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_010578	TGT	2	6	27939	27944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_010578	CAT	2	6	27947	27952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_010578	ATG	2	6	29456	29461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_010578	CAA	2	6	31381	31386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_010578	TAT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_010578	ATT	2	6	32703	32708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_010578	AAT	2	6	32754	32759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_010578	GCC	2	6	32768	32773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_010578	GCA	2	6	32793	32798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_010578	TCT	2	6	32843	32848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_010578	GTC	2	6	32968	32973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_010578	TGT	2	6	32984	32989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_010578	CGA	2	6	32999	33004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_010578	TCG	2	6	33031	33036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_010578	GCT	2	6	33128	33133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_010578	ACT	2	6	34413	34418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_010578	TTG	2	6	42630	42635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010578	ACG	2	6	42657	42662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_010578	AAT	2	6	42688	42693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010578	ATG	2	6	42858	42863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_010578	CGA	2	6	43089	43094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_010578	ATG	2	6	43177	43182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010578	TAG	2	6	43249	43254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010578	ATA	2	6	43401	43406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010578	TTC	3	9	43620	43628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010578	GGA	2	6	43649	43654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010578	CTG	2	6	43877	43882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010578	TGG	2	6	43907	43912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010578	GTT	2	6	44028	44033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010578	AGA	2	6	44356	44361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010578	TCG	2	6	44807	44812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_010578	CTG	2	6	44863	44868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010578	GCT	2	6	45008	45013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_010578	CGA	2	6	45068	45073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_010578	GTT	2	6	45268	45273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010578	ATT	3	9	45319	45327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010578	AAG	2	6	45416	45421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010578	GCA	2	6	47111	47116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_010578	GGA	2	6	47187	47192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_010578	CGG	2	6	48518	48523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010578	TCC	2	6	50593	50598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_010578	GTA	2	6	50683	50688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010578	TGC	2	6	50737	50742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010578	CTC	2	6	50760	50765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_010578	TTA	2	6	50805	50810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010578	CGC	2	6	50830	50835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_010578	GTC	2	6	50867	50872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_010578	AGA	2	6	50883	50888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_010578	GGC	2	6	50907	50912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_010578	GCC	2	6	50931	50936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_010578	GCG	2	6	51160	51165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_010578	GTC	2	6	51983	51988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_010578	CGG	2	6	51994	51999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010578	GTG	2	6	52037	52042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010578	GGC	2	6	52087	52092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010578	CGC	5	15	52141	52155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_010578	GCC	2	6	52160	52165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_010578	CCG	2	6	52248	52253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_010578	GCG	2	6	52287	52292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_010578	GGC	2	6	52334	52339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010578	GCC	2	6	52361	52366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_010578	CTT	2	6	52496	52501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_010578	GGA	2	6	52589	52594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010578	CGC	2	6	52598	52603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_010578	CGC	2	6	52607	52612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_010578	CTG	2	6	52617	52622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_010578	GGC	2	6	52668	52673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_010578	GCG	3	9	52693	52701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_010578	AGG	2	6	52716	52721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_010578	GGC	2	6	53792	53797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_010578	GCC	3	9	54105	54113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_010578	TTC	2	6	54120	54125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_010578	GGC	2	6	54209	54214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.