MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350 chromosome

Total Repeats: 9363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010572	TCGCT	2	10	31	40	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_010572	GCGCC	2	10	1594	1603	0 %	0 %	40 %	60 %	182433794
3	NC_010572	GGCCG	2	10	2042	2051	0 %	0 %	60 %	40 %	182433794
4	NC_010572	TTCGA	2	10	2435	2444	20 %	40 %	20 %	20 %	182433794
5	NC_010572	CAACT	2	10	3104	3113	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_010572	GACGG	2	10	6422	6431	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_010572	CCGGA	2	10	6579	6588	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_010572	CTGCT	2	10	6832	6841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_010572	GGAGA	2	10	7370	7379	40 %	0 %	60 %	0 %	182433800
10	NC_010572	CTGCC	2	10	7583	7592	0 %	20 %	20 %	60 %	182433800
11	NC_010572	TGAAT	2	10	7791	7800	40 %	40 %	20 %	0 %	182433801
12	NC_010572	TGGTC	2	10	9473	9482	0 %	40 %	40 %	20 %	182433801
13	NC_010572	GACTG	2	10	9718	9727	20 %	20 %	40 %	20 %	182433801
14	NC_010572	GTCCC	2	10	9970	9979	0 %	20 %	20 %	60 %	182433801
15	NC_010572	GCGGT	2	10	10336	10345	0 %	20 %	60 %	20 %	182433801
16	NC_010572	AGGCC	2	10	10526	10535	20 %	0 %	40 %	40 %	182433801
17	NC_010572	GGCCG	2	10	12291	12300	0 %	0 %	60 %	40 %	182433801
18	NC_010572	GGCCC	2	10	14096	14105	0 %	0 %	40 %	60 %	182433801
19	NC_010572	GGCAG	2	10	14253	14262	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_010572	CTGCC	2	10	14441	14450	0 %	20 %	20 %	60 %	182433802
21	NC_010572	ACGCC	2	10	14463	14472	20 %	0 %	20 %	60 %	182433802
22	NC_010572	GGTGT	2	10	16358	16367	0 %	40 %	60 %	0 %	182433802
23	NC_010572	CCCCA	2	10	18019	18028	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
24	NC_010572	GCCGA	2	10	21120	21129	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_010572	CGGGG	2	10	22403	22412	0 %	0 %	80 %	20 %	182433808
26	NC_010572	GAGAA	2	10	22625	22634	60 %	0 %	40 %	0 %	182433808
27	NC_010572	TCCCC	2	10	22706	22715	0 %	20 %	0 %	80 %	182433808
28	NC_010572	GCGCC	2	10	22973	22982	0 %	0 %	40 %	60 %	182433808
29	NC_010572	GCTGG	2	10	23425	23434	0 %	20 %	60 %	20 %	182433808
30	NC_010572	TCGGG	2	10	25052	25061	0 %	20 %	60 %	20 %	182433810
31	NC_010572	CCCTG	2	10	25099	25108	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_010572	CTCCG	2	10	25353	25362	0 %	20 %	20 %	60 %	182433811
33	NC_010572	CGGCG	2	10	27863	27872	0 %	0 %	60 %	40 %	182433815
34	NC_010572	CGGTC	2	10	27920	27929	0 %	20 %	40 %	40 %	182433815
35	NC_010572	GGCCG	2	10	29668	29677	0 %	0 %	60 %	40 %	182433817
36	NC_010572	CCGGG	2	10	30560	30569	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_010572	CTTCC	2	10	30584	30593	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_010572	CAGGA	2	10	31672	31681	40 %	0 %	40 %	20 %	182433818
39	NC_010572	GCAGG	2	10	34271	34280	20 %	0 %	60 %	20 %	182433821
40	NC_010572	CCGCA	2	10	34304	34313	20 %	0 %	20 %	60 %	182433821
41	NC_010572	CACCG	2	10	34927	34936	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_010572	GGCCC	2	10	36653	36662	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_010572	GGGCC	2	10	36674	36683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_010572	GCCCG	2	10	37716	37725	0 %	0 %	40 %	60 %	182433826
45	NC_010572	GGCTC	2	10	38404	38413	0 %	20 %	40 %	40 %	182433826
46	NC_010572	CGGCA	2	10	40243	40252	20 %	0 %	40 %	40 %	182433829
