MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xylella fastidiosa M23 chromosome

Total Repeats: 28700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010577	TGA	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
2	NC_010577	CCA	2	6	82	87	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680573
3	NC_010577	TAG	2	6	179	184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
4	NC_010577	AGT	2	6	243	248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
5	NC_010577	ACA	2	6	274	279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
6	NC_010577	TAC	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680573
7	NC_010577	TTG	2	6	371	376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680573
8	NC_010577	TGC	2	6	402	407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
9	NC_010577	TGG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680573
10	NC_010577	TGC	2	6	501	506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680573
11	NC_010577	AAG	2	6	692	697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680573
12	NC_010577	ATT	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
13	NC_010577	CCT	2	6	838	843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680573
14	NC_010577	TAG	2	6	980	985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680573
15	NC_010577	CAA	2	6	1063	1068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
16	NC_010577	ATT	2	6	1106	1111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680573
17	NC_010577	ACA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680573
18	NC_010577	GTA	2	6	1695	1700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
19	NC_010577	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	182680574
20	NC_010577	GAT	2	6	1793	1798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
21	NC_010577	GAT	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
22	NC_010577	TAT	3	9	2015	2023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
23	NC_010577	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
24	NC_010577	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680574
25	NC_010577	TTA	2	6	2090	2095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
26	NC_010577	ATT	2	6	2214	2219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
27	NC_010577	TTA	2	6	2253	2258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
28	NC_010577	GGC	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680574
29	NC_010577	GTG	2	6	2473	2478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
30	NC_010577	AAG	3	9	2533	2541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
31	NC_010577	GAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680574
32	NC_010577	ATT	2	6	2602	2607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680574
33	NC_010577	GTG	2	6	2632	2637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680574
34	NC_010577	TTC	2	6	2669	2674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680574
35	NC_010577	AGT	2	6	2714	2719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680574
36	NC_010577	GTT	2	6	3078	3083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680575
37	NC_010577	AGT	2	6	3410	3415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680575
38	NC_010577	TCA	2	6	3423	3428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
39	NC_010577	ACG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680575
40	NC_010577	ATT	2	6	3469	3474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680575
41	NC_010577	AAC	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
42	NC_010577	AAC	2	6	3651	3656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680575
43	NC_010577	CGT	2	6	3728	3733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680575
44	NC_010577	CTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680575
45	NC_010577	GCT	2	6	4657	4662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
46	NC_010577	GGC	2	6	4670	4675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680577
47	NC_010577	TAC	2	6	4701	4706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
48	NC_010577	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680577
49	NC_010577	AGA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
50	NC_010577	TGG	2	6	4966	4971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
51	NC_010577	CGA	2	6	4978	4983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680577
52	NC_010577	TGG	2	6	5002	5007	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
53	NC_010577	CAA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
54	NC_010577	TAC	2	6	5158	5163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
55	NC_010577	GTG	2	6	5289	5294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
56	NC_010577	GGT	2	6	5324	5329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680577
57	NC_010577	TTG	2	6	5415	5420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
58	NC_010577	TGC	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
59	NC_010577	TGC	2	6	5524	5529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
60	NC_010577	TGA	2	6	5602	5607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
61	NC_010577	TTC	2	6	5662	5667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680577
62	NC_010577	GGA	2	6	5737	5742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680577
63	NC_010577	TGC	2	6	5797	5802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
64	NC_010577	GCT	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
65	NC_010577	TCG	2	6	5931	5936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
66	NC_010577	CTG	2	6	5946	5951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
67	NC_010577	TCA	2	6	6144	6149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
68	NC_010577	GCC	2	6	6259	6264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
69	NC_010577	GCC	2	6	6382	6387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
70	NC_010577	CGC	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
71	NC_010577	CCT	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680577
72	NC_010577	TGA	2	6	6625	6630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680577
73	NC_010577	ACA	2	6	6631	6636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680577
74	NC_010577	GCC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680577
75	NC_010577	TTG	2	6	6647	6652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680577
76	NC_010577	GAA	2	6	6853	6858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680577
77	NC_010577	TAC	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680577
78	NC_010577	TGC	2	6	6976	6981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680577
79	NC_010577	TCA	2	6	7235	7240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
80	NC_010577	TGG	2	6	7376	7381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680578
81	NC_010577	GTT	3	9	7407	7415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680578
82	NC_010577	TGA	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680578
83	NC_010577	CAT	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
84	NC_010577	TCG	2	6	7640	7645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680578
85	NC_010577	ATT	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680578
86	NC_010577	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680578
87	NC_010577	TAC	2	6	7890	7895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680578
88	NC_010577	TGA	2	6	8016	8021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	182680579
89	NC_010577	GTG	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680579
90	NC_010577	GCA	3	9	8119	8127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680579
91	NC_010577	TTG	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680579
92	NC_010577	GAA	2	6	8294	8299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680579
93	NC_010577	GCT	2	6	8381	8386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680579
94	NC_010577	CGT	2	6	8410	8415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680579
95	NC_010577	TCA	2	6	8422	8427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	182680579
96	NC_010577	GAG	2	6	8429	8434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	182680579
97	NC_010577	TGC	2	6	8512	8517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680579
98	NC_010577	TTG	2	6	8604	8609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	182680579
99	NC_010577	GAA	2	6	8665	8670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680579
100	NC_010577	CCG	2	6	8696	8701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680579
101	NC_010577	AGC	2	6	8751	8756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680579
102	NC_010577	GCA	2	6	8825	8830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680579
103	NC_010577	CTG	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
104	NC_010577	GGT	2	6	8997	9002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680580
105	NC_010577	CTG	2	6	9013	9018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
106	NC_010577	TGC	2	6	9056	9061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
107	NC_010577	CTC	2	6	9125	9130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	182680580
108	NC_010577	GCT	2	6	9279	9284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
109	NC_010577	GCA	2	6	9311	9316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680580
110	NC_010577	AAC	2	6	9357	9362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680580
111	NC_010577	TGC	2	6	9376	9381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
112	NC_010577	TTA	2	6	9538	9543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680580
113	NC_010577	CTT	2	6	9559	9564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680580
114	NC_010577	TTA	2	6	9591	9596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680580
115	NC_010577	GTG	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	182680580
116	NC_010577	ACA	2	6	9826	9831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	182680580
117	NC_010577	TTA	2	6	9923	9928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	182680580
118	NC_010577	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680580
119	NC_010577	GCT	2	6	9972	9977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680580
120	NC_010577	ACG	2	6	9988	9993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	182680580
121	NC_010577	GCC	2	6	10036	10041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680580
122	NC_010577	AGA	2	6	10097	10102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680580
123	NC_010577	AAG	2	6	10107	10112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680580
124	NC_010577	GAA	2	6	10580	10585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	182680581
125	NC_010577	TGC	2	6	10678	10683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680581
126	NC_010577	CTG	2	6	10704	10709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	182680581
127	NC_010577	GCG	2	6	10745	10750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	182680581
128	NC_010577	CGC	4	12	10770	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	182680581
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130	NC_010577	CAC	3	9	10839	10847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	182680581
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500	NC_010577	CTT	2	6	47032	47037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	182680607

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