MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	CGTTG	2	10	8213	8222	0 %	40 %	40 %	20 %	182680579
2	NC_010577	GATGT	2	10	12636	12645	20 %	40 %	40 %	0 %	182680584
3	NC_010577	CAATT	2	10	12760	12769	40 %	40 %	0 %	20 %	182680584
4	NC_010577	GCGTC	2	10	15659	15668	0 %	20 %	40 %	40 %	182680585
5	NC_010577	TGTGT	2	10	16865	16874	0 %	60 %	40 %	0 %	182680587
6	NC_010577	CTTTT	2	10	16887	16896	0 %	80 %	0 %	20 %	182680587
7	NC_010577	TGCGT	2	10	22469	22478	0 %	40 %	40 %	20 %	182680589
8	NC_010577	AGATC	2	10	23349	23358	40 %	20 %	20 %	20 %	182680590
9	NC_010577	AGCGA	2	10	24536	24545	40 %	0 %	40 %	20 %	182680592
10	NC_010577	AATGG	2	10	24566	24575	40 %	20 %	40 %	0 %	182680592
11	NC_010577	AATTG	2	10	24861	24870	40 %	40 %	20 %	0 %	182680593
12	NC_010577	ACAAT	2	10	25226	25235	60 %	20 %	0 %	20 %	182680593
13	NC_010577	GTGCA	2	10	25460	25469	20 %	20 %	40 %	20 %	182680593
14	NC_010577	GGGAC	2	10	28256	28265	20 %	0 %	60 %	20 %	182680595
15	NC_010577	ACGGT	2	10	29928	29937	20 %	20 %	40 %	20 %	182680595
16	NC_010577	GGTGA	2	10	30434	30443	20 %	20 %	60 %	0 %	182680596
17	NC_010577	TGGCG	2	10	31084	31093	0 %	20 %	60 %	20 %	182680597
18	NC_010577	GTTTG	2	10	36964	36973	0 %	60 %	40 %	0 %	182680600
19	NC_010577	TGCGC	2	10	38201	38210	0 %	20 %	40 %	40 %	182680601
20	NC_010577	TGCGT	2	10	40727	40736	0 %	40 %	40 %	20 %	182680603
21	NC_010577	GGCTT	2	10	41601	41610	0 %	40 %	40 %	20 %	182680603
22	NC_010577	TTTGG	2	10	42534	42543	0 %	60 %	40 %	0 %	182680603
23	NC_010577	ATTTG	2	10	46579	46588	20 %	60 %	20 %	0 %	182680607
24	NC_010577	CGTTG	2	10	46707	46716	0 %	40 %	40 %	20 %	182680607
25	NC_010577	TAGGA	2	10	47079	47088	40 %	20 %	40 %	0 %	182680607
26	NC_010577	CGATG	2	10	48577	48586	20 %	20 %	40 %	20 %	182680607
27	NC_010577	CGTTT	2	10	50567	50576	0 %	60 %	20 %	20 %	182680608
28	NC_010577	GGTAT	2	10	50862	50871	20 %	40 %	40 %	0 %	182680608
29	NC_010577	TGATC	2	10	51099	51108	20 %	40 %	20 %	20 %	182680608
30	NC_010577	CATCA	2	10	56807	56816	40 %	20 %	0 %	40 %	182680612
31	NC_010577	TTGAG	2	10	56895	56904	20 %	40 %	40 %	0 %	182680612
32	NC_010577	GCAGC	2	10	57258	57267	20 %	0 %	40 %	40 %	182680612
33	NC_010577	GACTG	2	10	57510	57519	20 %	20 %	40 %	20 %	182680613
34	NC_010577	TTGCT	2	10	58314	58323	0 %	60 %	20 %	20 %	182680613
35	NC_010577	TTGCT	2	10	73109	73118	0 %	60 %	20 %	20 %	182680619
36	NC_010577	CGCTG	2	10	75155	75164	0 %	20 %	40 %	40 %	182680621
37	NC_010577	TTCGG	2	10	81803	81812	0 %	40 %	40 %	20 %	182680624