47	NC_010572	GGGCT	2	10	43265	43274	0 %	20 %	60 %	20 %	182433834
48	NC_010572	GGCGT	2	10	43404	43413	0 %	20 %	60 %	20 %	182433834
49	NC_010572	CTGTC	2	10	43460	43469	0 %	40 %	20 %	40 %	182433834
50	NC_010572	GCGGG	2	10	45498	45507	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_010572	TCGCG	2	10	47105	47114	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_010572	TGGGG	2	10	47565	47574	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010572	GCGGG	2	10	47891	47900	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_010572	CTGTC	2	10	47917	47926	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_010572	GGGCA	2	10	48035	48044	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_010572	CCGGA	2	10	49497	49506	20 %	0 %	40 %	40 %	182433838
57	NC_010572	GGGCG	2	10	50383	50392	0 %	0 %	80 %	20 %	182433839
58	NC_010572	GGGCG	2	10	50412	50421	0 %	0 %	80 %	20 %	182433839
59	NC_010572	CTCGC	2	10	52019	52028	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_010572	AGCGG	2	10	52523	52532	20 %	0 %	60 %	20 %	182433842
61	NC_010572	TCATC	2	10	53372	53381	20 %	40 %	0 %	40 %	182433843
62	NC_010572	GTCTT	2	10	53977	53986	0 %	60 %	20 %	20 %	182433843
63	NC_010572	AGTCA	2	10	54083	54092	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_010572	CCCGA	2	10	54373	54382	20 %	0 %	20 %	60 %	182433844
65	NC_010572	TGCGG	2	10	54795	54804	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_010572	GCCGG	2	10	55113	55122	0 %	0 %	60 %	40 %	182433845
67	NC_010572	GGCGG	2	10	57021	57030	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_010572	GTGCC	2	10	57127	57136	0 %	20 %	40 %	40 %	182433847
69	NC_010572	GCCGT	2	10	58030	58039	0 %	20 %	40 %	40 %	182433847
70	NC_010572	GGCGG	2	10	59093	59102	0 %	0 %	80 %	20 %	182433849
71	NC_010572	CCGCC	2	10	60077	60086	0 %	0 %	20 %	80 %	182433849
72	NC_010572	GGCCG	2	10	61206	61215	0 %	0 %	60 %	40 %	182433850
73	NC_010572	CACGG	2	10	61623	61632	20 %	0 %	40 %	40 %	182433850
74	NC_010572	GTCGA	2	10	62501	62510	20 %	20 %	40 %	20 %	182433851
75	NC_010572	TGGCG	2	10	65601	65610	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_010572	GGGAG	2	10	65804	65813	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010572	CGGGG	2	10	67345	67354	0 %	0 %	80 %	20 %	182433856
78	NC_010572	CCGGG	2	10	68407	68416	0 %	0 %	60 %	40 %	182433857
79	NC_010572	GGGGT	2	10	69577	69586	0 %	20 %	80 %	0 %	182433859
80	NC_010572	CGGGC	2	10	69773	69782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_010572	TCCGG	2	10	70110	70119	0 %	20 %	40 %	40 %	182433861
82	NC_010572	CGCAG	2	10	71940	71949	20 %	0 %	40 %	40 %	182433862
83	NC_010572	AGGAC	2	10	74230	74239	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_010572	GCCCG	2	10	74264	74273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_010572	GGACG	2	10	74495	74504	20 %	0 %	60 %	20 %	182433863
86	NC_010572	CTTTC	2	10	76027	76036	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_010572	CGTCG	2	10	79552	79561	0 %	20 %	40 %	40 %	182433870
88	NC_010572	CGTCG	2	10	79729	79738	0 %	20 %	40 %	40 %	182433870
89	NC_010572	CCAGT	2	10	80801	80810	20 %	20 %	20 %	40 %	182433871
90	NC_010572	GGAAG	2	10	82073	82082	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010572	CGAGG	2	10	82772	82781	20 %	0 %	60 %	20 %	182433872
92	NC_010572	CGGTC	2	10	84118	84127	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_010572	GCCGG	2	10	84691	84700	0 %	0 %	60 %	40 %	182433874
94	NC_010572	GCCAA	2	10	85440	85449	40 %	0 %	20 %	40 %	182433875
95	NC_010572	CCGGA	2	10	85768	85777	20 %	0 %	40 %	40 %	182433876
96	NC_010572	CGCTC	2	10	85997	86006	0 %	20 %	20 %	60 %	182433876
97	NC_010572	CAGGG	2	10	87098	87107	20 %	0 %	60 %	20 %	182433878
98	NC_010572	AGCCG	2	10	87345	87354	20 %	0 %	40 %	40 %	182433878
99	NC_010572	CCCGG	2	10	87881	87890	0 %	0 %	40 %	60 %	182433879
100	NC_010572	GAATC	2	10	89135	89144	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_010572	AGGAG	2	10	89660	89669	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010572	CCTCG	2	10	90195	90204	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_010572	ACCGC	2	10	90882	90891	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_010572	CGATC	2	10	91743	91752	20 %	20 %	20 %	40 %	182433885
105	NC_010572	GACCG	2	10	91789	91798	20 %	0 %	40 %	40 %	182433885
106	NC_010572	CTGCA	2	10	91906	91915	20 %	20 %	20 %	40 %	182433885
107	NC_010572	CGCCT	2	10	92371	92380	0 %	20 %	20 %	60 %	182433886
108	NC_010572	GAGCG	2	10	92500	92509	20 %	0 %	60 %	20 %	182433886
109	NC_010572	GATCT	2	10	95535	95544	20 %	40 %	20 %	20 %	182433890
110	NC_010572	GTTCG	2	10	96099	96108	0 %	40 %	40 %	20 %	182433891
111	NC_010572	TGGCC	2	10	98190	98199	0 %	20 %	40 %	40 %	182433891
112	NC_010572	CCTGC	2	10	98551	98560	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
113	NC_010572	GAGGG	2	10	98926	98935	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010572	CTCGG	2	10	99386	99395	0 %	20 %	40 %	40 %	182433892
115	NC_010572	GGACG	2	10	102273	102282	20 %	0 %	60 %	20 %	182433896
116	NC_010572	ACGCC	2	10	104540	104549	20 %	0 %	20 %	60 %	182433897
117	NC_010572	GCCTG	2	10	104763	104772	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_010572	GAGCG	2	10	105852	105861	20 %	0 %	60 %	20 %	182433898
119	NC_010572	CGGCG	2	10	105911	105920	0 %	0 %	60 %	40 %	182433898
120	NC_010572	GCAGG	2	10	108004	108013	20 %	0 %	60 %	20 %	182433901
121	NC_010572	AGGGG	2	10	109099	109108	20 %	0 %	80 %	0 %	182433902
122	NC_010572	CGGTG	2	10	110341	110350	0 %	20 %	60 %	20 %	182433903
123	NC_010572	TCGAT	2	10	110916	110925	20 %	40 %	20 %	20 %	182433903
124	NC_010572	CCACC	2	10	114230	114239	20 %	0 %	0 %	80 %	182433906
125	NC_010572	GCTCA	2	10	115977	115986	20 %	20 %	20 %	40 %	182433906
126	NC_010572	GCCCA	2	10	116448	116457	20 %	0 %	20 %	60 %	182433906
127	NC_010572	GTTCT	2	10	117931	117940	0 %	60 %	20 %	20 %	182433907
128	NC_010572	AGCAG	2	10	118731	118740	40 %	0 %	40 %	20 %	182433907
129	NC_010572	GGGCC	2	10	118951	118960	0 %	0 %	60 %	40 %	182433907
130	NC_010572	GCCGG	2	10	120480	120489	0 %	0 %	60 %	40 %	182433909
131	NC_010572	GCGGT	2	10	120630	120639	0 %	20 %	60 %	20 %	182433909
132	NC_010572	CTGCC	2	10	120931	120940	0 %	20 %	20 %	60 %	182433909
133	NC_010572	TGGCG	2	10	121161	121170	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
134	NC_010572	TCCTC	2	10	121747	121756	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_010572	GGCCG	2	10	122559	122568	0 %	0 %	60 %	40 %	182433911
136	NC_010572	GCAAC	2	10	122606	122615	40 %	0 %	20 %	40 %	182433911
137	NC_010572	CGAGC	2	10	123233	123242	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
138	NC_010572	CGGTG	2	10	124794	124803	0 %	20 %	60 %	20 %	182433913
139	NC_010572	CAGGT	2	10	125773	125782	20 %	20 %	40 %	20 %	182433913