38	NC_010577	CGTGA	2	10	81818	81827	20 %	20 %	40 %	20 %	182680624
39	NC_010577	AACGC	2	10	82111	82120	40 %	0 %	20 %	40 %	182680624
40	NC_010577	TCGAC	2	10	82137	82146	20 %	20 %	20 %	40 %	182680624
41	NC_010577	GATGC	2	10	82997	83006	20 %	20 %	40 %	20 %	182680625
42	NC_010577	GTACA	2	10	85545	85554	40 %	20 %	20 %	20 %	182680627
43	NC_010577	CGCTG	2	10	88449	88458	0 %	20 %	40 %	40 %	182680630
44	NC_010577	CCTCC	2	10	89169	89178	0 %	20 %	0 %	80 %	182680630
45	NC_010577	ATGTT	2	10	89563	89572	20 %	60 %	20 %	0 %	182680631
46	NC_010577	CAGCT	2	10	92673	92682	20 %	20 %	20 %	40 %	182680634
47	NC_010577	TGCAT	2	10	97793	97802	20 %	40 %	20 %	20 %	182680639
48	NC_010577	TCTTT	2	10	97805	97814	0 %	80 %	0 %	20 %	182680639
49	NC_010577	TGCAA	2	10	99213	99222	40 %	20 %	20 %	20 %	182680640
50	NC_010577	TGGCG	2	10	99722	99731	0 %	20 %	60 %	20 %	182680640
51	NC_010577	GCGTA	2	10	100507	100516	20 %	20 %	40 %	20 %	182680641
52	NC_010577	GCGGA	2	10	106803	106812	20 %	0 %	60 %	20 %	182680648
53	NC_010577	CAACC	2	10	108565	108574	40 %	0 %	0 %	60 %	182680650
54	NC_010577	TCGCA	2	10	110892	110901	20 %	20 %	20 %	40 %	182680652
55	NC_010577	CGCGT	2	10	112002	112011	0 %	20 %	40 %	40 %	182680653
56	NC_010577	CATCG	2	10	112290	112299	20 %	20 %	20 %	40 %	182680653
57	NC_010577	TGAGG	2	10	117418	117427	20 %	20 %	60 %	0 %	182680656
58	NC_010577	CTGAA	2	10	121846	121855	40 %	20 %	20 %	20 %	182680658
59	NC_010577	CGGCG	2	10	124205	124214	0 %	0 %	60 %	40 %	182680660
60	NC_010577	GTGAC	2	10	125891	125900	20 %	20 %	40 %	20 %	182680661
61	NC_010577	GCCAT	2	10	127213	127222	20 %	20 %	20 %	40 %	182680662
62	NC_010577	CCTTC	2	10	127522	127531	0 %	40 %	0 %	60 %	182680663
63	NC_010577	ACTGG	2	10	128305	128314	20 %	20 %	40 %	20 %	182680663
64	NC_010577	GAACA	2	10	128826	128835	60 %	0 %	20 %	20 %	182680663
65	NC_010577	TGCAA	2	10	130840	130849	40 %	20 %	20 %	20 %	182680665
66	NC_010577	GGCGC	2	10	131075	131084	0 %	0 %	60 %	40 %	182680665
67	NC_010577	TGTGG	2	10	136130	136139	0 %	40 %	60 %	0 %	182680669
68	NC_010577	TGTGT	2	10	139093	139102	0 %	60 %	40 %	0 %	182680673
69	NC_010577	GTGTT	2	10	139680	139689	0 %	60 %	40 %	0 %	182680674
70	NC_010577	GTTTG	2	10	143050	143059	0 %	60 %	40 %	0 %	182680676
71	NC_010577	AGCAC	2	10	145215	145224	40 %	0 %	20 %	40 %	182680677
72	NC_010577	CCGAC	2	10	145495	145504	20 %	0 %	20 %	60 %	182680677
73	NC_010577	GATGT	2	10	145762	145771	20 %	40 %	40 %	0 %	182680677
74	NC_010577	GGTGC	2	10	146440	146449	0 %	20 %	60 %	20 %	182680678
75	NC_010577	TGCGT	2	10	147716	147725	0 %	40 %	40 %	20 %	182680680
76	NC_010577	CGTTG	2	10	153029	153038	0 %	40 %	40 %	20 %	182680684
77	NC_010577	GTTGC	2	10	153355	153364	0 %	40 %	40 %	20 %	182680684
78	NC_010577	AGCGC	2	10	154118	154127	20 %	0 %	40 %	40 %	182680684
79	NC_010577	AGCGT	2	10	154246	154255	20 %	20 %	40 %	20 %	182680684
80	NC_010577	TGGAT	2	10	157325	157334	20 %	40 %	40 %	0 %	182680687
81	NC_010577	TTGCA	2	10	158558	158567	20 %	40 %	20 %	20 %	182680688
82	NC_010577	CGGAG	2	10	162984	162993	20 %	0 %	60 %	20 %	182680691
83	NC_010577	TGTGT	2	10	164332	164341	0 %	60 %	40 %	0 %	182680692
84	NC_010577	TCGAT	2	10	164925	164934	20 %	40 %	20 %	20 %	182680693
85	NC_010577	TGGAT	2	10	165426	165435	20 %	40 %	40 %	0 %	182680693
86	NC_010577	GAGGT	2	10	169560	169569	20 %	20 %	60 %	0 %	182680696
87	NC_010577	GCTTG	2	10	179497	179506	0 %	40 %	40 %	20 %	182680699
88	NC_010577	GAGTG	2	10	184180	184189	20 %	20 %	60 %	0 %	182680702
89	NC_010577	TTGCC	2	10	186259	186268	0 %	40 %	20 %	40 %	182680704
90	NC_010577	GACTG	2	10	190687	190696	20 %	20 %	40 %	20 %	182680706
91	NC_010577	ACGTA	2	10	191847	191856	40 %	20 %	20 %	20 %	182680707
92	NC_010577	TGCGA	2	10	192001	192010	20 %	20 %	40 %	20 %	182680707
93	NC_010577	CCCAT	2	10	193104	193113	20 %	20 %	0 %	60 %	182680708
94	NC_010577	TGCAT	2	10	195690	195699	20 %	40 %	20 %	20 %	182680711
95	NC_010577	CGCGC	2	10	197033	197042	0 %	0 %	40 %	60 %	182680713
96	NC_010577	GGCTT	2	10	197968	197977	0 %	40 %	40 %	20 %	182680713
97	NC_010577	TGTCA	2	10	198140	198149	20 %	40 %	20 %	20 %	182680714
98	NC_010577	GCATC	2	10	201451	201460	20 %	20 %	20 %	40 %	182680716
99	NC_010577	GTGGC	2	10	203758	203767	0 %	20 %	60 %	20 %	182680718
100	NC_010577	ACCGA	2	10	204382	204391	40 %	0 %	20 %	40 %	182680719
101	NC_010577	GTTGG	2	10	204680	204689	0 %	40 %	60 %	0 %	182680719
102	NC_010577	GTTGC	2	10	206926	206935	0 %	40 %	40 %	20 %	182680721
103	NC_010577	GGTTG	2	10	207544	207553	0 %	40 %	60 %	0 %	182680722
104	NC_010577	TGCGC	2	10	207637	207646	0 %	20 %	40 %	40 %	182680722
105	NC_010577	GGCGT	2	10	210723	210732	0 %	20 %	60 %	20 %	182680724
106	NC_010577	CCAGT	2	10	212910	212919	20 %	20 %	20 %	40 %	182680725
107	NC_010577	GATCG	2	10	213549	213558	20 %	20 %	40 %	20 %	182680725
108	NC_010577	GTCAT	2	10	217314	217323	20 %	40 %	20 %	20 %	182680728
109	NC_010577	TGACA	2	10	225076	225085	40 %	20 %	20 %	20 %	182680735
110	NC_010577	GGCGA	2	10	225218	225227	20 %	0 %	60 %	20 %	182680735