140	NC_010572	CGCCC	2	10	125912	125921	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
141	NC_010572	TGCCG	2	10	126592	126601	0 %	20 %	40 %	40 %	182433914
142	NC_010572	TTCCG	2	10	127305	127314	0 %	40 %	20 %	40 %	182433914
143	NC_010572	TCCCA	2	10	127618	127627	20 %	20 %	0 %	60 %	182433914
144	NC_010572	GGGTG	2	10	128113	128122	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_010572	GGCGG	2	10	128989	128998	0 %	0 %	80 %	20 %	182433916
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148	NC_010572	CGGGG	2	10	130027	130036	0 %	0 %	80 %	20 %	182433917
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150	NC_010572	CAGTG	2	10	131508	131517	20 %	20 %	40 %	20 %	182433919
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158	NC_010572	CGGGG	2	10	142070	142079	0 %	0 %	80 %	20 %	182433927
159	NC_010572	CCCGG	2	10	142974	142983	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
160	NC_010572	TGTGG	2	10	143231	143240	0 %	40 %	60 %	0 %	182433928
161	NC_010572	CGTGG	2	10	144101	144110	0 %	20 %	60 %	20 %	182433929
162	NC_010572	TCGGC	2	10	144520	144529	0 %	20 %	40 %	40 %	182433930
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164	NC_010572	GTGCG	2	10	144639	144648	0 %	20 %	60 %	20 %	182433930
165	NC_010572	ATCGG	2	10	144751	144760	20 %	20 %	40 %	20 %	182433930
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167	NC_010572	CGCGC	2	10	145915	145924	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
168	NC_010572	CGGAC	2	10	146594	146603	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
169	NC_010572	TCCCC	2	10	146637	146646	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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171	NC_010572	CCAAA	2	10	147933	147942	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
172	NC_010572	CACCG	2	10	151028	151037	20 %	0 %	20 %	60 %	182433935
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174	NC_010572	CTCCC	2	10	151642	151651	0 %	20 %	0 %	80 %	182433936
175	NC_010572	GGGGC	2	10	156700	156709	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
176	NC_010572	GGACG	2	10	157428	157437	20 %	0 %	60 %	20 %	182433942
177	NC_010572	CGGGG	2	10	158945	158954	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
178	NC_010572	GTCCG	3	15	159085	159099	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
179	NC_010572	CGGGC	2	10	159927	159936	0 %	0 %	60 %	40 %	182433945
180	NC_010572	CCGGT	2	10	161335	161344	0 %	20 %	40 %	40 %	182433945
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184	NC_010572	GCGTC	2	10	165005	165014	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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186	NC_010572	CCTGA	2	10	169881	169890	20 %	20 %	20 %	40 %	182433955
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189	NC_010572	TCGAC	2	10	174862	174871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
190	NC_010572	CCCGG	2	10	175671	175680	0 %	0 %	40 %	60 %	182433963
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201	NC_010572	TCACC	2	10	188091	188100	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
202	NC_010572	GCCGA	2	10	189613	189622	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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210	NC_010572	TGGGC	2	10	193639	193648	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