111	NC_010577	TCACG	2	10	225670	225679	20 %	20 %	20 %	40 %	182680735
112	NC_010577	TTCGC	2	10	226582	226591	0 %	40 %	20 %	40 %	182680736
113	NC_010577	GCAGC	2	10	226624	226633	20 %	0 %	40 %	40 %	182680736
114	NC_010577	CGTGG	2	10	230779	230788	0 %	20 %	60 %	20 %	182680738
115	NC_010577	GGTGT	2	10	231501	231510	0 %	40 %	60 %	0 %	182680739
116	NC_010577	GCGTG	2	10	232841	232850	0 %	20 %	60 %	20 %	182680740
117	NC_010577	GCGGT	2	10	234967	234976	0 %	20 %	60 %	20 %	182680742
118	NC_010577	GTGCG	2	10	235390	235399	0 %	20 %	60 %	20 %	182680742
119	NC_010577	GCCGC	2	10	235841	235850	0 %	0 %	40 %	60 %	182680742
120	NC_010577	GTTGG	2	10	236165	236174	0 %	40 %	60 %	0 %	182680743
121	NC_010577	GACTC	2	10	236848	236857	20 %	20 %	20 %	40 %	182680744
122	NC_010577	CGTGC	2	10	239050	239059	0 %	20 %	40 %	40 %	182680747
123	NC_010577	CTGCG	2	10	239066	239075	0 %	20 %	40 %	40 %	182680747
124	NC_010577	TGCGT	2	10	239241	239250	0 %	40 %	40 %	20 %	182680747
125	NC_010577	ATTGT	2	10	243494	243503	20 %	60 %	20 %	0 %	182680749
126	NC_010577	CGCGA	2	10	249824	249833	20 %	0 %	40 %	40 %	182680754
127	NC_010577	TACTC	2	10	251421	251430	20 %	40 %	0 %	40 %	182680755
128	NC_010577	CAGAT	2	10	251994	252003	40 %	20 %	20 %	20 %	182680756
129	NC_010577	TGCAT	2	10	253040	253049	20 %	40 %	20 %	20 %	182680757
130	NC_010577	GGCAT	2	10	253087	253096	20 %	20 %	40 %	20 %	182680757
131	NC_010577	ACTTG	2	10	253115	253124	20 %	40 %	20 %	20 %	182680757
132	NC_010577	ACCAA	2	10	254129	254138	60 %	0 %	0 %	40 %	182680758
133	NC_010577	GAATT	2	10	254405	254414	40 %	40 %	20 %	0 %	182680758
134	NC_010577	CATTG	2	10	254758	254767	20 %	40 %	20 %	20 %	182680758
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376	NC_010577	TCCCC	2	10	623841	623850	0 %	20 %	0 %	80 %	182681075
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381	NC_010577	AACGC	2	10	628371	628380	40 %	0 %	20 %	40 %	182681086
382	NC_010577	GCGCC	2	10	630972	630981	0 %	0 %	40 %	60 %	182681091
383	NC_010577	ATCAA	2	10	631352	631361	60 %	20 %	0 %	20 %	182681091
384	NC_010577	TGGCG	2	10	631398	631407	0 %	20 %	60 %	20 %	182681091
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386	NC_010577	TTCCG	2	10	646491	646500	0 %	40 %	20 %	40 %	182681101
387	NC_010577	TTGGT	2	10	648070	648079	0 %	60 %	40 %	0 %	182681103
388	NC_010577	GCTCA	2	10	648332	648341	20 %	20 %	20 %	40 %	182681104
389	NC_010577	GATGC	2	10	649752	649761	20 %	20 %	40 %	20 %	182681105
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