211	NC_010572	GTTCC	2	10	194235	194244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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240	NC_010572	GCACC	2	10	220704	220713	20 %	0 %	20 %	60 %	182434006
241	NC_010572	CACGG	2	10	220986	220995	20 %	0 %	40 %	40 %	182434006
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243	NC_010572	ACCGG	2	10	224635	224644	20 %	0 %	40 %	40 %	182434009
244	NC_010572	CGACC	2	10	225717	225726	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
245	NC_010572	GGGGT	2	10	226338	226347	0 %	20 %	80 %	0 %	182434010
246	NC_010572	GTCGG	2	10	226383	226392	0 %	20 %	60 %	20 %	182434010
247	NC_010572	CCCGG	2	10	226706	226715	0 %	0 %	40 %	60 %	182434010
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250	NC_010572	CCGGC	2	10	228855	228864	0 %	0 %	40 %	60 %	182434012
251	NC_010572	GGGCC	2	10	230637	230646	0 %	0 %	60 %	40 %	182434013
252	NC_010572	CTCGA	2	10	231657	231666	20 %	20 %	20 %	40 %	182434014
253	NC_010572	CGGGC	2	10	231889	231898	0 %	0 %	60 %	40 %	182434015
254	NC_010572	CGGGC	2	10	232576	232585	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
255	NC_010572	CCACC	2	10	232686	232695	20 %	0 %	0 %	80 %	182434016
256	NC_010572	CCGCG	2	10	232772	232781	0 %	0 %	40 %	60 %	182434016
257	NC_010572	CGGTC	2	10	232862	232871	0 %	20 %	40 %	40 %	182434016
258	NC_010572	GGCCG	2	10	234174	234183	0 %	0 %	60 %	40 %	182434017
259	NC_010572	GACGC	2	10	234393	234402	20 %	0 %	40 %	40 %	182434017
260	NC_010572	CGCGG	2	10	234528	234537	0 %	0 %	60 %	40 %	182434017
261	NC_010572	TGTCC	2	10	235491	235500	0 %	40 %	20 %	40 %	182434018
262	NC_010572	CCGGC	2	10	236544	236553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
263	NC_010572	GCCCC	2	10	237577	237586	0 %	0 %	20 %	80 %	182434020
264	NC_010572	CGGCG	2	10	238252	238261	0 %	0 %	60 %	40 %	182434020
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266	NC_010572	TGACG	2	10	240120	240129	20 %	20 %	40 %	20 %	182434021
267	NC_010572	TGCCG	2	10	241600	241609	0 %	20 %	40 %	40 %	182434023
268	NC_010572	GGTCC	2	10	241727	241736	0 %	20 %	40 %	40 %	182434023
269	NC_010572	CCTGC	2	10	244470	244479	0 %	20 %	20 %	60 %	182434024
270	NC_010572	CCCAG	2	10	245642	245651	20 %	0 %	20 %	60 %	182434024
271	NC_010572	CGTCG	2	10	247671	247680	0 %	20 %	40 %	40 %	182434024
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273	NC_010572	GCGCG	2	10	256289	256298	0 %	0 %	60 %	40 %	182434032
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373	NC_010572	CGCCT	2	10	350414	350423	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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391	NC_010572	CGGGC	2	10	369123	369132	0 %	0 %	60 %	40 %	182434135
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402	NC_010572	GCTCG	2	10	376123	376132	0 %	20 %	40 %	40 %	182434140
403	NC_010572	ACGGG	2	10	376238	376247	20 %	0 %	60 %	20 %	182434141
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406	NC_010572	GGCGC	2	10	377793	377802	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
407	NC_010572	CGGCT	2	10	377890	377899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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409	NC_010572	CGGCC	2	10	377983	377992	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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497	NC_010572	CCGGG	2	10	461706	461715	0 %	0 %	60 %	40 %	182434220
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